MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012523	CGG	2	6	43438	43443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1002	NC_012523	CGG	2	6	43530	43535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1003	NC_012523	CAG	2	6	43580	43585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1004	NC_012523	CGG	3	9	43606	43614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1005	NC_012523	GCT	2	6	43625	43630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1006	NC_012523	CGA	2	6	43645	43650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1007	NC_012523	GCA	2	6	43756	43761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1008	NC_012523	CGA	2	6	43771	43776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1009	NC_012523	CG	4	8	43816	43823	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
1010	NC_012523	CGAACC	2	12	43870	43881	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226334812
1011	NC_012523	GCA	2	6	43891	43896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1012	NC_012523	TCG	2	6	43908	43913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1013	NC_012523	AGGT	2	8	43926	43933	25 %	25 %	50 %	0 %	226334812
1014	NC_012523	CAC	2	6	43974	43979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334812
1015	NC_012523	CGG	2	6	43993	43998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1016	NC_012523	CCG	2	6	44017	44022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334812
1017	NC_012523	GCA	2	6	44071	44076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334812
1018	NC_012523	GCC	2	6	44169	44174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334812
1019	NC_012523	GC	3	6	44198	44203	0 %	0 %	50 %	50 %	226334812
1020	NC_012523	GCC	2	6	44240	44245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334812
1021	NC_012523	GCG	2	6	44246	44251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1022	NC_012523	GCG	2	6	44255	44260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1023	NC_012523	CGG	2	6	44326	44331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334812
1024	NC_012523	AAC	2	6	44409	44414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334812
1025	NC_012523	TCT	2	6	44461	44466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334812
1026	NC_012523	ATC	2	6	44536	44541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334813
1027	NC_012523	GCC	2	6	44542	44547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1028	NC_012523	GCC	2	6	44585	44590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1029	NC_012523	GAG	2	6	44608	44613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334813
1030	NC_012523	ACC	2	6	44617	44622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334813
1031	NC_012523	CGA	2	6	44661	44666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334813
1032	NC_012523	ACCGA	2	10	44677	44686	40 %	0 %	20 %	40 %	226334813
1033	NC_012523	CCG	2	6	44694	44699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1034	NC_012523	GGT	2	6	44746	44751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334813
1035	NC_012523	ACC	2	6	44780	44785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334813
1036	NC_012523	CCT	2	6	44811	44816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334813
1037	NC_012523	CGT	2	6	44854	44859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334813
1038	NC_012523	CGA	2	6	44888	44893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334813
1039	NC_012523	CGC	2	6	44898	44903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1040	NC_012523	CG	3	6	44908	44913	0 %	0 %	50 %	50 %	226334813
1041	NC_012523	CGC	2	6	44923	44928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1042	NC_012523	CCG	2	6	44940	44945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1043	NC_012523	GCA	3	9	44958	44966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334813
1044	NC_012523	CAA	2	6	44977	44982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334813
1045	NC_012523	CGC	2	6	45017	45022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1046	NC_012523	CGA	2	6	45045	45050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334813
1047	NC_012523	CCG	2	6	45077	45082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334813
1048	NC_012523	GTC	2	6	45341	45346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334814
1049	NC_012523	CAA	2	6	45362	45367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334814
1050	NC_012523	CGT	2	6	45389	45394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334814
1051	NC_012523	CGG	2	6	45410	45415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334814
1052	NC_012523	TCG	3	9	45466	45474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334814
1053	NC_012523	ACG	2	6	45485	45490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334814
1054	NC_012523	CGG	2	6	45500	45505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334814
1055	NC_012523	GAT	2	6	45522	45527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334814
1056	NC_012523	CG	3	6	45585	45590	0 %	0 %	50 %	50 %	226334815
1057	NC_012523	CGG	3	9	45612	45620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334815
1058	NC_012523	CGG	2	6	45695	45700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334815
1059	NC_012523	CCT	2	6	45753	45758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334815
1060	NC_012523	CGCGG	2	10	45777	45786	0 %	0 %	60 %	40 %	226334815
1061	NC_012523	GCA	2	6	45867	45872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334815
1062	NC_012523	CGC	2	6	46047	46052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334816
1063	NC_012523	GGGCG	2	10	46055	46064	0 %	0 %	80 %	20 %	226334816
1064	NC_012523	GACCG	2	10	46095	46104	20 %	0 %	40 %	40 %	226334816
1065	NC_012523	GGT	2	6	46163	46168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334816
1066	NC_012523	CGG	2	6	46223	46228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334816
1067	NC_012523	TGG	2	6	46237	46242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334816
1068	NC_012523	CGA	2	6	46250	46255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334816
1069	NC_012523	TGG	2	6	46273	46278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334816
1070	NC_012523	CCGG	2	8	46345	46352	0 %	0 %	50 %	50 %	226334816
1071	NC_012523	TCGATC	2	12	46411	46422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	226334816
1072	NC_012523	ACG	2	6	46423	46428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334816
1073	NC_012523	GGT	2	6	46437	46442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334816
1074	NC_012523	GTC	2	6	46531	46536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334817
1075	NC_012523	CCA	2	6	46560	46565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334817
1076	NC_012523	GC	3	6	46571	46576	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
1077	NC_012523	GTC	2	6	46591	46596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334817
1078	NC_012523	CG	5	10	46636	46645	0 %	0 %	50 %	50 %	226334817
1079	NC_012523	TGG	2	6	46680	46685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334817
1080	NC_012523	CA	3	6	46690	46695	50 %	0 %	0 %	50 %	226334817
1081	NC_012523	AGTC	2	8	47316	47323	25 %	25 %	25 %	25 %	226334818
1082	NC_012523	GGC	2	6	47335	47340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334818
1083	NC_012523	CTT	2	6	47363	47368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334818
1084	NC_012523	TTC	2	6	47370	47375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334818
1085	NC_012523	TCG	2	6	47424	47429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334818
1086	NC_012523	TCG	2	6	47517	47522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334818
1087	NC_012523	GAC	2	6	47633	47638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334818
1088	NC_012523	GCA	2	6	47641	47646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334818
1089	NC_012523	TGC	2	6	47694	47699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334818
1090	NC_012523	GTG	2	6	47835	47840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334818
1091	NC_012523	TCC	2	6	47938	47943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334818
1092	NC_012523	GA	3	6	47952	47957	50 %	0 %	50 %	0 %	226334818
1093	NC_012523	CGAC	2	8	47961	47968	25 %	0 %	25 %	50 %	226334818
1094	NC_012523	CGAAG	2	10	48079	48088	40 %	0 %	40 %	20 %	226334818
1095	NC_012523	TCT	2	6	48144	48149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334818
1096	NC_012523	CGG	2	6	48193	48198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334818
1097	NC_012523	GAA	2	6	49013	49018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334819
1098	NC_012523	CGA	2	6	49032	49037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1099	NC_012523	TGGC	2	8	49068	49075	0 %	25 %	50 %	25 %	226334819
1100	NC_012523	CGC	2	6	49114	49119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1101	NC_012523	GAG	2	6	49124	49129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334819
1102	NC_012523	AGC	2	6	49158	49163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1103	NC_012523	GAC	2	6	49181	49186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1104	NC_012523	CGA	2	6	49240	49245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1105	NC_012523	CGC	2	6	49263	49268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1106	NC_012523	TCT	2	6	49293	49298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334819
1107	NC_012523	GTC	2	6	49325	49330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1108	NC_012523	CGT	2	6	49423	49428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1109	NC_012523	GCCC	2	8	49447	49454	0 %	0 %	25 %	75 %	226334819
1110	NC_012523	CCG	2	6	49474	49479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1111	NC_012523	CCGGC	2	10	49510	49519	0 %	0 %	40 %	60 %	226334819
1112	NC_012523	CCG	2	6	49570	49575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1113	NC_012523	CCG	2	6	49579	49584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1114	NC_012523	CAG	2	6	49610	49615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1115	NC_012523	GTC	3	9	49625	49633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1116	NC_012523	GCA	2	6	49816	49821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334819
1117	NC_012523	TGACGT	2	12	49876	49887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	226334819
1118	NC_012523	GAA	2	6	49937	49942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334819
1119	NC_012523	CGG	2	6	50045	50050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334819
1120	NC_012523	GCC	2	6	50075	50080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334819
1121	NC_012523	TCC	2	6	50136	50141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334819
1122	NC_012523	CTC	3	9	50201	50209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334819
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1124	NC_012523	CGG	3	9	50568	50576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334820
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1372	NC_012523	GCCA	2	8	60333	60340	25 %	0 %	25 %	50 %	226334822
1373	NC_012523	ACG	2	6	60346	60351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334822
1374	NC_012523	CGA	2	6	60370	60375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334822
1375	NC_012523	CGT	2	6	60382	60387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334822
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1379	NC_012523	CGG	2	6	60917	60922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334823
1380	NC_012523	TTG	2	6	60930	60935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226334823
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1386	NC_012523	GGC	2	6	61109	61114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334823
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1392	NC_012523	CGG	2	6	61309	61314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334823
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1463	NC_012523	CCGA	3	12	65619	65630	25 %	0 %	25 %	50 %	226334833
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1478	NC_012523	TGTCC	2	10	66425	66434	0 %	40 %	20 %	40 %	226334833
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1481	NC_012523	CCG	2	6	67053	67058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334834
1482	NC_012523	GTG	2	6	67090	67095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334834
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1484	NC_012523	GGCG	2	8	67117	67124	0 %	0 %	75 %	25 %	226334834
1485	NC_012523	GGT	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334834
1486	NC_012523	ATC	2	6	67201	67206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334834
1487	NC_012523	CGGGCT	2	12	67209	67220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	226334834
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1489	NC_012523	CGGCG	2	10	67336	67345	0 %	0 %	60 %	40 %	226334834
1490	NC_012523	GCC	2	6	67365	67370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334834
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1492	NC_012523	CGC	2	6	67815	67820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334835
1493	NC_012523	GTTC	2	8	67823	67830	0 %	50 %	25 %	25 %	226334835
1494	NC_012523	CGGG	2	8	67832	67839	0 %	0 %	75 %	25 %	226334835
1495	NC_012523	CGC	2	6	67883	67888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334835
1496	NC_012523	GGT	2	6	67897	67902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334835
1497	NC_012523	CCG	2	6	67917	67922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334835
1498	NC_012523	CGG	2	6	67926	67931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334835
1499	NC_012523	CGG	3	9	67947	67955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334835
1500	NC_012523	GC	3	6	67967	67972	0 %	0 %	50 %	50 %	226334835

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