MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 21949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010997	GAC	2	6	23614	23619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
502	NC_010997	CCAGAT	2	12	23626	23637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190894365
503	NC_010997	CGT	2	6	23740	23745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894365
504	NC_010997	GCC	2	6	23750	23755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894365
505	NC_010997	C	6	6	23754	23759	0 %	0 %	0 %	100 %	190894365
506	NC_010997	CATC	2	8	23764	23771	25 %	25 %	0 %	50 %	190894365
507	NC_010997	AGC	3	9	23840	23848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
508	NC_010997	CGA	2	6	23925	23930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
509	NC_010997	CAC	2	6	23932	23937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894365
510	NC_010997	GAC	2	6	23941	23946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
511	NC_010997	GGA	2	6	23997	24002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894365
512	NC_010997	CGA	2	6	24096	24101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
513	NC_010997	TGATC	2	10	24147	24156	20 %	40 %	20 %	20 %	190894365
514	NC_010997	AGG	2	6	24185	24190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894365
515	NC_010997	AG	4	8	24246	24253	50 %	0 %	50 %	0 %	190894365
516	NC_010997	GCC	2	6	24260	24265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894365
517	NC_010997	AGC	2	6	24284	24289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894365
518	NC_010997	CGG	2	6	24306	24311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
519	NC_010997	CGG	2	6	24399	24404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
520	NC_010997	CGGCC	2	10	24426	24435	0 %	0 %	40 %	60 %	190894365
521	NC_010997	TGC	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894365
522	NC_010997	AAC	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894365
523	NC_010997	GC	3	6	24486	24491	0 %	0 %	50 %	50 %	190894365
524	NC_010997	GCG	2	6	24515	24520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894365
525	NC_010997	AGC	2	6	27352	27357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894366
526	NC_010997	GCCG	2	8	27359	27366	0 %	0 %	50 %	50 %	190894366
527	NC_010997	GAT	2	6	27379	27384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894366
528	NC_010997	TTC	2	6	27385	27390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894366
529	NC_010997	TC	3	6	27406	27411	0 %	50 %	0 %	50 %	190894366
530	NC_010997	AGG	2	6	27434	27439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894366
531	NC_010997	GCA	2	6	27444	27449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894366
532	NC_010997	AGC	2	6	27491	27496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894366
533	NC_010997	GGTC	2	8	27507	27514	0 %	25 %	50 %	25 %	190894366
534	NC_010997	ACG	2	6	27515	27520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894366
535	NC_010997	GCG	2	6	27593	27598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894366
536	NC_010997	CGA	2	6	27616	27621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894366
537	NC_010997	GCC	2	6	27639	27644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894366
538	NC_010997	TTC	2	6	27653	27658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894366
539	NC_010997	GCG	2	6	27662	27667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894366
540	NC_010997	GATG	2	8	27692	27699	25 %	25 %	50 %	0 %	190894366
541	NC_010997	GCG	2	6	28481	28486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894367
542	NC_010997	CGT	2	6	28635	28640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894367
543	NC_010997	GAC	2	6	28729	28734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894367
544	NC_010997	GCAC	2	8	28740	28747	25 %	0 %	25 %	50 %	190894367
545	NC_010997	GCCG	2	8	28764	28771	0 %	0 %	50 %	50 %	190894367
546	NC_010997	CGG	2	6	30853	30858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894368
547	NC_010997	TGC	3	9	30884	30892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894368
548	NC_010997	CG	3	6	30958	30963	0 %	0 %	50 %	50 %	190894368
549	NC_010997	TC	3	6	30976	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	190894368
550	NC_010997	GC	3	6	31040	31045	0 %	0 %	50 %	50 %	190894368
551	NC_010997	TCC	2	6	31050	31055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894368
552	NC_010997	TCG	2	6	31056	31061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894368
553	NC_010997	CTG	2	6	31118	31123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894368
554	NC_010997	TCG	2	6	31143	31148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894368
555	NC_010997	ATT	2	6	31304	31309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894368
556	NC_010997	GAT	2	6	31325	31330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894368
557	NC_010997	AAAACG	2	12	31401	31412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	190894368
558	NC_010997	ACC	2	6	31524	31529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894369
559	NC_010997	ACC	2	6	31557	31562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894369
560	NC_010997	GGT	2	6	31697	31702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894369
561	NC_010997	ATCG	2	8	31766	31773	25 %	25 %	25 %	25 %	190894369
562	NC_010997	AGCC	2	8	31815	31822	25 %	0 %	25 %	50 %	190894369
563	NC_010997	CAGC	2	8	31838	31845	25 %	0 %	25 %	50 %	190894369
564	NC_010997	GAT	2	6	31871	31876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894369
565	NC_010997	GGA	2	6	31883	31888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894369
566	NC_010997	CTC	2	6	31895	31900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894369
567	NC_010997	CTC	2	6	31904	31909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894369
568	NC_010997	AGC	2	6	32088	32093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894369
569	NC_010997	ACG	3	9	32190	32198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894369
570	NC_010997	TCG	2	6	32202	32207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894369
571	NC_010997	GCG	2	6	32234	32239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894369
572	NC_010997	CG	3	6	32264	32269	0 %	0 %	50 %	50 %	190894369
573	NC_010997	CTT	2	6	32309	32314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894369
574	NC_010997	CTG	2	6	32369	32374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894369
575	NC_010997	TCG	2	6	32400	32405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894369
576	NC_010997	GAC	2	6	32420	32425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894369
577	NC_010997	GAT	2	6	32429	32434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894369
578	NC_010997	CCT	2	6	32468	32473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894370
579	NC_010997	AGA	2	6	32494	32499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894370
580	NC_010997	CCGA	2	8	32587	32594	25 %	0 %	25 %	50 %	190894370
581	NC_010997	GCA	2	6	32606	32611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894370
582	NC_010997	TCA	2	6	32639	32644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894370
583	NC_010997	TCGGCC	2	12	32671	32682	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190894370
584	NC_010997	CTC	2	6	32724	32729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894370
585	NC_010997	TCC	2	6	32752	32757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894370
586	NC_010997	GC	3	6	32788	32793	0 %	0 %	50 %	50 %	190894370
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589	NC_010997	CTG	2	6	32905	32910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894370
590	NC_010997	TCG	2	6	32920	32925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894370
591	NC_010997	AGC	2	6	32998	33003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894370
592	NC_010997	TCG	2	6	33038	33043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894370
593	NC_010997	CCT	2	6	33101	33106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894370
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595	NC_010997	GCG	2	6	33240	33245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894370
596	NC_010997	AGGCC	2	10	33386	33395	20 %	0 %	40 %	40 %	190894370
597	NC_010997	CGG	2	6	33410	33415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894370
598	NC_010997	TGA	2	6	33458	33463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894370
599	NC_010997	CAT	2	6	33604	33609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894371
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601	NC_010997	GACG	2	8	33676	33683	25 %	0 %	50 %	25 %	190894371
602	NC_010997	GCG	2	6	33703	33708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894371
603	NC_010997	CGG	2	6	33745	33750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894371
604	NC_010997	GCG	2	6	33788	33793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894371
605	NC_010997	GCCGCG	2	12	33861	33872	0 %	0 %	50 %	50 %	190894371
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611	NC_010997	GAGC	2	8	34111	34118	25 %	0 %	50 %	25 %	190894371
612	NC_010997	AC	3	6	34303	34308	50 %	0 %	0 %	50 %	190894371
613	NC_010997	AGC	2	6	34473	34478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894372
614	NC_010997	GCCG	2	8	34533	34540	0 %	0 %	50 %	50 %	190894372
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618	NC_010997	CGG	2	6	34647	34652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894372
619	NC_010997	GGC	2	6	34720	34725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894372
620	NC_010997	ACGCC	2	10	34733	34742	20 %	0 %	20 %	60 %	190894372
621	NC_010997	CA	3	6	34763	34768	50 %	0 %	0 %	50 %	190894372
622	NC_010997	TCG	2	6	35189	35194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894373
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