MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012523	GT	4	8	131	138	0 %	50 %	50 %	0 %	226334773
2	NC_012523	GA	3	6	230	235	50 %	0 %	50 %	0 %	226334773
3	NC_012523	CT	3	6	1208	1213	0 %	50 %	0 %	50 %	226334774
4	NC_012523	GT	3	6	1265	1270	0 %	50 %	50 %	0 %	226334774
5	NC_012523	CG	3	6	1510	1515	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
6	NC_012523	GC	3	6	1716	1721	0 %	0 %	50 %	50 %	226334774
7	NC_012523	GC	3	6	2007	2012	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
8	NC_012523	CG	3	6	2173	2178	0 %	0 %	50 %	50 %	226334775
9	NC_012523	CG	3	6	4646	4651	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
10	NC_012523	GC	3	6	4776	4781	0 %	0 %	50 %	50 %	226334777
11	NC_012523	TC	3	6	5811	5816	0 %	50 %	0 %	50 %	226334778
12	NC_012523	CA	3	6	6349	6354	50 %	0 %	0 %	50 %	226334779
13	NC_012523	GC	3	6	7277	7282	0 %	0 %	50 %	50 %	226334779
14	NC_012523	GT	3	6	8206	8211	0 %	50 %	50 %	0 %	226334780
15	NC_012523	CG	3	6	8961	8966	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
16	NC_012523	GC	3	6	8967	8972	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
17	NC_012523	GC	3	6	9554	9559	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
18	NC_012523	GT	4	8	9829	9836	0 %	50 %	50 %	0 %	226334781
19	NC_012523	CG	3	6	10038	10043	0 %	0 %	50 %	50 %	226334781
20	NC_012523	TG	3	6	10593	10598	0 %	50 %	50 %	0 %	226334781
21	NC_012523	TC	3	6	11223	11228	0 %	50 %	0 %	50 %	226334782
22	NC_012523	GC	3	6	14658	14663	0 %	0 %	50 %	50 %	226334784
23	NC_012523	TC	3	6	14965	14970	0 %	50 %	0 %	50 %	226334784
24	NC_012523	AC	3	6	15967	15972	50 %	0 %	0 %	50 %	226334785
25	NC_012523	CG	3	6	16062	16067	0 %	0 %	50 %	50 %	226334785
26	NC_012523	CG	3	6	16457	16462	0 %	0 %	50 %	50 %	226334785
27	NC_012523	AC	3	6	16772	16777	50 %	0 %	0 %	50 %	226334786
28	NC_012523	CG	3	6	16954	16959	0 %	0 %	50 %	50 %	226334786
29	NC_012523	GC	3	6	17397	17402	0 %	0 %	50 %	50 %	226334786
30	NC_012523	CG	3	6	17644	17649	0 %	0 %	50 %	50 %	226334787
31	NC_012523	GC	3	6	22531	22536	0 %	0 %	50 %	50 %	226334794
32	NC_012523	GC	3	6	24535	24540	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
33	NC_012523	CG	3	6	24929	24934	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
34	NC_012523	GC	3	6	24949	24954	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
35	NC_012523	CG	3	6	25155	25160	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
36	NC_012523	GC	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	226334797
37	NC_012523	GC	3	6	27309	27314	0 %	0 %	50 %	50 %	226334798
38	NC_012523	GA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	50 %	0 %	226334798
39	NC_012523	CT	3	6	30088	30093	0 %	50 %	0 %	50 %	226334800
40	NC_012523	CG	3	6	30571	30576	0 %	0 %	50 %	50 %	226334800
41	NC_012523	AC	3	6	32009	32014	50 %	0 %	0 %	50 %	226334802
42	NC_012523	CG	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	226334802
43	NC_012523	GC	3	6	32565	32570	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
44	NC_012523	CG	3	6	32622	32627	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
45	NC_012523	GC	3	6	33137	33142	0 %	0 %	50 %	50 %	226334803
46	NC_012523	GA	3	6	34600	34605	50 %	0 %	50 %	0 %	226334804
47	NC_012523	CG	4	8	34832	34839	0 %	0 %	50 %	50 %	226334804
48	NC_012523	CG	4	8	35599	35606	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
49	NC_012523	CG	3	6	35664	35669	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
50	NC_012523	CG	3	6	35708	35713	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
51	NC_012523	CG	3	6	35898	35903	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
52	NC_012523	AC	3	6	35956	35961	50 %	0 %	0 %	50 %	226334805
53	NC_012523	CG	3	6	36386	36391	0 %	0 %	50 %	50 %	226334805
54	NC_012523	GT	3	6	37026	37031	0 %	50 %	50 %	0 %	226334805
55	NC_012523	CA	3	6	38204	38209	50 %	0 %	0 %	50 %	226334807
56	NC_012523	CG	4	8	38238	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	226334807
57	NC_012523	GC	3	6	38290	38295	0 %	0 %	50 %	50 %	226334807
58	NC_012523	GC	3	6	38685	38690	0 %	0 %	50 %	50 %	226334808
59	NC_012523	CG	4	8	38810	38817	0 %	0 %	50 %	50 %	226334808
60	NC_012523	CA	3	6	38939	38944	50 %	0 %	0 %	50 %	226334808
61	NC_012523	GC	4	8	41085	41092	0 %	0 %	50 %	50 %	226334810
62	NC_012523	CG	5	10	41383	41392	0 %	0 %	50 %	50 %	226334810
63	NC_012523	CG	3	6	42843	42848	0 %	0 %	50 %	50 %	226334811
64	NC_012523	GT	3	6	43009	43014	0 %	50 %	50 %	0 %	226334812
65	NC_012523	CG	4	8	43816	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
66	NC_012523	GC	3	6	44198	44203	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
67	NC_012523	CG	3	6	44908	44913	0 %	0 %	50 %	50 %	226334813
68	NC_012523	CG	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	226334815
69	NC_012523	GC	3	6	46571	46576	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
70	NC_012523	CG	5	10	46636	46645	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
71	NC_012523	CA	3	6	46690	46695	50 %	0 %	0 %	50 %	226334817
72	NC_012523	GA	3	6	47952	47957	50 %	0 %	50 %	0 %	226334818
73	NC_012523	GC	3	6	50597	50602	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
74	NC_012523	GT	4	8	51131	51138	0 %	50 %	50 %	0 %	226334820
75	NC_012523	CG	3	6	52042	52047	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
76	NC_012523	GC	3	6	54727	54732	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
77	NC_012523	GC	3	6	57293	57298	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
78	NC_012523	CG	3	6	57807	57812	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
79	NC_012523	GC	3	6	58793	58798	0 %	0 %	50 %	50 %	226334820
80	NC_012523	CG	3	6	59844	59849	0 %	0 %	50 %	50 %	226334821
81	NC_012523	GT	3	6	61124	61129	0 %	50 %	50 %	0 %	226334823
82	NC_012523	GC	3	6	61601	61606	0 %	0 %	50 %	50 %	226334824
83	NC_012523	CG	3	6	61843	61848	0 %	0 %	50 %	50 %	226334825
84	NC_012523	TG	3	6	61939	61944	0 %	50 %	50 %	0 %	226334825
85	NC_012523	GC	3	6	62284	62289	0 %	0 %	50 %	50 %	226334826
86	NC_012523	AG	3	6	62396	62401	50 %	0 %	50 %	0 %	226334826
87	NC_012523	GC	3	6	64065	64070	0 %	0 %	50 %	50 %	226334830
88	NC_012523	GC	3	6	64178	64183	0 %	0 %	50 %	50 %	226334830
89	NC_012523	GT	3	6	65608	65613	0 %	50 %	50 %	0 %	226334833
90	NC_012523	AC	3	6	66244	66249	50 %	0 %	0 %	50 %	226334833
91	NC_012523	CG	3	6	67026	67031	0 %	0 %	50 %	50 %	226334834
92	NC_012523	GC	3	6	67967	67972	0 %	0 %	50 %	50 %	226334835
93	NC_012523	CG	3	6	68672	68677	0 %	0 %	50 %	50 %	226334836
94	NC_012523	GT	3	6	70477	70482	0 %	50 %	50 %	0 %	226334839
95	NC_012523	GC	3	6	71779	71784	0 %	0 %	50 %	50 %	226334840
96	NC_012523	GC	3	6	71800	71805	0 %	0 %	50 %	50 %	226334840
97	NC_012523	CG	3	6	72480	72485	0 %	0 %	50 %	50 %	226334841
98	NC_012523	AC	3	6	75707	75712	50 %	0 %	0 %	50 %	226334845
99	NC_012523	CA	3	6	76726	76731	50 %	0 %	0 %	50 %	226334846
100	NC_012523	GC	3	6	76966	76971	0 %	0 %	50 %	50 %	226334846
101	NC_012523	AT	3	6	77149	77154	50 %	50 %	0 %	0 %	226334847
102	NC_012523	GC	3	6	78993	78998	0 %	0 %	50 %	50 %	226334848
103	NC_012523	GT	3	6	79014	79019	0 %	50 %	50 %	0 %	226334848
104	NC_012523	AC	3	6	79192	79197	50 %	0 %	0 %	50 %	226334848
105	NC_012523	AC	3	6	79301	79306	50 %	0 %	0 %	50 %	226334848
106	NC_012523	GC	4	8	80896	80903	0 %	0 %	50 %	50 %	226334850
107	NC_012523	CG	4	8	81037	81044	0 %	0 %	50 %	50 %	226334850
108	NC_012523	GA	3	6	81596	81601	50 %	0 %	50 %	0 %	226334850
109	NC_012523	CT	3	6	82858	82863	0 %	50 %	0 %	50 %	226334851
110	NC_012523	AG	3	6	82974	82979	50 %	0 %	50 %	0 %	226334851
111	NC_012523	TG	3	6	83748	83753	0 %	50 %	50 %	0 %	226334852
112	NC_012523	CG	3	6	84039	84044	0 %	0 %	50 %	50 %	226334852
113	NC_012523	AG	3	6	85329	85334	50 %	0 %	50 %	0 %	226334854
114	NC_012523	GC	3	6	85931	85936	0 %	0 %	50 %	50 %	226334854
115	NC_012523	TG	3	6	86569	86574	0 %	50 %	50 %	0 %	226334854
116	NC_012523	CG	3	6	86810	86815	0 %	0 %	50 %	50 %	226334855
117	NC_012523	GC	3	6	89224	89229	0 %	0 %	50 %	50 %	226334857
118	NC_012523	TC	3	6	89482	89487	0 %	50 %	0 %	50 %	226334857
119	NC_012523	GA	3	6	89492	89497	50 %	0 %	50 %	0 %	226334857
120	NC_012523	CG	3	6	89695	89700	0 %	0 %	50 %	50 %	226334857
121	NC_012523	CT	3	6	91011	91016	0 %	50 %	0 %	50 %	226334859
122	NC_012523	GC	3	6	91540	91545	0 %	0 %	50 %	50 %	226334859
123	NC_012523	GC	3	6	91908	91913	0 %	0 %	50 %	50 %	226334859
124	NC_012523	AC	3	6	92160	92165	50 %	0 %	0 %	50 %	226334859
125	NC_012523	CA	3	6	93570	93575	50 %	0 %	0 %	50 %	226334860
126	NC_012523	TG	3	6	98619	98624	0 %	50 %	50 %	0 %	226334865
127	NC_012523	GA	3	6	101207	101212	50 %	0 %	50 %	0 %	226334867
128	NC_012523	GC	3	6	101336	101341	0 %	0 %	50 %	50 %	226334867
129	NC_012523	GC	3	6	102017	102022	0 %	0 %	50 %	50 %	226334867
130	NC_012523	TG	3	6	103731	103736	0 %	50 %	50 %	0 %	226334868
131	NC_012523	AC	3	6	104317	104322	50 %	0 %	0 %	50 %	226334868
132	NC_012523	AG	3	6	104360	104365	50 %	0 %	50 %	0 %	226334868
133	NC_012523	GC	3	6	104425	104430	0 %	0 %	50 %	50 %	226334868
134	NC_012523	AC	3	6	105060	105065	50 %	0 %	0 %	50 %	226334869
135	NC_012523	CG	3	6	107158	107163	0 %	0 %	50 %	50 %	226334871
136	NC_012523	TC	3	6	107604	107609	0 %	50 %	0 %	50 %	226334871
137	NC_012523	CG	3	6	107889	107894	0 %	0 %	50 %	50 %	226334871
138	NC_012523	CT	3	6	108172	108177	0 %	50 %	0 %	50 %	226334872
139	NC_012523	GC	3	6	109326	109331	0 %	0 %	50 %	50 %	226334873
140	NC_012523	CA	3	6	110314	110319	50 %	0 %	0 %	50 %	226334873
141	NC_012523	GA	3	6	110364	110369	50 %	0 %	50 %	0 %	226334873

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.