MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 23198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_012633	TCT	2	6	267016	267021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586442
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5004	NC_012633	AAT	3	9	267095	267103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586442
5005	NC_012633	AT	3	6	267122	267127	50 %	50 %	0 %	0 %	229586442
5006	NC_012633	AAT	2	6	267211	267216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586442
5007	NC_012633	TAT	2	6	267221	267226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586442
5008	NC_012633	ATC	2	6	267261	267266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586442
5009	NC_012633	TA	3	6	267278	267283	50 %	50 %	0 %	0 %	229586442
5010	NC_012633	TTA	2	6	267289	267294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586442
5011	NC_012633	TCA	2	6	267316	267321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586442
5012	NC_012633	CAT	2	6	267332	267337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586442
5013	NC_012633	TAA	2	6	267374	267379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586442
5014	NC_012633	T	6	6	267402	267407	0 %	100 %	0 %	0 %	229586442
5015	NC_012633	AATT	2	8	267471	267478	50 %	50 %	0 %	0 %	229586442
5016	NC_012633	TTC	2	6	267574	267579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586442
5017	NC_012633	T	6	6	267598	267603	0 %	100 %	0 %	0 %	229586442
5018	NC_012633	AAG	2	6	267654	267659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586442
5019	NC_012633	AGC	2	6	267708	267713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586443
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5021	NC_012633	AAT	2	6	267753	267758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586443
5022	NC_012633	T	7	7	267831	267837	0 %	100 %	0 %	0 %	229586443
5023	NC_012633	TGT	2	6	267842	267847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586443
5024	NC_012633	TTC	3	9	267852	267860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586443
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5026	NC_012633	T	6	6	267974	267979	0 %	100 %	0 %	0 %	229586443
5027	NC_012633	CAT	2	6	267986	267991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586443
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5030	NC_012633	TGAT	2	8	268099	268106	25 %	50 %	25 %	0 %	229586444
5031	NC_012633	ATTA	2	8	268128	268135	50 %	50 %	0 %	0 %	229586444
5032	NC_012633	T	7	7	268161	268167	0 %	100 %	0 %	0 %	229586444
5033	NC_012633	ATT	2	6	268194	268199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586444
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5035	NC_012633	TAT	2	6	268238	268243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586444
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5038	NC_012633	GAT	2	6	268279	268284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586444
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5041	NC_012633	TAA	2	6	268356	268361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586444
5042	NC_012633	GTA	2	6	268366	268371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586444
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5044	NC_012633	ATA	2	6	268499	268504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586444
5045	NC_012633	AT	3	6	268543	268548	50 %	50 %	0 %	0 %	229586444
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5052	NC_012633	C	6	6	268829	268834	0 %	0 %	0 %	100 %	229586444
5053	NC_012633	TA	3	6	268889	268894	50 %	50 %	0 %	0 %	229586444
5054	NC_012633	TTA	2	6	268904	268909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586444
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5057	NC_012633	AATT	2	8	269019	269026	50 %	50 %	0 %	0 %	229586444
5058	NC_012633	TGTT	2	8	269034	269041	0 %	75 %	25 %	0 %	229586444
5059	NC_012633	CATTAT	2	12	269054	269065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229586444
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5071	NC_012633	TAAA	2	8	269494	269501	75 %	25 %	0 %	0 %	229586444
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5093	NC_012633	AGAGT	2	10	270189	270198	40 %	20 %	40 %	0 %	229586445
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5107	NC_012633	AT	4	8	270961	270968	50 %	50 %	0 %	0 %	229586446
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5123	NC_012633	AGC	2	6	271897	271902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586447
5124	NC_012633	GCC	2	6	271935	271940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586447
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5234	NC_012633	GTA	2	6	282373	282378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586451
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5237	NC_012633	TCA	2	6	282476	282481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586452
5238	NC_012633	ACTTA	2	10	282530	282539	40 %	40 %	0 %	20 %	229586452
5239	NC_012633	ATG	2	6	282610	282615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586452
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5241	NC_012633	TAAT	2	8	282628	282635	50 %	50 %	0 %	0 %	229586452
5242	NC_012633	GTT	2	6	282657	282662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586452
5243	NC_012633	ATCC	3	12	282726	282737	25 %	25 %	0 %	50 %	229586452
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5493	NC_012633	TAT	2	6	298853	298858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586465
5494	NC_012633	T	6	6	298926	298931	0 %	100 %	0 %	0 %	229586465
5495	NC_012633	TGA	2	6	298933	298938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586465
5496	NC_012633	TCA	3	9	298981	298989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586465
5497	NC_012633	TAA	2	6	299026	299031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586465
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5499	NC_012633	T	7	7	299107	299113	0 %	100 %	0 %	0 %	229586465
5500	NC_012633	TCT	2	6	299213	299218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586465

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