MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 21949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010997	C	6	6	195152	195157	0 %	0 %	0 %	100 %	190894533
4002	NC_010997	CAT	2	6	195164	195169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894533
4003	NC_010997	GCG	2	6	195232	195237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894533
4004	NC_010997	GA	3	6	195250	195255	50 %	0 %	50 %	0 %	190894533
4005	NC_010997	GGC	2	6	195258	195263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894533
4006	NC_010997	GCA	2	6	195269	195274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4007	NC_010997	CGC	2	6	195275	195280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894533
4008	NC_010997	ATC	2	6	195292	195297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894533
4009	NC_010997	GCCGAG	2	12	195324	195335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190894533
4010	NC_010997	AAAGG	2	10	195336	195345	60 %	0 %	40 %	0 %	190894533
4011	NC_010997	GCC	2	6	195346	195351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894533
4012	NC_010997	CGA	2	6	195371	195376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4013	NC_010997	CGG	2	6	195399	195404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894533
4014	NC_010997	ACG	2	6	195559	195564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4015	NC_010997	TCG	2	6	195658	195663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4016	NC_010997	CCG	2	6	195670	195675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894533
4017	NC_010997	CG	3	6	195757	195762	0 %	0 %	50 %	50 %	190894533
4018	NC_010997	AGC	2	6	195841	195846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4019	NC_010997	GCCC	2	8	195847	195854	0 %	0 %	25 %	75 %	190894533
4020	NC_010997	AGC	2	6	195895	195900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894533
4021	NC_010997	GCC	2	6	195983	195988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894534
4022	NC_010997	CGA	2	6	196033	196038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4023	NC_010997	GAC	2	6	196073	196078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4024	NC_010997	GCG	2	6	196093	196098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894534
4025	NC_010997	CCT	2	6	196117	196122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894534
4026	NC_010997	GCC	2	6	196175	196180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894534
4027	NC_010997	GCC	2	6	196188	196193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894534
4028	NC_010997	GCA	2	6	196222	196227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4029	NC_010997	GC	3	6	196235	196240	0 %	0 %	50 %	50 %	190894534
4030	NC_010997	GCA	2	6	196249	196254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4031	NC_010997	CAG	2	6	196556	196561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4032	NC_010997	CGAA	2	8	196621	196628	50 %	0 %	25 %	25 %	190894534
4033	NC_010997	CAG	3	9	196649	196657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4034	NC_010997	GC	3	6	196684	196689	0 %	0 %	50 %	50 %	190894534
4035	NC_010997	CGGT	2	8	196694	196701	0 %	25 %	50 %	25 %	190894534
4036	NC_010997	CGAC	2	8	196708	196715	25 %	0 %	25 %	50 %	190894534
4037	NC_010997	AGAGCC	2	12	196750	196761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4038	NC_010997	GCCT	2	8	196803	196810	0 %	25 %	25 %	50 %	190894534
4039	NC_010997	CGC	2	6	196822	196827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894534
4040	NC_010997	CAC	2	6	196898	196903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894534
4041	NC_010997	CAG	2	6	196907	196912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4042	NC_010997	TGC	2	6	196921	196926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894534
4043	NC_010997	TGA	2	6	197152	197157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894535
4044	NC_010997	CGA	3	9	197194	197202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4045	NC_010997	GCT	2	6	197203	197208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4046	NC_010997	GC	3	6	197231	197236	0 %	0 %	50 %	50 %	190894535
4047	NC_010997	TGA	2	6	197266	197271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894535
4048	NC_010997	GCC	2	6	197297	197302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894535
4049	NC_010997	GTG	2	6	197352	197357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894535
4050	NC_010997	CGC	2	6	197371	197376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894535
4051	NC_010997	CGG	2	6	197384	197389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894535
4052	NC_010997	GGC	2	6	197612	197617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894535
4053	NC_010997	TTC	2	6	197670	197675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894535
4054	NC_010997	GGC	4	12	197690	197701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894535
4055	NC_010997	GCG	2	6	197789	197794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894535
4056	NC_010997	TGAT	2	8	197796	197803	25 %	50 %	25 %	0 %	190894535
4057	NC_010997	CGA	3	9	197806	197814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4058	NC_010997	CCG	2	6	197899	197904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894535
4059	NC_010997	GGC	2	6	197909	197914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894535
4060	NC_010997	TCG	2	6	197925	197930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4061	NC_010997	CG	3	6	197954	197959	0 %	0 %	50 %	50 %	190894535
4062	NC_010997	GCA	2	6	197965	197970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4063	NC_010997	TCG	2	6	197985	197990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4064	NC_010997	AAT	2	6	198013	198018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894535
4065	NC_010997	GTA	2	6	198038	198043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894535
4066	NC_010997	TTG	2	6	198096	198101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894535
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4068	NC_010997	CGA	2	6	198145	198150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4069	NC_010997	GAC	2	6	198158	198163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894535
4070	NC_010997	GGGCA	2	10	198164	198173	20 %	0 %	60 %	20 %	190894535
4071	NC_010997	GTC	2	6	198227	198232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894535
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4084	NC_010997	GGC	2	6	199093	199098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894536
4085	NC_010997	AGATCA	2	12	199126	199137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	190894536
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4090	NC_010997	CG	4	8	199336	199343	0 %	0 %	50 %	50 %	190894536
4091	NC_010997	GATC	2	8	199387	199394	25 %	25 %	25 %	25 %	190894536
4092	NC_010997	CGAC	2	8	199422	199429	25 %	0 %	25 %	50 %	190894536
4093	NC_010997	AACG	2	8	199433	199440	50 %	0 %	25 %	25 %	190894536
4094	NC_010997	AGA	2	6	199458	199463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894536
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4101	NC_010997	ATC	2	6	199680	199685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894536
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4103	NC_010997	TTGG	2	8	199730	199737	0 %	50 %	50 %	0 %	190894536
4104	NC_010997	GCC	3	9	199758	199766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894536
4105	NC_010997	GC	3	6	199813	199818	0 %	0 %	50 %	50 %	190894536
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4109	NC_010997	GCT	2	6	200153	200158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894537
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4117	NC_010997	CATT	2	8	200470	200477	25 %	50 %	0 %	25 %	190894537
4118	NC_010997	TTC	2	6	200483	200488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894537
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4121	NC_010997	GAA	2	6	200516	200521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894537
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4210	NC_010997	TAC	2	6	204738	204743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894541
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4222	NC_010997	TCT	3	9	205129	205137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894541
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4240	NC_010997	TCG	2	6	205994	205999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894542
4241	NC_010997	TCG	2	6	206087	206092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894542
4242	NC_010997	GGGCA	2	10	206131	206140	20 %	0 %	60 %	20 %	190894542
4243	NC_010997	TCG	2	6	206162	206167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894542
4244	NC_010997	TCG	2	6	206192	206197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894542
4245	NC_010997	TCG	2	6	206222	206227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894542
4246	NC_010997	CGC	2	6	206233	206238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894542
4247	NC_010997	ACCG	2	8	206470	206477	25 %	0 %	25 %	50 %	190894543
4248	NC_010997	TGCT	2	8	206496	206503	0 %	50 %	25 %	25 %	190894543
4249	NC_010997	GGCG	2	8	206518	206525	0 %	0 %	75 %	25 %	190894543
4250	NC_010997	GCG	3	9	206545	206553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894543
4251	NC_010997	ATC	2	6	206624	206629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894543
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4253	NC_010997	ATC	2	6	206717	206722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894543
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4256	NC_010997	CGT	2	6	206821	206826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894543
4257	NC_010997	GCG	4	12	206865	206876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894543
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4262	NC_010997	CTT	2	6	207094	207099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894543
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4264	NC_010997	CGC	2	6	207214	207219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894543
4265	NC_010997	CAAG	2	8	207244	207251	50 %	0 %	25 %	25 %	190894543
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4282	NC_010997	CGC	2	6	208277	208282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894545
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4352	NC_010997	ATC	2	6	211917	211922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894548
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4357	NC_010997	GAT	2	6	212054	212059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894548
4358	NC_010997	GAA	2	6	212098	212103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894549
4359	NC_010997	CGA	2	6	212196	212201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894549
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4361	NC_010997	GAC	2	6	212230	212235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894549
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4365	NC_010997	TTC	2	6	212394	212399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894549
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4463	NC_010997	GGCC	2	8	216434	216441	0 %	0 %	50 %	50 %	190894552
4464	NC_010997	GAA	2	6	216462	216467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894552
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4471	NC_010997	CCTT	2	8	216862	216869	0 %	50 %	0 %	50 %	190894552
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4476	NC_010997	AAG	2	6	217275	217280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894553
4477	NC_010997	CTTCG	2	10	217287	217296	0 %	40 %	20 %	40 %	190894553
4478	NC_010997	GCG	2	6	217334	217339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894553
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4480	NC_010997	CGG	2	6	217410	217415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
4481	NC_010997	GTC	3	9	217430	217438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
4482	NC_010997	TGGC	2	8	217461	217468	0 %	25 %	50 %	25 %	190894554
4483	NC_010997	CGGCG	2	10	217526	217535	0 %	0 %	60 %	40 %	190894554
4484	NC_010997	GGC	2	6	217638	217643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
4485	NC_010997	CTG	2	6	217701	217706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
4486	NC_010997	GGC	2	6	217712	217717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894554
4487	NC_010997	GGCT	2	8	217746	217753	0 %	25 %	50 %	25 %	190894554
4488	NC_010997	GCT	2	6	217760	217765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894554
4489	NC_010997	GGA	2	6	217797	217802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894554
4490	NC_010997	TCGG	2	8	217803	217810	0 %	25 %	50 %	25 %	190894554
4491	NC_010997	CAT	2	6	217832	217837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894554
4492	NC_010997	AGC	2	6	217843	217848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894554
4493	NC_010997	CGGC	2	8	217867	217874	0 %	0 %	50 %	50 %	190894554
4494	NC_010997	GCCA	2	8	217908	217915	25 %	0 %	25 %	50 %	190894554
4495	NC_010997	CAT	2	6	217940	217945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894554
4496	NC_010997	GA	3	6	218004	218009	50 %	0 %	50 %	0 %	190894554
4497	NC_010997	TGT	2	6	218040	218045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894555
4498	NC_010997	CGC	3	9	218102	218110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894555
4499	NC_010997	GCC	2	6	218159	218164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894555
4500	NC_010997	GCG	2	6	218179	218184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894555

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