MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pROB02

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012521	CG	3	6	1718	1723	0 %	0 %	50 %	50 %	226349833
2	NC_012521	TG	3	6	1891	1896	0 %	50 %	50 %	0 %	226349833
3	NC_012521	CG	4	8	1939	1946	0 %	0 %	50 %	50 %	226349833
4	NC_012521	GA	3	6	2769	2774	50 %	0 %	50 %	0 %	226349834
5	NC_012521	GA	3	6	3722	3727	50 %	0 %	50 %	0 %	226349835
6	NC_012521	CG	3	6	4273	4278	0 %	0 %	50 %	50 %	226349835
7	NC_012521	AC	3	6	4684	4689	50 %	0 %	0 %	50 %	226349835
8	NC_012521	TC	3	6	4829	4834	0 %	50 %	0 %	50 %	226349835
9	NC_012521	CG	3	6	10072	10077	0 %	0 %	50 %	50 %	226349838
10	NC_012521	GC	3	6	10510	10515	0 %	0 %	50 %	50 %	226349839
11	NC_012521	CG	3	6	10814	10819	0 %	0 %	50 %	50 %	226349839
12	NC_012521	GC	3	6	11613	11618	0 %	0 %	50 %	50 %	226349840
13	NC_012521	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	226349842
14	NC_012521	CG	3	6	13015	13020	0 %	0 %	50 %	50 %	226349842
15	NC_012521	GC	3	6	13209	13214	0 %	0 %	50 %	50 %	226349842
16	NC_012521	GT	3	6	14483	14488	0 %	50 %	50 %	0 %	226349843
17	NC_012521	GC	3	6	14617	14622	0 %	0 %	50 %	50 %	226349843
18	NC_012521	CG	3	6	16614	16619	0 %	0 %	50 %	50 %	226349843
19	NC_012521	CG	3	6	17360	17365	0 %	0 %	50 %	50 %	226349843
20	NC_012521	GC	3	6	17366	17371	0 %	0 %	50 %	50 %	226349843
21	NC_012521	CG	3	6	17858	17863	0 %	0 %	50 %	50 %	226349843
22	NC_012521	CG	3	6	18637	18642	0 %	0 %	50 %	50 %	226349844
23	NC_012521	GC	3	6	19303	19308	0 %	0 %	50 %	50 %	226349844
24	NC_012521	CG	3	6	19928	19933	0 %	0 %	50 %	50 %	226349845
25	NC_012521	GC	4	8	20026	20033	0 %	0 %	50 %	50 %	226349845
26	NC_012521	AC	3	6	20662	20667	50 %	0 %	0 %	50 %	226349845
27	NC_012521	CA	3	6	22810	22815	50 %	0 %	0 %	50 %	226349847
28	NC_012521	GC	3	6	24310	24315	0 %	0 %	50 %	50 %	226349849
29	NC_012521	GC	3	6	24331	24336	0 %	0 %	50 %	50 %	226349849
30	NC_012521	TG	4	8	24826	24833	0 %	50 %	50 %	0 %	226349850
31	NC_012521	CA	3	6	25322	25327	50 %	0 %	0 %	50 %	226349851
32	NC_012521	GC	3	6	26767	26772	0 %	0 %	50 %	50 %	226349853
33	NC_012521	GT	3	6	27824	27829	0 %	50 %	50 %	0 %	226349855
34	NC_012521	GC	3	6	29830	29835	0 %	0 %	50 %	50 %	226349857
35	NC_012521	CG	4	8	31483	31490	0 %	0 %	50 %	50 %	226349858
36	NC_012521	GC	3	6	32564	32569	0 %	0 %	50 %	50 %	226349860
37	NC_012521	CG	3	6	32884	32889	0 %	0 %	50 %	50 %	226349860
38	NC_012521	GC	3	6	33576	33581	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
39	NC_012521	GC	3	6	33832	33837	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
40	NC_012521	GC	4	8	34174	34181	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
41	NC_012521	GC	3	6	34194	34199	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
42	NC_012521	CG	3	6	34480	34485	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
43	NC_012521	GC	3	6	34732	34737	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
44	NC_012521	CG	3	6	34871	34876	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
45	NC_012521	CG	3	6	34934	34939	0 %	0 %	50 %	50 %	226349861
46	NC_012521	GC	3	6	36591	36596	0 %	0 %	50 %	50 %	226349862
47	NC_012521	CG	3	6	37061	37066	0 %	0 %	50 %	50 %	226349863
48	NC_012521	GC	3	6	37207	37212	0 %	0 %	50 %	50 %	226349863
49	NC_012521	CG	3	6	37583	37588	0 %	0 %	50 %	50 %	226349864
50	NC_012521	GC	3	6	38078	38083	0 %	0 %	50 %	50 %	226349864
51	NC_012521	CG	3	6	39923	39928	0 %	0 %	50 %	50 %	226349864
52	NC_012521	GC	3	6	40047	40052	0 %	0 %	50 %	50 %	226349864
53	NC_012521	CG	3	6	40277	40282	0 %	0 %	50 %	50 %	226349864
54	NC_012521	CA	3	6	41733	41738	50 %	0 %	0 %	50 %	226349865
55	NC_012521	CG	3	6	41935	41940	0 %	0 %	50 %	50 %	226349865
56	NC_012521	CG	3	6	42139	42144	0 %	0 %	50 %	50 %	226349865
57	NC_012521	GA	3	6	42568	42573	50 %	0 %	50 %	0 %	226349866
58	NC_012521	CG	3	6	42583	42588	0 %	0 %	50 %	50 %	226349866
59	NC_012521	GC	3	6	42712	42717	0 %	0 %	50 %	50 %	226349866
60	NC_012521	CG	3	6	42911	42916	0 %	0 %	50 %	50 %	226349866
61	NC_012521	GA	3	6	43369	43374	50 %	0 %	50 %	0 %	226349867
62	NC_012521	TG	3	6	44551	44556	0 %	50 %	50 %	0 %	226349867
63	NC_012521	GC	3	6	45392	45397	0 %	0 %	50 %	50 %	226349868
64	NC_012521	CG	3	6	45480	45485	0 %	0 %	50 %	50 %	226349868
65	NC_012521	TC	3	6	47238	47243	0 %	50 %	0 %	50 %	226349870
66	NC_012521	TG	3	6	47499	47504	0 %	50 %	50 %	0 %	226349871
67	NC_012521	GT	3	6	48501	48506	0 %	50 %	50 %	0 %	226349872
68	NC_012521	CG	3	6	49021	49026	0 %	0 %	50 %	50 %	226349873
69	NC_012521	GA	3	6	49095	49100	50 %	0 %	50 %	0 %	226349873
70	NC_012521	TG	3	6	49295	49300	0 %	50 %	50 %	0 %	226349874
71	NC_012521	CA	3	6	49975	49980	50 %	0 %	0 %	50 %	226349875
72	NC_012521	CG	3	6	49982	49987	0 %	0 %	50 %	50 %	226349875
73	NC_012521	TC	3	6	50990	50995	0 %	50 %	0 %	50 %	226349876
74	NC_012521	GC	3	6	51657	51662	0 %	0 %	50 %	50 %	226349876
75	NC_012521	TC	3	6	51777	51782	0 %	50 %	0 %	50 %	226349876
76	NC_012521	GC	3	6	51786	51791	0 %	0 %	50 %	50 %	226349876
77	NC_012521	CA	3	6	52075	52080	50 %	0 %	0 %	50 %	226349877
78	NC_012521	GT	3	6	52690	52695	0 %	50 %	50 %	0 %	226349877
79	NC_012521	AG	3	6	54104	54109	50 %	0 %	50 %	0 %	226349879
80	NC_012521	GC	3	6	54380	54385	0 %	0 %	50 %	50 %	226349879
81	NC_012521	CG	3	6	55020	55025	0 %	0 %	50 %	50 %	226349880
82	NC_012521	GC	3	6	55029	55034	0 %	0 %	50 %	50 %	226349880
83	NC_012521	GA	3	6	55740	55745	50 %	0 %	50 %	0 %	226349881
84	NC_012521	AC	3	6	56029	56034	50 %	0 %	0 %	50 %	226349882
85	NC_012521	CA	3	6	56544	56549	50 %	0 %	0 %	50 %	226349882
86	NC_012521	CA	3	6	57024	57029	50 %	0 %	0 %	50 %	226349883
87	NC_012521	GC	3	6	57300	57305	0 %	0 %	50 %	50 %	226349883
88	NC_012521	GT	3	6	57378	57383	0 %	50 %	50 %	0 %	226349883
89	NC_012521	CG	3	6	57752	57757	0 %	0 %	50 %	50 %	226349883
90	NC_012521	GC	4	8	57759	57766	0 %	0 %	50 %	50 %	226349883
91	NC_012521	CG	3	6	58087	58092	0 %	0 %	50 %	50 %	226349883
92	NC_012521	TG	3	6	58800	58805	0 %	50 %	50 %	0 %	226349884
93	NC_012521	CG	3	6	59518	59523	0 %	0 %	50 %	50 %	226349886
94	NC_012521	CG	3	6	59761	59766	0 %	0 %	50 %	50 %	226349886
95	NC_012521	CG	3	6	61152	61157	0 %	0 %	50 %	50 %	226349887
96	NC_012521	GC	3	6	61272	61277	0 %	0 %	50 %	50 %	226349887
97	NC_012521	CA	4	8	61334	61341	50 %	0 %	0 %	50 %	226349887
98	NC_012521	CG	3	6	63987	63992	0 %	0 %	50 %	50 %	226349888
99	NC_012521	CA	3	6	64028	64033	50 %	0 %	0 %	50 %	226349888
100	NC_012521	GC	4	8	64034	64041	0 %	0 %	50 %	50 %	226349888
101	NC_012521	GC	3	6	64398	64403	0 %	0 %	50 %	50 %	226349889
102	NC_012521	CG	3	6	64408	64413	0 %	0 %	50 %	50 %	226349889
103	NC_012521	GC	3	6	65562	65567	0 %	0 %	50 %	50 %	226349890
104	NC_012521	CG	3	6	65832	65837	0 %	0 %	50 %	50 %	226349890
105	NC_012521	GC	3	6	66358	66363	0 %	0 %	50 %	50 %	226349891
106	NC_012521	GC	3	6	66425	66430	0 %	0 %	50 %	50 %	226349891
107	NC_012521	CA	3	6	67379	67384	50 %	0 %	0 %	50 %	226349892
108	NC_012521	CA	3	6	67984	67989	50 %	0 %	0 %	50 %	226349893
109	NC_012521	CG	3	6	68994	68999	0 %	0 %	50 %	50 %	226349894
110	NC_012521	GC	3	6	69325	69330	0 %	0 %	50 %	50 %	226349894
111	NC_012521	TG	3	6	69413	69418	0 %	50 %	50 %	0 %	226349894
112	NC_012521	AC	3	6	70153	70158	50 %	0 %	0 %	50 %	226349896
113	NC_012521	GC	3	6	70564	70569	0 %	0 %	50 %	50 %	226349897
114	NC_012521	CG	3	6	71829	71834	0 %	0 %	50 %	50 %	226349899
115	NC_012521	GC	3	6	71933	71938	0 %	0 %	50 %	50 %	226349899
116	NC_012521	CA	3	6	72084	72089	50 %	0 %	0 %	50 %	226349899
117	NC_012521	GC	3	6	72537	72542	0 %	0 %	50 %	50 %	226349899
118	NC_012521	AC	3	6	72731	72736	50 %	0 %	0 %	50 %	226349899
119	NC_012521	CG	3	6	73085	73090	0 %	0 %	50 %	50 %	226349900
120	NC_012521	GC	3	6	73262	73267	0 %	0 %	50 %	50 %	226349900
121	NC_012521	TG	3	6	73967	73972	0 %	50 %	50 %	0 %	226349901
122	NC_012521	TC	3	6	74979	74984	0 %	50 %	0 %	50 %	226349901
123	NC_012521	AC	3	6	76093	76098	50 %	0 %	0 %	50 %	226349902
124	NC_012521	CG	3	6	76167	76172	0 %	0 %	50 %	50 %	226349902
125	NC_012521	CG	3	6	78567	78572	0 %	0 %	50 %	50 %	226349904
126	NC_012521	CT	3	6	78884	78889	0 %	50 %	0 %	50 %	226349904
127	NC_012521	GC	3	6	80594	80599	0 %	0 %	50 %	50 %	226349906
128	NC_012521	CG	3	6	81393	81398	0 %	0 %	50 %	50 %	226349906
129	NC_012521	GC	3	6	81680	81685	0 %	0 %	50 %	50 %	226349907
130	NC_012521	GC	3	6	82160	82165	0 %	0 %	50 %	50 %	226349907
131	NC_012521	AC	3	6	82602	82607	50 %	0 %	0 %	50 %	226349908
132	NC_012521	GT	3	6	83784	83789	0 %	50 %	50 %	0 %	226349909
133	NC_012521	GT	3	6	88876	88881	0 %	50 %	50 %	0 %	226349913
134	NC_012521	GC	3	6	89424	89429	0 %	0 %	50 %	50 %	226349913
135	NC_012521	GT	3	6	90180	90185	0 %	50 %	50 %	0 %	226349914
136	NC_012521	GT	3	6	90852	90857	0 %	50 %	50 %	0 %	226349914
137	NC_012521	CG	3	6	91347	91352	0 %	0 %	50 %	50 %	226349915
138	NC_012521	CG	3	6	91402	91407	0 %	0 %	50 %	50 %	226349915
139	NC_012521	AG	3	6	91737	91742	50 %	0 %	50 %	0 %	226349916
140	NC_012521	TG	3	6	91777	91782	0 %	50 %	50 %	0 %	226349916
141	NC_012521	CG	3	6	91939	91944	0 %	0 %	50 %	50 %	226349916
142	NC_012521	CG	3	6	92276	92281	0 %	0 %	50 %	50 %	226349918
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.