MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pKNR

Total Repeats: 2291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012523	TCC	2	6	22266	22271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334794
502	NC_012523	GCAAT	2	10	22337	22346	40 %	20 %	20 %	20 %	226334794
503	NC_012523	CGG	2	6	22384	22389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334794
504	NC_012523	CGG	2	6	22408	22413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334794
505	NC_012523	CGA	2	6	22443	22448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
506	NC_012523	GC	3	6	22531	22536	0 %	0 %	50 %	50 %	226334794
507	NC_012523	CGG	2	6	22614	22619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334794
508	NC_012523	CTCA	2	8	22688	22695	25 %	25 %	0 %	50 %	226334794
509	NC_012523	GTG	2	6	22742	22747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334794
510	NC_012523	CGA	2	6	22774	22779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
511	NC_012523	CGC	2	6	22813	22818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
512	NC_012523	ACC	2	6	22820	22825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334794
513	NC_012523	AAG	2	6	22835	22840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334794
514	NC_012523	CGC	2	6	22891	22896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
515	NC_012523	CCG	3	9	22932	22940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
516	NC_012523	GTG	2	6	22952	22957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334794
517	NC_012523	CGC	2	6	22958	22963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
518	NC_012523	CGA	2	6	23014	23019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
519	NC_012523	ACG	2	6	23085	23090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
520	NC_012523	TGA	2	6	23112	23117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334794
521	NC_012523	CGA	2	6	23140	23145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
522	NC_012523	ATC	2	6	23243	23248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334794
523	NC_012523	GAC	3	9	23249	23257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
524	NC_012523	TCG	2	6	23271	23276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334794
525	NC_012523	GCC	3	9	23309	23317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
526	NC_012523	CGA	2	6	23350	23355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334794
527	NC_012523	GCT	2	6	23389	23394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334794
528	NC_012523	TCACCG	2	12	23397	23408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	226334794
529	NC_012523	TGG	2	6	23445	23450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334794
530	NC_012523	CGC	2	6	23483	23488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
531	NC_012523	CGC	2	6	23515	23520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334794
532	NC_012523	TGC	3	9	23538	23546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334794
533	NC_012523	AGA	2	6	23583	23588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334794
534	NC_012523	CGG	3	9	23668	23676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334795
535	NC_012523	CGA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
536	NC_012523	CGC	2	6	23714	23719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
537	NC_012523	GAGCA	2	10	23744	23753	40 %	0 %	40 %	20 %	226334795
538	NC_012523	CGG	3	9	23800	23808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334795
539	NC_012523	CGC	2	6	23812	23817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
540	NC_012523	TCGG	2	8	23819	23826	0 %	25 %	50 %	25 %	226334795
541	NC_012523	CGA	2	6	23847	23852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
542	NC_012523	GCT	2	6	23962	23967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
543	NC_012523	CCG	2	6	23977	23982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
544	NC_012523	TCA	2	6	23988	23993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334795
545	NC_012523	TCGT	2	8	24041	24048	0 %	50 %	25 %	25 %	226334795
546	NC_012523	TCG	2	6	24129	24134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
547	NC_012523	GTC	2	6	24158	24163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
548	NC_012523	GGT	2	6	24203	24208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334795
549	NC_012523	ATC	2	6	24221	24226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334795
550	NC_012523	GCC	2	6	24282	24287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
551	NC_012523	AGACCG	2	12	24288	24299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
552	NC_012523	GCG	2	6	24319	24324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334795
553	NC_012523	TCG	2	6	24357	24362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
554	NC_012523	CGA	2	6	24385	24390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
555	NC_012523	CGA	2	6	24406	24411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
556	NC_012523	GCT	2	6	24418	24423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
557	NC_012523	ATC	2	6	24443	24448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334795
558	NC_012523	CTC	2	6	24464	24469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334795
559	NC_012523	GC	3	6	24535	24540	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
560	NC_012523	ACC	2	6	24587	24592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334795
561	NC_012523	AAG	2	6	24656	24661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334795
562	NC_012523	CGGA	2	8	24693	24700	25 %	0 %	50 %	25 %	226334795
563	NC_012523	TTC	2	6	24758	24763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226334795
564	NC_012523	GATG	2	8	24772	24779	25 %	25 %	50 %	0 %	226334795
565	NC_012523	GAT	2	6	24871	24876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334795
566	NC_012523	CCG	3	9	24903	24911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
567	NC_012523	CCA	2	6	24918	24923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334795
568	NC_012523	CG	3	6	24929	24934	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
569	NC_012523	GC	3	6	24949	24954	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
570	NC_012523	ATC	2	6	24965	24970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334795
571	NC_012523	CACCGA	2	12	25021	25032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226334795
572	NC_012523	GTC	2	6	25054	25059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334795
573	NC_012523	CGC	2	6	25062	25067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
574	NC_012523	AGC	2	6	25080	25085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
575	NC_012523	GCCC	2	8	25099	25106	0 %	0 %	25 %	75 %	226334795
576	NC_012523	CCG	2	6	25112	25117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
577	NC_012523	GAC	2	6	25148	25153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334795
578	NC_012523	CG	3	6	25155	25160	0 %	0 %	50 %	50 %	226334795
579	NC_012523	ACACCG	2	12	25236	25247	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	226334795
580	NC_012523	GAG	2	6	25256	25261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226334795
581	NC_012523	CGC	2	6	25264	25269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334795
582	NC_012523	CGC	2	6	25282	25287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334796
583	NC_012523	CCG	3	9	25316	25324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334796
584	NC_012523	CTC	2	6	25339	25344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334796
585	NC_012523	TCC	2	6	25357	25362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334796
586	NC_012523	GGCG	2	8	25367	25374	0 %	0 %	75 %	25 %	226334796
587	NC_012523	TCG	2	6	25382	25387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334796
588	NC_012523	CGC	2	6	25462	25467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334796
589	NC_012523	GAT	2	6	25521	25526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334796
590	NC_012523	GTC	2	6	25536	25541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334796
591	NC_012523	CGGG	2	8	25560	25567	0 %	0 %	75 %	25 %	226334796
592	NC_012523	AAG	2	6	25590	25595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334797
593	NC_012523	CGC	3	9	25601	25609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
594	NC_012523	GCC	2	6	25614	25619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
595	NC_012523	TGC	2	6	25633	25638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334797
596	NC_012523	TGG	2	6	25639	25644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334797
597	NC_012523	TCG	3	9	25645	25653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226334797
598	NC_012523	CCCGGC	2	12	25676	25687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
599	NC_012523	CGG	2	6	25694	25699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334797
600	NC_012523	ACCG	2	8	25730	25737	25 %	0 %	25 %	50 %	226334797
601	NC_012523	CAC	3	9	25745	25753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334797
602	NC_012523	ATC	2	6	25893	25898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226334797
603	NC_012523	GGT	2	6	25922	25927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334797
604	NC_012523	CGA	2	6	25952	25957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
605	NC_012523	CCG	2	6	25990	25995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
606	NC_012523	ACC	2	6	26031	26036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334797
607	NC_012523	GC	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	226334797
608	NC_012523	GCC	2	6	26071	26076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
609	NC_012523	CCG	2	6	26095	26100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
610	NC_012523	CGCC	2	8	26231	26238	0 %	0 %	25 %	75 %	226334797
611	NC_012523	GTG	2	6	26361	26366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226334797
612	NC_012523	ACG	2	6	26389	26394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
613	NC_012523	ACA	2	6	26407	26412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334797
614	NC_012523	CAG	3	9	26430	26438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
615	NC_012523	CGA	2	6	26459	26464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
616	NC_012523	TGA	2	6	26467	26472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226334797
617	NC_012523	CGC	2	6	26549	26554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
618	NC_012523	CGC	2	6	26606	26611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226334797
619	NC_012523	CAC	2	6	26654	26659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334797
620	NC_012523	CGA	2	6	26660	26665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
621	NC_012523	TCC	2	6	26679	26684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226334797
622	NC_012523	GGC	2	6	26745	26750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334797
623	NC_012523	GCG	2	6	26836	26841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334797
624	NC_012523	CGG	3	9	26876	26884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226334797
625	NC_012523	CAA	2	6	26909	26914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226334797
626	NC_012523	ACG	2	6	27025	27030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334797
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742	NC_012523	CGA	2	6	31697	31702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226334802
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746	NC_012523	GCACC	2	10	31931	31940	20 %	0 %	20 %	60 %	226334802
747	NC_012523	GAA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226334802
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749	NC_012523	CG	3	6	32031	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	226334802
750	NC_012523	CCA	2	6	32116	32121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226334802
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752	NC_012523	C	6	6	32216	32221	0 %	0 %	0 %	100 %	226334802
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