MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011369	CGGC	2	8	210290	210297	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4502	NC_011369	TCGGCC	2	12	210310	210321	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209547818
4503	NC_011369	CGGC	2	8	210377	210384	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4504	NC_011369	TGCG	2	8	210460	210467	0 %	25 %	50 %	25 %	209547818
4505	NC_011369	CGG	3	9	210539	210547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4506	NC_011369	CGC	2	6	210551	210556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
4507	NC_011369	GCG	2	6	210562	210567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4508	NC_011369	CGA	2	6	210587	210592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4509	NC_011369	CCG	2	6	210599	210604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
4510	NC_011369	GCC	2	6	210613	210618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
4511	NC_011369	GAT	2	6	210621	210626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547818
4512	NC_011369	AT	3	6	210625	210630	50 %	50 %	0 %	0 %	209547818
4513	NC_011369	TCG	2	6	210631	210636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4514	NC_011369	TCG	2	6	210638	210643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4515	NC_011369	CGG	2	6	210683	210688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4516	NC_011369	GCG	2	6	210694	210699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4517	NC_011369	CG	3	6	210704	210709	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4518	NC_011369	GCTC	2	8	210710	210717	0 %	25 %	25 %	50 %	209547818
4519	NC_011369	TTC	2	6	210754	210759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547818
4520	NC_011369	TCGG	2	8	210772	210779	0 %	25 %	50 %	25 %	209547818
4521	NC_011369	GCC	2	6	210784	210789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
4522	NC_011369	CT	3	6	210793	210798	0 %	50 %	0 %	50 %	209547818
4523	NC_011369	GCG	2	6	210808	210813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4524	NC_011369	CGT	2	6	210851	210856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4525	NC_011369	CGGC	2	8	210866	210873	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4526	NC_011369	CGG	2	6	210876	210881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4527	NC_011369	TCG	2	6	210895	210900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4528	NC_011369	CGT	2	6	210938	210943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4529	NC_011369	GCG	2	6	211013	211018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4530	NC_011369	CAG	2	6	211038	211043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4531	NC_011369	TCG	2	6	211066	211071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4532	NC_011369	TCA	2	6	211147	211152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547818
4533	NC_011369	CAT	2	6	211172	211177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547818
4534	NC_011369	TCA	2	6	211181	211186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547818
4535	NC_011369	GGC	2	6	211251	211256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4536	NC_011369	TCG	2	6	211291	211296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4537	NC_011369	GGC	2	6	211311	211316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4538	NC_011369	TGC	2	6	211355	211360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4539	NC_011369	TGGCGA	2	12	211379	211390	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209547818
4540	NC_011369	GCC	2	6	211434	211439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547818
4541	NC_011369	GTC	2	6	211455	211460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4542	NC_011369	GCGA	2	8	211471	211478	25 %	0 %	50 %	25 %	209547818
4543	NC_011369	CG	3	6	211571	211576	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4544	NC_011369	AGCG	2	8	211591	211598	25 %	0 %	50 %	25 %	209547818
4545	NC_011369	CTC	2	6	211602	211607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547818
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4547	NC_011369	GC	3	6	211693	211698	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4548	NC_011369	GTC	2	6	211701	211706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
4549	NC_011369	GTC	2	6	211851	211856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547818
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4551	NC_011369	TGCGG	2	10	211882	211891	0 %	20 %	60 %	20 %	209547818
4552	NC_011369	GGCGC	2	10	211892	211901	0 %	0 %	60 %	40 %	209547818
4553	NC_011369	CGGC	2	8	211948	211955	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4554	NC_011369	GC	3	6	211963	211968	0 %	0 %	50 %	50 %	209547818
4555	NC_011369	GCG	2	6	212030	212035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547818
4556	NC_011369	CGAG	2	8	212156	212163	25 %	0 %	50 %	25 %	209547818
4557	NC_011369	TCT	2	6	212207	212212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547818
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4559	NC_011369	GCT	2	6	212725	212730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547819
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4561	NC_011369	GTC	2	6	212764	212769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547819
4562	NC_011369	GGGC	2	8	212800	212807	0 %	0 %	75 %	25 %	209547819
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4566	NC_011369	ACGC	2	8	213133	213140	25 %	0 %	25 %	50 %	209547820
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4570	NC_011369	TGC	2	6	213320	213325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547820
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4580	NC_011369	GCGA	2	8	213620	213627	25 %	0 %	50 %	25 %	209547820
4581	NC_011369	CGA	2	6	213651	213656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547820
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4586	NC_011369	CGCC	2	8	213909	213916	0 %	0 %	25 %	75 %	209547821
4587	NC_011369	GCAG	2	8	213921	213928	25 %	0 %	50 %	25 %	209547821
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4593	NC_011369	GAT	2	6	214159	214164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547821
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4599	NC_011369	GCCGC	2	10	214397	214406	0 %	0 %	40 %	60 %	209547821
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4604	NC_011369	GGC	2	6	214822	214827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547822
4605	NC_011369	GAA	2	6	214838	214843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547822
4606	NC_011369	ATT	2	6	214860	214865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209547822
4607	NC_011369	GAT	2	6	214895	214900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547822
4608	NC_011369	GGC	2	6	214955	214960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547822
4609	NC_011369	GGA	2	6	214981	214986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547822
4610	NC_011369	CGG	2	6	214990	214995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547822
4611	NC_011369	CCG	2	6	215043	215048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547822
4612	NC_011369	TGA	2	6	215061	215066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547822
4613	NC_011369	CGC	2	6	215095	215100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547822
4614	NC_011369	TGG	2	6	215151	215156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547822
4615	NC_011369	TGC	2	6	215217	215222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547822
4616	NC_011369	AGA	2	6	215271	215276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547822
4617	NC_011369	CCG	2	6	215286	215291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547822
4618	NC_011369	GCG	2	6	215442	215447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547822
4619	NC_011369	ACGCCA	2	12	215472	215483	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	209547822
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4621	NC_011369	TGA	3	9	215559	215567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547822
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4983	NC_011369	CGC	2	6	231851	231856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547834
4984	NC_011369	GCT	2	6	231870	231875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547834
4985	NC_011369	CTG	2	6	231892	231897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547834
4986	NC_011369	CG	3	6	232220	232225	0 %	0 %	50 %	50 %	209547835
4987	NC_011369	GGC	2	6	232230	232235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547835
4988	NC_011369	TCG	2	6	232250	232255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547835
4989	NC_011369	GTC	2	6	232258	232263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547835
4990	NC_011369	TGGG	2	8	232300	232307	0 %	25 %	75 %	0 %	209547835
4991	NC_011369	GCG	2	6	232345	232350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547835
4992	NC_011369	GCTT	2	8	232359	232366	0 %	50 %	25 %	25 %	209547835
4993	NC_011369	ATT	2	6	232427	232432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209547835
4994	NC_011369	CAG	2	6	232434	232439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547835
4995	NC_011369	GAT	2	6	232534	232539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547835
4996	NC_011369	CGC	3	9	232575	232583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835
4997	NC_011369	GC	4	8	232598	232605	0 %	0 %	50 %	50 %	209547835
4998	NC_011369	GCC	2	6	232669	232674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835
4999	NC_011369	CGA	2	6	232736	232741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547835
5000	NC_011369	CCG	2	6	232773	232778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547835

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