MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011004	TCT	2	6	21559	21564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288453
502	NC_011004	CAC	2	6	21566	21571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
503	NC_011004	AGC	2	6	21588	21593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288453
504	NC_011004	GCC	2	6	21599	21604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
505	NC_011004	CCG	2	6	21619	21624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
506	NC_011004	CGGA	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	192288453
507	NC_011004	GCCG	2	8	21643	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
508	NC_011004	GGCC	2	8	21709	21716	0 %	0 %	50 %	50 %	192288453
509	NC_011004	GCG	2	6	21805	21810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288453
510	NC_011004	GAT	2	6	21839	21844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288453
511	NC_011004	CGC	2	6	21920	21925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288453
512	NC_011004	ACC	2	6	21968	21973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288453
513	NC_011004	TCG	2	6	22399	22404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
514	NC_011004	ATCA	2	8	22410	22417	50 %	25 %	0 %	25 %	192288454
515	NC_011004	CGC	2	6	22554	22559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
516	NC_011004	TCG	2	6	22579	22584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
517	NC_011004	CCG	2	6	22609	22614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
518	NC_011004	CCA	2	6	22619	22624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288454
519	NC_011004	ACCG	2	8	22632	22639	25 %	0 %	25 %	50 %	192288454
520	NC_011004	CGC	2	6	22640	22645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
521	NC_011004	GCC	2	6	22743	22748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
522	NC_011004	CGA	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288454
523	NC_011004	GAGC	2	8	22823	22830	25 %	0 %	50 %	25 %	192288454
524	NC_011004	GCC	2	6	22878	22883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
525	NC_011004	CGC	3	9	22973	22981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
526	NC_011004	CGT	2	6	22997	23002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
527	NC_011004	CAC	2	6	23028	23033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288454
528	NC_011004	GGA	2	6	23074	23079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288454
529	NC_011004	TCG	2	6	23087	23092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288454
530	NC_011004	CG	3	6	23126	23131	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
531	NC_011004	CCG	2	6	23138	23143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
532	NC_011004	GGCCG	2	10	23147	23156	0 %	0 %	60 %	40 %	192288454
533	NC_011004	GCCG	2	8	23192	23199	0 %	0 %	50 %	50 %	192288454
534	NC_011004	GCC	2	6	23208	23213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288454
535	NC_011004	CAC	2	6	23321	23326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288455
536	NC_011004	GCT	2	6	23376	23381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288455
537	NC_011004	CGG	2	6	23416	23421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
538	NC_011004	CAG	2	6	23425	23430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288455
539	NC_011004	TTC	2	6	23534	23539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
540	NC_011004	CG	3	6	23550	23555	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
541	NC_011004	CG	3	6	23572	23577	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
542	NC_011004	CGC	2	6	23602	23607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
543	NC_011004	GCC	2	6	23617	23622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
544	NC_011004	ACG	2	6	23628	23633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288455
545	NC_011004	GAA	2	6	23647	23652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288455
546	NC_011004	TGCCC	2	10	23658	23667	0 %	20 %	20 %	60 %	192288455
547	NC_011004	GC	3	6	23668	23673	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
548	NC_011004	GCCC	2	8	23710	23717	0 %	0 %	25 %	75 %	192288455
549	NC_011004	GGT	2	6	23755	23760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288455
550	NC_011004	GCG	2	6	23814	23819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
551	NC_011004	CTT	2	6	23856	23861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
552	NC_011004	CGAG	3	12	23874	23885	25 %	0 %	50 %	25 %	192288455
553	NC_011004	GCC	2	6	23896	23901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288455
554	NC_011004	GGC	2	6	23902	23907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
555	NC_011004	CCA	2	6	23919	23924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288455
556	NC_011004	CGGC	2	8	23951	23958	0 %	0 %	50 %	50 %	192288455
557	NC_011004	CGG	2	6	23976	23981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288455
558	NC_011004	CTT	2	6	23986	23991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288455
559	NC_011004	GTG	2	6	24048	24053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288455
560	NC_011004	GAA	2	6	24218	24223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288456
561	NC_011004	CGA	2	6	24235	24240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288456
562	NC_011004	CGC	2	6	24262	24267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288456
563	NC_011004	GGA	2	6	24356	24361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288456
564	NC_011004	GCC	2	6	24369	24374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288456
565	NC_011004	GCG	2	6	24375	24380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288456
566	NC_011004	TCT	2	6	24397	24402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288456
567	NC_011004	CCAC	2	8	24409	24416	25 %	0 %	0 %	75 %	192288456
568	NC_011004	TGG	2	6	24420	24425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288456
569	NC_011004	GCA	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288456
570	NC_011004	CA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	0 %	50 %	192288456
571	NC_011004	CCA	3	9	24568	24576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288456
572	NC_011004	CCG	2	6	24613	24618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288456
573	NC_011004	TTG	3	9	24624	24632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288456
574	NC_011004	GCT	2	6	24691	24696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288456
575	NC_011004	CAT	2	6	25006	25011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288457
576	NC_011004	CAA	2	6	25014	25019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288457
577	NC_011004	GGA	2	6	25050	25055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288457
578	NC_011004	ATG	2	6	25102	25107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288457
579	NC_011004	GC	3	6	25122	25127	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
580	NC_011004	TCG	2	6	25196	25201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288457
581	NC_011004	TCG	2	6	25208	25213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288457
582	NC_011004	CGGC	2	8	25227	25234	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
583	NC_011004	CGC	2	6	25241	25246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288457
584	NC_011004	GCC	2	6	25308	25313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288457
585	NC_011004	CTG	3	9	25315	25323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288457
586	NC_011004	GCT	2	6	25326	25331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288457
587	NC_011004	ATG	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288457
588	NC_011004	GC	3	6	25350	25355	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
589	NC_011004	TGG	2	6	25385	25390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288457
590	NC_011004	GC	3	6	25397	25402	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
591	NC_011004	TCG	2	6	25412	25417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288457
592	NC_011004	ATT	2	6	25442	25447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288457
593	NC_011004	CCG	3	9	25496	25504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288457
594	NC_011004	GCC	3	9	25531	25539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288457
595	NC_011004	CGG	2	6	25545	25550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288457
596	NC_011004	CGCC	2	8	25599	25606	0 %	0 %	25 %	75 %	192288457
597	NC_011004	CG	3	6	25618	25623	0 %	0 %	50 %	50 %	192288457
598	NC_011004	GTA	2	6	25659	25664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288457
599	NC_011004	GCG	2	6	25792	25797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
600	NC_011004	GCG	2	6	25813	25818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
601	NC_011004	GTC	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288458
602	NC_011004	AAG	2	6	25839	25844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288458
603	NC_011004	ACA	2	6	25909	25914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288458
604	NC_011004	GTC	2	6	25919	25924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288458
605	NC_011004	GCG	2	6	25977	25982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
606	NC_011004	CG	3	6	26009	26014	0 %	0 %	50 %	50 %	192288458
607	NC_011004	ATC	2	6	26016	26021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288458
608	NC_011004	CGC	2	6	26026	26031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
609	NC_011004	CGG	2	6	26050	26055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
610	NC_011004	GTG	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288458
611	NC_011004	GA	3	6	26118	26123	50 %	0 %	50 %	0 %	192288458
612	NC_011004	CCA	2	6	26131	26136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288458
613	NC_011004	GCG	3	9	26203	26211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
614	NC_011004	GCC	2	6	26235	26240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
615	NC_011004	TTC	2	6	26241	26246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288458
616	NC_011004	CAT	2	6	26300	26305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288458
617	NC_011004	GTCG	2	8	26324	26331	0 %	25 %	50 %	25 %	192288458
618	NC_011004	GTT	2	6	26363	26368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288458
619	NC_011004	CCG	2	6	26385	26390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
620	NC_011004	TCG	2	6	26433	26438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288458
621	NC_011004	GCC	2	6	26468	26473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
622	NC_011004	CGC	2	6	26474	26479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
623	NC_011004	GGT	2	6	26534	26539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288458
624	NC_011004	GGC	2	6	26543	26548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288458
625	NC_011004	CGC	2	6	26573	26578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288458
626	NC_011004	TGA	2	6	26620	26625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288458
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628	NC_011004	CGC	2	6	26935	26940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288459
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