MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131001	NC_011004	GCC	2	6	5741674	5741679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293677
131002	NC_011004	AGC	2	6	5741748	5741753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293677
131003	NC_011004	CTG	2	6	5741770	5741775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293677
131004	NC_011004	CGG	2	6	5741791	5741796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293677
131005	NC_011004	CGGC	2	8	5741848	5741855	0 %	0 %	50 %	50 %	192293677
131006	NC_011004	CGG	2	6	5741868	5741873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293677
131007	NC_011004	GAA	2	6	5741902	5741907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293677
131008	NC_011004	CGGA	2	8	5742111	5742118	25 %	0 %	50 %	25 %	192293678
131009	NC_011004	CAG	4	12	5742120	5742131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293678
131010	NC_011004	GCTG	2	8	5742242	5742249	0 %	25 %	50 %	25 %	192293678
131011	NC_011004	TGG	2	6	5742253	5742258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293678
131012	NC_011004	GC	4	8	5742315	5742322	0 %	0 %	50 %	50 %	192293678
131013	NC_011004	C	6	6	5742345	5742350	0 %	0 %	0 %	100 %	192293678
131014	NC_011004	CAG	2	6	5742360	5742365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293678
131015	NC_011004	AAG	2	6	5742379	5742384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293678
131016	NC_011004	ATC	2	6	5742391	5742396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293678
131017	NC_011004	GGTC	2	8	5742849	5742856	0 %	25 %	50 %	25 %	192293679
131018	NC_011004	TCG	2	6	5742861	5742866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293679
131019	NC_011004	GCG	2	6	5742882	5742887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293679
131020	NC_011004	GCG	2	6	5742896	5742901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293679
131021	NC_011004	GC	3	6	5742937	5742942	0 %	0 %	50 %	50 %	192293679
131022	NC_011004	CAT	2	6	5742955	5742960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293679
131023	NC_011004	CGC	2	6	5742970	5742975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293679

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.