MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 6952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010998	TGC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
2	NC_010998	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
3	NC_010998	TGC	2	6	430	435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
4	NC_010998	CGG	2	6	444	449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
5	NC_010998	CGA	2	6	572	577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
6	NC_010998	GAG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895318
7	NC_010998	CTT	2	6	633	638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895318
8	NC_010998	ATG	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895318
9	NC_010998	CGA	3	9	746	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
10	NC_010998	TGC	2	6	793	798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895318
11	NC_010998	GCC	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
12	NC_010998	CAT	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895318
13	NC_010998	GGT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895318
14	NC_010998	CGG	2	6	959	964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
15	NC_010998	GCG	2	6	986	991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
16	NC_010998	GCC	2	6	1120	1125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
17	NC_010998	CAG	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895318
18	NC_010998	CGG	2	6	1183	1188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
19	NC_010998	GAT	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895318
20	NC_010998	CGC	2	6	1216	1221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895318
21	NC_010998	GCG	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895318
22	NC_010998	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895318
23	NC_010998	ACG	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
24	NC_010998	GAT	3	9	1666	1674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895319
25	NC_010998	CAT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895319
26	NC_010998	TCG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895319
27	NC_010998	TGG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895319
28	NC_010998	GGC	2	6	1762	1767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
29	NC_010998	GAA	2	6	1774	1779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895319
30	NC_010998	GAA	3	9	1906	1914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895319
31	NC_010998	GCG	2	6	1926	1931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
32	NC_010998	CAC	2	6	1939	1944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895319
33	NC_010998	GCG	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895319
34	NC_010998	CGA	2	6	1995	2000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
35	NC_010998	GCA	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895319
36	NC_010998	TCG	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895319
37	NC_010998	GGC	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
38	NC_010998	ACG	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895320
39	NC_010998	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
40	NC_010998	TCG	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895320
41	NC_010998	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
42	NC_010998	CGG	2	6	2648	2653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
43	NC_010998	CGG	2	6	2707	2712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
44	NC_010998	GCG	2	6	2713	2718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
45	NC_010998	GGC	2	6	2805	2810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
46	NC_010998	GGT	2	6	2819	2824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895320
47	NC_010998	GCG	2	6	2850	2855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895320
48	NC_010998	CGA	2	6	2900	2905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895320
49	NC_010998	TCT	2	6	2967	2972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895321
50	NC_010998	GGC	2	6	3049	3054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
51	NC_010998	TCC	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895321
52	NC_010998	GAA	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895321
53	NC_010998	CTG	2	6	3139	3144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895321
54	NC_010998	CAG	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895321
55	NC_010998	GGC	2	6	3210	3215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
56	NC_010998	AGC	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895321
57	NC_010998	GCC	2	6	3292	3297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895321
58	NC_010998	TCC	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895321
59	NC_010998	GCG	2	6	3404	3409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895321
60	NC_010998	CGG	2	6	3508	3513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895322
61	NC_010998	CGC	2	6	3520	3525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895322
62	NC_010998	CCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895322
63	NC_010998	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895322
64	NC_010998	TGA	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895322
65	NC_010998	CGA	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895322
66	NC_010998	GCG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895323
67	NC_010998	GTA	2	6	4271	4276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895323
68	NC_010998	GCC	3	9	4404	4412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
69	NC_010998	ATC	2	6	4416	4421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895324
70	NC_010998	CAG	3	9	4427	4435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
71	NC_010998	CGG	2	6	4459	4464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
72	NC_010998	TCG	2	6	4528	4533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
73	NC_010998	GCC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
74	NC_010998	CGA	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
75	NC_010998	CTT	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895324
76	NC_010998	TCG	2	6	4767	4772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
77	NC_010998	ATG	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895324
78	NC_010998	GGC	3	9	4865	4873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
79	NC_010998	CGC	2	6	4957	4962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
80	NC_010998	TCT	2	6	4975	4980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895324
81	NC_010998	GCC	2	6	5048	5053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
82	NC_010998	CGA	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
83	NC_010998	CGC	2	6	5116	5121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
84	NC_010998	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
85	NC_010998	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
86	NC_010998	GCC	2	6	5216	5221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
87	NC_010998	CGA	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
88	NC_010998	GAT	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895324
89	NC_010998	GAC	2	6	5483	5488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
90	NC_010998	ACG	2	6	5511	5516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
91	NC_010998	CGA	2	6	5596	5601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
92	NC_010998	GCC	2	6	5637	5642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
93	NC_010998	TTG	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895324
94	NC_010998	GCC	2	6	5672	5677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
95	NC_010998	ATC	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895324
96	NC_010998	CGA	2	6	5758	5763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
97	NC_010998	CCG	2	6	5867	5872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
98	NC_010998	CGA	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
99	NC_010998	CGA	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
100	NC_010998	GCC	3	9	5979	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
101	NC_010998	CGG	2	6	6004	6009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
102	NC_010998	CGA	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
103	NC_010998	GAA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895324
104	NC_010998	GCC	2	6	6165	6170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895324
105	NC_010998	CAC	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895324
106	NC_010998	CAG	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
107	NC_010998	TCG	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
108	NC_010998	GGA	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895324
109	NC_010998	TGA	2	6	6418	6423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895324
110	NC_010998	TGC	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895324
111	NC_010998	GCG	2	6	6648	6653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895324
112	NC_010998	GCA	2	6	6794	6799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895324
113	NC_010998	ATC	3	9	6809	6817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895324
114	NC_010998	GTG	3	9	6833	6841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895324
115	NC_010998	TGC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895325
116	NC_010998	CAG	2	6	7035	7040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895325
117	NC_010998	TCC	2	6	7087	7092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895325
118	NC_010998	GCG	2	6	7153	7158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895325
119	NC_010998	GAT	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895325
120	NC_010998	GCT	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895325
121	NC_010998	CGC	3	9	7314	7322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895325
122	NC_010998	TGG	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895325
123	NC_010998	CGA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895325
124	NC_010998	GCA	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895325
125	NC_010998	CAG	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895325
126	NC_010998	CGC	2	6	7572	7577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895325
127	NC_010998	TCC	2	6	7714	7719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895325
128	NC_010998	CGC	2	6	7892	7897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895325
129	NC_010998	GCG	2	6	7962	7967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895325
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