MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011004	CGGC	2	8	191506	191513	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4502	NC_011004	AGC	2	6	191533	191538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4503	NC_011004	CGG	2	6	191552	191557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4504	NC_011004	CG	3	6	191558	191563	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4505	NC_011004	CGA	2	6	191639	191644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4506	NC_011004	GAT	3	9	191655	191663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288609
4507	NC_011004	GC	3	6	191698	191703	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4508	NC_011004	TCGA	2	8	191710	191717	25 %	25 %	25 %	25 %	192288609
4509	NC_011004	CGC	2	6	191769	191774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4510	NC_011004	GGC	2	6	191848	191853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4511	NC_011004	TGG	2	6	191875	191880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288609
4512	NC_011004	CCAG	2	8	191912	191919	25 %	0 %	25 %	50 %	192288609
4513	NC_011004	GCG	2	6	191972	191977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4514	NC_011004	CAG	2	6	192000	192005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4515	NC_011004	CGC	2	6	192016	192021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4516	NC_011004	CGG	2	6	192078	192083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4517	NC_011004	CGC	2	6	192088	192093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4518	NC_011004	GATC	2	8	192095	192102	25 %	25 %	25 %	25 %	192288609
4519	NC_011004	CCG	2	6	192127	192132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4520	NC_011004	CAC	2	6	192246	192251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288609
4521	NC_011004	GC	3	6	192275	192280	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4522	NC_011004	TCC	2	6	192283	192288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288609
4523	NC_011004	CGA	2	6	192317	192322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4524	NC_011004	GC	4	8	192363	192370	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4525	NC_011004	ACG	2	6	192376	192381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4526	NC_011004	CGG	2	6	192392	192397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4527	NC_011004	GC	4	8	192414	192421	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4528	NC_011004	ATCAGG	2	12	192520	192531	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288609
4529	NC_011004	GCC	2	6	192616	192621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4530	NC_011004	GCC	2	6	192627	192632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288609
4531	NC_011004	CGGC	2	8	192689	192696	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4532	NC_011004	CG	3	6	192731	192736	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4533	NC_011004	TCG	2	6	192763	192768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4534	NC_011004	GCA	2	6	192830	192835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
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4536	NC_011004	GC	3	6	192867	192872	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4537	NC_011004	GCG	3	9	192887	192895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
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4539	NC_011004	GCA	2	6	192965	192970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4540	NC_011004	CG	3	6	192977	192982	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4541	NC_011004	CGG	2	6	193018	193023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4542	NC_011004	TCG	2	6	193027	193032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4543	NC_011004	GCG	2	6	193037	193042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288609
4544	NC_011004	GGATTC	2	12	193096	193107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288609
4545	NC_011004	ACG	2	6	193156	193161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4546	NC_011004	CG	3	6	193184	193189	0 %	0 %	50 %	50 %	192288609
4547	NC_011004	GATC	2	8	193211	193218	25 %	25 %	25 %	25 %	192288609
4548	NC_011004	CGA	2	6	193238	193243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288609
4549	NC_011004	GCT	2	6	193269	193274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288609
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4551	NC_011004	CGCCTC	2	12	193513	193524	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	192288610
4552	NC_011004	CCG	2	6	193555	193560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288610
4553	NC_011004	GCG	2	6	193595	193600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288610
4554	NC_011004	GC	3	6	193629	193634	0 %	0 %	50 %	50 %	192288610
4555	NC_011004	GCG	2	6	193675	193680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288610
4556	NC_011004	CGAC	2	8	193714	193721	25 %	0 %	25 %	50 %	192288610
4557	NC_011004	GGC	2	6	193736	193741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288610
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4559	NC_011004	GC	4	8	193778	193785	0 %	0 %	50 %	50 %	192288610
4560	NC_011004	CGTT	2	8	193797	193804	0 %	50 %	25 %	25 %	192288610
4561	NC_011004	GC	3	6	193843	193848	0 %	0 %	50 %	50 %	192288610
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4565	NC_011004	GAG	2	6	193947	193952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288610
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4574	NC_011004	CGG	2	6	194339	194344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288610
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4592	NC_011004	CGG	2	6	195136	195141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288611
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4595	NC_011004	GCA	2	6	195304	195309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288612
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4603	NC_011004	CAGCGC	2	12	195563	195574	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288612
4604	NC_011004	GCG	2	6	195595	195600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288612
4605	NC_011004	GC	3	6	195656	195661	0 %	0 %	50 %	50 %	192288612
4606	NC_011004	CGA	2	6	195697	195702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288612
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4608	NC_011004	CAG	2	6	195764	195769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288612
4609	NC_011004	TCA	2	6	195799	195804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288612
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4611	NC_011004	CCT	2	6	195880	195885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288613
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4621	NC_011004	TGG	2	6	196333	196338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288613
4622	NC_011004	GTC	2	6	196346	196351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288613
4623	NC_011004	CAC	2	6	196355	196360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288613
4624	NC_011004	TCG	2	6	196371	196376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288613
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4634	NC_011004	CTTGCC	2	12	196898	196909	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	192288613
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4653	NC_011004	CGC	2	6	197426	197431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288614
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4734	NC_011004	CCA	2	6	200226	200231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288617
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4741	NC_011004	AGT	2	6	200412	200417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288617
4742	NC_011004	GGT	2	6	200425	200430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288617
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4755	NC_011004	CGGTG	2	10	200964	200973	0 %	20 %	60 %	20 %	192288617
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4856	NC_011004	CAC	2	6	205382	205387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288620
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4862	NC_011004	TCG	2	6	205515	205520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288620
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4864	NC_011004	GCC	2	6	205619	205624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288620
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4979	NC_011004	ATCT	2	8	210702	210709	25 %	50 %	0 %	25 %	192288625
4980	NC_011004	CGGTG	2	10	210737	210746	0 %	20 %	60 %	20 %	192288625
4981	NC_011004	GGT	2	6	210818	210823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
4982	NC_011004	GGC	2	6	210824	210829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
4983	NC_011004	GCT	2	6	210869	210874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4984	NC_011004	CCG	2	6	210955	210960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
4985	NC_011004	TGC	2	6	211015	211020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4986	NC_011004	GGT	3	9	211025	211033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
4987	NC_011004	TGC	2	6	211099	211104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4988	NC_011004	GCG	2	6	211105	211110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288625
4989	NC_011004	CGC	2	6	211112	211117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
4990	NC_011004	CG	3	6	211133	211138	0 %	0 %	50 %	50 %	192288625
4991	NC_011004	TGC	2	6	211165	211170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4992	NC_011004	TCGCCA	2	12	211174	211185	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192288625
4993	NC_011004	CTT	3	9	211325	211333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288625
4994	NC_011004	TGC	2	6	211420	211425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4995	NC_011004	GCC	2	6	211440	211445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625
4996	NC_011004	TGC	2	6	211495	211500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288625
4997	NC_011004	CCGG	2	8	211536	211543	0 %	0 %	50 %	50 %	192288625
4998	NC_011004	GGT	2	6	211550	211555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
4999	NC_011004	GGT	2	6	211564	211569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288625
5000	NC_011004	CGC	2	6	211591	211596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288625

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