MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 24817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011368	ATG	2	6	115687	115692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546560
2502	NC_011368	TCG	2	6	115735	115740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546560
2503	NC_011368	ATGG	2	8	115775	115782	25 %	25 %	50 %	0 %	209546560
2504	NC_011368	TTC	2	6	115959	115964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546561
2505	NC_011368	CGT	2	6	116021	116026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546561
2506	NC_011368	TCG	2	6	116032	116037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546561
2507	NC_011368	AGCA	2	8	116106	116113	50 %	0 %	25 %	25 %	209546561
2508	NC_011368	CCG	2	6	116131	116136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546561
2509	NC_011368	TGA	2	6	116138	116143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546561
2510	NC_011368	GGC	2	6	116183	116188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546561
2511	NC_011368	CGG	2	6	116232	116237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546561
2512	NC_011368	CGA	2	6	116267	116272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546561
2513	NC_011368	CG	3	6	116276	116281	0 %	0 %	50 %	50 %	209546561
2514	NC_011368	TCA	2	6	116297	116302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546561
2515	NC_011368	CCA	2	6	116304	116309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546561
2516	NC_011368	TAA	2	6	116317	116322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546561
2517	NC_011368	TCG	2	6	116344	116349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546561
2518	NC_011368	GGC	2	6	116359	116364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546561
2519	NC_011368	GA	3	6	116423	116428	50 %	0 %	50 %	0 %	209546561
2520	NC_011368	GCC	2	6	116498	116503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546561
2521	NC_011368	GTC	2	6	116620	116625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2522	NC_011368	CGG	2	6	116633	116638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2523	NC_011368	AAC	2	6	116657	116662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546562
2524	NC_011368	GCG	2	6	116725	116730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2525	NC_011368	CCG	2	6	116765	116770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2526	NC_011368	TCG	2	6	116771	116776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2527	NC_011368	CGA	2	6	116801	116806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2528	NC_011368	GAT	2	6	116814	116819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546562
2529	NC_011368	CGC	2	6	116820	116825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2530	NC_011368	AGC	2	6	116845	116850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2531	NC_011368	ACGA	3	12	116854	116865	50 %	0 %	25 %	25 %	209546562
2532	NC_011368	TCG	2	6	116932	116937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2533	NC_011368	AGCTCG	2	12	117022	117033	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2534	NC_011368	GGC	2	6	117043	117048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2535	NC_011368	CT	3	6	117055	117060	0 %	50 %	0 %	50 %	209546562
2536	NC_011368	CAA	2	6	117128	117133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546562
2537	NC_011368	TCG	2	6	117139	117144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2538	NC_011368	GGC	2	6	117156	117161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2539	NC_011368	GCA	2	6	117176	117181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2540	NC_011368	GCC	2	6	117207	117212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2541	NC_011368	CTC	2	6	117213	117218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546562
2542	NC_011368	GGCG	2	8	117237	117244	0 %	0 %	75 %	25 %	209546562
2543	NC_011368	GCTG	2	8	117257	117264	0 %	25 %	50 %	25 %	209546562
2544	NC_011368	CCG	2	6	117307	117312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2545	NC_011368	AGCC	2	8	117389	117396	25 %	0 %	25 %	50 %	209546562
2546	NC_011368	CG	4	8	117449	117456	0 %	0 %	50 %	50 %	209546562
2547	NC_011368	GCC	2	6	117462	117467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
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2549	NC_011368	ATG	2	6	117547	117552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546562
2550	NC_011368	TCG	2	6	117553	117558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2551	NC_011368	CGGC	2	8	117565	117572	0 %	0 %	50 %	50 %	209546562
2552	NC_011368	ACG	2	6	117580	117585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2553	NC_011368	GCC	2	6	117600	117605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2554	NC_011368	TCG	2	6	117730	117735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2555	NC_011368	TCCGC	2	10	117782	117791	0 %	20 %	20 %	60 %	209546562
2556	NC_011368	TGA	2	6	117800	117805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546562
2557	NC_011368	GCCG	2	8	117813	117820	0 %	0 %	50 %	50 %	209546562
2558	NC_011368	GGTCGA	2	12	117854	117865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	209546562
2559	NC_011368	TCG	2	6	117916	117921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2560	NC_011368	CAT	2	6	117965	117970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546562
2561	NC_011368	GCAAG	2	10	117971	117980	40 %	0 %	40 %	20 %	209546562
2562	NC_011368	TGCA	2	8	117987	117994	25 %	25 %	25 %	25 %	209546562
2563	NC_011368	TTC	2	6	118003	118008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546562
2564	NC_011368	GCT	2	6	118020	118025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2565	NC_011368	CAG	2	6	118038	118043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2566	NC_011368	GCC	2	6	118130	118135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
2567	NC_011368	CGTCG	2	10	118167	118176	0 %	20 %	40 %	40 %	209546562
2568	NC_011368	TCG	2	6	118198	118203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2569	NC_011368	CGG	2	6	118208	118213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2570	NC_011368	GC	4	8	118224	118231	0 %	0 %	50 %	50 %	209546562
2571	NC_011368	CTG	2	6	118242	118247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2572	NC_011368	TCG	2	6	118258	118263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2573	NC_011368	ACG	2	6	118288	118293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
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2579	NC_011368	GGC	2	6	118367	118372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2580	NC_011368	GGC	2	6	118427	118432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546562
2581	NC_011368	CGTT	2	8	118449	118456	0 %	50 %	25 %	25 %	209546562
2582	NC_011368	CGA	3	9	118583	118591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2583	NC_011368	GCCG	2	8	118641	118648	0 %	0 %	50 %	50 %	209546562
2584	NC_011368	CCG	3	9	118646	118654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546562
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2588	NC_011368	GCTGGC	2	12	118790	118801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209546562
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2590	NC_011368	ACG	2	6	118852	118857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546562
2591	NC_011368	GGAA	2	8	118944	118951	50 %	0 %	50 %	0 %	209546562
2592	NC_011368	TGC	2	6	119090	119095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546563
2593	NC_011368	GC	3	6	119118	119123	0 %	0 %	50 %	50 %	209546563
2594	NC_011368	GGCG	2	8	119133	119140	0 %	0 %	75 %	25 %	209546563
2595	NC_011368	GGTAT	2	10	119146	119155	20 %	40 %	40 %	0 %	209546563
2596	NC_011368	GGC	2	6	119178	119183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546563
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2600	NC_011368	ACG	2	6	119378	119383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546563
2601	NC_011368	ATC	2	6	119386	119391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546563
2602	NC_011368	GCG	2	6	119415	119420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546563
2603	NC_011368	ACA	2	6	119450	119455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546563
2604	NC_011368	CGT	2	6	119540	119545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546563
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2606	NC_011368	ATC	2	6	119653	119658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546563
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2619	NC_011368	CAT	2	6	120431	120436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546565
2620	NC_011368	CGC	2	6	120463	120468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546565
2621	NC_011368	CG	3	6	120478	120483	0 %	0 %	50 %	50 %	209546565
2622	NC_011368	TGC	2	6	120523	120528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546565
2623	NC_011368	CGA	2	6	120529	120534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546565
2624	NC_011368	TTG	2	6	120621	120626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546565
2625	NC_011368	GAC	2	6	120641	120646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546565
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2628	NC_011368	GC	3	6	120738	120743	0 %	0 %	50 %	50 %	209546565
2629	NC_011368	GC	3	6	120869	120874	0 %	0 %	50 %	50 %	209546565
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2633	NC_011368	GCA	2	6	120971	120976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546565
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2641	NC_011368	ACG	2	6	121260	121265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546565
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2644	NC_011368	GAT	2	6	122204	122209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546566
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2649	NC_011368	CGC	2	6	122498	122503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546567
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2652	NC_011368	CGG	2	6	122601	122606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546567
2653	NC_011368	CCAGCG	2	12	122636	122647	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546567
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2657	NC_011368	CCGA	2	8	122704	122711	25 %	0 %	25 %	50 %	209546567
2658	NC_011368	GAC	2	6	122751	122756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546567
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2721	NC_011368	GTC	3	9	125067	125075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546569
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2723	NC_011368	CAG	2	6	125141	125146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546569
2724	NC_011368	GCGAT	2	10	125172	125181	20 %	20 %	40 %	20 %	209546569
2725	NC_011368	GATCAG	2	12	125213	125224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209546569
2726	NC_011368	TCA	2	6	125416	125421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546570
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2728	NC_011368	GTT	2	6	125532	125537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546570
2729	NC_011368	GCC	2	6	125568	125573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546570
2730	NC_011368	GCC	2	6	125575	125580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546570
2731	NC_011368	ACCG	2	8	125604	125611	25 %	0 %	25 %	50 %	209546570
2732	NC_011368	CGT	2	6	125633	125638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546570
2733	NC_011368	CCG	2	6	125650	125655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546570
2734	NC_011368	GGCA	2	8	125711	125718	25 %	0 %	50 %	25 %	209546570
2735	NC_011368	GGCG	2	8	125726	125733	0 %	0 %	75 %	25 %	209546570
2736	NC_011368	AGCG	2	8	125736	125743	25 %	0 %	50 %	25 %	209546570
2737	NC_011368	TGC	2	6	125845	125850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546570
2738	NC_011368	AGC	2	6	125932	125937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546570
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2740	NC_011368	CGA	2	6	126008	126013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546570
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2861	NC_011368	GGC	2	6	130879	130884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546573
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2977	NC_011368	GCC	4	12	135735	135746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546578
2978	NC_011368	GGC	2	6	135818	135823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546578
2979	NC_011368	GC	3	6	135822	135827	0 %	0 %	50 %	50 %	209546578
2980	NC_011368	CCA	2	6	135896	135901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546578
2981	NC_011368	CGG	2	6	135908	135913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546578
2982	NC_011368	GC	3	6	135923	135928	0 %	0 %	50 %	50 %	209546578
2983	NC_011368	CGA	2	6	135974	135979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546578
2984	NC_011368	CGA	2	6	135982	135987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546578
2985	NC_011368	CAC	2	6	136001	136006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546578
2986	NC_011368	GGC	2	6	136022	136027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546578
2987	NC_011368	GCC	2	6	136059	136064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546578
2988	NC_011368	CGT	2	6	136088	136093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546578
2989	NC_011368	CAT	2	6	136112	136117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546578
2990	NC_011368	ATC	2	6	136164	136169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546578
2991	NC_011368	CAGG	2	8	136211	136218	25 %	0 %	50 %	25 %	209546578
2992	NC_011368	GCC	2	6	136233	136238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546578
2993	NC_011368	GTC	2	6	136350	136355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546578
2994	NC_011368	TCCGGC	2	12	136362	136373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546578
2995	NC_011368	GC	3	6	136386	136391	0 %	0 %	50 %	50 %	209546578
2996	NC_011368	GCC	2	6	136409	136414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546578
2997	NC_011368	AGC	2	6	136416	136421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546578
2998	NC_011368	GCCG	2	8	136468	136475	0 %	0 %	50 %	50 %	209546578
2999	NC_011368	ACG	2	6	136477	136482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546578
3000	NC_011368	CAT	2	6	136553	136558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546578

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