MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011366	TGA	2	6	248633	248638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546220
5502	NC_011366	CGC	2	6	248673	248678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546220
5503	NC_011366	TCG	2	6	248765	248770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5504	NC_011366	GCG	2	6	248777	248782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546220
5505	NC_011366	CGC	2	6	248850	248855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546220
5506	NC_011366	CGA	2	6	248894	248899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5507	NC_011366	TCG	2	6	248912	248917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5508	NC_011366	AGC	2	6	248927	248932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5509	NC_011366	TGA	2	6	248936	248941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546220
5510	NC_011366	CG	3	6	248942	248947	0 %	0 %	50 %	50 %	209546220
5511	NC_011366	GC	3	6	248948	248953	0 %	0 %	50 %	50 %	209546220
5512	NC_011366	GAC	2	6	248955	248960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5513	NC_011366	CAT	2	6	248997	249002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546220
5514	NC_011366	CAT	2	6	249048	249053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546220
5515	NC_011366	CGC	2	6	249065	249070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546220
5516	NC_011366	ATC	2	6	249091	249096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546220
5517	NC_011366	TCG	2	6	249113	249118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5518	NC_011366	CGGCGC	2	12	249162	249173	0 %	0 %	50 %	50 %	209546220
5519	NC_011366	CTG	2	6	249190	249195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5520	NC_011366	CGG	2	6	249207	249212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546220
5521	NC_011366	CAT	2	6	249213	249218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546220
5522	NC_011366	CGG	2	6	249313	249318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546221
5523	NC_011366	TCG	2	6	249328	249333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546221
5524	NC_011366	CCA	2	6	249334	249339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546221
5525	NC_011366	GGC	2	6	249380	249385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546221
5526	NC_011366	GAA	2	6	249428	249433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546221
5527	NC_011366	CAGA	2	8	249478	249485	50 %	0 %	25 %	25 %	209546221
5528	NC_011366	GCC	3	9	249528	249536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546221
5529	NC_011366	CCAG	2	8	249562	249569	25 %	0 %	25 %	50 %	209546221
5530	NC_011366	GGC	2	6	249611	249616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546221
5531	NC_011366	CCG	2	6	249637	249642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546221
5532	NC_011366	GCC	2	6	249693	249698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546221
5533	NC_011366	GC	3	6	249726	249731	0 %	0 %	50 %	50 %	209546221
5534	NC_011366	GAC	2	6	250049	250054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5535	NC_011366	CG	3	6	250116	250121	0 %	0 %	50 %	50 %	209546222
5536	NC_011366	GCC	2	6	250145	250150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5537	NC_011366	TGC	2	6	250176	250181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5538	NC_011366	TGT	2	6	250216	250221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546222
5539	NC_011366	CGT	2	6	250228	250233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5540	NC_011366	GCT	2	6	250264	250269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5541	NC_011366	ATC	2	6	250283	250288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
5542	NC_011366	GCT	2	6	250318	250323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5543	NC_011366	GAG	2	6	250325	250330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546222
5544	NC_011366	CGA	2	6	250378	250383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5545	NC_011366	GCC	2	6	250410	250415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5546	NC_011366	GCT	2	6	250444	250449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5547	NC_011366	ACG	2	6	250506	250511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5548	NC_011366	ATC	2	6	250562	250567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
5549	NC_011366	CGA	2	6	250576	250581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5550	NC_011366	ATC	2	6	250589	250594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
5551	NC_011366	TCA	2	6	250614	250619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
5552	NC_011366	CGA	2	6	250744	250749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5553	NC_011366	GCT	2	6	250753	250758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5554	NC_011366	GCG	2	6	250796	250801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546222
5555	NC_011366	ATC	2	6	250827	250832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
5556	NC_011366	GCG	2	6	250898	250903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546222
5557	NC_011366	AACC	2	8	250915	250922	50 %	0 %	0 %	50 %	209546222
5558	NC_011366	CATCG	2	10	250957	250966	20 %	20 %	20 %	40 %	209546222
5559	NC_011366	CGG	2	6	250990	250995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546222
5560	NC_011366	CGA	2	6	251029	251034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5561	NC_011366	CGCCA	2	10	251042	251051	20 %	0 %	20 %	60 %	209546222
5562	NC_011366	CAA	2	6	251056	251061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546222
5563	NC_011366	GC	3	6	251082	251087	0 %	0 %	50 %	50 %	209546222
5564	NC_011366	GAA	2	6	251089	251094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546222
5565	NC_011366	TGG	2	6	251111	251116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546222
5566	NC_011366	CGA	2	6	251131	251136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5567	NC_011366	CAC	2	6	251197	251202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209546222
5568	NC_011366	CG	4	8	251203	251210	0 %	0 %	50 %	50 %	209546222
5569	NC_011366	GGC	2	6	251218	251223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546222
5570	NC_011366	CGC	2	6	251232	251237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5571	NC_011366	CTG	2	6	251258	251263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5572	NC_011366	TGC	2	6	251373	251378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5573	NC_011366	GC	3	6	251415	251420	0 %	0 %	50 %	50 %	209546222
5574	NC_011366	CTT	4	12	251431	251442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546222
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5577	NC_011366	CAT	2	6	251515	251520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
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5580	NC_011366	GAA	2	6	251608	251613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546222
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5582	NC_011366	CGT	2	6	251689	251694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5585	NC_011366	GCA	2	6	251715	251720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5587	NC_011366	CGA	2	6	251758	251763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5589	NC_011366	CGC	2	6	251806	251811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5590	NC_011366	CCG	2	6	251877	251882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5591	NC_011366	GCT	2	6	251923	251928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5593	NC_011366	GCT	2	6	251947	251952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5601	NC_011366	GGA	2	6	252151	252156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546222
5602	NC_011366	CGT	2	6	252181	252186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546222
5603	NC_011366	CGA	2	6	252187	252192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546222
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5606	NC_011366	CCG	2	6	252360	252365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546222
5607	NC_011366	ATC	2	6	252458	252463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546222
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5612	NC_011366	GT	3	6	252549	252554	0 %	50 %	50 %	0 %	209546222
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5739	NC_011366	CCAGCG	2	12	258562	258573	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209546229
5740	NC_011366	TGC	3	9	258612	258620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546229
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5843	NC_011366	CAT	2	6	262732	262737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546233
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5855	NC_011366	GAA	2	6	263254	263259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546233
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5972	NC_011366	GAACA	2	10	269105	269114	60 %	0 %	20 %	20 %	209546239
5973	NC_011366	CGCC	2	8	269119	269126	0 %	0 %	25 %	75 %	209546239
5974	NC_011366	CGG	2	6	269170	269175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546239
5975	NC_011366	CGA	2	6	269275	269280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546239
5976	NC_011366	CCGAT	2	10	269343	269352	20 %	20 %	20 %	40 %	209546239
5977	NC_011366	GCA	2	6	269520	269525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546240
5978	NC_011366	CGG	2	6	269544	269549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546240
5979	NC_011366	CGA	2	6	269554	269559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546240
5980	NC_011366	CGC	2	6	269566	269571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546240
5981	NC_011366	CCG	2	6	269597	269602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546240
5982	NC_011366	CCGCAT	2	12	269620	269631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546240
5983	NC_011366	CGGT	2	8	269633	269640	0 %	25 %	50 %	25 %	209546240
5984	NC_011366	GCCTGC	2	12	269657	269668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546240
5985	NC_011366	GC	5	10	269676	269685	0 %	0 %	50 %	50 %	209546240
5986	NC_011366	CTC	2	6	269728	269733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546240
5987	NC_011366	CGG	3	9	269826	269834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546240
5988	NC_011366	CGA	2	6	269848	269853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546240
5989	NC_011366	CGC	2	6	269893	269898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546240
5990	NC_011366	GTCG	2	8	269925	269932	0 %	25 %	50 %	25 %	209546240
5991	NC_011366	ATA	2	6	269936	269941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546240
5992	NC_011366	GAT	2	6	269977	269982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546240
5993	NC_011366	ATC	2	6	270011	270016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546240
5994	NC_011366	GAT	2	6	270210	270215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546241
5995	NC_011366	CTT	2	6	270268	270273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546241
5996	NC_011366	GGC	2	6	270292	270297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546241
5997	NC_011366	CA	3	6	270309	270314	50 %	0 %	0 %	50 %	209546241
5998	NC_011366	GCC	2	6	270319	270324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546241
5999	NC_011366	TCG	2	6	270343	270348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546241
6000	NC_011366	CAT	2	6	270429	270434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546241

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