MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_011004	GAT	2	6	169057	169062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288586
4002	NC_011004	TCA	2	6	169077	169082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288586
4003	NC_011004	GATCG	2	10	169156	169165	20 %	20 %	40 %	20 %	192288586
4004	NC_011004	GTC	2	6	169207	169212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288586
4005	NC_011004	CAC	2	6	169228	169233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288586
4006	NC_011004	GCG	2	6	169237	169242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288586
4007	NC_011004	GAA	2	6	169509	169514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288587
4008	NC_011004	CGA	2	6	169534	169539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288587
4009	NC_011004	CCG	2	6	169558	169563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288587
4010	NC_011004	CG	3	6	169566	169571	0 %	0 %	50 %	50 %	192288587
4011	NC_011004	GCCGAA	2	12	169572	169583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288587
4012	NC_011004	AGC	2	6	169603	169608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288587
4013	NC_011004	TCG	2	6	169621	169626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288587
4014	NC_011004	CCG	2	6	169634	169639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288587
4015	NC_011004	GCCGTC	2	12	169803	169814	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288588
4016	NC_011004	ACGT	2	8	169819	169826	25 %	25 %	25 %	25 %	192288588
4017	NC_011004	CGC	2	6	169890	169895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288588
4018	NC_011004	CG	5	10	169899	169908	0 %	0 %	50 %	50 %	192288588
4019	NC_011004	GGC	2	6	169969	169974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288589
4020	NC_011004	TGC	2	6	169982	169987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4021	NC_011004	GAT	2	6	170019	170024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288589
4022	NC_011004	CAG	2	6	170070	170075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4023	NC_011004	CGG	2	6	170087	170092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288589
4024	NC_011004	ATC	2	6	170101	170106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288589
4025	NC_011004	CAC	2	6	170121	170126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288589
4026	NC_011004	AGCG	2	8	170149	170156	25 %	0 %	50 %	25 %	192288589
4027	NC_011004	CAG	2	6	170166	170171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4028	NC_011004	ACCG	2	8	170172	170179	25 %	0 %	25 %	50 %	192288589
4029	NC_011004	AGC	3	9	170263	170271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4030	NC_011004	CTG	2	6	170283	170288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4031	NC_011004	CAG	2	6	170337	170342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4032	NC_011004	CG	3	6	170456	170461	0 %	0 %	50 %	50 %	192288589
4033	NC_011004	AAC	2	6	170485	170490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288589
4034	NC_011004	CCGA	2	8	170497	170504	25 %	0 %	25 %	50 %	192288589
4035	NC_011004	CGA	2	6	170514	170519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4036	NC_011004	TGA	2	6	170534	170539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288589
4037	NC_011004	GCG	2	6	170669	170674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288589
4038	NC_011004	CAG	2	6	170682	170687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4039	NC_011004	GCA	2	6	170702	170707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4040	NC_011004	CAG	2	6	170709	170714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4041	NC_011004	CCGA	2	8	170719	170726	25 %	0 %	25 %	50 %	192288589
4042	NC_011004	ACG	2	6	170737	170742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4043	NC_011004	CGAA	2	8	170762	170769	50 %	0 %	25 %	25 %	192288589
4044	NC_011004	CAG	2	6	170784	170789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4045	NC_011004	CAG	2	6	170793	170798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288589
4046	NC_011004	GGT	2	6	170835	170840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288589
4047	NC_011004	CGG	2	6	171057	171062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4048	NC_011004	CCG	2	6	171081	171086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288590
4049	NC_011004	CGG	2	6	171105	171110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4050	NC_011004	GGC	2	6	171118	171123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4051	NC_011004	GGC	2	6	171127	171132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4052	NC_011004	CGG	2	6	171135	171140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4053	NC_011004	CAT	2	6	171144	171149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288590
4054	NC_011004	GCC	2	6	171157	171162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288590
4055	NC_011004	CAG	2	6	171196	171201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288590
4056	NC_011004	GGC	2	6	171220	171225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4057	NC_011004	CGG	2	6	171255	171260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4058	NC_011004	CGA	2	6	171303	171308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288590
4059	NC_011004	GGC	2	6	171370	171375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4060	NC_011004	GGC	2	6	171379	171384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288590
4061	NC_011004	TCC	2	6	171406	171411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288590
4062	NC_011004	GAA	2	6	171454	171459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288590
4063	NC_011004	GCC	2	6	171553	171558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288590
4064	NC_011004	CAC	2	6	171585	171590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288590
4065	NC_011004	GTG	2	6	171610	171615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288590
4066	NC_011004	TGC	3	9	171728	171736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288590
4067	NC_011004	AGATCG	2	12	171827	171838	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288590
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4070	NC_011004	AAG	2	6	171913	171918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288590
4071	NC_011004	CGC	2	6	171920	171925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288590
4072	NC_011004	TGC	2	6	171926	171931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288590
4073	NC_011004	TGCG	2	8	171968	171975	0 %	25 %	50 %	25 %	192288590
4074	NC_011004	CCG	2	6	172025	172030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288590
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4077	NC_011004	CTG	2	6	172270	172275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
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4079	NC_011004	TGGC	2	8	172309	172316	0 %	25 %	50 %	25 %	192288591
4080	NC_011004	GGC	2	6	172351	172356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
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4082	NC_011004	GTC	2	6	172374	172379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4083	NC_011004	CGGA	2	8	172395	172402	25 %	0 %	50 %	25 %	192288591
4084	NC_011004	CG	3	6	172418	172423	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4085	NC_011004	GCC	2	6	172450	172455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288591
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4088	NC_011004	CGG	2	6	172561	172566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
4089	NC_011004	CTG	2	6	172600	172605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4090	NC_011004	GC	3	6	172611	172616	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4091	NC_011004	CCA	2	6	172649	172654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288591
4092	NC_011004	GGC	2	6	172686	172691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
4093	NC_011004	GC	3	6	172690	172695	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4094	NC_011004	CCA	2	6	172700	172705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288591
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4099	NC_011004	GGC	2	6	172887	172892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288591
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4101	NC_011004	GATC	2	8	172941	172948	25 %	25 %	25 %	25 %	192288591
4102	NC_011004	GC	3	6	173087	173092	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4103	NC_011004	GC	3	6	173094	173099	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4104	NC_011004	CTG	2	6	173110	173115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288591
4105	NC_011004	CCGG	2	8	173116	173123	0 %	0 %	50 %	50 %	192288591
4106	NC_011004	ACG	2	6	173216	173221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288591
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4113	NC_011004	TGA	2	6	173596	173601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288592
4114	NC_011004	CGC	3	9	173624	173632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288592
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4116	NC_011004	AGA	2	6	173662	173667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288592
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4118	NC_011004	CGA	2	6	173744	173749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4119	NC_011004	CTGACG	2	12	173790	173801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288592
4120	NC_011004	CG	4	8	173804	173811	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4121	NC_011004	GGT	2	6	173837	173842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288592
4122	NC_011004	GTG	2	6	173934	173939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288592
4123	NC_011004	GCG	2	6	174022	174027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
4124	NC_011004	CG	3	6	174051	174056	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4125	NC_011004	CTC	2	6	174153	174158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288592
4126	NC_011004	CG	3	6	174193	174198	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4127	NC_011004	CG	4	8	174215	174222	0 %	0 %	50 %	50 %	192288592
4128	NC_011004	AAGCG	2	10	174227	174236	40 %	0 %	40 %	20 %	192288592
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4130	NC_011004	GCT	2	6	174371	174376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288592
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4133	NC_011004	GCG	2	6	174451	174456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288592
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4241	NC_011004	GCCG	2	8	179261	179268	0 %	0 %	50 %	50 %	192288597
4242	NC_011004	CGA	2	6	179336	179341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288597
4243	NC_011004	GCC	2	6	179366	179371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288597
4244	NC_011004	GAC	2	6	179382	179387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288597
4245	NC_011004	CTG	2	6	179412	179417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288597
4246	NC_011004	ACC	2	6	179460	179465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288597
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4249	NC_011004	CAA	2	6	179498	179503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288597
4250	NC_011004	GGC	2	6	179504	179509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288597
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4254	NC_011004	CGA	2	6	179873	179878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288598
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4260	NC_011004	CCGAA	2	10	179965	179974	40 %	0 %	20 %	40 %	192288598
4261	NC_011004	GCC	2	6	179982	179987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288598
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4264	NC_011004	CGT	2	6	180038	180043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288598
4265	NC_011004	CAG	2	6	180079	180084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288598
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4269	NC_011004	GAC	2	6	180191	180196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288598
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4271	NC_011004	CGGCG	2	10	180263	180272	0 %	0 %	60 %	40 %	192288598
4272	NC_011004	TGA	2	6	180289	180294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288598
4273	NC_011004	GCCG	2	8	180299	180306	0 %	0 %	50 %	50 %	192288598
4274	NC_011004	GCT	2	6	180446	180451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288598
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4276	NC_011004	GC	3	6	180541	180546	0 %	0 %	50 %	50 %	192288598
4277	NC_011004	TCG	2	6	180550	180555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288598
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4282	NC_011004	GCCG	2	8	180710	180717	0 %	0 %	50 %	50 %	192288598
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4291	NC_011004	CGT	2	6	181300	181305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288599
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4301	NC_011004	GCCC	2	8	181775	181782	0 %	0 %	25 %	75 %	192288600
4302	NC_011004	CGT	2	6	181790	181795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288600
4303	NC_011004	CAG	2	6	181818	181823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288600
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4306	NC_011004	CGT	2	6	181964	181969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288600
4307	NC_011004	TCGG	2	8	181981	181988	0 %	25 %	50 %	25 %	192288600
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4309	NC_011004	CGCC	2	8	182003	182010	0 %	0 %	25 %	75 %	192288600
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4312	NC_011004	CGC	2	6	182044	182049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288600
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4314	NC_011004	TCT	2	6	182096	182101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288600
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4320	NC_011004	ACC	2	6	182494	182499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288600
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4324	NC_011004	GCA	2	6	182540	182545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288600
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4345	NC_011004	CGC	2	6	183950	183955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288602
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4347	NC_011004	ATC	2	6	184031	184036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288602
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4349	NC_011004	CGA	2	6	184075	184080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288602
4350	NC_011004	ACG	2	6	184191	184196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288602
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4480	NC_011004	CAC	2	6	190485	190490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288608
4481	NC_011004	GAT	2	6	190512	190517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288608
4482	NC_011004	CCA	4	12	190581	190592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288608
4483	NC_011004	CCA	2	6	190596	190601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288608
4484	NC_011004	AGC	2	6	190636	190641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288608
4485	NC_011004	TAC	2	6	190672	190677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288608
4486	NC_011004	CCGCA	2	10	190695	190704	20 %	0 %	20 %	60 %	192288608
4487	NC_011004	CCG	2	6	190736	190741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288608
4488	NC_011004	CGCAC	2	10	190742	190751	20 %	0 %	20 %	60 %	192288608
4489	NC_011004	CGT	3	9	190797	190805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288608
4490	NC_011004	CG	5	10	190866	190875	0 %	0 %	50 %	50 %	192288608
4491	NC_011004	GCCA	2	8	191149	191156	25 %	0 %	25 %	50 %	192288609
4492	NC_011004	AGT	2	6	191165	191170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288609
4493	NC_011004	CAG	2	6	191202	191207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4494	NC_011004	GCG	2	6	191240	191245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4495	NC_011004	GGC	2	6	191303	191308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4496	NC_011004	GCCG	2	8	191334	191341	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4497	NC_011004	GAT	2	6	191343	191348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288609
4498	NC_011004	CGG	2	6	191370	191375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4499	NC_011004	TCA	2	6	191447	191452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288609
4500	NC_011004	CGC	2	6	191489	191494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609

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