MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011004	CGT	2	6	234425	234430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288646
5502	NC_011004	GCC	2	6	234498	234503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288646
5503	NC_011004	TTC	2	6	234517	234522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288646
5504	NC_011004	CGG	2	6	234668	234673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288647
5505	NC_011004	CGT	2	6	234685	234690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5506	NC_011004	GGC	2	6	234839	234844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288647
5507	NC_011004	CAC	2	6	234857	234862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288647
5508	NC_011004	CGA	2	6	234898	234903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5509	NC_011004	GTT	2	6	235022	235027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288647
5510	NC_011004	TGC	2	6	235038	235043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5511	NC_011004	GCC	2	6	235073	235078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5512	NC_011004	CGG	2	6	235120	235125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288647
5513	NC_011004	GCT	2	6	235144	235149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5514	NC_011004	GCGCA	2	10	235173	235182	20 %	0 %	40 %	40 %	192288647
5515	NC_011004	GCG	2	6	235188	235193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288647
5516	NC_011004	CAC	2	6	235292	235297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288647
5517	NC_011004	GTC	2	6	235304	235309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5518	NC_011004	CTT	2	6	235316	235321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288647
5519	NC_011004	TCG	2	6	235345	235350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5520	NC_011004	GCC	2	6	235355	235360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5521	NC_011004	TGT	2	6	235363	235368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288647
5522	NC_011004	GGATCG	2	12	235384	235395	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288647
5523	NC_011004	GCA	2	6	235462	235467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5524	NC_011004	CTT	3	9	235508	235516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288647
5525	NC_011004	CGC	2	6	235522	235527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5526	NC_011004	GC	3	6	235554	235559	0 %	0 %	50 %	50 %	192288647
5527	NC_011004	CG	3	6	235570	235575	0 %	0 %	50 %	50 %	192288647
5528	NC_011004	CGC	2	6	235651	235656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5529	NC_011004	GAAC	2	8	235711	235718	50 %	0 %	25 %	25 %	192288647
5530	NC_011004	GC	3	6	235743	235748	0 %	0 %	50 %	50 %	192288647
5531	NC_011004	CGC	2	6	235759	235764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5532	NC_011004	AGG	2	6	235795	235800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288647
5533	NC_011004	GCC	2	6	235817	235822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5534	NC_011004	TGG	2	6	235834	235839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288647
5535	NC_011004	GATG	2	8	235855	235862	25 %	25 %	50 %	0 %	192288647
5536	NC_011004	CGT	2	6	235867	235872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5537	NC_011004	ACG	2	6	235887	235892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5538	NC_011004	GCA	2	6	235898	235903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5539	NC_011004	GAA	2	6	235934	235939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288647
5540	NC_011004	GCA	2	6	235990	235995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5541	NC_011004	CGG	2	6	236014	236019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288647
5542	NC_011004	TGCGC	2	10	236029	236038	0 %	20 %	40 %	40 %	192288647
5543	NC_011004	GCC	2	6	236066	236071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5544	NC_011004	TCGA	2	8	236172	236179	25 %	25 %	25 %	25 %	192288647
5545	NC_011004	CGAG	2	8	236257	236264	25 %	0 %	50 %	25 %	192288647
5546	NC_011004	GCC	2	6	236273	236278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5547	NC_011004	GC	3	6	236364	236369	0 %	0 %	50 %	50 %	192288647
5548	NC_011004	CGC	2	6	236377	236382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5549	NC_011004	ACC	2	6	236391	236396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288647
5550	NC_011004	ACG	2	6	236397	236402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288647
5551	NC_011004	GCC	2	6	236435	236440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5552	NC_011004	CGC	2	6	236441	236446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5553	NC_011004	CGC	2	6	236465	236470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288647
5554	NC_011004	GAA	2	6	236537	236542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288648
5555	NC_011004	GTT	2	6	236543	236548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288648
5556	NC_011004	ATG	2	6	236553	236558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288648
5557	NC_011004	CAC	2	6	236600	236605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288648
5558	NC_011004	ATG	2	6	236640	236645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288648
5559	NC_011004	GCG	2	6	236691	236696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288648
5560	NC_011004	GCC	2	6	236697	236702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288648
5561	NC_011004	AGC	2	6	236715	236720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288648
5562	NC_011004	CAC	2	6	236729	236734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288648
5563	NC_011004	CAG	2	6	236750	236755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288648
5564	NC_011004	GCT	2	6	236779	236784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288648
5565	NC_011004	CGG	2	6	236809	236814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288648
5566	NC_011004	GCT	2	6	236882	236887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288648
5567	NC_011004	GCC	2	6	236957	236962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288649
5568	NC_011004	CGG	2	6	236982	236987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288649
5569	NC_011004	CGC	2	6	237027	237032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288649
5570	NC_011004	GCCG	2	8	237078	237085	0 %	0 %	50 %	50 %	192288649
5571	NC_011004	CGG	2	6	237132	237137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288649
5572	NC_011004	CCA	2	6	237151	237156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288649
5573	NC_011004	CAA	2	6	237163	237168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288649
5574	NC_011004	CATCGT	2	12	237214	237225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192288649
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5576	NC_011004	CAT	2	6	237685	237690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288650
5577	NC_011004	CGC	2	6	237731	237736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288650
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5579	NC_011004	TGG	3	9	237875	237883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288650
5580	NC_011004	CGC	2	6	237891	237896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288650
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5583	NC_011004	CTC	2	6	237948	237953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288650
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5586	NC_011004	TGG	3	9	238067	238075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288650
5587	NC_011004	TCA	2	6	238091	238096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288650
5588	NC_011004	GGC	2	6	238170	238175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288650
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5591	NC_011004	ATC	2	6	238216	238221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288650
5592	NC_011004	TCG	2	6	238265	238270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288650
5593	NC_011004	GGT	2	6	238272	238277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288650
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5595	NC_011004	CG	3	6	238340	238345	0 %	0 %	50 %	50 %	192288650
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5599	NC_011004	GTG	2	6	238600	238605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288650
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5602	NC_011004	CTT	2	6	238931	238936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288651
5603	NC_011004	GCA	2	6	238975	238980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288651
5604	NC_011004	ATCG	2	8	238991	238998	25 %	25 %	25 %	25 %	192288651
5605	NC_011004	CAC	3	9	239015	239023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288651
5606	NC_011004	GCC	2	6	239135	239140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288651
5607	NC_011004	TCG	2	6	239190	239195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288651
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5616	NC_011004	ATC	2	6	239676	239681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288651
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5621	NC_011004	CGC	2	6	239876	239881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288651
5622	NC_011004	ATC	2	6	239885	239890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288651
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5625	NC_011004	CGC	2	6	240005	240010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288651
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5633	NC_011004	CCA	2	6	240247	240252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288651
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5734	NC_011004	CCA	2	6	244476	244481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288656
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5741	NC_011004	GCGCC	2	10	244643	244652	0 %	0 %	40 %	60 %	192288656
5742	NC_011004	GCC	2	6	244672	244677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288656
5743	NC_011004	GC	3	6	244703	244708	0 %	0 %	50 %	50 %	192288656
5744	NC_011004	CGC	2	6	244755	244760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288656
5745	NC_011004	GC	3	6	244796	244801	0 %	0 %	50 %	50 %	192288656
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5760	NC_011004	CTG	2	6	245500	245505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288657
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5765	NC_011004	GC	3	6	245694	245699	0 %	0 %	50 %	50 %	192288657
5766	NC_011004	CAA	2	6	245778	245783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288657
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5772	NC_011004	TGC	2	6	246017	246022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288657
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5840	NC_011004	CGA	2	6	249666	249671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288661
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5979	NC_011004	CGG	2	6	256505	256510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288669
5980	NC_011004	CCGCA	2	10	256520	256529	20 %	0 %	20 %	60 %	192288669
5981	NC_011004	CG	3	6	256545	256550	0 %	0 %	50 %	50 %	192288669
5982	NC_011004	GCCC	2	8	256568	256575	0 %	0 %	25 %	75 %	192288669
5983	NC_011004	TTC	2	6	256607	256612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288669
5984	NC_011004	CGT	2	6	256641	256646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288669
5985	NC_011004	CGG	2	6	256847	256852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5986	NC_011004	GGC	2	6	256870	256875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5987	NC_011004	GGCGCT	2	12	256912	256923	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288670
5988	NC_011004	GCC	2	6	256961	256966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288670
5989	NC_011004	GCA	2	6	256987	256992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288670
5990	NC_011004	GGC	2	6	257006	257011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5991	NC_011004	CGG	2	6	257023	257028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5992	NC_011004	GGT	2	6	257039	257044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288670
5993	NC_011004	GGC	2	6	257051	257056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5994	NC_011004	CGG	2	6	257080	257085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5995	NC_011004	CGG	2	6	257088	257093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5996	NC_011004	CGG	3	9	257110	257118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288670
5997	NC_011004	GC	3	6	257151	257156	0 %	0 %	50 %	50 %	192288670
5998	NC_011004	ACGG	2	8	257166	257173	25 %	0 %	50 %	25 %	192288670
5999	NC_011004	CCG	2	6	257209	257214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288670
6000	NC_011004	TAC	2	6	257216	257221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288670

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