MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011366	CCG	2	6	161854	161859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546141
3502	NC_011366	GC	3	6	161880	161885	0 %	0 %	50 %	50 %	209546141
3503	NC_011366	GCC	2	6	161921	161926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546141
3504	NC_011366	CGA	3	9	161929	161937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546141
3505	NC_011366	CCG	2	6	161982	161987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546141
3506	NC_011366	GA	3	6	162048	162053	50 %	0 %	50 %	0 %	209546141
3507	NC_011366	AGG	2	6	162084	162089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546141
3508	NC_011366	CGC	2	6	162112	162117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546141
3509	NC_011366	GTG	2	6	162138	162143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546141
3510	NC_011366	GCG	2	6	162175	162180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546141
3511	NC_011366	GCC	2	6	162185	162190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546141
3512	NC_011366	AAT	2	6	162199	162204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546141
3513	NC_011366	AGCC	2	8	162298	162305	25 %	0 %	25 %	50 %	209546142
3514	NC_011366	GGCCC	2	10	162328	162337	0 %	0 %	40 %	60 %	209546142
3515	NC_011366	CCA	2	6	162409	162414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546142
3516	NC_011366	CGG	2	6	162429	162434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3517	NC_011366	CGG	2	6	162454	162459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3518	NC_011366	TGC	2	6	162483	162488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3519	NC_011366	CGG	2	6	162502	162507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3520	NC_011366	CG	3	6	162508	162513	0 %	0 %	50 %	50 %	209546142
3521	NC_011366	CGA	2	6	162523	162528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3522	NC_011366	CTG	2	6	162620	162625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3523	NC_011366	TGA	2	6	162643	162648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546142
3524	NC_011366	CGA	2	6	162694	162699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3525	NC_011366	GCGCTG	2	12	162740	162751	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209546142
3526	NC_011366	GCC	2	6	162752	162757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546142
3527	NC_011366	CGC	2	6	162779	162784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546142
3528	NC_011366	GA	3	6	162795	162800	50 %	0 %	50 %	0 %	209546142
3529	NC_011366	CAG	2	6	162812	162817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3530	NC_011366	CGA	2	6	162823	162828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3531	NC_011366	CG	3	6	162843	162848	0 %	0 %	50 %	50 %	209546142
3532	NC_011366	CACC	2	8	162889	162896	25 %	0 %	0 %	75 %	209546142
3533	NC_011366	ATC	2	6	162936	162941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546142
3534	NC_011366	TCCT	2	8	162969	162976	0 %	50 %	0 %	50 %	209546142
3535	NC_011366	CGA	2	6	163003	163008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3536	NC_011366	ATG	2	6	163041	163046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546142
3537	NC_011366	GC	3	6	163047	163052	0 %	0 %	50 %	50 %	209546142
3538	NC_011366	CGT	2	6	163055	163060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3539	NC_011366	TTC	2	6	163200	163205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546142
3540	NC_011366	CGG	2	6	163237	163242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3541	NC_011366	ACC	2	6	163281	163286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546142
3542	NC_011366	GGC	2	6	163306	163311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3543	NC_011366	CGAGC	2	10	163319	163328	20 %	0 %	40 %	40 %	209546142
3544	NC_011366	CGG	2	6	163387	163392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3545	NC_011366	CGC	2	6	163414	163419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546142
3546	NC_011366	CAC	2	6	163427	163432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546142
3547	NC_011366	CGA	2	6	163453	163458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3548	NC_011366	TGA	2	6	163474	163479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546142
3549	NC_011366	CTC	3	9	163496	163504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546142
3550	NC_011366	GCA	2	6	163507	163512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3551	NC_011366	TGA	2	6	163516	163521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546142
3552	NC_011366	CGT	2	6	163559	163564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3553	NC_011366	TCG	2	6	163569	163574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3554	NC_011366	CGGC	2	8	163589	163596	0 %	0 %	50 %	50 %	209546142
3555	NC_011366	ATC	2	6	163614	163619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546142
3556	NC_011366	GCC	2	6	163634	163639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546142
3557	NC_011366	TCG	2	6	163659	163664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3558	NC_011366	GGC	2	6	163673	163678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546142
3559	NC_011366	CAG	2	6	163700	163705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3560	NC_011366	AGC	2	6	163755	163760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3561	NC_011366	ATC	2	6	163824	163829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546142
3562	NC_011366	CAG	2	6	163877	163882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3563	NC_011366	CGA	2	6	163987	163992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3564	NC_011366	CGT	2	6	164072	164077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546142
3565	NC_011366	TCGA	2	8	164112	164119	25 %	25 %	25 %	25 %	209546142
3566	NC_011366	GCA	2	6	164176	164181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546143
3567	NC_011366	GAT	2	6	164225	164230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546143
3568	NC_011366	GC	4	8	164241	164248	0 %	0 %	50 %	50 %	209546143
3569	NC_011366	GAT	2	6	164357	164362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546143
3570	NC_011366	CGG	2	6	164363	164368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546143
3571	NC_011366	CGA	2	6	164428	164433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546143
3572	NC_011366	TTG	2	6	164457	164462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546143
3573	NC_011366	GC	3	6	164482	164487	0 %	0 %	50 %	50 %	209546143
3574	NC_011366	GA	3	6	164528	164533	50 %	0 %	50 %	0 %	209546143
3575	NC_011366	CCGG	2	8	164681	164688	0 %	0 %	50 %	50 %	209546143
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3579	NC_011366	CAG	2	6	164849	164854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546143
3580	NC_011366	CGA	2	6	164863	164868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546143
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3588	NC_011366	GCCG	2	8	165131	165138	0 %	0 %	50 %	50 %	209546143
3589	NC_011366	CGC	2	6	165166	165171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546143
3590	NC_011366	CTTGC	2	10	165195	165204	0 %	40 %	20 %	40 %	209546143
3591	NC_011366	CGA	2	6	165223	165228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546143
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3599	NC_011366	TGA	2	6	165559	165564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546144
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3601	NC_011366	CGGCA	2	10	165587	165596	20 %	0 %	40 %	40 %	209546144
3602	NC_011366	AGC	2	6	165609	165614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546144
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3604	NC_011366	GA	3	6	165636	165641	50 %	0 %	50 %	0 %	209546144
3605	NC_011366	CAT	2	6	165652	165657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546144
3606	NC_011366	CG	3	6	165763	165768	0 %	0 %	50 %	50 %	209546144
3607	NC_011366	CCA	2	6	165802	165807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546144
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3614	NC_011366	GGC	2	6	166111	166116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546145
3615	NC_011366	CGG	2	6	166117	166122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546145
3616	NC_011366	ATC	2	6	166125	166130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546145
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3620	NC_011366	ATG	2	6	166269	166274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546145
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3964	NC_011366	T	7	7	182124	182130	0 %	100 %	0 %	0 %	209546153
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3967	NC_011366	ATG	2	6	182388	182393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546153
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3970	NC_011366	GACCG	2	10	182826	182835	20 %	0 %	40 %	40 %	209546154
3971	NC_011366	CG	3	6	182855	182860	0 %	0 %	50 %	50 %	209546154
3972	NC_011366	CAC	2	6	182883	182888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546154
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3978	NC_011366	CCCG	2	8	183485	183492	0 %	0 %	25 %	75 %	209546155
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3980	NC_011366	GGT	2	6	183582	183587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546155
3981	NC_011366	CCG	2	6	183638	183643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
3982	NC_011366	TCG	2	6	183650	183655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546156
3983	NC_011366	GCT	2	6	183658	183663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546156
3984	NC_011366	CAA	2	6	183666	183671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546156
3985	NC_011366	GCC	2	6	183703	183708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
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3987	NC_011366	CGC	2	6	183744	183749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
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3989	NC_011366	ATT	2	6	183895	183900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209546156
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3991	NC_011366	CCG	2	6	183944	183949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546156
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