MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG201

Total Repeats: 24817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011368	AGC	2	6	21776	21781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
502	NC_011368	GCC	2	6	21789	21794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546470
503	NC_011368	GCG	2	6	21801	21806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546470
504	NC_011368	AGC	2	6	21822	21827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546470
505	NC_011368	ACA	2	6	21832	21837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546470
506	NC_011368	TGCAT	2	10	22334	22343	20 %	40 %	20 %	20 %	209546471
507	NC_011368	ACG	2	6	22461	22466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546471
508	NC_011368	ACC	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546471
509	NC_011368	GCGG	2	8	22534	22541	0 %	0 %	75 %	25 %	209546471
510	NC_011368	GCC	2	6	22565	22570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546471
511	NC_011368	CCG	2	6	22590	22595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546471
512	NC_011368	CAG	2	6	22634	22639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546471
513	NC_011368	TGA	2	6	22791	22796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546471
514	NC_011368	GCC	2	6	23122	23127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546472
515	NC_011368	GC	3	6	23217	23222	0 %	0 %	50 %	50 %	209546472
516	NC_011368	CGTT	2	8	23270	23277	0 %	50 %	25 %	25 %	209546472
517	NC_011368	CAC	2	6	23278	23283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546472
518	NC_011368	CATC	2	8	23298	23305	25 %	25 %	0 %	50 %	209546472
519	NC_011368	CGT	2	6	23325	23330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546472
520	NC_011368	GTC	2	6	23344	23349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546472
521	NC_011368	CCG	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546472
522	NC_011368	CAGG	2	8	23481	23488	25 %	0 %	50 %	25 %	209546472
523	NC_011368	CGA	2	6	23505	23510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546472
524	NC_011368	AC	3	6	23681	23686	50 %	0 %	0 %	50 %	209546473
525	NC_011368	CGA	2	6	23756	23761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546473
526	NC_011368	GAT	2	6	23780	23785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
527	NC_011368	AAG	2	6	23789	23794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546473
528	NC_011368	CCGCTG	2	12	23860	23871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546473
529	NC_011368	AT	3	6	23893	23898	50 %	50 %	0 %	0 %	209546473
530	NC_011368	TCG	2	6	23899	23904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
531	NC_011368	CG	3	6	23903	23908	0 %	0 %	50 %	50 %	209546473
532	NC_011368	CGC	2	6	23941	23946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
533	NC_011368	TCG	2	6	23956	23961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
534	NC_011368	TCG	2	6	23984	23989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
535	NC_011368	ACC	2	6	23995	24000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546473
536	NC_011368	CTT	2	6	24024	24029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546473
537	NC_011368	GCG	2	6	24098	24103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
538	NC_011368	GGC	2	6	24113	24118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
539	NC_011368	GTC	2	6	24123	24128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
540	NC_011368	CGC	2	6	24140	24145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
541	NC_011368	ATGG	2	8	24159	24166	25 %	25 %	50 %	0 %	209546473
542	NC_011368	CCG	2	6	24187	24192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
543	NC_011368	CCCG	2	8	24228	24235	0 %	0 %	25 %	75 %	209546473
544	NC_011368	CGG	2	6	24250	24255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546473
545	NC_011368	TGA	2	6	24341	24346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
546	NC_011368	GCC	2	6	24351	24356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
547	NC_011368	TTTCCG	2	12	24427	24438	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209546473
548	NC_011368	TCG	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
549	NC_011368	TGGA	2	8	24565	24572	25 %	25 %	50 %	0 %	209546473
550	NC_011368	ATTGGC	2	12	24629	24640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209546473
551	NC_011368	CG	3	6	24722	24727	0 %	0 %	50 %	50 %	209546473
552	NC_011368	CGC	2	6	24846	24851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546473
553	NC_011368	ATG	2	6	24931	24936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546473
554	NC_011368	CGT	2	6	24938	24943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546473
555	NC_011368	CCG	2	6	24991	24996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546474
556	NC_011368	AAG	2	6	25011	25016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546474
557	NC_011368	GAC	2	6	25020	25025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
558	NC_011368	ACG	2	6	25033	25038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
559	NC_011368	GAACGA	2	12	25040	25051	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209546474
560	NC_011368	TGA	2	6	25052	25057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546474
561	NC_011368	AAGG	2	8	25071	25078	50 %	0 %	50 %	0 %	209546474
562	NC_011368	GCA	3	9	25088	25096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
563	NC_011368	TCC	2	6	25123	25128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
564	NC_011368	CTC	2	6	25200	25205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
565	NC_011368	GCCG	2	8	25289	25296	0 %	0 %	50 %	50 %	209546474
566	NC_011368	CAT	2	6	25311	25316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546474
567	NC_011368	CGA	2	6	25352	25357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546474
568	NC_011368	CGC	3	9	25377	25385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546474
569	NC_011368	GGC	2	6	25445	25450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
570	NC_011368	GCGCC	2	10	25471	25480	0 %	0 %	40 %	60 %	209546474
571	NC_011368	GGT	2	6	25638	25643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546474
572	NC_011368	CGG	2	6	25652	25657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
573	NC_011368	GCCC	2	8	25665	25672	0 %	0 %	25 %	75 %	209546474
574	NC_011368	TCG	2	6	25772	25777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546474
575	NC_011368	CTC	2	6	25794	25799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546474
576	NC_011368	A	6	6	25851	25856	100 %	0 %	0 %	0 %	209546474
577	NC_011368	GGC	2	6	25866	25871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546474
578	NC_011368	GAA	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546474
579	NC_011368	ACTC	2	8	25919	25926	25 %	25 %	0 %	50 %	209546474
580	NC_011368	CAG	2	6	25996	26001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
581	NC_011368	CAC	2	6	26008	26013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546475
582	NC_011368	ATC	2	6	26072	26077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546475
583	NC_011368	CCG	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
584	NC_011368	CGACGC	2	12	26268	26279	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546475
585	NC_011368	CG	3	6	26376	26381	0 %	0 %	50 %	50 %	209546475
586	NC_011368	CCA	2	6	26382	26387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546475
587	NC_011368	CGC	2	6	26395	26400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
588	NC_011368	GCG	2	6	26479	26484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
589	NC_011368	GAC	2	6	26500	26505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
590	NC_011368	GAG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546475
591	NC_011368	GCA	2	6	26667	26672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546475
592	NC_011368	GCC	2	6	26694	26699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546475
593	NC_011368	GCG	2	6	26708	26713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
594	NC_011368	GAT	2	6	26748	26753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546475
595	NC_011368	GCG	2	6	26852	26857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546475
596	NC_011368	CGA	2	6	26972	26977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
597	NC_011368	CCGC	2	8	27018	27025	0 %	0 %	25 %	75 %	209546476
598	NC_011368	CGA	2	6	27168	27173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
599	NC_011368	GCGA	2	8	27179	27186	25 %	0 %	50 %	25 %	209546476
600	NC_011368	GCCG	2	8	27236	27243	0 %	0 %	50 %	50 %	209546476
601	NC_011368	CG	3	6	27251	27256	0 %	0 %	50 %	50 %	209546476
602	NC_011368	GTC	2	6	27274	27279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546476
603	NC_011368	GCA	2	6	27311	27316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
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605	NC_011368	CGA	2	6	27347	27352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
606	NC_011368	TTC	2	6	27382	27387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546476
607	NC_011368	CGTC	2	8	27415	27422	0 %	25 %	25 %	50 %	209546476
608	NC_011368	CGG	2	6	27429	27434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546476
609	NC_011368	GCT	2	6	27461	27466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546476
610	NC_011368	CGA	2	6	27525	27530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546476
611	NC_011368	GGT	2	6	27546	27551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546476
612	NC_011368	CCG	2	6	27568	27573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546476
613	NC_011368	GAA	2	6	27614	27619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546476
614	NC_011368	GCATC	2	10	27623	27632	20 %	20 %	20 %	40 %	209546476
615	NC_011368	GGCG	2	8	27761	27768	0 %	0 %	75 %	25 %	209546476
616	NC_011368	TCG	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546476
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620	NC_011368	AGG	2	6	27835	27840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546476
621	NC_011368	CGG	2	6	27863	27868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546476
622	NC_011368	TGT	2	6	27905	27910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546476
623	NC_011368	GTC	2	6	27939	27944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546476
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626	NC_011368	TCG	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546476
627	NC_011368	GATCA	2	10	27999	28008	40 %	20 %	20 %	20 %	209546476
628	NC_011368	TTG	2	6	28036	28041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546476
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631	NC_011368	CCTG	2	8	28298	28305	0 %	25 %	25 %	50 %	209546476
632	NC_011368	CCG	2	6	28445	28450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546477
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635	NC_011368	GGCA	2	8	28549	28556	25 %	0 %	50 %	25 %	209546477
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739	NC_011368	CGG	2	6	33132	33137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546482
740	NC_011368	CAA	2	6	33175	33180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546482
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748	NC_011368	CG	4	8	33557	33564	0 %	0 %	50 %	50 %	209546483
749	NC_011368	TGA	2	6	33637	33642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546483
750	NC_011368	CAT	2	6	33646	33651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546483
751	NC_011368	GTT	2	6	33725	33730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546483
752	NC_011368	GTC	2	6	33732	33737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546483
753	NC_011368	CGC	2	6	33754	33759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546483
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756	NC_011368	CGA	2	6	33940	33945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546483
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760	NC_011368	CTG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546483
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872	NC_011368	CGATG	2	10	41384	41393	20 %	20 %	40 %	20 %	209546490
873	NC_011368	GC	3	6	41479	41484	0 %	0 %	50 %	50 %	209546490
874	NC_011368	GCA	2	6	41491	41496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546490
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