MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG204

Total Repeats: 5523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011371	ACG	2	6	23646	23651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
502	NC_011371	GTC	2	6	23774	23779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
503	NC_011371	CGA	2	6	23782	23787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
504	NC_011371	GCC	2	6	23894	23899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
505	NC_011371	GTC	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
506	NC_011371	AAT	2	6	23959	23964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552220
507	NC_011371	GCC	2	6	23966	23971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
508	NC_011371	TCA	2	6	24004	24009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552220
509	NC_011371	GATA	2	8	24031	24038	50 %	25 %	25 %	0 %	209552220
510	NC_011371	AAGG	2	8	24110	24117	50 %	0 %	50 %	0 %	209552220
511	NC_011371	GC	3	6	24140	24145	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
512	NC_011371	CGT	2	6	24151	24156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
513	NC_011371	CCG	2	6	24159	24164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
514	NC_011371	AAG	2	6	24206	24211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552220
515	NC_011371	TCG	2	6	24319	24324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
516	NC_011371	CG	3	6	24323	24328	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
517	NC_011371	GGC	2	6	24359	24364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
518	NC_011371	TTC	2	6	24482	24487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552220
519	NC_011371	GTT	2	6	24499	24504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552220
520	NC_011371	CGA	2	6	24580	24585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
521	NC_011371	CCG	3	9	24610	24618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
522	NC_011371	GCC	2	6	24771	24776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
523	NC_011371	GGC	2	6	24839	24844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
524	NC_011371	CCT	2	6	24859	24864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552220
525	NC_011371	GCCGC	2	10	24928	24937	0 %	0 %	40 %	60 %	209552220
526	NC_011371	CGG	2	6	24952	24957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
527	NC_011371	CGC	2	6	25069	25074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
528	NC_011371	GGC	2	6	25118	25123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
529	NC_011371	CAT	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552220
530	NC_011371	GCA	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
531	NC_011371	CAT	2	6	25237	25242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552220
532	NC_011371	GC	4	8	25248	25255	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
533	NC_011371	GCT	2	6	25287	25292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
534	NC_011371	GCCG	2	8	25354	25361	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
535	NC_011371	GTC	2	6	25373	25378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
536	NC_011371	CTC	2	6	25391	25396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552220
537	NC_011371	GCA	2	6	25413	25418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
538	NC_011371	GGC	2	6	25445	25450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
539	NC_011371	CCG	2	6	25497	25502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
540	NC_011371	CAG	2	6	25594	25599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
541	NC_011371	TTC	2	6	25736	25741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552220
542	NC_011371	CCG	2	6	25786	25791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
543	NC_011371	CGG	2	6	25903	25908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
544	NC_011371	CGT	2	6	25932	25937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
545	NC_011371	GAT	2	6	25952	25957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552220
546	NC_011371	GCA	3	9	25975	25983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
547	NC_011371	GCCAGC	2	12	26055	26066	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209552220
548	NC_011371	GC	3	6	26102	26107	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
549	NC_011371	GCG	2	6	26136	26141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
550	NC_011371	GTC	2	6	26156	26161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
551	NC_011371	GATCGC	2	12	26162	26173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209552220
552	NC_011371	GCA	2	6	26260	26265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
553	NC_011371	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
554	NC_011371	GCC	2	6	26326	26331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
555	NC_011371	GC	3	6	26366	26371	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
556	NC_011371	CG	3	6	26409	26414	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
557	NC_011371	GT	3	6	26479	26484	0 %	50 %	50 %	0 %	209552220
558	NC_011371	CGAG	2	8	26515	26522	25 %	0 %	50 %	25 %	209552220
559	NC_011371	CGA	2	6	26549	26554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552220
560	NC_011371	CTT	2	6	26558	26563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552220
561	NC_011371	TCG	2	6	26580	26585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
562	NC_011371	GAT	2	6	26669	26674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552220
563	NC_011371	GCC	2	6	26681	26686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
564	NC_011371	GTC	2	6	26702	26707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
565	NC_011371	GCC	2	6	26744	26749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552220
566	NC_011371	TCG	2	6	26793	26798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
567	NC_011371	CG	3	6	26862	26867	0 %	0 %	50 %	50 %	209552220
568	NC_011371	TGC	2	6	26908	26913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552220
569	NC_011371	GGC	2	6	26945	26950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
570	NC_011371	GGT	2	6	26954	26959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552220
571	NC_011371	ATCG	2	8	27029	27036	25 %	25 %	25 %	25 %	209552220
572	NC_011371	GGC	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552220
573	NC_011371	GCG	2	6	27122	27127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
574	NC_011371	TCA	2	6	27182	27187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552221
575	NC_011371	GGC	2	6	27212	27217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
576	NC_011371	TCG	2	6	27254	27259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552221
577	NC_011371	CAGC	2	8	27300	27307	25 %	0 %	25 %	50 %	209552221
578	NC_011371	ACG	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552221
579	NC_011371	CGG	3	9	27321	27329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
580	NC_011371	CGC	2	6	27402	27407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552221
581	NC_011371	GCT	2	6	27408	27413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552221
582	NC_011371	GCG	2	6	27462	27467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
583	NC_011371	GC	3	6	27487	27492	0 %	0 %	50 %	50 %	209552221
584	NC_011371	GCG	2	6	27501	27506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
585	NC_011371	ATC	2	6	27568	27573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552221
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587	NC_011371	GTC	2	6	27649	27654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552221
588	NC_011371	ATG	2	6	27725	27730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552221
589	NC_011371	TGA	2	6	27761	27766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552221
590	NC_011371	AGT	2	6	27783	27788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552221
591	NC_011371	CGG	2	6	27843	27848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
592	NC_011371	ATG	2	6	27869	27874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552221
593	NC_011371	CGCC	2	8	27888	27895	0 %	0 %	25 %	75 %	209552221
594	NC_011371	CGG	2	6	27898	27903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
595	NC_011371	TGG	2	6	27984	27989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552221
596	NC_011371	GCC	2	6	28009	28014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552221
597	NC_011371	CATCG	2	10	28063	28072	20 %	20 %	20 %	40 %	209552221
598	NC_011371	GAC	2	6	28093	28098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552221
599	NC_011371	CCCG	2	8	28103	28110	0 %	0 %	25 %	75 %	209552221
600	NC_011371	CGA	2	6	28227	28232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552221
601	NC_011371	TCAC	2	8	28259	28266	25 %	25 %	0 %	50 %	209552221
602	NC_011371	CGG	2	6	28329	28334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552221
603	NC_011371	GAGC	2	8	28700	28707	25 %	0 %	50 %	25 %	209552222
604	NC_011371	GCCG	2	8	28746	28753	0 %	0 %	50 %	50 %	209552222
605	NC_011371	CGG	2	6	28768	28773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552222
606	NC_011371	GAGC	2	8	28790	28797	25 %	0 %	50 %	25 %	209552222
607	NC_011371	GCT	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552222
608	NC_011371	GC	3	6	28826	28831	0 %	0 %	50 %	50 %	209552222
609	NC_011371	TGG	2	6	28832	28837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552222
610	NC_011371	CGGC	2	8	28865	28872	0 %	0 %	50 %	50 %	209552222
611	NC_011371	GACC	2	8	28948	28955	25 %	0 %	25 %	50 %	209552222
612	NC_011371	CG	3	6	28999	29004	0 %	0 %	50 %	50 %	209552222
613	NC_011371	CGT	2	6	29013	29018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552222
614	NC_011371	AGC	2	6	29053	29058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552222
615	NC_011371	TCA	2	6	29069	29074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552222
616	NC_011371	GCG	2	6	29084	29089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552222
617	NC_011371	TCG	2	6	29176	29181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552222
618	NC_011371	ATG	2	6	29182	29187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552222
619	NC_011371	GAA	2	6	29327	29332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552222
620	NC_011371	CGGG	2	8	29366	29373	0 %	0 %	75 %	25 %	209552222
621	NC_011371	CCAG	2	8	29413	29420	25 %	0 %	25 %	50 %	209552222
622	NC_011371	CGA	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552222
623	NC_011371	CCTG	2	8	29522	29529	0 %	25 %	25 %	50 %	209552222
624	NC_011371	AGC	2	6	29644	29649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552222
625	NC_011371	AG	3	6	29705	29710	50 %	0 %	50 %	0 %	209552222
626	NC_011371	CG	3	6	29719	29724	0 %	0 %	50 %	50 %	209552222
627	NC_011371	TGGC	2	8	29728	29735	0 %	25 %	50 %	25 %	209552222
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754	NC_011371	CGGC	2	8	35255	35262	0 %	0 %	50 %	50 %	209552228
755	NC_011371	GTC	2	6	35272	35277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552228
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758	NC_011371	GTC	2	6	35310	35315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552228
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1000	NC_011371	CGC	2	6	47559	47564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552240

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