MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011366	CGC	2	6	45651	45656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1002	NC_011366	CCG	2	6	45680	45685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1003	NC_011366	TCT	2	6	45737	45742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1004	NC_011366	CTG	2	6	45756	45761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1005	NC_011366	TTC	3	9	45766	45774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1006	NC_011366	TCG	2	6	45833	45838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1007	NC_011366	CGG	2	6	45864	45869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1008	NC_011366	GCCG	2	8	45880	45887	0 %	0 %	50 %	50 %	209546042
1009	NC_011366	CGT	2	6	45888	45893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1010	NC_011366	TCG	2	6	45905	45910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1011	NC_011366	TGA	2	6	45914	45919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546042
1012	NC_011366	CAT	2	6	45939	45944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
1013	NC_011366	GTC	2	6	45960	45965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1014	NC_011366	GGCT	2	8	45994	46001	0 %	25 %	50 %	25 %	209546042
1015	NC_011366	CGG	2	6	46104	46109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1016	NC_011366	CTT	2	6	46113	46118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546042
1017	NC_011366	CAT	2	6	46146	46151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546042
1018	NC_011366	CGGCGC	2	12	46284	46295	0 %	0 %	50 %	50 %	209546042
1019	NC_011366	CGC	2	6	46341	46346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546042
1020	NC_011366	CGG	2	6	46389	46394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1021	NC_011366	TCG	2	6	46430	46435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1022	NC_011366	AAG	2	6	46453	46458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546042
1023	NC_011366	TGC	2	6	46466	46471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546042
1024	NC_011366	CGG	2	6	46488	46493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546042
1025	NC_011366	GCC	2	6	46646	46651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546043
1026	NC_011366	GCC	2	6	46679	46684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546043
1027	NC_011366	TCG	2	6	46746	46751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1028	NC_011366	GAGCTT	2	12	46754	46765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209546043
1029	NC_011366	GCC	2	6	46839	46844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546043
1030	NC_011366	CAG	2	6	46903	46908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1031	NC_011366	GAT	2	6	46910	46915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546043
1032	NC_011366	GTTC	2	8	46923	46930	0 %	50 %	25 %	25 %	209546043
1033	NC_011366	GCG	2	6	46942	46947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546043
1034	NC_011366	CGC	3	9	46957	46965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546043
1035	NC_011366	TCG	2	6	47007	47012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1036	NC_011366	CAGC	2	8	47030	47037	25 %	0 %	25 %	50 %	209546043
1037	NC_011366	GCG	2	6	47047	47052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546043
1038	NC_011366	CGA	2	6	47092	47097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1039	NC_011366	CAG	2	6	47120	47125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1040	NC_011366	CGGG	2	8	47150	47157	0 %	0 %	75 %	25 %	209546043
1041	NC_011366	CG	3	6	47164	47169	0 %	0 %	50 %	50 %	209546043
1042	NC_011366	TGA	2	6	47243	47248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546043
1043	NC_011366	TCG	2	6	47256	47261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1044	NC_011366	GCAT	2	8	47304	47311	25 %	25 %	25 %	25 %	209546043
1045	NC_011366	GGC	2	6	47341	47346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546043
1046	NC_011366	TCG	2	6	47355	47360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1047	NC_011366	GGC	2	6	47377	47382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546043
1048	NC_011366	TGG	2	6	47431	47436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546043
1049	NC_011366	CGA	2	6	47437	47442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1050	NC_011366	TCGG	2	8	47457	47464	0 %	25 %	50 %	25 %	209546043
1051	NC_011366	GC	3	6	47465	47470	0 %	0 %	50 %	50 %	209546043
1052	NC_011366	CAGC	2	8	47474	47481	25 %	0 %	25 %	50 %	209546043
1053	NC_011366	GAT	2	6	47486	47491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546043
1054	NC_011366	CGG	2	6	47521	47526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546043
1055	NC_011366	GCC	2	6	47540	47545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546043
1056	NC_011366	TCG	2	6	47559	47564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1057	NC_011366	AGC	2	6	47565	47570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1058	NC_011366	TCG	2	6	47586	47591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1059	NC_011366	GAC	2	6	47633	47638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546043
1060	NC_011366	GAC	2	6	47904	47909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1061	NC_011366	CGG	2	6	47929	47934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1062	NC_011366	CG	5	10	47976	47985	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1063	NC_011366	AGA	2	6	48004	48009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546044
1064	NC_011366	TGCGG	2	10	48021	48030	0 %	20 %	60 %	20 %	209546044
1065	NC_011366	CG	3	6	48038	48043	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1066	NC_011366	ATAGGA	2	12	48068	48079	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	209546044
1067	NC_011366	GCC	2	6	48080	48085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546044
1068	NC_011366	CGC	2	6	48116	48121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546044
1069	NC_011366	GCC	2	6	48159	48164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546044
1070	NC_011366	CGG	2	6	48172	48177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1071	NC_011366	GGC	2	6	48188	48193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1072	NC_011366	CGA	2	6	48247	48252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1073	NC_011366	CGGC	2	8	48325	48332	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1074	NC_011366	CCT	2	6	48337	48342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546044
1075	NC_011366	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1076	NC_011366	CGC	3	9	48392	48400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546044
1077	NC_011366	TCT	2	6	48406	48411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546044
1078	NC_011366	AGGG	2	8	48418	48425	25 %	0 %	75 %	0 %	209546044
1079	NC_011366	CGG	2	6	48442	48447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1080	NC_011366	TCG	2	6	48457	48462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1081	NC_011366	CG	3	6	48479	48484	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1082	NC_011366	CGGC	2	8	48522	48529	0 %	0 %	50 %	50 %	209546044
1083	NC_011366	GGT	2	6	48535	48540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546044
1084	NC_011366	GGGCCA	2	12	48633	48644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209546044
1085	NC_011366	CGA	2	6	48664	48669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1086	NC_011366	TCA	2	6	48771	48776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546044
1087	NC_011366	GCG	2	6	48825	48830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1088	NC_011366	CCA	2	6	48864	48869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546044
1089	NC_011366	TCG	2	6	48909	48914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1090	NC_011366	CAGC	2	8	48950	48957	25 %	0 %	25 %	50 %	209546044
1091	NC_011366	GCT	2	6	48984	48989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1092	NC_011366	GCC	2	6	49016	49021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546044
1093	NC_011366	CAG	3	9	49040	49048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1094	NC_011366	CGGA	2	8	49061	49068	25 %	0 %	50 %	25 %	209546044
1095	NC_011366	CGG	2	6	49099	49104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546044
1096	NC_011366	GAT	2	6	49115	49120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546044
1097	NC_011366	GAC	2	6	49121	49126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546044
1098	NC_011366	AG	3	6	49289	49294	50 %	0 %	50 %	0 %	209546045
1099	NC_011366	GC	4	8	49342	49349	0 %	0 %	50 %	50 %	209546045
1100	NC_011366	GCCG	2	8	49358	49365	0 %	0 %	50 %	50 %	209546045
1101	NC_011366	GCCG	2	8	49374	49381	0 %	0 %	50 %	50 %	209546045
1102	NC_011366	GC	3	6	49402	49407	0 %	0 %	50 %	50 %	209546045
1103	NC_011366	AG	3	6	49416	49421	50 %	0 %	50 %	0 %	209546045
1104	NC_011366	TCC	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546045
1105	NC_011366	ATC	2	6	49549	49554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546045
1106	NC_011366	CGA	2	6	49581	49586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1107	NC_011366	CGG	2	6	49590	49595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546045
1108	NC_011366	TCG	2	6	49607	49612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1109	NC_011366	GGC	2	6	49621	49626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546045
1110	NC_011366	GCA	2	6	49629	49634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1111	NC_011366	CGATG	2	10	49683	49692	20 %	20 %	40 %	20 %	209546045
1112	NC_011366	ATC	2	6	49753	49758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546045
1113	NC_011366	CGA	2	6	49802	49807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1114	NC_011366	GGCCTG	2	12	49821	49832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209546045
1115	NC_011366	TCG	2	6	49892	49897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1116	NC_011366	CG	3	6	49927	49932	0 %	0 %	50 %	50 %	209546045
1117	NC_011366	GAC	2	6	49936	49941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546045
1118	NC_011366	GCCA	2	8	50014	50021	25 %	0 %	25 %	50 %	209546045
1119	NC_011366	CGCATC	2	12	50029	50040	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546045
1120	NC_011366	GACG	2	8	50113	50120	25 %	0 %	50 %	25 %	209546045
1121	NC_011366	TGG	2	6	50131	50136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546045
1122	NC_011366	CCG	2	6	50215	50220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546045
1123	NC_011366	GC	3	6	50519	50524	0 %	0 %	50 %	50 %	209546046
1124	NC_011366	GAC	2	6	50531	50536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546046
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1132	NC_011366	GC	3	6	51434	51439	0 %	0 %	50 %	50 %	209546047
1133	NC_011366	GCCG	2	8	51454	51461	0 %	0 %	50 %	50 %	209546047
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1375	NC_011366	TCG	2	6	62762	62767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546054
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1495	NC_011366	CGAA	2	8	69543	69550	50 %	0 %	25 %	25 %	209546060
1496	NC_011366	CGC	2	6	69561	69566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546060
1497	NC_011366	CGG	2	6	69573	69578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546060
1498	NC_011366	CGG	2	6	69609	69614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546060
1499	NC_011366	GGCC	2	8	69658	69665	0 %	0 %	50 %	50 %	209546060
1500	NC_011366	GCC	2	6	69691	69696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546060

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