MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011004	CG	3	6	257226	257231	0 %	0 %	50 %	50 %	192288670
6002	NC_011004	TAT	2	6	257255	257260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288670
6003	NC_011004	CTA	3	9	257269	257277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670
6004	NC_011004	CTA	2	6	257284	257289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670
6005	NC_011004	CTA	2	6	257293	257298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670
6006	NC_011004	GTG	2	6	257318	257323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288670
6007	NC_011004	GGC	2	6	257367	257372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
6008	NC_011004	GGC	2	6	257391	257396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
6009	NC_011004	ATC	3	9	257397	257405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670
6010	NC_011004	CCA	3	9	257407	257415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288670
6011	NC_011004	TCA	2	6	257416	257421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670
6012	NC_011004	CGA	2	6	257530	257535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288671
6013	NC_011004	CGG	4	12	257551	257562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288671
6014	NC_011004	TCGAGG	2	12	257626	257637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288671
6015	NC_011004	AGC	2	6	257689	257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288671
6016	NC_011004	TGA	2	6	257722	257727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288671
6017	NC_011004	CTCGGC	2	12	257744	257755	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288671
6018	NC_011004	GAT	2	6	257786	257791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288671
6019	NC_011004	GGC	3	9	257834	257842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288671
6020	NC_011004	GC	3	6	257841	257846	0 %	0 %	50 %	50 %	192288671
6021	NC_011004	GC	4	8	257944	257951	0 %	0 %	50 %	50 %	192288671
6022	NC_011004	CGG	2	6	258053	258058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288671
6023	NC_011004	CAGCG	2	10	258059	258068	20 %	0 %	40 %	40 %	192288671
6024	NC_011004	GC	3	6	258097	258102	0 %	0 %	50 %	50 %	192288671
6025	NC_011004	CGT	2	6	258103	258108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288671
6026	NC_011004	AGCGC	2	10	258130	258139	20 %	0 %	40 %	40 %	192288671
6027	NC_011004	GCGG	2	8	258169	258176	0 %	0 %	75 %	25 %	192288671
6028	NC_011004	GCC	2	6	258230	258235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288671
6029	NC_011004	TCGA	2	8	258237	258244	25 %	25 %	25 %	25 %	192288671
6030	NC_011004	AGCG	2	8	258279	258286	25 %	0 %	50 %	25 %	192288671
6031	NC_011004	GCC	2	6	258323	258328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288671
6032	NC_011004	GAT	2	6	258347	258352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288671
6033	NC_011004	CTT	2	6	258425	258430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288671
6034	NC_011004	GC	3	6	258493	258498	0 %	0 %	50 %	50 %	192288671
6035	NC_011004	TGG	2	6	258541	258546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288671
6036	NC_011004	ACC	2	6	258729	258734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288671
6037	NC_011004	TCT	2	6	258742	258747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288671
6038	NC_011004	GCG	2	6	258796	258801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288671
6039	NC_011004	CAG	2	6	258836	258841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288671
6040	NC_011004	GTG	2	6	258900	258905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288671
6041	NC_011004	GCCG	2	8	259022	259029	0 %	0 %	50 %	50 %	192288672
6042	NC_011004	GGC	2	6	259046	259051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288672
6043	NC_011004	GTC	2	6	259056	259061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288672
6044	NC_011004	GCG	3	9	259080	259088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288672
6045	NC_011004	TCCA	2	8	259101	259108	25 %	25 %	0 %	50 %	192288672
6046	NC_011004	CGG	2	6	259234	259239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288673
6047	NC_011004	GCGGT	2	10	259251	259260	0 %	20 %	60 %	20 %	192288673
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6049	NC_011004	CGA	2	6	259273	259278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288673
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6051	NC_011004	CAG	2	6	259376	259381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288673
6052	NC_011004	GCC	3	9	259445	259453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288673
6053	NC_011004	CG	3	6	259489	259494	0 %	0 %	50 %	50 %	192288673
6054	NC_011004	CGA	2	6	259507	259512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288673
6055	NC_011004	GCCG	2	8	259565	259572	0 %	0 %	50 %	50 %	192288673
6056	NC_011004	CGTC	2	8	259737	259744	0 %	25 %	25 %	50 %	192288674
6057	NC_011004	T	6	6	259748	259753	0 %	100 %	0 %	0 %	192288674
6058	NC_011004	T	6	6	259758	259763	0 %	100 %	0 %	0 %	192288674
6059	NC_011004	GGC	2	6	259801	259806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288674
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6061	NC_011004	GCCTCG	2	12	259838	259849	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288674
6062	NC_011004	CAG	2	6	259888	259893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288674
6063	NC_011004	CAG	2	6	259951	259956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288674
6064	NC_011004	TCG	2	6	259973	259978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288674
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6067	NC_011004	CG	4	8	260100	260107	0 %	0 %	50 %	50 %	192288674
6068	NC_011004	GGCCCG	2	12	260156	260167	0 %	0 %	50 %	50 %	192288674
6069	NC_011004	TCA	2	6	260217	260222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288674
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6089	NC_011004	CAC	2	6	260966	260971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288675
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6091	NC_011004	GC	4	8	261014	261021	0 %	0 %	50 %	50 %	192288675
6092	NC_011004	CGG	2	6	261067	261072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288675
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6101	NC_011004	CGA	3	9	261418	261426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288676
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6108	NC_011004	CGC	2	6	261803	261808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288677
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6118	NC_011004	ATCGA	2	10	262057	262066	40 %	20 %	20 %	20 %	192288677
6119	NC_011004	GTC	2	6	262095	262100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288677
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6122	NC_011004	GCC	2	6	262161	262166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288677
6123	NC_011004	GCC	2	6	262170	262175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288677
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6235	NC_011004	TTCCA	2	10	266695	266704	20 %	40 %	0 %	40 %	192288681
6236	NC_011004	GC	3	6	266941	266946	0 %	0 %	50 %	50 %	192288682
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6238	NC_011004	GCCG	2	8	267032	267039	0 %	0 %	50 %	50 %	192288682
6239	NC_011004	GCGG	2	8	267044	267051	0 %	0 %	75 %	25 %	192288682
6240	NC_011004	GGC	2	6	267053	267058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288682
6241	NC_011004	TGC	3	9	267082	267090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288682
6242	NC_011004	ACA	2	6	267133	267138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288682
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6244	NC_011004	GCAG	2	8	267201	267208	25 %	0 %	50 %	25 %	192288682
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6366	NC_011004	CGG	2	6	271605	271610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288687
6367	NC_011004	GGC	3	9	271622	271630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288687
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6370	NC_011004	GCG	2	6	271771	271776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288687
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6486	NC_011004	ACG	2	6	276238	276243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288690
6487	NC_011004	CCT	2	6	276253	276258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288690
6488	NC_011004	ACG	2	6	276285	276290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288690
6489	NC_011004	GTGACG	2	12	276300	276311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288690
6490	NC_011004	GGC	2	6	276317	276322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288690
6491	NC_011004	ACCG	2	8	276353	276360	25 %	0 %	25 %	50 %	192288690
6492	NC_011004	GTG	2	6	276363	276368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288690
6493	NC_011004	GAC	2	6	276401	276406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288690
6494	NC_011004	CGG	2	6	276436	276441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288690
6495	NC_011004	TCG	2	6	276447	276452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288690
6496	NC_011004	CCG	2	6	276464	276469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288690
6497	NC_011004	CGC	2	6	276533	276538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288690
6498	NC_011004	CG	3	6	276558	276563	0 %	0 %	50 %	50 %	192288690
6499	NC_011004	CCGG	2	8	276570	276577	0 %	0 %	50 %	50 %	192288690
6500	NC_011004	AGC	2	6	276582	276587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288690

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