MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011369	CGG	2	6	232830	232835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547835
5003	NC_011369	GCCG	2	8	232866	232873	0 %	0 %	50 %	50 %	209547835
5004	NC_011369	GAA	2	6	232902	232907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547835
5005	NC_011369	TCG	2	6	232940	232945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547835
5006	NC_011369	CGC	2	6	232946	232951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835
5007	NC_011369	CGA	2	6	233049	233054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547835
5008	NC_011369	GCC	2	6	233062	233067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835
5009	NC_011369	GGC	2	6	233079	233084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547835
5010	NC_011369	CCA	2	6	233120	233125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547835
5011	NC_011369	GCC	2	6	233203	233208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835
5012	NC_011369	TCG	2	6	233216	233221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547835
5013	NC_011369	CGG	2	6	233265	233270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547835
5014	NC_011369	GC	3	6	233283	233288	0 %	0 %	50 %	50 %	209547835
5015	NC_011369	GCG	2	6	233574	233579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547836
5016	NC_011369	AT	3	6	233584	233589	50 %	50 %	0 %	0 %	209547836
5017	NC_011369	GCT	2	6	233611	233616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547836
5018	NC_011369	TC	3	6	233650	233655	0 %	50 %	0 %	50 %	209547836
5019	NC_011369	CGG	2	6	233682	233687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547836
5020	NC_011369	GAA	2	6	233728	233733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547836
5021	NC_011369	TCAT	2	8	233763	233770	25 %	50 %	0 %	25 %	209547836
5022	NC_011369	CCG	2	6	233781	233786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547836
5023	NC_011369	ACA	2	6	233826	233831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547836
5024	NC_011369	GCT	2	6	233851	233856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547836
5025	NC_011369	GTCG	2	8	233863	233870	0 %	25 %	50 %	25 %	209547836
5026	NC_011369	TCT	2	6	233892	233897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547836
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5028	NC_011369	CCTC	2	8	233955	233962	0 %	25 %	0 %	75 %	209547836
5029	NC_011369	TGA	2	6	233994	233999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547836
5030	NC_011369	TGC	2	6	234009	234014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547836
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5032	NC_011369	CCAC	2	8	234117	234124	25 %	0 %	0 %	75 %	209547836
5033	NC_011369	TCA	2	6	234126	234131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547836
5034	NC_011369	GCA	2	6	234146	234151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547836
5035	NC_011369	CAGCGT	2	12	234166	234177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209547836
5036	NC_011369	CCCA	2	8	234194	234201	25 %	0 %	0 %	75 %	209547836
5037	NC_011369	GCA	2	6	234268	234273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547836
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5039	NC_011369	GCGCC	3	15	234392	234406	0 %	0 %	40 %	60 %	209547836
5040	NC_011369	CGT	2	6	234421	234426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547836
5041	NC_011369	GCTC	2	8	234501	234508	0 %	25 %	25 %	50 %	209547836
5042	NC_011369	CGA	2	6	234541	234546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547836
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5045	NC_011369	GTC	2	6	234765	234770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547837
5046	NC_011369	TCA	2	6	234800	234805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547837
5047	NC_011369	CACC	2	8	234825	234832	25 %	0 %	0 %	75 %	209547837
5048	NC_011369	CGC	2	6	234842	234847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547837
5049	NC_011369	CTG	2	6	234903	234908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547837
5050	NC_011369	GC	3	6	234945	234950	0 %	0 %	50 %	50 %	209547837
5051	NC_011369	TGA	2	6	234959	234964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547837
5052	NC_011369	CGG	2	6	235005	235010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547837
5053	NC_011369	CAG	2	6	235048	235053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547837
5054	NC_011369	TCG	2	6	235073	235078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547837
5055	NC_011369	GGC	2	6	235122	235127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547837
5056	NC_011369	GAC	2	6	235134	235139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547837
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5061	NC_011369	GCGG	2	8	235311	235318	0 %	0 %	75 %	25 %	209547837
5062	NC_011369	GAG	2	6	235324	235329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547837
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5066	NC_011369	TCCG	2	8	235431	235438	0 %	25 %	25 %	50 %	209547837
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5102	NC_011369	CG	3	6	237340	237345	0 %	0 %	50 %	50 %	209547838
5103	NC_011369	GCTCG	2	10	237346	237355	0 %	20 %	40 %	40 %	209547838
5104	NC_011369	CG	3	6	237381	237386	0 %	0 %	50 %	50 %	209547838
5105	NC_011369	GAT	2	6	237469	237474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547838
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5107	NC_011369	CGC	2	6	237544	237549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547838
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5120	NC_011369	CGCGGG	2	12	238067	238078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547839
5121	NC_011369	AGC	2	6	238093	238098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547839
5122	NC_011369	TCC	2	6	238105	238110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547839
5123	NC_011369	CGA	2	6	238160	238165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547839
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5125	NC_011369	AGC	2	6	238243	238248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547839
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5128	NC_011369	CCG	2	6	238327	238332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547839
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5133	NC_011369	GCA	2	6	238469	238474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547839
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5152	NC_011369	CGCGC	2	10	239675	239684	0 %	0 %	40 %	60 %	209547839
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5199	NC_011369	CAG	2	6	242605	242610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547845
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5219	NC_011369	TGA	2	6	243330	243335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547846
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5225	NC_011369	CGT	2	6	243568	243573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547846
5226	NC_011369	GCGCC	2	10	243622	243631	0 %	0 %	40 %	60 %	209547846
5227	NC_011369	CAA	2	6	243652	243657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547846
5228	NC_011369	TGA	2	6	243762	243767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547846
5229	NC_011369	CATG	2	8	243820	243827	25 %	25 %	25 %	25 %	209547846
5230	NC_011369	GCG	2	6	243906	243911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547846
5231	NC_011369	GCC	2	6	243968	243973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547846
5232	NC_011369	GAG	2	6	244031	244036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547846
5233	NC_011369	GCG	2	6	244050	244055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547846
5234	NC_011369	CGT	2	6	244057	244062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547846
5235	NC_011369	ATC	2	6	244220	244225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547847
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5237	NC_011369	AGCGCA	2	12	244332	244343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547847
5238	NC_011369	GCC	2	6	244356	244361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547847
5239	NC_011369	GCT	2	6	244441	244446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547847
5240	NC_011369	GCTGTC	2	12	244495	244506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547847
5241	NC_011369	CGG	2	6	244564	244569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547847
5242	NC_011369	CCT	2	6	244581	244586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547847
5243	NC_011369	CTGG	2	8	244679	244686	0 %	25 %	50 %	25 %	209547848
5244	NC_011369	AGC	2	6	244708	244713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5245	NC_011369	GAC	2	6	244730	244735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5246	NC_011369	CGT	2	6	244766	244771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5247	NC_011369	CAT	2	6	244778	244783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547848
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5249	NC_011369	GAG	2	6	244881	244886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547848
5250	NC_011369	CGC	2	6	244892	244897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547848
5251	NC_011369	GCA	2	6	244941	244946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5252	NC_011369	CAT	2	6	244962	244967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547848
5253	NC_011369	GAC	2	6	245001	245006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547848
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5255	NC_011369	TGA	2	6	245098	245103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547848
5256	NC_011369	TGCCG	2	10	245105	245114	0 %	20 %	40 %	40 %	209547848
5257	NC_011369	CGG	2	6	245162	245167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547848
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5260	NC_011369	CGG	2	6	245231	245236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547848
5261	NC_011369	GCC	2	6	245325	245330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547848
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5264	NC_011369	CTG	2	6	245436	245441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5265	NC_011369	CGA	2	6	245486	245491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547848
5266	NC_011369	CCG	2	6	245560	245565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547848
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5269	NC_011369	CGG	2	6	245759	245764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547848
5270	NC_011369	TGC	2	6	245776	245781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547848
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5272	NC_011369	TCC	2	6	245805	245810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547848
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5274	NC_011369	CGG	2	6	245887	245892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547848
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5280	NC_011369	CGG	2	6	246114	246119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547849
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5288	NC_011369	GC	3	6	246599	246604	0 %	0 %	50 %	50 %	209547850
5289	NC_011369	TCG	2	6	246622	246627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547850
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5291	NC_011369	GCC	2	6	246664	246669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547850
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5297	NC_011369	CGAT	2	8	246772	246779	25 %	25 %	25 %	25 %	209547850
5298	NC_011369	CGA	2	6	246793	246798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547850
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5300	NC_011369	AGA	2	6	247061	247066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547851
5301	NC_011369	ATC	2	6	247146	247151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547851
5302	NC_011369	CGTCG	2	10	247369	247378	0 %	20 %	40 %	40 %	209547852
5303	NC_011369	CAGG	2	8	247390	247397	25 %	0 %	50 %	25 %	209547852
5304	NC_011369	CGA	2	6	247431	247436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547852
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5310	NC_011369	CGA	2	6	247611	247616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547852
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5312	NC_011369	TCG	2	6	247712	247717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547852
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5314	NC_011369	AGA	2	6	247838	247843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547852
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5319	NC_011369	GCTG	2	8	248122	248129	0 %	25 %	50 %	25 %	209547853
5320	NC_011369	CGA	3	9	248156	248164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547853
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5322	NC_011369	GCC	2	6	248581	248586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547854
5323	NC_011369	GCAT	2	8	248591	248598	25 %	25 %	25 %	25 %	209547854
5324	NC_011369	TCT	2	6	248629	248634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547854
5325	NC_011369	GTC	3	9	248787	248795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547854
5326	NC_011369	GCT	2	6	248884	248889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5327	NC_011369	ATA	2	6	248989	248994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209547855
5328	NC_011369	CGACC	2	10	249042	249051	20 %	0 %	20 %	60 %	209547855
5329	NC_011369	CAG	2	6	249055	249060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5330	NC_011369	CGC	2	6	249068	249073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
5331	NC_011369	GAA	2	6	249084	249089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547855
5332	NC_011369	TCC	2	6	249131	249136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547855
5333	NC_011369	AGA	2	6	249179	249184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547855
5334	NC_011369	CGA	2	6	249186	249191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5335	NC_011369	TG	3	6	249223	249228	0 %	50 %	50 %	0 %	209547855
5336	NC_011369	GTC	2	6	249289	249294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5337	NC_011369	GC	4	8	249425	249432	0 %	0 %	50 %	50 %	209547855
5338	NC_011369	CTG	2	6	249454	249459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5339	NC_011369	TC	3	6	249508	249513	0 %	50 %	0 %	50 %	209547855
5340	NC_011369	TTC	2	6	249550	249555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547855
5341	NC_011369	GCC	2	6	249584	249589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
5342	NC_011369	CGA	2	6	249606	249611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5343	NC_011369	T	6	6	249633	249638	0 %	100 %	0 %	0 %	209547855
5344	NC_011369	CGG	2	6	249671	249676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
5345	NC_011369	TCG	2	6	249752	249757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5346	NC_011369	CGC	2	6	249774	249779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
5347	NC_011369	GGCG	2	8	249798	249805	0 %	0 %	75 %	25 %	209547855
5348	NC_011369	CTTC	2	8	249809	249816	0 %	50 %	0 %	50 %	209547855
5349	NC_011369	GTC	2	6	249868	249873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5350	NC_011369	CCG	2	6	249928	249933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547855
5351	NC_011369	CGA	2	6	250047	250052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5352	NC_011369	CAG	2	6	250066	250071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5353	NC_011369	ACG	2	6	250085	250090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5354	NC_011369	GCG	2	6	250118	250123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
5355	NC_011369	CGG	2	6	250150	250155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547855
5356	NC_011369	GCTGTC	2	12	250172	250183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547855
5357	NC_011369	TCCC	2	8	250271	250278	0 %	25 %	0 %	75 %	209547856
5358	NC_011369	GGT	2	6	250297	250302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547856
5359	NC_011369	CGCT	2	8	250324	250331	0 %	25 %	25 %	50 %	209547856
5360	NC_011369	ATG	2	6	250363	250368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547856
5361	NC_011369	TTG	2	6	250375	250380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547856
5362	NC_011369	ACG	2	6	250417	250422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547856
5363	NC_011369	ATC	2	6	250500	250505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547856
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5392	NC_011369	GCG	2	6	251611	251616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547856
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5472	NC_011369	CGTC	2	8	256414	256421	0 %	25 %	25 %	50 %	209547860
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5477	NC_011369	GCGTG	2	10	256621	256630	0 %	20 %	60 %	20 %	209547860
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5481	NC_011369	CGA	3	9	256720	256728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547860
5482	NC_011369	CGG	2	6	256816	256821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547860
5483	NC_011369	GGA	2	6	256913	256918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547860
5484	NC_011369	TCG	2	6	257005	257010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547860
5485	NC_011369	CG	3	6	257009	257014	0 %	0 %	50 %	50 %	209547860
5486	NC_011369	TCA	2	6	257047	257052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547860
5487	NC_011369	TCG	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547860
5488	NC_011369	AGC	2	6	257061	257066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547860
5489	NC_011369	ATG	2	6	257082	257087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547860
5490	NC_011369	TCG	2	6	257128	257133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547860
5491	NC_011369	TTG	2	6	257145	257150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547860
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5498	NC_011369	CGTCA	2	10	257414	257423	20 %	20 %	20 %	40 %	209547860
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5500	NC_011369	ATCC	2	8	257509	257516	25 %	25 %	0 %	50 %	209547860

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