MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011004	CAG	2	6	147923	147928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288567
3502	NC_011004	GCC	2	6	147977	147982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288567
3503	NC_011004	CAG	2	6	148030	148035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288567
3504	NC_011004	CAA	2	6	148130	148135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288567
3505	NC_011004	CG	3	6	148164	148169	0 %	0 %	50 %	50 %	192288567
3506	NC_011004	GCG	2	6	148172	148177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288567
3507	NC_011004	CGG	2	6	148210	148215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288567
3508	NC_011004	CAG	2	6	148223	148228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288567
3509	NC_011004	GCA	2	6	148303	148308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288567
3510	NC_011004	GCG	2	6	148309	148314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288567
3511	NC_011004	GCA	2	6	148345	148350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288567
3512	NC_011004	TCG	3	9	148379	148387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3513	NC_011004	GCC	2	6	148401	148406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288568
3514	NC_011004	GCA	2	6	148419	148424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3515	NC_011004	CGACCA	2	12	148452	148463	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192288568
3516	NC_011004	CGG	2	6	148482	148487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288568
3517	NC_011004	AGC	2	6	148544	148549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3518	NC_011004	CGT	2	6	148585	148590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3519	NC_011004	CAG	2	6	148615	148620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3520	NC_011004	TCAG	2	8	148637	148644	25 %	25 %	25 %	25 %	192288568
3521	NC_011004	GGC	2	6	148747	148752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288568
3522	NC_011004	CAC	3	9	148762	148770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288568
3523	NC_011004	GCC	2	6	148780	148785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288568
3524	NC_011004	CAG	2	6	148792	148797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3525	NC_011004	ACC	2	6	148805	148810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288568
3526	NC_011004	GAT	2	6	148837	148842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288568
3527	NC_011004	GC	3	6	148859	148864	0 %	0 %	50 %	50 %	192288568
3528	NC_011004	CTT	2	6	148869	148874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288568
3529	NC_011004	CGG	2	6	148947	148952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288568
3530	NC_011004	AGC	2	6	148958	148963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3531	NC_011004	GACC	2	8	148968	148975	25 %	0 %	25 %	50 %	192288568
3532	NC_011004	ATC	2	6	148988	148993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288568
3533	NC_011004	CAG	3	9	149074	149082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288568
3534	NC_011004	CG	3	6	149117	149122	0 %	0 %	50 %	50 %	192288568
3535	NC_011004	CGC	2	6	149138	149143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288569
3536	NC_011004	GCCG	2	8	149152	149159	0 %	0 %	50 %	50 %	192288569
3537	NC_011004	CGA	2	6	149161	149166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3538	NC_011004	GTC	2	6	149210	149215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3539	NC_011004	AAC	2	6	149234	149239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288569
3540	NC_011004	GGCA	2	8	149279	149286	25 %	0 %	50 %	25 %	192288569
3541	NC_011004	CGG	2	6	149311	149316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
3542	NC_011004	GCG	2	6	149331	149336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
3543	NC_011004	GGC	2	6	149360	149365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
3544	NC_011004	CGA	2	6	149377	149382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3545	NC_011004	CAG	2	6	149399	149404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3546	NC_011004	GGC	2	6	149458	149463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
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3550	NC_011004	GGC	2	6	149537	149542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
3551	NC_011004	GCA	2	6	149551	149556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3552	NC_011004	CGGC	2	8	149571	149578	0 %	0 %	50 %	50 %	192288569
3553	NC_011004	GCA	2	6	149659	149664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3554	NC_011004	ACA	2	6	149674	149679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288569
3555	NC_011004	CAG	2	6	149705	149710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3556	NC_011004	TGC	2	6	149713	149718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3557	NC_011004	CGAC	2	8	149734	149741	25 %	0 %	25 %	50 %	192288569
3558	NC_011004	CG	3	6	149755	149760	0 %	0 %	50 %	50 %	192288569
3559	NC_011004	GAC	2	6	149786	149791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3560	NC_011004	GAA	2	6	149822	149827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288569
3561	NC_011004	GGC	2	6	149831	149836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
3562	NC_011004	GC	3	6	149886	149891	0 %	0 %	50 %	50 %	192288569
3563	NC_011004	CTG	2	6	149939	149944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288569
3564	NC_011004	CGG	2	6	150019	150024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288569
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3568	NC_011004	GCA	2	6	150220	150225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288570
3569	NC_011004	GCA	2	6	150256	150261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288570
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3571	NC_011004	TTG	2	6	150291	150296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288570
3572	NC_011004	GGC	2	6	150314	150319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288570
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3601	NC_011004	GAT	2	6	151160	151165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288570
3602	NC_011004	GGCA	2	8	151187	151194	25 %	0 %	50 %	25 %	192288570
3603	NC_011004	CCGCA	2	10	151220	151229	20 %	0 %	20 %	60 %	192288570
3604	NC_011004	CAC	2	6	151241	151246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288570
3605	NC_011004	GAC	2	6	151250	151255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288570
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3607	NC_011004	CCA	2	6	151390	151395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288570
3608	NC_011004	TCT	2	6	151435	151440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288570
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3613	NC_011004	GAT	2	6	151642	151647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288570
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3617	NC_011004	CG	3	6	151869	151874	0 %	0 %	50 %	50 %	192288570
3618	NC_011004	CAGGA	2	10	151875	151884	40 %	0 %	40 %	20 %	192288570
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3620	NC_011004	GAC	2	6	152028	152033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288571
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3622	NC_011004	GGC	2	6	152079	152084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288571
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3861	NC_011004	ATC	2	6	162134	162139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288578
3862	NC_011004	TGA	2	6	162171	162176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288578
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3864	NC_011004	GCG	2	6	162220	162225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288578
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3868	NC_011004	TCG	2	6	162407	162412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288578
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3874	NC_011004	GCGGG	2	10	162522	162531	0 %	0 %	80 %	20 %	192288578
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3979	NC_011004	CAAGCG	2	12	168018	168029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288584
3980	NC_011004	TGC	2	6	168053	168058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288584
3981	NC_011004	AAG	2	6	168085	168090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288584
3982	NC_011004	TCGG	2	8	168094	168101	0 %	25 %	50 %	25 %	192288584
3983	NC_011004	GGC	2	6	168123	168128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288584
3984	NC_011004	AGC	2	6	168141	168146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288584
3985	NC_011004	GGCG	2	8	168257	168264	0 %	0 %	75 %	25 %	192288585
3986	NC_011004	GGC	2	6	168321	168326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288585
3987	NC_011004	CAT	2	6	168347	168352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288585
3988	NC_011004	GGC	2	6	168503	168508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288585
3989	NC_011004	ACC	2	6	168668	168673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288586
3990	NC_011004	GCGAG	2	10	168687	168696	20 %	0 %	60 %	20 %	192288586
3991	NC_011004	TCGCT	2	10	168762	168771	0 %	40 %	20 %	40 %	192288586
3992	NC_011004	GTC	2	6	168788	168793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288586
3993	NC_011004	CGG	2	6	168803	168808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288586
3994	NC_011004	CG	3	6	168825	168830	0 %	0 %	50 %	50 %	192288586
3995	NC_011004	ACG	2	6	168831	168836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288586
3996	NC_011004	CG	3	6	168838	168843	0 %	0 %	50 %	50 %	192288586
3997	NC_011004	AGC	2	6	168866	168871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288586
3998	NC_011004	TCG	2	6	168918	168923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288586
3999	NC_011004	GCA	2	6	168976	168981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288586
4000	NC_011004	CG	3	6	169009	169014	0 %	0 %	50 %	50 %	192288586

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