MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 21949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010997	GC	3	6	218204	218209	0 %	0 %	50 %	50 %	190894555
4502	NC_010997	TGCC	2	8	218419	218426	0 %	25 %	25 %	50 %	190894555
4503	NC_010997	GC	3	6	218522	218527	0 %	0 %	50 %	50 %	190894555
4504	NC_010997	GCCCGC	2	12	218579	218590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894555
4505	NC_010997	TCG	2	6	218598	218603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894555
4506	NC_010997	GCG	2	6	218709	218714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4507	NC_010997	CG	3	6	218713	218718	0 %	0 %	50 %	50 %	190894556
4508	NC_010997	TGG	2	6	218773	218778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894556
4509	NC_010997	CGG	2	6	218796	218801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4510	NC_010997	CGG	2	6	218822	218827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4511	NC_010997	CGGCG	2	10	218893	218902	0 %	0 %	60 %	40 %	190894556
4512	NC_010997	ACC	2	6	218903	218908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894556
4513	NC_010997	CTT	2	6	218925	218930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894556
4514	NC_010997	CGT	2	6	218931	218936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4515	NC_010997	TGC	2	6	218954	218959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4516	NC_010997	CGG	2	6	219023	219028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4517	NC_010997	CGC	2	6	219152	219157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894556
4518	NC_010997	CTT	2	6	219163	219168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894556
4519	NC_010997	TCG	2	6	219185	219190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4520	NC_010997	TG	3	6	219216	219221	0 %	50 %	50 %	0 %	190894556
4521	NC_010997	CGG	3	9	219291	219299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4522	NC_010997	TCG	2	6	219314	219319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4523	NC_010997	GCT	2	6	219324	219329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4524	NC_010997	GGC	2	6	219360	219365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4525	NC_010997	TCG	3	9	219383	219391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894556
4526	NC_010997	CTT	2	6	219396	219401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894556
4527	NC_010997	CGG	2	6	219402	219407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4528	NC_010997	GGC	2	6	219475	219480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894556
4529	NC_010997	CGC	2	6	219510	219515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894556
4530	NC_010997	TTC	2	6	219523	219528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894556
4531	NC_010997	GCT	2	6	219619	219624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894557
4532	NC_010997	GAC	2	6	219710	219715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894557
4533	NC_010997	GCCG	2	8	219766	219773	0 %	0 %	50 %	50 %	190894557
4534	NC_010997	GCC	2	6	219799	219804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894557
4535	NC_010997	AGCC	2	8	219828	219835	25 %	0 %	25 %	50 %	190894557
4536	NC_010997	GAC	2	6	219860	219865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894557
4537	NC_010997	ATC	2	6	219896	219901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894557
4538	NC_010997	TTC	2	6	219920	219925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894558
4539	NC_010997	GCC	3	9	219944	219952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
4540	NC_010997	GCA	2	6	219996	220001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894558
4541	NC_010997	GCC	2	6	220147	220152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
4542	NC_010997	GTC	2	6	220195	220200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894558
4543	NC_010997	GAA	2	6	220213	220218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894558
4544	NC_010997	CGG	2	6	220258	220263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894558
4545	NC_010997	GCC	3	9	220264	220272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
4546	NC_010997	CGGG	2	8	220326	220333	0 %	0 %	75 %	25 %	190894558
4547	NC_010997	GCC	3	9	220453	220461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
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4549	NC_010997	TTG	2	6	220526	220531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894558
4550	NC_010997	GCTGC	2	10	220579	220588	0 %	20 %	40 %	40 %	190894558
4551	NC_010997	CGC	2	6	220617	220622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894558
4552	NC_010997	TCG	2	6	220646	220651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894558
4553	NC_010997	CTT	2	6	220732	220737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894558
4554	NC_010997	CATA	2	8	220819	220826	50 %	25 %	0 %	25 %	190894558
4555	NC_010997	CGA	2	6	221024	221029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4556	NC_010997	CAC	2	6	221052	221057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894559
4557	NC_010997	CGA	2	6	221063	221068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4558	NC_010997	GAG	2	6	221071	221076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894559
4559	NC_010997	CAG	2	6	221112	221117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4560	NC_010997	CT	3	6	221132	221137	0 %	50 %	0 %	50 %	190894559
4561	NC_010997	GCC	2	6	221143	221148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894559
4562	NC_010997	CAG	2	6	221154	221159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4563	NC_010997	GGA	2	6	221160	221165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894559
4564	NC_010997	GGC	2	6	221166	221171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894559
4565	NC_010997	ATC	2	6	221188	221193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894559
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4567	NC_010997	GGC	2	6	221250	221255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894559
4568	NC_010997	GCA	2	6	221363	221368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4569	NC_010997	ATGCCG	2	12	221395	221406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190894559
4570	NC_010997	GAT	2	6	221409	221414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894559
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4573	NC_010997	CG	4	8	221720	221727	0 %	0 %	50 %	50 %	190894560
4574	NC_010997	CCG	2	6	221799	221804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894560
4575	NC_010997	TCG	2	6	221830	221835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894560
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4585	NC_010997	GCT	2	6	222038	222043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894560
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4592	NC_010997	CCG	2	6	222448	222453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894560
4593	NC_010997	TCGG	2	8	222578	222585	0 %	25 %	50 %	25 %	190894561
4594	NC_010997	CGT	2	6	222699	222704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894561
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4603	NC_010997	TCG	2	6	223034	223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894561
4604	NC_010997	GAA	2	6	223042	223047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894561
4605	NC_010997	GCA	2	6	223053	223058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894561
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4607	NC_010997	GCC	2	6	223237	223242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894561
4608	NC_010997	CCT	2	6	223245	223250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894561
4609	NC_010997	GCC	3	9	223279	223287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894561
4610	NC_010997	GAT	2	6	223288	223293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894561
4611	NC_010997	CGGC	2	8	223294	223301	0 %	0 %	50 %	50 %	190894561
4612	NC_010997	GCG	2	6	223315	223320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894561
4613	NC_010997	GCG	3	9	223398	223406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894562
4614	NC_010997	ATCG	2	8	223535	223542	25 %	25 %	25 %	25 %	190894562
4615	NC_010997	CGA	2	6	223603	223608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894562
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4618	NC_010997	CCGA	2	8	223746	223753	25 %	0 %	25 %	50 %	190894562
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4620	NC_010997	CGC	2	6	223816	223821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894562
4621	NC_010997	GTC	3	9	223845	223853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894562
4622	NC_010997	GCC	2	6	223907	223912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894562
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4650	NC_010997	GC	3	6	225475	225480	0 %	0 %	50 %	50 %	190894564
4651	NC_010997	GGC	2	6	225482	225487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894564
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4865	NC_010997	ACC	3	9	235494	235502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894573
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4980	NC_010997	TTC	2	6	241867	241872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894580
4981	NC_010997	CGC	2	6	241948	241953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894580
4982	NC_010997	CCA	2	6	241965	241970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894580
4983	NC_010997	GCT	2	6	242033	242038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894580
4984	NC_010997	GCC	2	6	242156	242161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894580
4985	NC_010997	CCT	2	6	242244	242249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894580
4986	NC_010997	GCCGC	2	10	242313	242322	0 %	0 %	40 %	60 %	190894580
4987	NC_010997	CGG	2	6	242337	242342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894580
4988	NC_010997	TCGC	2	8	242351	242358	0 %	25 %	25 %	50 %	190894580
4989	NC_010997	GCG	2	6	242372	242377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894580
4990	NC_010997	CGG	2	6	242380	242385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894580
4991	NC_010997	TCG	2	6	242387	242392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894580
4992	NC_010997	CGC	2	6	242422	242427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894580
4993	NC_010997	GCG	2	6	242432	242437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894580
4994	NC_010997	CGC	2	6	242454	242459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894580
4995	NC_010997	GGC	2	6	242503	242508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894580
4996	NC_010997	TGG	2	6	242526	242531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894580
4997	NC_010997	GC	3	6	242554	242559	0 %	0 %	50 %	50 %	190894580
4998	NC_010997	GCA	2	6	242592	242597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894580
4999	NC_010997	CAT	2	6	242622	242627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894580
5000	NC_010997	GC	3	6	242635	242640	0 %	0 %	50 %	50 %	190894580

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