MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011004	TCG	2	6	542002	542007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
12502	NC_011004	TCG	2	6	542029	542034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288927
12503	NC_011004	CGCC	2	8	542060	542067	0 %	0 %	25 %	75 %	192288927
12504	NC_011004	CCG	2	6	542070	542075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
12505	NC_011004	CG	3	6	542074	542079	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
12506	NC_011004	CG	3	6	542093	542098	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
12507	NC_011004	CGC	2	6	542120	542125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
12508	NC_011004	GC	3	6	542244	542249	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
12509	NC_011004	GC	3	6	542335	542340	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
12510	NC_011004	GC	3	6	542356	542361	0 %	0 %	50 %	50 %	192288927
12511	NC_011004	TCGG	2	8	542371	542378	0 %	25 %	50 %	25 %	192288927
12512	NC_011004	CTTC	2	8	542381	542388	0 %	50 %	0 %	50 %	192288927
12513	NC_011004	GTG	2	6	542416	542421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288927
12514	NC_011004	CGA	2	6	542677	542682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288928
12515	NC_011004	CGA	2	6	542689	542694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288928
12516	NC_011004	TGT	2	6	542758	542763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288928
12517	NC_011004	CTT	2	6	542789	542794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288928
12518	NC_011004	AGC	2	6	542885	542890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288929
12519	NC_011004	CCA	2	6	542906	542911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288929
12520	NC_011004	TCG	2	6	542926	542931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
12521	NC_011004	TTG	2	6	542935	542940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288929
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12524	NC_011004	CTTGGC	2	12	543123	543134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
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12528	NC_011004	CTG	2	6	543219	543224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
12529	NC_011004	TGA	2	6	543305	543310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288929
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12532	NC_011004	CGGC	2	8	543385	543392	0 %	0 %	50 %	50 %	192288929
12533	NC_011004	TCG	2	6	543400	543405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288929
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12535	NC_011004	CGC	2	6	543567	543572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288929
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12537	NC_011004	GTG	2	6	543664	543669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288929
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12540	NC_011004	TCA	2	6	543830	543835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288929
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12543	NC_011004	GCT	2	6	544193	544198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
12544	NC_011004	GGT	2	6	544211	544216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288930
12545	NC_011004	CTGG	2	8	544287	544294	0 %	25 %	50 %	25 %	192288930
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12556	NC_011004	CTG	2	6	544566	544571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288930
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12565	NC_011004	TCG	2	6	545015	545020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288931
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12598	NC_011004	GCTGG	2	10	546501	546510	0 %	20 %	60 %	20 %	192288933
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12857	NC_011004	AAG	2	6	558318	558323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288942
12858	NC_011004	CG	3	6	558472	558477	0 %	0 %	50 %	50 %	192288943
12859	NC_011004	TCG	2	6	558486	558491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288943
12860	NC_011004	GCT	2	6	558520	558525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288943
12861	NC_011004	CTCG	2	8	558530	558537	0 %	25 %	25 %	50 %	192288943
12862	NC_011004	CGG	2	6	558550	558555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288943
12863	NC_011004	GTC	2	6	558587	558592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288943
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12871	NC_011004	CTGTT	2	10	558858	558867	0 %	60 %	20 %	20 %	192288943
12872	NC_011004	CGC	2	6	558884	558889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288943
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12875	NC_011004	GTC	2	6	559031	559036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288943
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12956	NC_011004	CGGCG	2	10	561893	561902	0 %	0 %	60 %	40 %	192288944
12957	NC_011004	CGGC	2	8	561907	561914	0 %	0 %	50 %	50 %	192288944
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12960	NC_011004	GCT	2	6	562103	562108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288944
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12964	NC_011004	GCCTC	2	10	562168	562177	0 %	20 %	20 %	60 %	192288944
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12967	NC_011004	GCCT	2	8	562311	562318	0 %	25 %	25 %	50 %	192288944
12968	NC_011004	CGA	2	6	562337	562342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288944
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12972	NC_011004	GCTGGC	2	12	562457	562468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288944
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12974	NC_011004	AACT	2	8	562521	562528	50 %	25 %	0 %	25 %	192288944
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12976	NC_011004	TTGC	2	8	562745	562752	0 %	50 %	25 %	25 %	192288945
12977	NC_011004	GCC	2	6	562758	562763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
12978	NC_011004	GAT	3	9	562775	562783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
12979	NC_011004	CCG	2	6	562795	562800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
12980	NC_011004	CGG	2	6	562801	562806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
12981	NC_011004	GAT	2	6	562844	562849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
12982	NC_011004	CAT	2	6	562877	562882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
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12984	NC_011004	GATC	2	8	562906	562913	25 %	25 %	25 %	25 %	192288945
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