MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG203

Total Repeats: 5256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011370	CGGTG	2	10	259747	259756	0 %	20 %	60 %	20 %	209552154
4502	NC_011370	CTT	3	9	259795	259803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552154
4503	NC_011370	ATG	2	6	259811	259816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552154
4504	NC_011370	GTTC	2	8	259839	259846	0 %	50 %	25 %	25 %	209552154
4505	NC_011370	GCC	2	6	259900	259905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552154
4506	NC_011370	GTC	2	6	260017	260022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552154
4507	NC_011370	GCTT	2	8	260030	260037	0 %	50 %	25 %	25 %	209552154
4508	NC_011370	CGA	2	6	260040	260045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552154
4509	NC_011370	AGCG	2	8	260098	260105	25 %	0 %	50 %	25 %	209552154
4510	NC_011370	ATC	2	6	260116	260121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552154
4511	NC_011370	TCC	2	6	260177	260182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552154
4512	NC_011370	GAC	2	6	260203	260208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552154
4513	NC_011370	AAC	2	6	260209	260214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552154
4514	NC_011370	AT	3	6	260856	260861	50 %	50 %	0 %	0 %	209552155
4515	NC_011370	CGA	2	6	260872	260877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4516	NC_011370	CAC	2	6	260914	260919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552155
4517	NC_011370	GCA	2	6	261060	261065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4518	NC_011370	AGA	2	6	261187	261192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552155
4519	NC_011370	TCG	2	6	261193	261198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4520	NC_011370	GCC	2	6	261232	261237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552155
4521	NC_011370	CAG	2	6	261428	261433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4522	NC_011370	AGAA	2	8	261465	261472	75 %	0 %	25 %	0 %	209552155
4523	NC_011370	ACCG	2	8	261479	261486	25 %	0 %	25 %	50 %	209552155
4524	NC_011370	CGG	2	6	261577	261582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552155
4525	NC_011370	CCCG	2	8	261603	261610	0 %	0 %	25 %	75 %	209552155
4526	NC_011370	CGTC	2	8	261675	261682	0 %	25 %	25 %	50 %	209552155
4527	NC_011370	G	6	6	261707	261712	0 %	0 %	100 %	0 %	209552155
4528	NC_011370	ATG	2	6	261744	261749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552155
4529	NC_011370	GGA	2	6	261931	261936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552155
4530	NC_011370	CGC	2	6	262037	262042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552155
4531	NC_011370	CAG	2	6	262076	262081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4532	NC_011370	TCG	2	6	262092	262097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4533	NC_011370	CGT	2	6	262100	262105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552155
4534	NC_011370	GATC	2	8	262207	262214	25 %	25 %	25 %	25 %	209552155
4535	NC_011370	CCG	2	6	262461	262466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552156
4536	NC_011370	CGA	2	6	262476	262481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552156
4537	NC_011370	AGGC	2	8	262536	262543	25 %	0 %	50 %	25 %	209552156
4538	NC_011370	TAG	2	6	262590	262595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552156
4539	NC_011370	CGTT	2	8	262694	262701	0 %	50 %	25 %	25 %	209552156
4540	NC_011370	GCGTCC	2	12	262739	262750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209552156
4541	NC_011370	GAA	2	6	262761	262766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552156
4542	NC_011370	TCCC	2	8	262772	262779	0 %	25 %	0 %	75 %	209552156
4543	NC_011370	CTTTA	2	10	262780	262789	20 %	60 %	0 %	20 %	209552156
4544	NC_011370	CG	3	6	262792	262797	0 %	0 %	50 %	50 %	209552156
4545	NC_011370	ACTG	2	8	262818	262825	25 %	25 %	25 %	25 %	209552156
4546	NC_011370	TGGCC	2	10	262917	262926	0 %	20 %	40 %	40 %	209552156
4547	NC_011370	ATC	2	6	262933	262938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552156
4548	NC_011370	T	6	6	262956	262961	0 %	100 %	0 %	0 %	209552156
4549	NC_011370	AG	3	6	263097	263102	50 %	0 %	50 %	0 %	209552156
4550	NC_011370	CTC	2	6	263137	263142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552156
4551	NC_011370	AT	3	6	263147	263152	50 %	50 %	0 %	0 %	209552156
4552	NC_011370	TTC	2	6	263161	263166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552156
4553	NC_011370	CTC	2	6	263240	263245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552156
4554	NC_011370	ATC	2	6	263314	263319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552156
4555	NC_011370	GCT	2	6	263368	263373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552156
4556	NC_011370	ATG	2	6	263393	263398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552156
4557	NC_011370	TGA	2	6	263450	263455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552156
4558	NC_011370	C	6	6	263465	263470	0 %	0 %	0 %	100 %	209552156
4559	NC_011370	CGC	2	6	263676	263681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552156
4560	NC_011370	ATC	2	6	263780	263785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552156
4561	NC_011370	TCG	2	6	263847	263852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552156
4562	NC_011370	GCG	2	6	263862	263867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552156
4563	NC_011370	CCG	2	6	264033	264038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552156
4564	NC_011370	CAA	2	6	264183	264188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209552156
4565	NC_011370	ATG	2	6	264269	264274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552156
4566	NC_011370	CCA	2	6	264320	264325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552156
4567	NC_011370	CCAT	2	8	264385	264392	25 %	25 %	0 %	50 %	209552156
4568	NC_011370	GT	3	6	264421	264426	0 %	50 %	50 %	0 %	209552156
4569	NC_011370	CGA	2	6	264486	264491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552156
4570	NC_011370	GCCGC	2	10	264502	264511	0 %	0 %	40 %	60 %	209552156
4571	NC_011370	CAGC	2	8	264538	264545	25 %	0 %	25 %	50 %	209552156
4572	NC_011370	GCG	2	6	264562	264567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552156
4573	NC_011370	TGT	2	6	264716	264721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552156
4574	NC_011370	GGC	2	6	265394	265399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552157
4575	NC_011370	TGGAA	2	10	265405	265414	40 %	20 %	40 %	0 %	209552157
4576	NC_011370	CCT	2	6	265450	265455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552157
4577	NC_011370	GTCG	2	8	265506	265513	0 %	25 %	50 %	25 %	209552157
4578	NC_011370	GCT	2	6	265518	265523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552157
4579	NC_011370	CTT	2	6	265609	265614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552157
4580	NC_011370	CGT	2	6	265691	265696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552157
4581	NC_011370	GT	3	6	265716	265721	0 %	50 %	50 %	0 %	209552157
4582	NC_011370	ACG	2	6	265758	265763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552157
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4584	NC_011370	GCC	2	6	266305	266310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552158
4585	NC_011370	AGCC	2	8	266399	266406	25 %	0 %	25 %	50 %	209552158
4586	NC_011370	CA	3	6	266413	266418	50 %	0 %	0 %	50 %	209552158
4587	NC_011370	GTT	3	9	266456	266464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209552158
4588	NC_011370	GGC	2	6	267415	267420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552159
4589	NC_011370	TCG	2	6	267479	267484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552159
4590	NC_011370	TCGA	2	8	267625	267632	25 %	25 %	25 %	25 %	209552159
4591	NC_011370	GATCA	2	10	267703	267712	40 %	20 %	20 %	20 %	209552159
4592	NC_011370	CTTT	2	8	267734	267741	0 %	75 %	0 %	25 %	209552159
4593	NC_011370	TGG	2	6	267767	267772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552159
4594	NC_011370	TAT	2	6	267789	267794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209552159
4595	NC_011370	TCT	2	6	267802	267807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552159
4596	NC_011370	GTG	2	6	267821	267826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552159
4597	NC_011370	CGT	2	6	267864	267869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552159
4598	NC_011370	GGTG	2	8	268150	268157	0 %	25 %	75 %	0 %	209552159
4599	NC_011370	GAG	2	6	268408	268413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552160
4600	NC_011370	GCTG	2	8	268447	268454	0 %	25 %	50 %	25 %	209552160
4601	NC_011370	CGG	2	6	268505	268510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552160
4602	NC_011370	CG	3	6	268623	268628	0 %	0 %	50 %	50 %	209552160
4603	NC_011370	AAGC	2	8	268681	268688	50 %	0 %	25 %	25 %	209552160
4604	NC_011370	CTC	2	6	268736	268741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552160
4605	NC_011370	TCA	2	6	268751	268756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552160
4606	NC_011370	GCC	2	6	268815	268820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552160
4607	NC_011370	GATT	2	8	268925	268932	25 %	50 %	25 %	0 %	209552160
4608	NC_011370	TGC	2	6	268953	268958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552160
4609	NC_011370	AG	3	6	268963	268968	50 %	0 %	50 %	0 %	209552160
4610	NC_011370	GAC	2	6	268996	269001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552160
4611	NC_011370	CTT	2	6	269185	269190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209552160
4612	NC_011370	GCG	2	6	269237	269242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552161
4613	NC_011370	ATG	2	6	269364	269369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552161
4614	NC_011370	TGG	2	6	269719	269724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552162
4615	NC_011370	CGG	2	6	269725	269730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552162
4616	NC_011370	GCC	2	6	269801	269806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552162
4617	NC_011370	ACG	2	6	269868	269873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4618	NC_011370	GAC	2	6	269894	269899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4619	NC_011370	GAA	2	6	269903	269908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552162
4620	NC_011370	CGC	3	9	269936	269944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552162
4621	NC_011370	GTC	2	6	269957	269962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4622	NC_011370	GTC	2	6	270055	270060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4623	NC_011370	AGA	2	6	270097	270102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552162
4624	NC_011370	A	7	7	270102	270108	100 %	0 %	0 %	0 %	209552162
4625	NC_011370	CGA	2	6	270118	270123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4626	NC_011370	GAC	2	6	270125	270130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552162
4627	NC_011370	ATC	2	6	270138	270143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209552162
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4629	NC_011370	GGC	2	6	270206	270211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552162
4630	NC_011370	GAA	2	6	270257	270262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209552162
4631	NC_011370	GGC	2	6	270272	270277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209552162
4632	NC_011370	CCG	2	6	270321	270326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209552162
4633	NC_011370	GAGC	2	8	270403	270410	25 %	0 %	50 %	25 %	209552162
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4642	NC_011370	CGA	2	6	270770	270775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552163
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4654	NC_011370	AGTAA	2	10	271228	271237	60 %	20 %	20 %	0 %	209552163
4655	NC_011370	ATAC	2	8	271274	271281	50 %	25 %	0 %	25 %	209552163
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4663	NC_011370	TGG	2	6	271449	271454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209552163
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4728	NC_011370	CGAAC	2	10	275161	275170	40 %	0 %	20 %	40 %	209552166
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4733	NC_011370	TG	3	6	275472	275477	0 %	50 %	50 %	0 %	209552167
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4735	NC_011370	ACAG	2	8	275527	275534	50 %	0 %	25 %	25 %	209552167
4736	NC_011370	GCA	2	6	275547	275552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552167
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4863	NC_011370	GCA	2	6	282280	282285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552172
4864	NC_011370	ACC	2	6	282438	282443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209552172
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4866	NC_011370	TGA	2	6	282463	282468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209552172
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4972	NC_011370	GGCGT	2	10	289141	289150	0 %	20 %	60 %	20 %	209552178
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4975	NC_011370	TCCC	2	8	289211	289218	0 %	25 %	0 %	75 %	209552178
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4986	NC_011370	GAC	2	6	289772	289777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209552179
4987	NC_011370	TCC	2	6	289832	289837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209552179
4988	NC_011370	ATA	2	6	289838	289843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209552179
4989	NC_011370	AGG	2	6	289852	289857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209552179
4990	NC_011370	CGT	2	6	289999	290004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209552179
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