MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 5523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011371	GCC	2	6	50	55	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
2	NC_011371	TCG	2	6	90	95	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
3	NC_011371	GCG	2	6	100	105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552196
4	NC_011371	CGA	2	6	115	120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
5	NC_011371	CGGCT	2	10	147	156	0 %	20 %	40 %	40 %	209552196
6	NC_011371	TCGC	2	8	180	187	0 %	25 %	25 %	50 %	209552196
7	NC_011371	GGA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552196
8	NC_011371	CTT	2	6	287	292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552196
9	NC_011371	GTC	2	6	293	298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
10	NC_011371	CATC	2	8	418	425	25 %	25 %	0 %	50 %	209552196
11	NC_011371	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
12	NC_011371	ATA	2	6	557	562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552196
13	NC_011371	CAGC	2	8	637	644	25 %	0 %	25 %	50 %	209552196
14	NC_011371	ATC	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552196
15	NC_011371	TCG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552196
16	NC_011371	CGAC	2	8	736	743	25 %	0 %	25 %	50 %	209552196
17	NC_011371	GCC	2	6	782	787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
18	NC_011371	ATC	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552196
19	NC_011371	AGC	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
20	NC_011371	TTC	2	6	1031	1036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552196
21	NC_011371	AGC	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
22	NC_011371	CGA	2	6	1153	1158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552196
23	NC_011371	GGGC	2	8	1160	1167	0 %	0 %	75 %	25 %	209552196
24	NC_011371	CGCCTG	2	12	1202	1213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209552196
25	NC_011371	GAT	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552196
26	NC_011371	GCC	2	6	1241	1246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552196
27	NC_011371	CT	3	6	1266	1271	0 %	50 %	0 %	50 %	209552196
28	NC_011371	CGC	2	6	1350	1355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
29	NC_011371	GCG	2	6	1393	1398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
30	NC_011371	GCG	2	6	1415	1420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
31	NC_011371	TCA	2	6	1440	1445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
32	NC_011371	GC	3	6	1536	1541	0 %	0 %	50 %	50 %	209552197
33	NC_011371	AGG	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552197
34	NC_011371	ACG	2	6	1565	1570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
35	NC_011371	GAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552197
36	NC_011371	CCG	2	6	1649	1654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
37	NC_011371	GAT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
38	NC_011371	CAG	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
39	NC_011371	GAT	3	9	1807	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
40	NC_011371	GAA	2	6	1843	1848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552197
41	NC_011371	GGCC	2	8	1849	1856	0 %	0 %	50 %	50 %	209552197
42	NC_011371	TGG	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552197
43	NC_011371	ATA	2	6	1954	1959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552197
44	NC_011371	GCA	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552197
45	NC_011371	CGC	2	6	2055	2060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
46	NC_011371	AGCC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	209552197
47	NC_011371	ATC	2	6	2126	2131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
48	NC_011371	ATG	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
49	NC_011371	GCG	2	6	2217	2222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552197
50	NC_011371	GCC	2	6	2240	2245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552197
51	NC_011371	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552197
52	NC_011371	CAT	2	6	2281	2286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552197
53	NC_011371	GAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552198
54	NC_011371	ACAGCG	2	12	2333	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
55	NC_011371	TGG	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552198
56	NC_011371	GGC	2	6	2430	2435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
57	NC_011371	GAC	2	6	2439	2444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
58	NC_011371	ACA	2	6	2476	2481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552198
59	NC_011371	GTC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552198
60	NC_011371	CAGG	2	8	2580	2587	25 %	0 %	50 %	25 %	209552198
61	NC_011371	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
62	NC_011371	GAC	3	9	2700	2708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
63	NC_011371	AGCC	2	8	2709	2716	25 %	0 %	25 %	50 %	209552198
64	NC_011371	CGATCG	2	12	2717	2728	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209552198
65	NC_011371	GCA	2	6	2768	2773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
66	NC_011371	CAG	3	9	2877	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
67	NC_011371	GAC	2	6	2892	2897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
68	NC_011371	GAATGA	2	12	2933	2944	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209552198
69	NC_011371	CAG	4	12	2970	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
70	NC_011371	AGC	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
71	NC_011371	GCC	2	6	3028	3033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552198
72	NC_011371	CGG	3	9	3104	3112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
73	NC_011371	GCG	2	6	3131	3136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552198
74	NC_011371	GC	3	6	3218	3223	0 %	0 %	50 %	50 %	209552198
75	NC_011371	CGCCAG	2	12	3246	3257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209552198
76	NC_011371	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552198
77	NC_011371	CAT	2	6	3358	3363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552199
78	NC_011371	CGT	2	6	3387	3392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
79	NC_011371	GGC	2	6	3414	3419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
80	NC_011371	CGA	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
81	NC_011371	TCG	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
82	NC_011371	CAG	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
83	NC_011371	CGG	2	6	3489	3494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
84	NC_011371	CGG	2	6	3503	3508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
85	NC_011371	GC	3	6	3520	3525	0 %	0 %	50 %	50 %	209552199
86	NC_011371	GCC	2	6	3533	3538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
87	NC_011371	TCG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
88	NC_011371	GCC	2	6	3591	3596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
89	NC_011371	GCC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
90	NC_011371	CCG	3	9	3668	3676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
91	NC_011371	TCG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
92	NC_011371	CGA	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
93	NC_011371	CGC	3	9	3912	3920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
94	NC_011371	GA	3	6	3938	3943	50 %	0 %	50 %	0 %	209552199
95	NC_011371	CGC	2	6	3955	3960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
96	NC_011371	GAT	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552199
97	NC_011371	CGAT	2	8	4034	4041	25 %	25 %	25 %	25 %	209552199
98	NC_011371	CGG	2	6	4124	4129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552199
99	NC_011371	GCC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
100	NC_011371	GCA	2	6	4203	4208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
101	NC_011371	CGA	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552199
102	NC_011371	GCC	2	6	4226	4231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
103	NC_011371	TCG	2	6	4238	4243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
104	NC_011371	TCG	2	6	4346	4351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
105	NC_011371	TGC	2	6	4403	4408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552199
106	NC_011371	CCGA	2	8	4412	4419	25 %	0 %	25 %	50 %	209552199
107	NC_011371	CTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552199
108	NC_011371	CGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
109	NC_011371	CGC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552199
110	NC_011371	CCGG	2	8	4663	4670	0 %	0 %	50 %	50 %	209552199
111	NC_011371	TCA	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552199
112	NC_011371	ACC	2	6	4745	4750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552199
113	NC_011371	CATGC	2	10	4965	4974	20 %	20 %	20 %	40 %	209552200
114	NC_011371	AGGC	2	8	5026	5033	25 %	0 %	50 %	25 %	209552200
115	NC_011371	GCG	2	6	5036	5041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
116	NC_011371	CGGA	2	8	5087	5094	25 %	0 %	50 %	25 %	209552200
117	NC_011371	TGG	2	6	5216	5221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552200
118	NC_011371	CG	3	6	5237	5242	0 %	0 %	50 %	50 %	209552200
119	NC_011371	TGACG	2	10	5349	5358	20 %	20 %	40 %	20 %	209552200
120	NC_011371	GC	4	8	5416	5423	0 %	0 %	50 %	50 %	209552200
121	NC_011371	GTCG	2	8	5454	5461	0 %	25 %	50 %	25 %	209552200
122	NC_011371	CG	3	6	5578	5583	0 %	0 %	50 %	50 %	209552200
123	NC_011371	CCG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
124	NC_011371	GCA	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552200
125	NC_011371	GGC	2	6	5703	5708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552200
126	NC_011371	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
127	NC_011371	CGA	2	6	5753	5758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552200
128	NC_011371	GCC	2	6	5776	5781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
129	NC_011371	CCG	2	6	5785	5790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
130	NC_011371	GCC	2	6	5796	5801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
131	NC_011371	TCG	2	6	5885	5890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552200
132	NC_011371	ACAG	2	8	5900	5907	50 %	0 %	25 %	25 %	209552200
133	NC_011371	CGC	2	6	5951	5956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552200
134	NC_011371	TC	3	6	5961	5966	0 %	50 %	0 %	50 %	209552200
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243	NC_011371	CTC	2	6	11353	11358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552207
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247	NC_011371	GCC	3	9	11438	11446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552207
248	NC_011371	ATGCCG	2	12	11483	11494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209552207
249	NC_011371	GAT	2	6	11497	11502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552207
250	NC_011371	AGCG	2	8	11829	11836	25 %	0 %	50 %	25 %	209552208
251	NC_011371	CG	3	6	11843	11848	0 %	0 %	50 %	50 %	209552208
252	NC_011371	CAGG	2	8	11879	11886	25 %	0 %	50 %	25 %	209552208
253	NC_011371	GTCG	2	8	11912	11919	0 %	25 %	50 %	25 %	209552208
254	NC_011371	CCG	2	6	11922	11927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552208
255	NC_011371	TCG	2	6	11953	11958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552208
256	NC_011371	TCG	2	6	11967	11972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552208
257	NC_011371	CGC	2	6	11983	11988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552208
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259	NC_011371	CGG	2	6	12050	12055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552208
260	NC_011371	CAT	2	6	12083	12088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552208
261	NC_011371	CGG	2	6	12089	12094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552208
262	NC_011371	GCC	2	6	12095	12100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552208
263	NC_011371	GCG	2	6	12136	12141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552208
264	NC_011371	GCT	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552208
265	NC_011371	CAA	2	6	12248	12253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552208
266	NC_011371	TGC	2	6	12280	12285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552208
267	NC_011371	GCC	2	6	12306	12311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552208
268	NC_011371	GAT	2	6	12447	12452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552208
269	NC_011371	CGG	2	6	12454	12459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552208
270	NC_011371	CGA	2	6	12503	12508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552208
271	NC_011371	CGG	2	6	12569	12574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552208
272	NC_011371	GTGATG	2	12	12576	12587	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	209552208
273	NC_011371	TGA	2	6	12697	12702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552209
274	NC_011371	GAT	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552209
275	NC_011371	CAT	2	6	12731	12736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552209
276	NC_011371	GCG	2	6	12931	12936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552209
277	NC_011371	ATCGAA	2	12	12998	13009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	209552210
278	NC_011371	AGG	2	6	13086	13091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552210
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280	NC_011371	GGC	2	6	13473	13478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552211
281	NC_011371	CTG	2	6	13611	13616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552211
282	NC_011371	GGCGAT	2	12	13665	13676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209552211
283	NC_011371	GCG	2	6	13741	13746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552211
284	NC_011371	CCT	2	6	13811	13816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552211
285	NC_011371	GCCG	2	8	13826	13833	0 %	0 %	50 %	50 %	209552211
286	NC_011371	GTT	2	6	13856	13861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552211
287	NC_011371	CGG	3	9	13889	13897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552211
288	NC_011371	CGA	2	6	13924	13929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552211
289	NC_011371	CGC	2	6	13992	13997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552211
290	NC_011371	GGC	2	6	14067	14072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552211
291	NC_011371	GCC	2	6	14161	14166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552211
292	NC_011371	ACG	2	6	14236	14241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552211
293	NC_011371	GCC	2	6	14280	14285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552211
294	NC_011371	TTC	2	6	14378	14383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552212
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296	NC_011371	CGT	2	6	14490	14495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552212
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298	NC_011371	ACAT	2	8	14519	14526	50 %	25 %	0 %	25 %	209552212
299	NC_011371	CTT	2	6	14536	14541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552212
300	NC_011371	GC	3	6	14557	14562	0 %	0 %	50 %	50 %	209552212
301	NC_011371	GTT	3	9	14611	14619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552212
302	NC_011371	GGT	2	6	14641	14646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552212
303	NC_011371	AGT	2	6	14679	14684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552212
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373	NC_011371	AGC	2	6	17400	17405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552213
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378	NC_011371	GCCG	2	8	17554	17561	0 %	0 %	50 %	50 %	209552213
379	NC_011371	CGGA	2	8	17592	17599	25 %	0 %	50 %	25 %	209552213
380	NC_011371	TCAT	2	8	17614	17621	25 %	50 %	0 %	25 %	209552213
381	NC_011371	CAG	2	6	17629	17634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552214
382	NC_011371	CCA	2	6	17710	17715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552214
383	NC_011371	GGT	2	6	17719	17724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552214
384	NC_011371	CGG	2	6	17770	17775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552214
385	NC_011371	GCCGAG	2	12	17782	17793	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209552214
386	NC_011371	GCA	2	6	17874	17879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552214
387	NC_011371	ATG	2	6	17891	17896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552214
388	NC_011371	CGG	2	6	17922	17927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552214
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391	NC_011371	GAT	2	6	18049	18054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552214
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500	NC_011371	TGG	2	6	23625	23630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552220

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