MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 9258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_010998	GCC	2	6	226871	226876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895523
5003	NC_010998	GC	4	8	226881	226888	0 %	0 %	50 %	50 %	190895523
5004	NC_010998	GCGG	2	8	226903	226910	0 %	0 %	75 %	25 %	190895523
5005	NC_010998	TGA	2	6	226940	226945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895523
5006	NC_010998	CGCC	2	8	226968	226975	0 %	0 %	25 %	75 %	190895523
5007	NC_010998	CAG	2	6	227014	227019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5008	NC_010998	GTC	2	6	227023	227028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5009	NC_010998	CGG	2	6	227112	227117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895523
5010	NC_010998	GAT	2	6	227179	227184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895523
5011	NC_010998	CGT	2	6	227190	227195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5012	NC_010998	GAT	2	6	227206	227211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895523
5013	NC_010998	GAC	2	6	227257	227262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5014	NC_010998	CGT	2	6	227296	227301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5015	NC_010998	TCG	2	6	227390	227395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5016	NC_010998	CGA	2	6	227414	227419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5017	NC_010998	CG	3	6	227478	227483	0 %	0 %	50 %	50 %	190895523
5018	NC_010998	GAT	2	6	227485	227490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895523
5019	NC_010998	CGA	2	6	227538	227543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895523
5020	NC_010998	GAC	2	6	227551	227556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895523
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5022	NC_010998	CG	3	6	227652	227657	0 %	0 %	50 %	50 %	190895523
5023	NC_010998	GTC	2	6	227719	227724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895523
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5032	NC_010998	GGC	3	9	228263	228271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895524
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5035	NC_010998	TTC	2	6	228366	228371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895524
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5044	NC_010998	GAT	3	9	228688	228696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895525
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5047	NC_010998	GAT	2	6	228802	228807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895525
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5050	NC_010998	CG	3	6	228858	228863	0 %	0 %	50 %	50 %	190895525
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5055	NC_010998	CGC	2	6	229023	229028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895525
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5119	NC_010998	CGG	2	6	231021	231026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895526
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5239	NC_010998	CGA	2	6	237188	237193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895531
5240	NC_010998	GCG	2	6	237245	237250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895531
5241	NC_010998	AAG	2	6	237348	237353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895531
5242	NC_010998	GGC	2	6	237465	237470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895532
5243	NC_010998	GAT	2	6	237492	237497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895532
5244	NC_010998	CGTG	2	8	237512	237519	0 %	25 %	50 %	25 %	190895532
5245	NC_010998	GGCG	2	8	237557	237564	0 %	0 %	75 %	25 %	190895532
5246	NC_010998	TCG	2	6	237574	237579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895532
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5248	NC_010998	CG	3	6	237612	237617	0 %	0 %	50 %	50 %	190895532
5249	NC_010998	CGG	2	6	237675	237680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895532
5250	NC_010998	TCC	2	6	237688	237693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895532
5251	NC_010998	GCAG	2	8	237710	237717	25 %	0 %	50 %	25 %	190895532
5252	NC_010998	CGAG	2	8	237728	237735	25 %	0 %	50 %	25 %	190895532
5253	NC_010998	CCG	2	6	237740	237745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895532
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5257	NC_010998	GC	3	6	237860	237865	0 %	0 %	50 %	50 %	190895532
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5262	NC_010998	GAC	2	6	238092	238097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895532
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5264	NC_010998	CGG	2	6	238247	238252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895532
5265	NC_010998	CGAG	2	8	238316	238323	25 %	0 %	50 %	25 %	190895532
5266	NC_010998	TCA	2	6	238334	238339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895532
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5269	NC_010998	TGC	2	6	238531	238536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895532
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5271	NC_010998	GCT	2	6	238583	238588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895532
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5274	NC_010998	TGC	2	6	238633	238638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895532
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5302	NC_010998	CTG	2	6	239703	239708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895534
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5313	NC_010998	TGA	2	6	240345	240350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895535
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5315	NC_010998	CTG	3	9	240365	240373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895535
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5327	NC_010998	GAC	2	6	241225	241230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895536
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5331	NC_010998	ACG	2	6	241304	241309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895536
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5333	NC_010998	CGG	2	6	241384	241389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895536
5334	NC_010998	GCG	2	6	241407	241412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895536
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5340	NC_010998	GTC	2	6	241502	241507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895536
5341	NC_010998	TCCT	2	8	241547	241554	0 %	50 %	0 %	50 %	190895536
5342	NC_010998	ATC	2	6	241567	241572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895536
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5346	NC_010998	GCT	2	6	241678	241683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895536
5347	NC_010998	CTGACG	2	12	241733	241744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190895536
5348	NC_010998	CGA	3	9	241765	241773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895536
5349	NC_010998	A	6	6	241790	241795	100 %	0 %	0 %	0 %	190895536
5350	NC_010998	TTC	2	6	241796	241801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895536
5351	NC_010998	CGA	2	6	241891	241896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895536
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5353	NC_010998	GAT	2	6	241981	241986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895536
5354	NC_010998	CTG	2	6	242000	242005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895536
5355	NC_010998	AAG	2	6	242012	242017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895536
5356	NC_010998	CCA	2	6	242061	242066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895536
5357	NC_010998	GTG	2	6	242170	242175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895537
5358	NC_010998	CCGC	2	8	242180	242187	0 %	0 %	25 %	75 %	190895537
5359	NC_010998	CGG	2	6	242205	242210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895537
5360	NC_010998	ACC	2	6	242293	242298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895537
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5363	NC_010998	CGC	2	6	242375	242380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895537
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5365	NC_010998	CGG	2	6	242426	242431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895537
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5477	NC_010998	CGC	2	6	246403	246408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895541
5478	NC_010998	TGC	2	6	246445	246450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5479	NC_010998	GCGG	2	8	246452	246459	0 %	0 %	75 %	25 %	190895541
5480	NC_010998	GTC	2	6	246468	246473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5481	NC_010998	GGC	2	6	246587	246592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895541
5482	NC_010998	CCG	2	6	246614	246619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895541
5483	NC_010998	CGATGG	2	12	246628	246639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190895541
5484	NC_010998	CGA	2	6	246841	246846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5485	NC_010998	TCG	2	6	246919	246924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5486	NC_010998	CCGG	2	8	246947	246954	0 %	0 %	50 %	50 %	190895541
5487	NC_010998	GC	3	6	247001	247006	0 %	0 %	50 %	50 %	190895541
5488	NC_010998	ACG	2	6	247023	247028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5489	NC_010998	CGT	2	6	247076	247081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5490	NC_010998	CGA	2	6	247174	247179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895541
5491	NC_010998	GGC	3	9	247196	247204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895541
5492	NC_010998	GAT	2	6	247205	247210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895541
5493	NC_010998	GGGC	2	8	247274	247281	0 %	0 %	75 %	25 %	190895542
5494	NC_010998	GGC	2	6	247286	247291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5495	NC_010998	GGC	2	6	247352	247357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5496	NC_010998	GCG	2	6	247366	247371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895542
5497	NC_010998	TGC	2	6	247429	247434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895542
5498	NC_010998	GCAGG	2	10	247436	247445	20 %	0 %	60 %	20 %	190895542
5499	NC_010998	GGAC	2	8	247462	247469	25 %	0 %	50 %	25 %	190895542
5500	NC_010998	CCA	2	6	247513	247518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895542

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