MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 9258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010998	ACG	2	6	157653	157658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895453
3502	NC_010998	TCG	2	6	157741	157746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895453
3503	NC_010998	CAC	2	6	157798	157803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895454
3504	NC_010998	CGA	3	9	157821	157829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895454
3505	NC_010998	TGC	2	6	157830	157835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895454
3506	NC_010998	TCG	2	6	157853	157858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895454
3507	NC_010998	CGAC	2	8	157875	157882	25 %	0 %	25 %	50 %	190895454
3508	NC_010998	GGA	2	6	158044	158049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895455
3509	NC_010998	CGA	2	6	158154	158159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895455
3510	NC_010998	GAC	2	6	158224	158229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895455
3511	NC_010998	GCC	2	6	158275	158280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895455
3512	NC_010998	TGC	2	6	158291	158296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895455
3513	NC_010998	GAC	2	6	158338	158343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895455
3514	NC_010998	TGA	2	6	158412	158417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895455
3515	NC_010998	GC	3	6	158434	158439	0 %	0 %	50 %	50 %	190895455
3516	NC_010998	TCG	2	6	158453	158458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895455
3517	NC_010998	CAGC	2	8	158486	158493	25 %	0 %	25 %	50 %	190895455
3518	NC_010998	CAGC	2	8	158598	158605	25 %	0 %	25 %	50 %	190895455
3519	NC_010998	TAAAGG	2	12	158652	158663	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190895455
3520	NC_010998	CGG	2	6	158704	158709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895455
3521	NC_010998	CG	3	6	158761	158766	0 %	0 %	50 %	50 %	190895455
3522	NC_010998	GAT	2	6	158848	158853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895455
3523	NC_010998	CGG	2	6	158856	158861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895455
3524	NC_010998	ATC	2	6	158876	158881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895455
3525	NC_010998	CCT	2	6	158991	158996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895455
3526	NC_010998	AGA	2	6	159150	159155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895456
3527	NC_010998	CAGGAT	2	12	159161	159172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190895456
3528	NC_010998	GCCA	2	8	159254	159261	25 %	0 %	25 %	50 %	190895456
3529	NC_010998	CGC	2	6	159363	159368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895457
3530	NC_010998	GTTC	2	8	159381	159388	0 %	50 %	25 %	25 %	190895457
3531	NC_010998	AGCG	2	8	159408	159415	25 %	0 %	50 %	25 %	190895457
3532	NC_010998	GTC	2	6	159418	159423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895457
3533	NC_010998	CGA	2	6	159441	159446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895457
3534	NC_010998	CGC	2	6	159582	159587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895457
3535	NC_010998	TCCAGC	2	12	159592	159603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190895457
3536	NC_010998	CAG	2	6	159732	159737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895457
3537	NC_010998	GCA	2	6	159746	159751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895457
3538	NC_010998	GGC	2	6	159763	159768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895457
3539	NC_010998	CGC	3	9	159806	159814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895457
3540	NC_010998	GC	3	6	159857	159862	0 %	0 %	50 %	50 %	190895457
3541	NC_010998	TCG	2	6	159964	159969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895457
3542	NC_010998	CCA	2	6	160026	160031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895457
3543	NC_010998	AGG	2	6	160076	160081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895457
3544	NC_010998	CGA	2	6	160129	160134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3545	NC_010998	CAG	2	6	160136	160141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3546	NC_010998	CAG	2	6	160172	160177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3547	NC_010998	ACC	2	6	160265	160270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895458
3548	NC_010998	TCG	2	6	160290	160295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3549	NC_010998	CATC	2	8	160309	160316	25 %	25 %	0 %	50 %	190895458
3550	NC_010998	CAG	2	6	160337	160342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3551	NC_010998	TTG	2	6	160389	160394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895458
3552	NC_010998	CCG	2	6	160395	160400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895458
3553	NC_010998	ATG	2	6	160494	160499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895458
3554	NC_010998	TGT	2	6	160537	160542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895458
3555	NC_010998	AGC	2	6	160602	160607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3556	NC_010998	GC	3	6	160702	160707	0 %	0 %	50 %	50 %	190895458
3557	NC_010998	CAA	2	6	160724	160729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895458
3558	NC_010998	ACG	3	9	160740	160748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3559	NC_010998	GC	3	6	160769	160774	0 %	0 %	50 %	50 %	190895458
3560	NC_010998	GAA	2	6	160871	160876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895458
3561	NC_010998	GAAC	2	8	160903	160910	50 %	0 %	25 %	25 %	190895458
3562	NC_010998	CGA	3	9	160912	160920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895458
3563	NC_010998	GGC	2	6	161150	161155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895459
3564	NC_010998	CGA	2	6	161188	161193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3565	NC_010998	CGA	2	6	161215	161220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
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3567	NC_010998	TCT	2	6	161308	161313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895459
3568	NC_010998	CGA	2	6	161323	161328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3569	NC_010998	TCG	2	6	161337	161342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3570	NC_010998	CAG	2	6	161423	161428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3571	NC_010998	CCA	2	6	161472	161477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895459
3572	NC_010998	AT	3	6	161490	161495	50 %	50 %	0 %	0 %	190895459
3573	NC_010998	GCT	2	6	161511	161516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3574	NC_010998	CGA	2	6	161563	161568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3575	NC_010998	TCG	2	6	161583	161588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3576	NC_010998	CGGC	2	8	161637	161644	0 %	0 %	50 %	50 %	190895459
3577	NC_010998	CGG	2	6	161690	161695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895459
3578	NC_010998	CAG	2	6	161705	161710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895459
3579	NC_010998	AGT	2	6	161719	161724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895459
3580	NC_010998	CTT	2	6	161732	161737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895459
3581	NC_010998	CGG	3	9	161740	161748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895459
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3583	NC_010998	CGAC	2	8	161830	161837	25 %	0 %	25 %	50 %	190895459
3584	NC_010998	GAA	2	6	161840	161845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895459
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3589	NC_010998	ATC	2	6	162017	162022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895459
3590	NC_010998	TGA	2	6	162052	162057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895459
3591	NC_010998	GTG	2	6	162120	162125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895459
3592	NC_010998	GCGA	2	8	162171	162178	25 %	0 %	50 %	25 %	190895459
3593	NC_010998	GGC	2	6	162437	162442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895459
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3595	NC_010998	CGA	2	6	162857	162862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895460
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3599	NC_010998	GCT	2	6	163262	163267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895460
3600	NC_010998	GGA	2	6	163382	163387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895460
3601	NC_010998	TTC	2	6	163446	163451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895460
3602	NC_010998	CAA	2	6	163487	163492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895460
3603	NC_010998	CCA	2	6	163607	163612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895460
3604	NC_010998	CGA	2	6	163624	163629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895460
3605	NC_010998	CCA	2	6	163645	163650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895460
3606	NC_010998	CCGTT	2	10	163660	163669	0 %	40 %	20 %	40 %	190895460
3607	NC_010998	ATA	2	6	163715	163720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190895461
3608	NC_010998	TGC	2	6	163721	163726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895461
3609	NC_010998	CGG	2	6	163742	163747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895461
3610	NC_010998	CTC	2	6	163772	163777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895461
3611	NC_010998	CCT	2	6	163782	163787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895461
3612	NC_010998	TCGT	2	8	163811	163818	0 %	50 %	25 %	25 %	190895461
3613	NC_010998	CAA	2	6	163860	163865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895461
3614	NC_010998	ACG	2	6	163866	163871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895461
3615	NC_010998	GAA	2	6	163881	163886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895461
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3617	NC_010998	CCG	2	6	164244	164249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895462
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3619	NC_010998	ATC	2	6	164293	164298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895462
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3981	NC_010998	CTT	2	6	181456	181461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895476
3982	NC_010998	GCC	2	6	181532	181537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895476
3983	NC_010998	TCA	2	6	181548	181553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895476
3984	NC_010998	CCG	2	6	181575	181580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895476
3985	NC_010998	CGA	2	6	181651	181656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895476
3986	NC_010998	CGGC	2	8	181804	181811	0 %	0 %	50 %	50 %	190895476
3987	NC_010998	TTC	2	6	181841	181846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895476
3988	NC_010998	GATCC	2	10	181862	181871	20 %	20 %	20 %	40 %	190895476
3989	NC_010998	CGG	2	6	181930	181935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895476
3990	NC_010998	GAT	2	6	181976	181981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895476
3991	NC_010998	CGG	2	6	182005	182010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895476
3992	NC_010998	GC	3	6	182030	182035	0 %	0 %	50 %	50 %	190895476
3993	NC_010998	CCT	2	6	182082	182087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895476
3994	NC_010998	CAAT	2	8	182088	182095	50 %	25 %	0 %	25 %	190895476
3995	NC_010998	CGCGG	2	10	182251	182260	0 %	0 %	60 %	40 %	190895476
3996	NC_010998	GCG	4	12	182263	182274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895476
3997	NC_010998	ATG	2	6	182279	182284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895476
3998	NC_010998	GAT	2	6	182314	182319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895476
3999	NC_010998	CTGG	2	8	182321	182328	0 %	25 %	50 %	25 %	190895476
4000	NC_010998	CGA	2	6	182329	182334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895476

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