MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010996	GAA	2	6	201845	201850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894155
3002	NC_010996	TGC	2	6	201975	201980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894155
3003	NC_010996	AC	3	6	201996	202001	50 %	0 %	0 %	50 %	190894155
3004	NC_010996	GCAC	2	8	202015	202022	25 %	0 %	25 %	50 %	190894155
3005	NC_010996	ATG	2	6	202048	202053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894155
3006	NC_010996	CGG	2	6	202085	202090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894155
3007	NC_010996	GCTCA	2	10	202091	202100	20 %	20 %	20 %	40 %	190894155
3008	NC_010996	TTC	2	6	202128	202133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894155
3009	NC_010996	GCC	2	6	202229	202234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894156
3010	NC_010996	CTG	2	6	202335	202340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894156
3011	NC_010996	CTTC	2	8	202475	202482	0 %	50 %	0 %	50 %	190894156
3012	NC_010996	GAA	2	6	202503	202508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894156
3013	NC_010996	CGC	2	6	202543	202548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894156
3014	NC_010996	TCG	2	6	202558	202563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894156
3015	NC_010996	CGA	2	6	202583	202588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894156
3016	NC_010996	TGC	2	6	202615	202620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894156
3017	NC_010996	GAT	2	6	202683	202688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894156
3018	NC_010996	TCT	2	6	202723	202728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894156
3019	NC_010996	ATG	2	6	202749	202754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894156
3020	NC_010996	A	6	6	202767	202772	100 %	0 %	0 %	0 %	190894156
3021	NC_010996	GAG	2	6	202781	202786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894156
3022	NC_010996	CG	3	6	202939	202944	0 %	0 %	50 %	50 %	190894156
3023	NC_010996	GCC	2	6	202959	202964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894156
3024	NC_010996	CTC	2	6	202974	202979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894156
3025	NC_010996	AGT	2	6	203006	203011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894156
3026	NC_010996	GCG	2	6	203085	203090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894156
3027	NC_010996	CGGA	2	8	203103	203110	25 %	0 %	50 %	25 %	190894156
3028	NC_010996	GGT	2	6	203136	203141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894156
3029	NC_010996	A	7	7	203144	203150	100 %	0 %	0 %	0 %	190894156
3030	NC_010996	CTC	2	6	203187	203192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894156
3031	NC_010996	AGG	2	6	203261	203266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894157
3032	NC_010996	GAT	2	6	203302	203307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894157
3033	NC_010996	AGA	2	6	203314	203319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894157
3034	NC_010996	TTG	2	6	203408	203413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894157
3035	NC_010996	AGC	2	6	203461	203466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894157
3036	NC_010996	AGC	2	6	204472	204477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3037	NC_010996	TAT	2	6	204487	204492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894158
3038	NC_010996	ATCT	2	8	204505	204512	25 %	50 %	0 %	25 %	190894158
3039	NC_010996	GGC	2	6	204561	204566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894158
3040	NC_010996	GCC	2	6	204631	204636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894158
3041	NC_010996	TGG	2	6	204657	204662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894158
3042	NC_010996	TCG	2	6	204684	204689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3043	NC_010996	TC	3	6	204750	204755	0 %	50 %	0 %	50 %	190894158
3044	NC_010996	CAT	2	6	204840	204845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894158
3045	NC_010996	TCGT	2	8	204854	204861	0 %	50 %	25 %	25 %	190894158
3046	NC_010996	TTCA	2	8	204876	204883	25 %	50 %	0 %	25 %	190894158
3047	NC_010996	CGC	2	6	204924	204929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894158
3048	NC_010996	TCC	2	6	204980	204985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894158
3049	NC_010996	GCT	2	6	205017	205022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3050	NC_010996	TTCTCG	2	12	205044	205055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	190894158
3051	NC_010996	TCG	2	6	205080	205085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3052	NC_010996	TCG	2	6	205109	205114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3053	NC_010996	TCAC	2	8	205116	205123	25 %	25 %	0 %	50 %	190894158
3054	NC_010996	ACC	2	6	205129	205134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894158
3055	NC_010996	CTT	2	6	205285	205290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894158
3056	NC_010996	CGA	2	6	205309	205314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894158
3057	NC_010996	GGGC	2	8	205486	205493	0 %	0 %	75 %	25 %	190894158
3058	NC_010996	CTT	2	6	205531	205536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894158
3059	NC_010996	CAT	2	6	205545	205550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894158
3060	NC_010996	CTT	2	6	205626	205631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894158
3061	NC_010996	AGGTG	2	10	205718	205727	20 %	20 %	60 %	0 %	190894159
3062	NC_010996	ATT	2	6	205745	205750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894159
3063	NC_010996	GGC	2	6	205799	205804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894159
3064	NC_010996	GGATC	2	10	205815	205824	20 %	20 %	40 %	20 %	190894159
3065	NC_010996	CG	3	6	205838	205843	0 %	0 %	50 %	50 %	190894159
3066	NC_010996	GGC	2	6	205877	205882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894159
3067	NC_010996	CAG	2	6	205906	205911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894159
3068	NC_010996	TGC	2	6	205954	205959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894159
3069	NC_010996	CCACCT	2	12	205970	205981	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	190894159
3070	NC_010996	CG	3	6	206034	206039	0 %	0 %	50 %	50 %	190894159
3071	NC_010996	GCA	2	6	206161	206166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894159
3072	NC_010996	GCT	2	6	206200	206205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894159
3073	NC_010996	TGA	2	6	206240	206245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894159
3074	NC_010996	CGG	2	6	206299	206304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894159
3075	NC_010996	TTC	2	6	206368	206373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894159
3076	NC_010996	TGA	2	6	206378	206383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894159
3077	NC_010996	ACC	2	6	206410	206415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894159
3078	NC_010996	GGCT	2	8	206520	206527	0 %	25 %	50 %	25 %	190894159
3079	NC_010996	T	6	6	206543	206548	0 %	100 %	0 %	0 %	190894159
3080	NC_010996	GGC	2	6	206566	206571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894159
3081	NC_010996	TCC	2	6	206599	206604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894159
3082	NC_010996	GAT	2	6	206619	206624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894159
3083	NC_010996	CGC	2	6	206641	206646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894159
3084	NC_010996	CTG	2	6	206694	206699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894159
3085	NC_010996	CCTG	2	8	206720	206727	0 %	25 %	25 %	50 %	190894159
3086	NC_010996	GCGT	2	8	206728	206735	0 %	25 %	50 %	25 %	190894159
3087	NC_010996	TAT	2	6	206763	206768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894159
3088	NC_010996	AAC	2	6	206805	206810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894159
3089	NC_010996	AC	3	6	206818	206823	50 %	0 %	0 %	50 %	190894159
3090	NC_010996	CAT	2	6	206876	206881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894159
3091	NC_010996	CTC	2	6	206882	206887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894159
3092	NC_010996	TCC	2	6	207042	207047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894159
3093	NC_010996	CCA	2	6	207465	207470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894160
3094	NC_010996	AGC	2	6	207484	207489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894160
3095	NC_010996	GC	3	6	207536	207541	0 %	0 %	50 %	50 %	190894160
3096	NC_010996	CCG	2	6	207589	207594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894160
3097	NC_010996	GCA	2	6	207649	207654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894160
3098	NC_010996	CGG	2	6	207828	207833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894160
3099	NC_010996	GAC	2	6	207851	207856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894160
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3101	NC_010996	A	6	6	208037	208042	100 %	0 %	0 %	0 %	190894161
3102	NC_010996	TTC	2	6	208057	208062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894161
3103	NC_010996	TC	3	6	208061	208066	0 %	50 %	0 %	50 %	190894161
3104	NC_010996	GCC	2	6	208123	208128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894161
3105	NC_010996	CGG	2	6	208284	208289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894161
3106	NC_010996	AT	3	6	208362	208367	50 %	50 %	0 %	0 %	190894161
3107	NC_010996	TGC	2	6	208465	208470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894161
3108	NC_010996	TGA	2	6	208489	208494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894161
3109	NC_010996	GT	3	6	208514	208519	0 %	50 %	50 %	0 %	190894161
3110	NC_010996	CTT	2	6	208529	208534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894161
3111	NC_010996	ACG	2	6	208576	208581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894161
3112	NC_010996	GCG	2	6	208584	208589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894161
3113	NC_010996	ATCTG	2	10	208599	208608	20 %	40 %	20 %	20 %	190894161
3114	NC_010996	CG	3	6	208683	208688	0 %	0 %	50 %	50 %	190894161
3115	NC_010996	AGA	2	6	208705	208710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894161
3116	NC_010996	TTG	2	6	208921	208926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894161
3117	NC_010996	TG	3	6	208952	208957	0 %	50 %	50 %	0 %	190894161
3118	NC_010996	CCT	2	6	208964	208969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894161
3119	NC_010996	CGG	2	6	208989	208994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894161
3120	NC_010996	GTT	2	6	209013	209018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894161
3121	NC_010996	CCA	2	6	209110	209115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894161
3122	NC_010996	GAC	2	6	209117	209122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894161
3123	NC_010996	ATAG	2	8	209124	209131	50 %	25 %	25 %	0 %	190894161
3124	NC_010996	GCTT	2	8	209160	209167	0 %	50 %	25 %	25 %	190894161
3125	NC_010996	GCG	2	6	209366	209371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894162
3126	NC_010996	GCTC	2	8	209393	209400	0 %	25 %	25 %	50 %	190894162
3127	NC_010996	GGC	2	6	209427	209432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894162
3128	NC_010996	CGT	2	6	209468	209473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894162
3129	NC_010996	GCC	2	6	209598	209603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894162
3130	NC_010996	CGAGAT	2	12	209621	209632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190894162
3131	NC_010996	TGT	2	6	209636	209641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894162
3132	NC_010996	TCG	2	6	209663	209668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894162
3133	NC_010996	GAT	2	6	209710	209715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894162
3134	NC_010996	CTC	2	6	209757	209762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894162
3135	NC_010996	GTTG	2	8	209855	209862	0 %	50 %	50 %	0 %	190894162
3136	NC_010996	CGAT	2	8	209891	209898	25 %	25 %	25 %	25 %	190894162
3137	NC_010996	TTC	2	6	209899	209904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894162
3138	NC_010996	ATG	2	6	209932	209937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894162
3139	NC_010996	TCC	2	6	210014	210019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894162
3140	NC_010996	G	6	6	210068	210073	0 %	0 %	100 %	0 %	190894162
3141	NC_010996	GCG	2	6	210089	210094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894162
3142	NC_010996	GTT	2	6	210144	210149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894162
3143	NC_010996	GAC	2	6	210156	210161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894162
3144	NC_010996	ACG	2	6	210193	210198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894162
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3146	NC_010996	CGG	2	6	210312	210317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894163
3147	NC_010996	AGC	2	6	210385	210390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894163
3148	NC_010996	AGC	2	6	210475	210480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894163
3149	NC_010996	ACC	2	6	210520	210525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894163
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3151	NC_010996	GCG	2	6	210679	210684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894163
3152	NC_010996	TGA	2	6	210867	210872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894163
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3154	NC_010996	GCG	2	6	211033	211038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894164
3155	NC_010996	AAG	2	6	211057	211062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894164
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3157	NC_010996	TA	3	6	211141	211146	50 %	50 %	0 %	0 %	190894164
3158	NC_010996	CGA	2	6	211173	211178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894164
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3163	NC_010996	ACG	2	6	211379	211384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894164
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3194	NC_010996	GAA	2	6	214333	214338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894167
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3200	NC_010996	CAGAA	2	10	214721	214730	60 %	0 %	20 %	20 %	190894168
3201	NC_010996	TCG	2	6	214837	214842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894168
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3229	NC_010996	CTGCA	2	10	217540	217549	20 %	20 %	20 %	40 %	190894172
3230	NC_010996	CAG	2	6	217623	217628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894172
3231	NC_010996	GCA	2	6	217664	217669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894172
3232	NC_010996	GGA	2	6	217706	217711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894172
3233	NC_010996	GCC	2	6	218172	218177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894173
3234	NC_010996	CGA	2	6	218242	218247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894173
3235	NC_010996	ATC	2	6	218262	218267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894173
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3237	NC_010996	TCA	2	6	218350	218355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894173
3238	NC_010996	TGGC	2	8	218468	218475	0 %	25 %	50 %	25 %	190894173
3239	NC_010996	GAG	2	6	218496	218501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894173
3240	NC_010996	CGGC	2	8	218502	218509	0 %	0 %	50 %	50 %	190894173
3241	NC_010996	CG	3	6	218757	218762	0 %	0 %	50 %	50 %	190894174
3242	NC_010996	TCG	2	6	218801	218806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894174
3243	NC_010996	ATC	2	6	218807	218812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894174
3244	NC_010996	CCT	2	6	218823	218828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894174
3245	NC_010996	GAC	2	6	218838	218843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894174
3246	NC_010996	CGA	2	6	218877	218882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894174
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3250	NC_010996	GCG	2	6	219206	219211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894175
3251	NC_010996	TCGT	2	8	219220	219227	0 %	50 %	25 %	25 %	190894175
3252	NC_010996	GC	3	6	219831	219836	0 %	0 %	50 %	50 %	190894176
3253	NC_010996	GCAGT	2	10	219921	219930	20 %	20 %	40 %	20 %	190894176
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3259	NC_010996	GAA	2	6	220371	220376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894176
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3262	NC_010996	CGGG	2	8	220428	220435	0 %	0 %	75 %	25 %	190894176
3263	NC_010996	GTT	2	6	220438	220443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894176
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3265	NC_010996	G	6	6	220504	220509	0 %	0 %	100 %	0 %	190894176
3266	NC_010996	G	6	6	220542	220547	0 %	0 %	100 %	0 %	190894176
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3272	NC_010996	GTGG	2	8	221541	221548	0 %	25 %	75 %	0 %	190894177
3273	NC_010996	CGG	3	9	221558	221566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894177
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3352	NC_010996	GTCT	2	8	225742	225749	0 %	50 %	25 %	25 %	190894179
3353	NC_010996	GCA	3	9	225765	225773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894179
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