MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011004	TCA	2	6	106066	106071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288531
2502	NC_011004	GGT	2	6	106076	106081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288531
2503	NC_011004	CTG	2	6	106092	106097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2504	NC_011004	GCG	3	9	106133	106141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288531
2505	NC_011004	CCGGT	2	10	106162	106171	0 %	20 %	40 %	40 %	192288531
2506	NC_011004	CG	3	6	106278	106283	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2507	NC_011004	CCGT	2	8	106302	106309	0 %	25 %	25 %	50 %	192288532
2508	NC_011004	TGT	2	6	106331	106336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288532
2509	NC_011004	CGC	2	6	106338	106343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2510	NC_011004	TCG	2	6	106357	106362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
2511	NC_011004	GCT	2	6	106364	106369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
2512	NC_011004	CGC	2	6	106370	106375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2513	NC_011004	GCG	2	6	106402	106407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288532
2514	NC_011004	GCC	2	6	106409	106414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2515	NC_011004	ACC	2	6	106458	106463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288532
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2517	NC_011004	AGC	2	6	106534	106539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288532
2518	NC_011004	TCG	2	6	106543	106548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
2519	NC_011004	GAA	2	6	106562	106567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288532
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2521	NC_011004	CCG	2	6	106596	106601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288532
2522	NC_011004	GC	3	6	106625	106630	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2523	NC_011004	CAGGCC	2	12	106641	106652	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288532
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2527	NC_011004	GCGCA	2	10	106746	106755	20 %	0 %	40 %	40 %	192288532
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2529	NC_011004	GGCGCA	2	12	106778	106789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192288532
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2536	NC_011004	CGGC	2	8	107039	107046	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2537	NC_011004	TCG	2	6	107074	107079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288532
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2540	NC_011004	CAT	2	6	107108	107113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288532
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2543	NC_011004	CG	3	6	107209	107214	0 %	0 %	50 %	50 %	192288532
2544	NC_011004	GACC	2	8	107246	107253	25 %	0 %	25 %	50 %	192288532
2545	NC_011004	CTACGT	2	12	107264	107275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192288532
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2554	NC_011004	CGA	2	6	107611	107616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2556	NC_011004	GTC	2	6	107679	107684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2557	NC_011004	ACG	2	6	107725	107730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2560	NC_011004	TCG	3	9	107871	107879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2561	NC_011004	TGC	2	6	107881	107886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2568	NC_011004	CGA	2	6	108152	108157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2588	NC_011004	CGC	2	6	108987	108992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
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2590	NC_011004	GCCG	2	8	109069	109076	0 %	0 %	50 %	50 %	192288533
2591	NC_011004	TGGCGG	2	12	109090	109101	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	192288533
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2602	NC_011004	TGC	2	6	109450	109455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2603	NC_011004	GCC	2	6	109466	109471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2604	NC_011004	GTC	2	6	109473	109478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2612	NC_011004	CGGA	2	8	109754	109761	25 %	0 %	50 %	25 %	192288533
2613	NC_011004	GC	3	6	109792	109797	0 %	0 %	50 %	50 %	192288533
2614	NC_011004	ATCG	2	8	109865	109872	25 %	25 %	25 %	25 %	192288533
2615	NC_011004	CCGGC	2	10	109891	109900	0 %	0 %	40 %	60 %	192288533
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2620	NC_011004	CGC	2	6	110273	110278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288533
2621	NC_011004	TCG	2	6	110296	110301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2622	NC_011004	AGC	2	6	110314	110319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288533
2623	NC_011004	TGA	3	9	110383	110391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288533
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2625	NC_011004	GGCGC	2	10	110453	110462	0 %	0 %	60 %	40 %	192288533
2626	NC_011004	CAT	2	6	110513	110518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288533
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2629	NC_011004	CTG	2	6	110607	110612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288533
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2633	NC_011004	GC	3	6	110893	110898	0 %	0 %	50 %	50 %	192288534
2634	NC_011004	CA	3	6	110951	110956	50 %	0 %	0 %	50 %	192288534
2635	NC_011004	CGCC	2	8	110977	110984	0 %	0 %	25 %	75 %	192288534
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2642	NC_011004	GCG	2	6	111480	111485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288535
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2646	NC_011004	TCG	2	6	111665	111670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288535
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2741	NC_011004	GCT	3	9	115750	115758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288539
2742	NC_011004	CGT	2	6	115759	115764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288539
2743	NC_011004	GTG	2	6	115791	115796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288539
2744	NC_011004	TCG	2	6	115830	115835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288539
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2861	NC_011004	GC	3	6	120653	120658	0 %	0 %	50 %	50 %	192288542
2862	NC_011004	GCCA	2	8	120673	120680	25 %	0 %	25 %	50 %	192288542
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2869	NC_011004	CGT	2	6	120900	120905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288542
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2980	NC_011004	GC	3	6	124880	124885	0 %	0 %	50 %	50 %	192288545
2981	NC_011004	GCA	2	6	124890	124895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288545
2982	NC_011004	AGC	2	6	124913	124918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288545
2983	NC_011004	CCGCG	2	10	124920	124929	0 %	0 %	40 %	60 %	192288545
2984	NC_011004	CGT	2	6	124936	124941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288545
2985	NC_011004	GATGC	2	10	124993	125002	20 %	20 %	40 %	20 %	192288545
2986	NC_011004	CGC	2	6	125043	125048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288545
2987	NC_011004	GCG	3	9	125079	125087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288545
2988	NC_011004	CGA	2	6	125091	125096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288545
2989	NC_011004	AAC	2	6	125099	125104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288545
2990	NC_011004	GCCCG	2	10	125158	125167	0 %	0 %	40 %	60 %	192288545
2991	NC_011004	GC	4	8	125201	125208	0 %	0 %	50 %	50 %	192288545
2992	NC_011004	CGG	2	6	125217	125222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288545
2993	NC_011004	GGCC	2	8	125226	125233	0 %	0 %	50 %	50 %	192288545
2994	NC_011004	CCG	2	6	125306	125311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288545
2995	NC_011004	CGC	2	6	125367	125372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288545
2996	NC_011004	GCCG	2	8	125386	125393	0 %	0 %	50 %	50 %	192288545
2997	NC_011004	TCG	2	6	125553	125558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288546
2998	NC_011004	GCG	2	6	125674	125679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288546
2999	NC_011004	TTG	2	6	125976	125981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288546
3000	NC_011004	CG	4	8	126007	126014	0 %	0 %	50 %	50 %	192288546

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