MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011004	TTG	2	6	65011	65016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288494
1502	NC_011004	CGG	2	6	65175	65180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288494
1503	NC_011004	AGT	2	6	65195	65200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288494
1504	NC_011004	GGT	2	6	65325	65330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288494
1505	NC_011004	GAT	2	6	65412	65417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288494
1506	NC_011004	GCC	2	6	65436	65441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288494
1507	NC_011004	CGCC	2	8	65602	65609	0 %	0 %	25 %	75 %	192288494
1508	NC_011004	GCGAG	2	10	65612	65621	20 %	0 %	60 %	20 %	192288494
1509	NC_011004	TTG	2	6	65641	65646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288494
1510	NC_011004	CGC	2	6	65667	65672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288494
1511	NC_011004	AGGG	2	8	65687	65694	25 %	0 %	75 %	0 %	192288494
1512	NC_011004	TCG	2	6	65710	65715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288494
1513	NC_011004	CCGG	2	8	65716	65723	0 %	0 %	50 %	50 %	192288494
1514	NC_011004	TGA	2	6	65735	65740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288494
1515	NC_011004	GCC	2	6	65781	65786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288494
1516	NC_011004	GATC	2	8	65801	65808	25 %	25 %	25 %	25 %	192288494
1517	NC_011004	CTT	2	6	65907	65912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288495
1518	NC_011004	ACGG	2	8	66005	66012	25 %	0 %	50 %	25 %	192288495
1519	NC_011004	GCAG	2	8	66061	66068	25 %	0 %	50 %	25 %	192288495
1520	NC_011004	TCA	2	6	66097	66102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288495
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1522	NC_011004	ATG	2	6	66712	66717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288496
1523	NC_011004	CTT	3	9	66737	66745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288496
1524	NC_011004	TCG	2	6	66766	66771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288496
1525	NC_011004	TCG	3	9	66775	66783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288496
1526	NC_011004	TCG	2	6	66790	66795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288496
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1530	NC_011004	CAC	2	6	66975	66980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288496
1531	NC_011004	CGT	2	6	67038	67043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288496
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1533	NC_011004	GC	3	6	67256	67261	0 %	0 %	50 %	50 %	192288497
1534	NC_011004	GCG	2	6	67266	67271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288497
1535	NC_011004	CG	4	8	67285	67292	0 %	0 %	50 %	50 %	192288497
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1537	NC_011004	TCA	2	6	67389	67394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288497
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1539	NC_011004	GCCG	2	8	67605	67612	0 %	0 %	50 %	50 %	192288497
1540	NC_011004	GCG	2	6	67615	67620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288497
1541	NC_011004	TCG	2	6	67623	67628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288497
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1549	NC_011004	TGC	2	6	67845	67850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288497
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1552	NC_011004	GCCG	2	8	67951	67958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288497
1553	NC_011004	CGG	2	6	67968	67973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288497
1554	NC_011004	TGG	2	6	67995	68000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288497
1555	NC_011004	TGA	2	6	68031	68036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288497
1556	NC_011004	ACG	2	6	68063	68068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288497
1557	NC_011004	GCC	2	6	68176	68181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288497
1558	NC_011004	GAT	2	6	68197	68202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288497
1559	NC_011004	CGA	2	6	68203	68208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288497
1560	NC_011004	CGC	2	6	68227	68232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288497
1561	NC_011004	CAC	2	6	68248	68253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288497
1562	NC_011004	CGG	2	6	68310	68315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288497
1563	NC_011004	TGC	2	6	68319	68324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288497
1564	NC_011004	CGA	2	6	68356	68361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288497
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1571	NC_011004	GAT	2	6	68527	68532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288497
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1589	NC_011004	CG	3	6	69576	69581	0 %	0 %	50 %	50 %	192288499
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1606	NC_011004	CGA	2	6	70374	70379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288500
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1611	NC_011004	GATCG	2	10	70585	70594	20 %	20 %	40 %	20 %	192288500
1612	NC_011004	CG	3	6	70622	70627	0 %	0 %	50 %	50 %	192288500
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1997	NC_011004	GCG	2	6	85364	85369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288511
1998	NC_011004	ACG	2	6	85370	85375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288511
1999	NC_011004	GC	3	6	85378	85383	0 %	0 %	50 %	50 %	192288511
2000	NC_011004	GC	3	6	85386	85391	0 %	0 %	50 %	50 %	192288511

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