MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 9258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010998	AGC	2	6	247530	247535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895542
5502	NC_010998	CGG	2	6	247595	247600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5503	NC_010998	CGG	2	6	247604	247609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5504	NC_010998	GGCG	2	8	247637	247644	0 %	0 %	75 %	25 %	190895542
5505	NC_010998	AAG	2	6	247695	247700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895542
5506	NC_010998	GCG	2	6	247711	247716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5507	NC_010998	GGC	2	6	247733	247738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5508	NC_010998	CAA	2	6	247748	247753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895542
5509	NC_010998	TCG	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895542
5510	NC_010998	CGC	2	6	247946	247951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895542
5511	NC_010998	AGG	2	6	247984	247989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895542
5512	NC_010998	GCG	2	6	248002	248007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5513	NC_010998	GGC	2	6	248030	248035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5514	NC_010998	GGC	2	6	248070	248075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5515	NC_010998	GAT	2	6	248273	248278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895543
5516	NC_010998	GC	3	6	248291	248296	0 %	0 %	50 %	50 %	190895543
5517	NC_010998	GAC	2	6	248324	248329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
5518	NC_010998	TCG	2	6	248412	248417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895543
5519	NC_010998	AGC	2	6	248418	248423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
5520	NC_010998	CAT	2	6	248447	248452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895543
5521	NC_010998	GC	3	6	248463	248468	0 %	0 %	50 %	50 %	190895543
5522	NC_010998	CGC	2	6	248476	248481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895543
5523	NC_010998	CGA	2	6	248494	248499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895543
5524	NC_010998	GCTT	2	8	248561	248568	0 %	50 %	25 %	25 %	190895543
5525	NC_010998	CGTGC	2	10	248582	248591	0 %	20 %	40 %	40 %	190895543
5526	NC_010998	GCC	2	6	248706	248711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895543
5527	NC_010998	GCGA	2	8	248753	248760	25 %	0 %	50 %	25 %	190895543
5528	NC_010998	CCA	2	6	248800	248805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895543
5529	NC_010998	GGAT	2	8	248851	248858	25 %	25 %	50 %	0 %	190895543
5530	NC_010998	TCAA	2	8	249042	249049	50 %	25 %	0 %	25 %	190895544
5531	NC_010998	GAC	2	6	249118	249123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
5532	NC_010998	CGC	2	6	249126	249131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895544
5533	NC_010998	TGA	2	6	249147	249152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895544
5534	NC_010998	GC	3	6	249153	249158	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
5535	NC_010998	CAT	2	6	249249	249254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895544
5536	NC_010998	CGGC	2	8	249263	249270	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
5537	NC_010998	GCG	2	6	249285	249290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895544
5538	NC_010998	GCC	2	6	249292	249297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895544
5539	NC_010998	CAG	2	6	249373	249378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
5540	NC_010998	CAG	2	6	249415	249420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895544
5541	NC_010998	GCG	2	6	249618	249623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895544
5542	NC_010998	CGGC	2	8	249705	249712	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
5543	NC_010998	TCC	2	6	249731	249736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895544
5544	NC_010998	GC	4	8	249777	249784	0 %	0 %	50 %	50 %	190895544
5545	NC_010998	CCGG	2	8	249981	249988	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
5546	NC_010998	CGGC	2	8	250052	250059	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
5547	NC_010998	CGG	2	6	250062	250067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
5548	NC_010998	AGC	2	6	250070	250075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5549	NC_010998	CGA	3	9	250110	250118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5550	NC_010998	AGGC	2	8	250145	250152	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
5551	NC_010998	TCA	2	6	250158	250163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895545
5552	NC_010998	AGGC	2	8	250175	250182	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
5553	NC_010998	GGC	3	9	250180	250188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
5554	NC_010998	CG	3	6	250198	250203	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
5555	NC_010998	GCA	3	9	250275	250283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5556	NC_010998	CGC	2	6	250312	250317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895545
5557	NC_010998	GGC	2	6	250321	250326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
5558	NC_010998	CCCG	2	8	250371	250378	0 %	0 %	25 %	75 %	190895545
5559	NC_010998	GGAC	2	8	250398	250405	25 %	0 %	50 %	25 %	190895545
5560	NC_010998	GAT	2	6	250452	250457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895545
5561	NC_010998	CGC	2	6	250464	250469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895545
5562	NC_010998	GAC	2	6	250504	250509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5563	NC_010998	GCA	2	6	250542	250547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5564	NC_010998	GCA	2	6	250623	250628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5565	NC_010998	GA	3	6	250747	250752	50 %	0 %	50 %	0 %	190895545
5566	NC_010998	GGC	2	6	250765	250770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
5567	NC_010998	TGG	2	6	250815	250820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895545
5568	NC_010998	TCT	2	6	250851	250856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895545
5569	NC_010998	GC	3	6	250869	250874	0 %	0 %	50 %	50 %	190895545
5570	NC_010998	GCG	2	6	250899	250904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895545
5571	NC_010998	TCG	2	6	250913	250918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5572	NC_010998	AGG	2	6	250920	250925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895545
5573	NC_010998	TGCGGC	2	12	251020	251031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190895545
5574	NC_010998	GTGG	2	8	251035	251042	0 %	25 %	75 %	0 %	190895545
5575	NC_010998	ACG	2	6	251207	251212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
5576	NC_010998	CGA	2	6	251252	251257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895545
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5578	NC_010998	CCA	2	6	251352	251357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895546
5579	NC_010998	TTC	2	6	251359	251364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895546
5580	NC_010998	GATG	2	8	251450	251457	25 %	25 %	50 %	0 %	190895546
5581	NC_010998	TCG	2	6	251512	251517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895546
5582	NC_010998	GCG	2	6	251609	251614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895547
5583	NC_010998	GAT	2	6	251618	251623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
5584	NC_010998	TGA	3	9	251638	251646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
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5586	NC_010998	CGC	2	6	251743	251748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895547
5587	NC_010998	GCC	2	6	251762	251767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895547
5588	NC_010998	GCC	2	6	251780	251785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895547
5589	NC_010998	GAC	2	6	251801	251806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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5591	NC_010998	ATG	2	6	251886	251891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
5592	NC_010998	CAG	2	6	251897	251902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
5593	NC_010998	GAAT	2	8	251908	251915	50 %	25 %	25 %	0 %	190895547
5594	NC_010998	GGC	2	6	251948	251953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895547
5595	NC_010998	GCCG	2	8	251983	251990	0 %	0 %	50 %	50 %	190895547
5596	NC_010998	TCG	2	6	251995	252000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895547
5597	NC_010998	GCA	3	9	252004	252012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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5599	NC_010998	CGG	2	6	252100	252105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895547
5600	NC_010998	GAC	2	6	252179	252184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
5601	NC_010998	CGC	2	6	252229	252234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895547
5602	NC_010998	TGCCGA	2	12	252247	252258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895547
5603	NC_010998	AGCG	2	8	252317	252324	25 %	0 %	50 %	25 %	190895547
5604	NC_010998	GAT	2	6	252326	252331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895547
5605	NC_010998	AG	3	6	252341	252346	50 %	0 %	50 %	0 %	190895547
5606	NC_010998	AGC	2	6	252369	252374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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5608	NC_010998	TGAAGA	2	12	252469	252480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190895547
5609	NC_010998	AGC	2	6	252501	252506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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5612	NC_010998	TGGA	2	8	252573	252580	25 %	25 %	50 %	0 %	190895547
5613	NC_010998	TGC	2	6	252592	252597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895547
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5615	NC_010998	GAT	2	6	252637	252642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
5616	NC_010998	ATG	2	6	252689	252694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
5617	NC_010998	TGA	2	6	252756	252761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895548
5618	NC_010998	GC	3	6	252774	252779	0 %	0 %	50 %	50 %	190895548
5619	NC_010998	CGC	2	6	252807	252812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895548
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5621	NC_010998	GAA	2	6	252955	252960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895548
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5855	NC_010998	CGT	2	6	262091	262096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895555
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5857	NC_010998	CG	3	6	262141	262146	0 %	0 %	50 %	50 %	190895555
5858	NC_010998	GGGCC	2	10	262175	262184	0 %	0 %	60 %	40 %	190895555
5859	NC_010998	GGC	2	6	262187	262192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895555
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5863	NC_010998	TCG	2	6	262695	262700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895556
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5969	NC_010998	ACGCTG	2	12	267198	267209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895561
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5978	NC_010998	GGC	3	9	267796	267804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895563
5979	NC_010998	CGA	2	6	267954	267959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895563
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5981	NC_010998	GCT	2	6	268108	268113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895564
5982	NC_010998	TGA	2	6	268136	268141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895564
5983	NC_010998	GCG	2	6	268143	268148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895564
5984	NC_010998	TGT	2	6	268149	268154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895564
5985	NC_010998	CGG	2	6	268158	268163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895564
5986	NC_010998	GGC	2	6	268165	268170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895564
5987	NC_010998	GTC	2	6	268181	268186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895564
5988	NC_010998	GAA	2	6	268205	268210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895564
5989	NC_010998	CGACAA	2	12	268251	268262	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190895564
5990	NC_010998	CGCCGG	2	12	268317	268328	0 %	0 %	50 %	50 %	190895564
5991	NC_010998	GTCG	2	8	268656	268663	0 %	25 %	50 %	25 %	190895565
5992	NC_010998	GCG	2	6	268688	268693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895565
5993	NC_010998	CGA	2	6	268749	268754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895565
5994	NC_010998	TGC	2	6	268769	268774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895565
5995	NC_010998	GAA	2	6	268792	268797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895565
5996	NC_010998	GCTC	2	8	268832	268839	0 %	25 %	25 %	50 %	190895565
5997	NC_010998	CTG	2	6	268843	268848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895565
5998	NC_010998	GAC	3	9	268896	268904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895565
5999	NC_010998	CG	3	6	268913	268918	0 %	0 %	50 %	50 %	190895565
6000	NC_010998	GCCG	2	8	268935	268942	0 %	0 %	50 %	50 %	190895565

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