MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011004	GCG	2	6	41362	41367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1002	NC_011004	CGC	2	6	41412	41417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1003	NC_011004	CGA	2	6	41451	41456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1004	NC_011004	CGA	2	6	41472	41477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1005	NC_011004	ACG	2	6	41508	41513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1006	NC_011004	CAC	2	6	41527	41532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1007	NC_011004	CGA	2	6	41544	41549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1008	NC_011004	CGG	2	6	41576	41581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1009	NC_011004	GAT	2	6	41641	41646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
1010	NC_011004	GTC	2	6	41650	41655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1011	NC_011004	ACC	3	9	41672	41680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1012	NC_011004	GCC	2	6	41695	41700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1013	NC_011004	TGG	2	6	41721	41726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288469
1014	NC_011004	GCA	2	6	41742	41747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1015	NC_011004	CGC	2	6	41763	41768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1016	NC_011004	GC	3	6	41782	41787	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1017	NC_011004	GGT	2	6	41866	41871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288469
1018	NC_011004	AGC	2	6	41880	41885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1019	NC_011004	C	6	6	41897	41902	0 %	0 %	0 %	100 %	192288469
1020	NC_011004	ATG	2	6	41903	41908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
1021	NC_011004	GCGA	2	8	41912	41919	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
1022	NC_011004	TCG	2	6	41933	41938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1023	NC_011004	AGC	2	6	41990	41995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1024	NC_011004	GGCGC	2	10	42010	42019	0 %	0 %	60 %	40 %	192288469
1025	NC_011004	ACC	2	6	42020	42025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1026	NC_011004	GGC	2	6	42043	42048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1027	NC_011004	GCGA	2	8	42069	42076	25 %	0 %	50 %	25 %	192288469
1028	NC_011004	CGG	3	9	42303	42311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1029	NC_011004	CG	4	8	42318	42325	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1030	NC_011004	GGC	2	6	42412	42417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1031	NC_011004	ACCG	2	8	42418	42425	25 %	0 %	25 %	50 %	192288469
1032	NC_011004	CGGC	2	8	42432	42439	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1033	NC_011004	GAT	2	6	42445	42450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
1034	NC_011004	CGT	2	6	42453	42458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1035	NC_011004	CGC	2	6	42513	42518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288469
1036	NC_011004	TGCCGA	2	12	42525	42536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1037	NC_011004	AT	3	6	42557	42562	50 %	50 %	0 %	0 %	192288469
1038	NC_011004	GCG	2	6	42570	42575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1039	NC_011004	GC	4	8	42596	42603	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1040	NC_011004	GC	3	6	42609	42614	0 %	0 %	50 %	50 %	192288469
1041	NC_011004	CAC	2	6	42619	42624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288469
1042	NC_011004	GGC	2	6	42694	42699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288469
1043	NC_011004	TCG	2	6	42809	42814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288469
1044	NC_011004	GAT	2	6	42822	42827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288469
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1046	NC_011004	GC	3	6	43052	43057	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
1047	NC_011004	GC	3	6	43061	43066	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
1048	NC_011004	G	6	6	43094	43099	0 %	0 %	100 %	0 %	192288470
1049	NC_011004	GC	3	6	43216	43221	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
1050	NC_011004	ACC	2	6	43274	43279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288470
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1052	NC_011004	CG	3	6	43419	43424	0 %	0 %	50 %	50 %	192288470
1053	NC_011004	CCGC	2	8	43723	43730	0 %	0 %	25 %	75 %	192288471
1054	NC_011004	AAC	2	6	43792	43797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288471
1055	NC_011004	CGAT	2	8	43837	43844	25 %	25 %	25 %	25 %	192288471
1056	NC_011004	CCAG	2	8	43937	43944	25 %	0 %	25 %	50 %	192288471
1057	NC_011004	CGG	2	6	43981	43986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288471
1058	NC_011004	GAA	2	6	44025	44030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288471
1059	NC_011004	GAA	2	6	44067	44072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288471
1060	NC_011004	CGG	2	6	44220	44225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288471
1061	NC_011004	CTTC	2	8	44294	44301	0 %	50 %	0 %	50 %	192288471
1062	NC_011004	CCGGG	2	10	44331	44340	0 %	0 %	60 %	40 %	192288471
1063	NC_011004	GTC	2	6	44376	44381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288471
1064	NC_011004	CGG	3	9	44483	44491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288471
1065	NC_011004	CGG	2	6	44525	44530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288471
1066	NC_011004	CGG	2	6	44569	44574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288471
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1072	NC_011004	CGC	2	6	44981	44986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288472
1073	NC_011004	CGA	3	9	45025	45033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288472
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1084	NC_011004	CTT	2	6	45463	45468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288473
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1098	NC_011004	CGA	2	6	46261	46266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288474
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1109	NC_011004	CTG	3	9	47118	47126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288475
1110	NC_011004	GCC	2	6	47140	47145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288475
1111	NC_011004	GCG	3	9	47146	47154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288475
1112	NC_011004	GCC	2	6	47160	47165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288475
1113	NC_011004	CGCCGG	2	12	47191	47202	0 %	0 %	50 %	50 %	192288475
1114	NC_011004	GTCCG	2	10	47377	47386	0 %	20 %	40 %	40 %	192288475
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1126	NC_011004	ACG	2	6	47994	47999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288476
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1130	NC_011004	GC	4	8	48145	48152	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
1131	NC_011004	CGG	2	6	48240	48245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288476
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1134	NC_011004	CGG	2	6	48402	48407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288476
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1143	NC_011004	CG	3	6	48727	48732	0 %	0 %	50 %	50 %	192288476
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1152	NC_011004	CAGC	2	8	49101	49108	25 %	0 %	25 %	50 %	192288477
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1245	NC_011004	CTCG	2	8	53482	53489	0 %	25 %	25 %	50 %	192288481
1246	NC_011004	CGC	2	6	53503	53508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288481
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1250	NC_011004	ACC	2	6	53845	53850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288482
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1253	NC_011004	CGT	2	6	53954	53959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288482
1254	NC_011004	CGG	2	6	53965	53970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288482
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1369	NC_011004	G	6	6	59845	59850	0 %	0 %	100 %	0 %	192288489
1370	NC_011004	GAC	2	6	59868	59873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288489
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1496	NC_011004	GCCG	2	8	64899	64906	0 %	0 %	50 %	50 %	192288494
1497	NC_011004	AGC	2	6	64921	64926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288494
1498	NC_011004	CGT	2	6	64946	64951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288494
1499	NC_011004	GCTG	2	8	64952	64959	0 %	25 %	50 %	25 %	192288494
1500	NC_011004	GCG	2	6	64987	64992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288494

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