MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011366	GA	3	6	184323	184328	50 %	0 %	50 %	0 %	209546156
4002	NC_011366	CGAT	2	8	184334	184341	25 %	25 %	25 %	25 %	209546156
4003	NC_011366	GACGCT	2	12	184459	184470	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4004	NC_011366	CAT	2	6	184575	184580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546156
4005	NC_011366	TTG	3	9	184631	184639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546156
4006	NC_011366	CGGCC	2	10	184661	184670	0 %	0 %	40 %	60 %	209546156
4007	NC_011366	GCA	2	6	184713	184718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4008	NC_011366	CGT	2	6	184731	184736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4009	NC_011366	GAC	2	6	184789	184794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4010	NC_011366	CGA	2	6	184884	184889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4011	NC_011366	CAG	2	6	184891	184896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4012	NC_011366	CTG	2	6	184924	184929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4013	NC_011366	CAG	2	6	185068	185073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546156
4014	NC_011366	CGG	2	6	185130	185135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546156
4015	NC_011366	GCC	2	6	185161	185166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
4016	NC_011366	ATC	2	6	185236	185241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546156
4017	NC_011366	CGC	2	6	185272	185277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
4018	NC_011366	GCG	2	6	185285	185290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546156
4019	NC_011366	TCG	2	6	185363	185368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546157
4020	NC_011366	TCA	2	6	185421	185426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546157
4021	NC_011366	CGG	2	6	185442	185447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546157
4022	NC_011366	CTT	2	6	185455	185460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546157
4023	NC_011366	CTTGTC	2	12	185632	185643	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	209546157
4024	NC_011366	GGC	2	6	185657	185662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546157
4025	NC_011366	GCCG	2	8	185746	185753	0 %	0 %	50 %	50 %	209546157
4026	NC_011366	ATA	2	6	185767	185772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546157
4027	NC_011366	GTC	2	6	185776	185781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546157
4028	NC_011366	GCGCCG	2	12	185799	185810	0 %	0 %	50 %	50 %	209546157
4029	NC_011366	CGAT	2	8	185883	185890	25 %	25 %	25 %	25 %	209546157
4030	NC_011366	TGC	2	6	185928	185933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546157
4031	NC_011366	GCC	2	6	186797	186802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546158
4032	NC_011366	GCC	2	6	186861	186866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546158
4033	NC_011366	CGCC	2	8	186874	186881	0 %	0 %	25 %	75 %	209546158
4034	NC_011366	GAA	2	6	186897	186902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546158
4035	NC_011366	CGA	2	6	186905	186910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4036	NC_011366	GC	3	6	186928	186933	0 %	0 %	50 %	50 %	209546158
4037	NC_011366	GGC	2	6	186983	186988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546158
4038	NC_011366	CAA	2	6	186997	187002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546158
4039	NC_011366	CGGC	2	8	187006	187013	0 %	0 %	50 %	50 %	209546158
4040	NC_011366	CCG	2	6	187058	187063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546158
4041	NC_011366	CTG	2	6	187080	187085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4042	NC_011366	CGA	2	6	187096	187101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4043	NC_011366	ATC	2	6	187125	187130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546158
4044	NC_011366	CGG	2	6	187139	187144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546158
4045	NC_011366	CAG	2	6	187224	187229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4046	NC_011366	TCG	2	6	187234	187239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4047	NC_011366	GCGG	2	8	187277	187284	0 %	0 %	75 %	25 %	209546158
4048	NC_011366	GCT	2	6	187333	187338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4049	NC_011366	CCTG	2	8	187345	187352	0 %	25 %	25 %	50 %	209546158
4050	NC_011366	GAG	2	6	187434	187439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546158
4051	NC_011366	GCA	2	6	187440	187445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546158
4052	NC_011366	TGCAC	2	10	187490	187499	20 %	20 %	20 %	40 %	209546158
4053	NC_011366	CGG	2	6	187540	187545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546158
4054	NC_011366	GC	3	6	187622	187627	0 %	0 %	50 %	50 %	209546159
4055	NC_011366	CGG	2	6	187639	187644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546159
4056	NC_011366	CGA	2	6	187647	187652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546159
4057	NC_011366	GAT	2	6	187690	187695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546159
4058	NC_011366	ACG	2	6	187755	187760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546159
4059	NC_011366	GGC	2	6	187768	187773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546159
4060	NC_011366	AGG	2	6	187809	187814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546159
4061	NC_011366	GAT	2	6	187840	187845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546159
4062	NC_011366	TCG	2	6	187914	187919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546159
4063	NC_011366	AGC	2	6	187971	187976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546159
4064	NC_011366	TGG	2	6	188004	188009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546159
4065	NC_011366	GTCG	2	8	188026	188033	0 %	25 %	50 %	25 %	209546159
4066	NC_011366	CGG	2	6	188038	188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546159
4067	NC_011366	AGC	2	6	188134	188139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546159
4068	NC_011366	CGC	2	6	188144	188149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546159
4069	NC_011366	CGC	2	6	188152	188157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546159
4070	NC_011366	GCG	2	6	188222	188227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4071	NC_011366	CCGC	2	8	188258	188265	0 %	0 %	25 %	75 %	209546160
4072	NC_011366	GCG	2	6	188324	188329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4073	NC_011366	CCG	2	6	188487	188492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546160
4074	NC_011366	TGA	2	6	188519	188524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546160
4075	NC_011366	GCC	2	6	188539	188544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546160
4076	NC_011366	CTG	2	6	188545	188550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4077	NC_011366	GCT	2	6	188583	188588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4078	NC_011366	GCT	2	6	188601	188606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4079	NC_011366	CCTG	2	8	188616	188623	0 %	25 %	25 %	50 %	209546160
4080	NC_011366	GCC	3	9	188626	188634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546160
4081	NC_011366	CTG	2	6	188635	188640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4082	NC_011366	GGC	2	6	188673	188678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4083	NC_011366	AGC	2	6	188687	188692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4084	NC_011366	GC	4	8	188694	188701	0 %	0 %	50 %	50 %	209546160
4085	NC_011366	CGGCC	2	10	188703	188712	0 %	0 %	40 %	60 %	209546160
4086	NC_011366	GGC	2	6	188728	188733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4087	NC_011366	CGA	2	6	188745	188750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4088	NC_011366	CGG	2	6	188800	188805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4089	NC_011366	GGC	2	6	188856	188861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546160
4090	NC_011366	TCGCCA	2	12	188897	188908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546160
4091	NC_011366	CGC	3	9	188931	188939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546160
4092	NC_011366	GCA	2	6	188976	188981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546160
4093	NC_011366	C	6	6	189320	189325	0 %	0 %	0 %	100 %	209546161
4094	NC_011366	TCG	3	9	189337	189345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546161
4095	NC_011366	CAG	2	6	189357	189362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546161
4096	NC_011366	TGCC	2	8	189416	189423	0 %	25 %	25 %	50 %	209546161
4097	NC_011366	CGG	2	6	189437	189442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546161
4098	NC_011366	GCT	2	6	189446	189451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546161
4099	NC_011366	ACGAC	2	10	189466	189475	40 %	0 %	20 %	40 %	209546161
4100	NC_011366	GC	3	6	189477	189482	0 %	0 %	50 %	50 %	209546161
4101	NC_011366	CTT	2	6	189485	189490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546161
4102	NC_011366	GCCT	2	8	189552	189559	0 %	25 %	25 %	50 %	209546161
4103	NC_011366	ATGCCT	2	12	189583	189594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209546161
4104	NC_011366	TCG	2	6	189757	189762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4105	NC_011366	GAA	2	6	189789	189794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546162
4106	NC_011366	CGGC	2	8	189836	189843	0 %	0 %	50 %	50 %	209546162
4107	NC_011366	CGA	2	6	189908	189913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4108	NC_011366	GGC	2	6	189939	189944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546162
4109	NC_011366	GCA	2	6	189950	189955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4110	NC_011366	GC	3	6	190011	190016	0 %	0 %	50 %	50 %	209546162
4111	NC_011366	A	6	6	190035	190040	100 %	0 %	0 %	0 %	209546162
4112	NC_011366	TCC	2	6	190053	190058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546162
4113	NC_011366	GAT	2	6	190073	190078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546162
4114	NC_011366	GCT	2	6	190102	190107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4115	NC_011366	GAC	2	6	190133	190138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4116	NC_011366	CGC	2	6	190187	190192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546162
4117	NC_011366	TGA	2	6	190243	190248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546162
4118	NC_011366	CG	3	6	190269	190274	0 %	0 %	50 %	50 %	209546162
4119	NC_011366	CGCT	2	8	190324	190331	0 %	25 %	25 %	50 %	209546162
4120	NC_011366	GTC	2	6	190392	190397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546162
4121	NC_011366	ACG	2	6	190447	190452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546162
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4123	NC_011366	GCC	2	6	190620	190625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546162
4124	NC_011366	GACG	2	8	190634	190641	25 %	0 %	50 %	25 %	209546162
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4239	NC_011366	GCG	2	6	195275	195280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546167
4240	NC_011366	CG	3	6	195279	195284	0 %	0 %	50 %	50 %	209546167
4241	NC_011366	GCCG	2	8	195305	195312	0 %	0 %	50 %	50 %	209546167
4242	NC_011366	GGCGCT	2	12	195313	195324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209546167
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4245	NC_011366	GCG	2	6	195428	195433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546167
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4353	NC_011366	CCGGCG	2	12	200037	200048	0 %	0 %	50 %	50 %	209546173
4354	NC_011366	ACCA	2	8	200060	200067	50 %	0 %	0 %	50 %	209546173
4355	NC_011366	GAC	2	6	200078	200083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546173
4356	NC_011366	TC	3	6	200119	200124	0 %	50 %	0 %	50 %	209546173
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4359	NC_011366	CGG	2	6	200241	200246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546173
4360	NC_011366	TGA	2	6	200292	200297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546173
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4362	NC_011366	CGG	2	6	200342	200347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546173
4363	NC_011366	CGA	2	6	200383	200388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546173
4364	NC_011366	ATC	2	6	200444	200449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546173
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4367	NC_011366	TGA	2	6	200538	200543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546173
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4387	NC_011366	GCG	2	6	201546	201551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546174
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4389	NC_011366	GCG	2	6	201621	201626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546174
4390	NC_011366	CCAT	2	8	201643	201650	25 %	25 %	0 %	50 %	209546174
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4464	NC_011366	GGCGC	2	10	205146	205155	0 %	0 %	60 %	40 %	209546179
4465	NC_011366	TTG	2	6	205210	205215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546179
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4469	NC_011366	GAC	2	6	205529	205534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546180
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4474	NC_011366	GGC	3	9	205794	205802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546181
4475	NC_011366	TGC	2	6	205806	205811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546181
4476	NC_011366	CGC	2	6	205845	205850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546181
4477	NC_011366	CCG	2	6	205853	205858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546181
4478	NC_011366	GCC	2	6	205861	205866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546181
4479	NC_011366	AGCCCC	2	12	205876	205887	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	209546181
4480	NC_011366	CCA	2	6	205898	205903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546181
4481	NC_011366	CAGG	2	8	205932	205939	25 %	0 %	50 %	25 %	209546181
4482	NC_011366	GGC	2	6	205959	205964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546181
4483	NC_011366	GCCC	2	8	205980	205987	0 %	0 %	25 %	75 %	209546181
4484	NC_011366	CTT	2	6	206019	206024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546181
4485	NC_011366	GCA	2	6	206117	206122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546181
4486	NC_011366	GCC	2	6	206158	206163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546181
4487	NC_011366	GC	3	6	206243	206248	0 %	0 %	50 %	50 %	209546181
4488	NC_011366	GGA	2	6	206265	206270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546181
4489	NC_011366	GATC	2	8	206424	206431	25 %	25 %	25 %	25 %	209546182
4490	NC_011366	GCG	2	6	206432	206437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546182
4491	NC_011366	TCG	2	6	206453	206458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
4492	NC_011366	GCT	2	6	206493	206498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546182
4493	NC_011366	ACG	2	6	206614	206619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
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4495	NC_011366	CCT	2	6	206661	206666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546182
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4499	NC_011366	CGA	2	6	206823	206828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546182
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