MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_011004	GTCC	2	8	85500	85507	0 %	25 %	25 %	50 %	192288511
2003	NC_011004	CCG	2	6	85563	85568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288511
2004	NC_011004	GGA	2	6	85594	85599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288511
2005	NC_011004	GAG	2	6	85600	85605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288511
2006	NC_011004	GCT	2	6	85635	85640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2007	NC_011004	CATG	2	8	85680	85687	25 %	25 %	25 %	25 %	192288511
2008	NC_011004	GCC	2	6	85747	85752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288511
2009	NC_011004	CGC	2	6	85765	85770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288511
2010	NC_011004	GTC	2	6	85771	85776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2011	NC_011004	CAC	2	6	85801	85806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288511
2012	NC_011004	CG	3	6	85823	85828	0 %	0 %	50 %	50 %	192288511
2013	NC_011004	AGC	2	6	85838	85843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2014	NC_011004	CGCTG	2	10	85893	85902	0 %	20 %	40 %	40 %	192288511
2015	NC_011004	CGCGC	2	10	85941	85950	0 %	0 %	40 %	60 %	192288511
2016	NC_011004	CGGT	2	8	85964	85971	0 %	25 %	50 %	25 %	192288511
2017	NC_011004	GTC	2	6	86101	86106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2018	NC_011004	TCG	2	6	86123	86128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2019	NC_011004	AGCGCC	2	12	86132	86143	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288511
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2021	NC_011004	CAA	2	6	86230	86235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288511
2022	NC_011004	TCG	2	6	86318	86323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2023	NC_011004	CGA	2	6	86337	86342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288511
2024	NC_011004	GCA	3	9	86349	86357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288511
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2027	NC_011004	CCGG	2	8	86401	86408	0 %	0 %	50 %	50 %	192288511
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2031	NC_011004	ATG	2	6	86810	86815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288512
2032	NC_011004	GCG	2	6	86816	86821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288512
2033	NC_011004	CAC	2	6	86839	86844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288512
2034	NC_011004	CAG	3	9	86938	86946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288512
2035	NC_011004	CGGG	2	8	86957	86964	0 %	0 %	75 %	25 %	192288512
2036	NC_011004	GC	3	6	86983	86988	0 %	0 %	50 %	50 %	192288512
2037	NC_011004	GAT	2	6	87033	87038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288512
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2040	NC_011004	CGC	2	6	87081	87086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288512
2041	NC_011004	GAT	2	6	87157	87162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288512
2042	NC_011004	GAC	2	6	87187	87192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288512
2043	NC_011004	ACGG	2	8	87243	87250	25 %	0 %	50 %	25 %	192288512
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2047	NC_011004	CAGCT	2	10	87594	87603	20 %	20 %	20 %	40 %	192288513
2048	NC_011004	CGA	2	6	87629	87634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288513
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2053	NC_011004	ACG	2	6	87786	87791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288513
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2055	NC_011004	GGT	2	6	87931	87936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288514
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2057	NC_011004	CG	3	6	88120	88125	0 %	0 %	50 %	50 %	192288514
2058	NC_011004	AGC	2	6	88183	88188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288514
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2373	NC_011004	CGA	2	6	100415	100420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2374	NC_011004	GGC	2	6	100425	100430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
2375	NC_011004	CTG	3	9	100465	100473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2376	NC_011004	GCCG	2	8	100545	100552	0 %	0 %	50 %	50 %	192288523
2377	NC_011004	GCCG	2	8	100560	100567	0 %	0 %	50 %	50 %	192288523
2378	NC_011004	ACA	2	6	100592	100597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288523
2379	NC_011004	CG	3	6	100599	100604	0 %	0 %	50 %	50 %	192288523
2380	NC_011004	CGG	2	6	100616	100621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
2381	NC_011004	CGG	2	6	100623	100628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
2382	NC_011004	GTG	2	6	100633	100638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288523
2383	NC_011004	GGC	2	6	100656	100661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
2384	NC_011004	CGC	2	6	100665	100670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288523
2385	NC_011004	TGC	3	9	100703	100711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2386	NC_011004	GGC	2	6	100715	100720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
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2388	NC_011004	TGG	2	6	100877	100882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288523
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2392	NC_011004	GAT	2	6	101022	101027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288523
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2395	NC_011004	TCG	3	9	101090	101098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
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2397	NC_011004	GCTGGG	2	12	101228	101239	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	192288523
2398	NC_011004	TGC	2	6	101276	101281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2399	NC_011004	CTG	2	6	101323	101328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2400	NC_011004	GCC	2	6	101334	101339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288523
2401	NC_011004	CTG	2	6	101368	101373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2402	NC_011004	GGT	2	6	101418	101423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288523
2403	NC_011004	CGA	2	6	101451	101456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288523
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2405	NC_011004	AGG	2	6	101483	101488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288523
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2408	NC_011004	GGTGCG	2	12	101679	101690	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	192288523
2409	NC_011004	TGC	2	6	101765	101770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288523
2410	NC_011004	GCG	2	6	101786	101791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288523
2411	NC_011004	GTCA	2	8	101946	101953	25 %	25 %	25 %	25 %	192288525
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2427	NC_011004	GC	4	8	102870	102877	0 %	0 %	50 %	50 %	192288527
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2433	NC_011004	CAC	2	6	103020	103025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288527
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2464	NC_011004	TTC	2	6	104944	104949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288530
2465	NC_011004	CGA	2	6	104952	104957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288530
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2470	NC_011004	GCCGC	2	10	105039	105048	0 %	0 %	40 %	60 %	192288530
2471	NC_011004	GAG	3	9	105052	105060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288530
2472	NC_011004	CTC	2	6	105097	105102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288530
2473	NC_011004	CGC	2	6	105123	105128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288530
2474	NC_011004	GCTGCA	2	12	105159	105170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288530
2475	NC_011004	CGG	2	6	105225	105230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288530
2476	NC_011004	TCA	2	6	105271	105276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288530
2477	NC_011004	AAC	2	6	105279	105284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288530
2478	NC_011004	CGCTGC	2	12	105328	105339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288531
2479	NC_011004	CAT	2	6	105344	105349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288531
2480	NC_011004	GTCG	2	8	105368	105375	0 %	25 %	50 %	25 %	192288531
2481	NC_011004	TGC	2	6	105382	105387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2482	NC_011004	GCCG	2	8	105401	105408	0 %	0 %	50 %	50 %	192288531
2483	NC_011004	GCC	2	6	105420	105425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288531
2484	NC_011004	GC	3	6	105468	105473	0 %	0 %	50 %	50 %	192288531
2485	NC_011004	CAA	2	6	105498	105503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288531
2486	NC_011004	AGCCGC	2	12	105554	105565	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288531
2487	NC_011004	CTG	2	6	105585	105590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2488	NC_011004	GCG	2	6	105599	105604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288531
2489	NC_011004	TGA	2	6	105670	105675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288531
2490	NC_011004	GCG	2	6	105738	105743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288531
2491	NC_011004	CTG	3	9	105762	105770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2492	NC_011004	CGC	2	6	105823	105828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288531
2493	NC_011004	CG	3	6	105832	105837	0 %	0 %	50 %	50 %	192288531
2494	NC_011004	GCA	2	6	105863	105868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2495	NC_011004	ACG	2	6	105883	105888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288531
2496	NC_011004	GAT	2	6	105902	105907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288531
2497	NC_011004	CGG	2	6	105917	105922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288531
2498	NC_011004	ATG	2	6	105927	105932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288531
2499	NC_011004	GC	3	6	105959	105964	0 %	0 %	50 %	50 %	192288531
2500	NC_011004	GCT	2	6	106016	106021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288531

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