MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131A

Total Repeats: 3949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011962	CTCG	2	8	39576	39583	0 %	25 %	25 %	50 %	221218230
1002	NC_011962	CTGT	2	8	39615	39622	0 %	50 %	25 %	25 %	221218230
1003	NC_011962	CGG	2	6	39695	39700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1004	NC_011962	TGC	2	6	39752	39757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1005	NC_011962	CAA	2	6	39777	39782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221218230
1006	NC_011962	CCT	2	6	39822	39827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221218230
1007	NC_011962	TGC	2	6	39845	39850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1008	NC_011962	CGG	2	6	39860	39865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1009	NC_011962	CG	4	8	39929	39936	0 %	0 %	50 %	50 %	221218230
1010	NC_011962	GCG	2	6	39947	39952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1011	NC_011962	TCT	2	6	39968	39973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221218230
1012	NC_011962	TGC	3	9	39980	39988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1013	NC_011962	CTG	2	6	40021	40026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1014	NC_011962	GC	3	6	40037	40042	0 %	0 %	50 %	50 %	221218230
1015	NC_011962	CTT	2	6	40047	40052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221218230
1016	NC_011962	GCT	2	6	40065	40070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1017	NC_011962	CAG	2	6	40111	40116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1018	NC_011962	CGT	2	6	40158	40163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1019	NC_011962	TCA	2	6	40172	40177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218230
1020	NC_011962	GTG	2	6	40186	40191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218230
1021	NC_011962	GTC	2	6	40202	40207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1022	NC_011962	GCG	2	6	40232	40237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1023	NC_011962	GCC	2	6	40261	40266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218230
1024	NC_011962	GCCC	2	8	40288	40295	0 %	0 %	25 %	75 %	221218230
1025	NC_011962	CCG	3	9	40296	40304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218230
1026	NC_011962	GCT	2	6	40344	40349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1027	NC_011962	ATC	2	6	40414	40419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218230
1028	NC_011962	TCG	2	6	40442	40447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1029	NC_011962	TCA	3	9	40448	40456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218230
1030	NC_011962	GCGAG	2	10	40466	40475	20 %	0 %	60 %	20 %	221218230
1031	NC_011962	CGC	2	6	40490	40495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218230
1032	NC_011962	TTC	2	6	40525	40530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221218230
1033	NC_011962	CGG	2	6	40586	40591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1034	NC_011962	CGG	2	6	40616	40621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1035	NC_011962	TGC	2	6	40667	40672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1036	NC_011962	GAT	2	6	40686	40691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221218230
1037	NC_011962	GCC	2	6	40695	40700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218230
1038	NC_011962	CGT	2	6	40701	40706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1039	NC_011962	GGC	2	6	40770	40775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1040	NC_011962	CGG	2	6	40788	40793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1041	NC_011962	TCG	2	6	40814	40819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1042	NC_011962	TTC	2	6	40945	40950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221218230
1043	NC_011962	CGA	2	6	40968	40973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1044	NC_011962	TGC	2	6	41090	41095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218230
1045	NC_011962	TGG	2	6	41096	41101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218230
1046	NC_011962	CGG	2	6	41103	41108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218230
1047	NC_011962	ATC	2	6	41110	41115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218230
1048	NC_011962	GC	3	6	41119	41124	0 %	0 %	50 %	50 %	221218230
1049	NC_011962	GTCGCG	2	12	41133	41144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	221218230
1050	NC_011962	GCT	2	6	41246	41251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218231
1051	NC_011962	GCCGG	2	10	41253	41262	0 %	0 %	60 %	40 %	221218231
1052	NC_011962	TCA	2	6	41284	41289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218231
1053	NC_011962	CGG	3	9	41300	41308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218231
1054	NC_011962	TGCGC	2	10	41318	41327	0 %	20 %	40 %	40 %	221218231
1055	NC_011962	GGT	2	6	41369	41374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218231
1056	NC_011962	CTC	2	6	41475	41480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221218231
1057	NC_011962	CTG	2	6	41486	41491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218231
1058	NC_011962	ATG	2	6	41514	41519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221218231
1059	NC_011962	GGA	2	6	41522	41527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221218231
1060	NC_011962	AGA	2	6	41533	41538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221218231
1061	NC_011962	ACA	2	6	41614	41619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221218231
1062	NC_011962	GCG	2	6	41632	41637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218231
1063	NC_011962	GC	4	8	41786	41793	0 %	0 %	50 %	50 %	221218231
1064	NC_011962	AAG	2	6	41796	41801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221218231
1065	NC_011962	TGG	2	6	41832	41837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218231
1066	NC_011962	GCC	2	6	41852	41857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218231
1067	NC_011962	GCT	2	6	41861	41866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218231
1068	NC_011962	CTT	2	6	41978	41983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221218231
1069	NC_011962	GC	3	6	41998	42003	0 %	0 %	50 %	50 %	221218231
1070	NC_011962	GCT	2	6	42026	42031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218231
1071	NC_011962	GGC	2	6	42037	42042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218231
1072	NC_011962	GC	3	6	42053	42058	0 %	0 %	50 %	50 %	221218231
1073	NC_011962	CTC	2	6	42095	42100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221218231
1074	NC_011962	GGT	2	6	42101	42106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218231
1075	NC_011962	GGC	2	6	42113	42118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218231
1076	NC_011962	CAA	2	6	42146	42151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221218231
1077	NC_011962	CG	4	8	42166	42173	0 %	0 %	50 %	50 %	221218231
1078	NC_011962	GGC	2	6	42213	42218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218231
1079	NC_011962	CTG	2	6	42261	42266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218231
1080	NC_011962	TCA	2	6	42396	42401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221218232
1081	NC_011962	CG	3	6	42444	42449	0 %	0 %	50 %	50 %	221218232
1082	NC_011962	CGC	2	6	42463	42468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218232
1083	NC_011962	CTG	2	6	42503	42508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218232
1084	NC_011962	GCC	2	6	42544	42549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218232
1085	NC_011962	GCA	2	6	42591	42596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218232
1086	NC_011962	CCG	2	6	42604	42609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218232
1087	NC_011962	GATCT	2	10	42614	42623	20 %	40 %	20 %	20 %	221218232
1088	NC_011962	CG	3	6	42628	42633	0 %	0 %	50 %	50 %	221218232
1089	NC_011962	CGA	2	6	42691	42696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218232
1090	NC_011962	GC	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	221218232
1091	NC_011962	CG	4	8	42765	42772	0 %	0 %	50 %	50 %	221218232
1092	NC_011962	CGA	2	6	42820	42825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218232
1093	NC_011962	GAG	2	6	42887	42892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221218232
1094	NC_011962	TGC	2	6	42939	42944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218232
1095	NC_011962	CGC	2	6	42967	42972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218232
1096	NC_011962	CTGCGC	2	12	42973	42984	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	221218232
1097	NC_011962	GCAA	2	8	43053	43060	50 %	0 %	25 %	25 %	221218232
1098	NC_011962	GGC	2	6	43090	43095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218232
1099	NC_011962	CCT	2	6	43339	43344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221218233
1100	NC_011962	GCG	2	6	43356	43361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218233
1101	NC_011962	GTG	2	6	43380	43385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218233
1102	NC_011962	TCG	3	9	43396	43404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218233
1103	NC_011962	GGCCG	2	10	43421	43430	0 %	0 %	60 %	40 %	221218233
1104	NC_011962	CGT	2	6	43448	43453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218233
1105	NC_011962	GCG	2	6	43456	43461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218233
1106	NC_011962	GTG	2	6	43476	43481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218233
1107	NC_011962	CGT	2	6	43592	43597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218233
1108	NC_011962	CGGC	2	8	43652	43659	0 %	0 %	50 %	50 %	221218233
1109	NC_011962	ATG	2	6	44199	44204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221218234
1110	NC_011962	CAG	2	6	44247	44252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218234
1111	NC_011962	CGGG	2	8	44339	44346	0 %	0 %	75 %	25 %	221218234
1112	NC_011962	GGC	2	6	44438	44443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218234
1113	NC_011962	GCT	2	6	44450	44455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218234
1114	NC_011962	CGG	2	6	44495	44500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218234
1115	NC_011962	CCCTCG	2	12	44506	44517	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	221218234
1116	NC_011962	AAC	2	6	44562	44567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221218234
1117	NC_011962	GCC	2	6	44574	44579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218234
1118	NC_011962	GGC	2	6	44622	44627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218234
1119	NC_011962	GAT	2	6	44651	44656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221218234
1120	NC_011962	GCC	2	6	44768	44773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218234
1121	NC_011962	CCT	2	6	44774	44779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221218234
1122	NC_011962	ACGC	2	8	44794	44801	25 %	0 %	25 %	50 %	221218234
1123	NC_011962	TGG	2	6	44812	44817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218234
1124	NC_011962	GC	3	6	44852	44857	0 %	0 %	50 %	50 %	221218234
1125	NC_011962	C	6	6	44860	44865	0 %	0 %	0 %	100 %	221218234
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1127	NC_011962	CGC	2	6	44912	44917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218234
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1133	NC_011962	CGCAG	2	10	45232	45241	20 %	0 %	40 %	40 %	221218235
1134	NC_011962	AAC	2	6	45290	45295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221218235
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1136	NC_011962	CGAG	2	8	45426	45433	25 %	0 %	50 %	25 %	221218235
1137	NC_011962	CG	3	6	45459	45464	0 %	0 %	50 %	50 %	221218235
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1153	NC_011962	TGA	2	6	46011	46016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221218235
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1240	NC_011962	GCG	2	6	48921	48926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218238
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1250	NC_011962	CGA	2	6	49453	49458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218239
1251	NC_011962	GGT	2	6	49540	49545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218239
1252	NC_011962	TCTCG	2	10	49615	49624	0 %	40 %	20 %	40 %	221218239
1253	NC_011962	GCT	2	6	49647	49652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218239
1254	NC_011962	CGG	2	6	49720	49725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218239
1255	NC_011962	GGC	2	6	49795	49800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218239
1256	NC_011962	GCT	2	6	49818	49823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218239
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1259	NC_011962	GCC	2	6	50030	50035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218239
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1262	NC_011962	CGG	2	6	50134	50139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218239
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1271	NC_011962	TCG	2	6	50504	50509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218240
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1280	NC_011962	GCC	2	6	50800	50805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218240
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1282	NC_011962	CGG	2	6	50875	50880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218240
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1285	NC_011962	GCG	2	6	50914	50919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218240
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1319	NC_011962	CTG	2	6	52191	52196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218241
1320	NC_011962	GCGG	3	12	52332	52343	0 %	0 %	75 %	25 %	221218241
1321	NC_011962	CGC	2	6	52395	52400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218241
1322	NC_011962	GCTTCG	2	12	52420	52431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221218241
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1357	NC_011962	CGA	2	6	53608	53613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218242
1358	NC_011962	GCC	2	6	53625	53630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221218242
1359	NC_011962	TCGCC	2	10	53655	53664	0 %	20 %	20 %	60 %	221218242
1360	NC_011962	GTGG	2	8	53665	53672	0 %	25 %	75 %	0 %	221218242
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1362	NC_011962	GC	3	6	53736	53741	0 %	0 %	50 %	50 %	221218242
1363	NC_011962	CG	3	6	53759	53764	0 %	0 %	50 %	50 %	221218242
1364	NC_011962	CAC	2	6	53812	53817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221218242
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1368	NC_011962	GGGC	2	8	54053	54060	0 %	0 %	75 %	25 %	221218243
1369	NC_011962	TGG	2	6	54069	54074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218243
1370	NC_011962	CGA	2	6	54086	54091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221218243
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1372	NC_011962	GC	3	6	54150	54155	0 %	0 %	50 %	50 %	221218243
1373	NC_011962	GTG	2	6	54156	54161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221218243
1374	NC_011962	GCG	2	6	54209	54214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218243
1375	NC_011962	CGG	2	6	54274	54279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221218243
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1495	NC_011962	C	6	6	58663	58668	0 %	0 %	0 %	100 %	221218246
1496	NC_011962	GA	3	6	58682	58687	50 %	0 %	50 %	0 %	221218246
1497	NC_011962	CGGCG	2	10	58693	58702	0 %	0 %	60 %	40 %	221218246
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