MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010996	TCC	2	6	176350	176355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894125
2502	NC_010996	TGTCA	2	10	176430	176439	20 %	40 %	20 %	20 %	190894125
2503	NC_010996	CGG	2	6	176659	176664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894126
2504	NC_010996	GCCG	2	8	176685	176692	0 %	0 %	50 %	50 %	190894126
2505	NC_010996	GCG	2	6	176748	176753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894126
2506	NC_010996	TAT	2	6	176789	176794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894126
2507	NC_010996	CGG	2	6	176833	176838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894126
2508	NC_010996	GCAA	2	8	176842	176849	50 %	0 %	25 %	25 %	190894126
2509	NC_010996	CGC	2	6	176865	176870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894126
2510	NC_010996	CTG	2	6	176890	176895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894126
2511	NC_010996	TGC	2	6	177079	177084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894127
2512	NC_010996	TCG	2	6	177087	177092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894127
2513	NC_010996	CGC	2	6	177205	177210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894127
2514	NC_010996	CGT	2	6	177331	177336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894127
2515	NC_010996	TAC	2	6	177392	177397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894127
2516	NC_010996	CGC	2	6	177400	177405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894127
2517	NC_010996	CG	3	6	177410	177415	0 %	0 %	50 %	50 %	190894127
2518	NC_010996	TAT	2	6	177455	177460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894127
2519	NC_010996	GAT	2	6	177467	177472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894127
2520	NC_010996	AAGCA	2	10	177519	177528	60 %	0 %	20 %	20 %	190894127
2521	NC_010996	GCC	2	6	177610	177615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894127
2522	NC_010996	TCC	2	6	177632	177637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894127
2523	NC_010996	GCG	2	6	177679	177684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894127
2524	NC_010996	TGAT	2	8	177709	177716	25 %	50 %	25 %	0 %	190894127
2525	NC_010996	GGC	2	6	177777	177782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894128
2526	NC_010996	GCC	2	6	177823	177828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894128
2527	NC_010996	TGC	2	6	177842	177847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894128
2528	NC_010996	TCG	2	6	177854	177859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894128
2529	NC_010996	CTG	2	6	177886	177891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894128
2530	NC_010996	TCA	3	9	177905	177913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894128
2531	NC_010996	CGG	2	6	177978	177983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894128
2532	NC_010996	TCG	2	6	178016	178021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894128
2533	NC_010996	GAC	2	6	178059	178064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894129
2534	NC_010996	CAT	2	6	178133	178138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894129
2535	NC_010996	GAC	2	6	178142	178147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894129
2536	NC_010996	CG	3	6	178215	178220	0 %	0 %	50 %	50 %	190894129
2537	NC_010996	GCC	2	6	178293	178298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894129
2538	NC_010996	GGGGC	2	10	178303	178312	0 %	0 %	80 %	20 %	190894129
2539	NC_010996	CG	3	6	178391	178396	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2540	NC_010996	CGA	2	6	178437	178442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2541	NC_010996	GAC	2	6	178443	178448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2542	NC_010996	TGA	2	6	178472	178477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894130
2543	NC_010996	GAT	2	6	178479	178484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894130
2544	NC_010996	GCC	2	6	178610	178615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894130
2545	NC_010996	CG	3	6	178671	178676	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2546	NC_010996	CCGG	2	8	178745	178752	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2547	NC_010996	GGC	2	6	178767	178772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894130
2548	NC_010996	TC	3	6	178779	178784	0 %	50 %	0 %	50 %	190894130
2549	NC_010996	CCGAT	2	10	178803	178812	20 %	20 %	20 %	40 %	190894130
2550	NC_010996	GTC	2	6	178864	178869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2551	NC_010996	GCT	2	6	178896	178901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2552	NC_010996	CCGAG	2	10	178934	178943	20 %	0 %	40 %	40 %	190894130
2553	NC_010996	CCA	2	6	178953	178958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894130
2554	NC_010996	TCG	2	6	178961	178966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2555	NC_010996	CGGC	2	8	178968	178975	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2556	NC_010996	CGA	2	6	179117	179122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2557	NC_010996	GGC	2	6	179262	179267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894130
2558	NC_010996	GGCGA	2	10	179287	179296	20 %	0 %	60 %	20 %	190894130
2559	NC_010996	GC	4	8	179398	179405	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2560	NC_010996	GCG	3	9	179417	179425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894130
2561	NC_010996	GTC	2	6	179428	179433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2562	NC_010996	GCC	2	6	179458	179463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894130
2563	NC_010996	TGG	2	6	179464	179469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894130
2564	NC_010996	CG	4	8	179497	179504	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2565	NC_010996	CGG	2	6	179561	179566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894130
2566	NC_010996	AAG	2	6	179569	179574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894130
2567	NC_010996	CCA	2	6	179646	179651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894130
2568	NC_010996	TCT	2	6	179756	179761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894130
2569	NC_010996	CGG	2	6	179802	179807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894130
2570	NC_010996	GC	3	6	179846	179851	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2571	NC_010996	CAA	2	6	180036	180041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894130
2572	NC_010996	TTGG	2	8	180098	180105	0 %	50 %	50 %	0 %	190894130
2573	NC_010996	GAG	2	6	180184	180189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894130
2574	NC_010996	AGC	2	6	180230	180235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2575	NC_010996	CAT	3	9	180252	180260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894130
2576	NC_010996	CGA	2	6	180267	180272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2577	NC_010996	TGT	2	6	180356	180361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894130
2578	NC_010996	CG	3	6	180377	180382	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2579	NC_010996	ATC	2	6	180412	180417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894130
2580	NC_010996	TCTT	2	8	180437	180444	0 %	75 %	0 %	25 %	190894130
2581	NC_010996	CG	3	6	180452	180457	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2582	NC_010996	CG	3	6	180518	180523	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2583	NC_010996	GCC	2	6	180539	180544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894130
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2585	NC_010996	CGA	3	9	180603	180611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894130
2586	NC_010996	CCGG	2	8	180626	180633	0 %	0 %	50 %	50 %	190894130
2587	NC_010996	GGA	2	6	180687	180692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894130
2588	NC_010996	AGG	2	6	180715	180720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894130
2589	NC_010996	GTT	2	6	180755	180760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894131
2590	NC_010996	ATCG	2	8	180830	180837	25 %	25 %	25 %	25 %	190894131
2591	NC_010996	CAG	2	6	180891	180896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2592	NC_010996	CAG	2	6	180900	180905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2593	NC_010996	CAG	2	6	180909	180914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2594	NC_010996	CTG	2	6	180963	180968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2595	NC_010996	GCT	2	6	181022	181027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2596	NC_010996	GCG	2	6	181042	181047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894131
2597	NC_010996	CGA	2	6	181106	181111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2598	NC_010996	CCAGAA	2	12	181139	181150	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	190894131
2599	NC_010996	CAG	2	6	181173	181178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2600	NC_010996	TGC	2	6	181241	181246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2601	NC_010996	CAG	2	6	181344	181349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2602	NC_010996	CGA	2	6	181364	181369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894131
2603	NC_010996	GCG	2	6	181416	181421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894131
2604	NC_010996	GGT	2	6	181431	181436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894132
2605	NC_010996	GGC	2	6	181465	181470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894132
2606	NC_010996	TGCTC	2	10	181525	181534	0 %	40 %	20 %	40 %	190894132
2607	NC_010996	TCG	2	6	181682	181687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894133
2608	NC_010996	ATTTC	2	10	181715	181724	20 %	60 %	0 %	20 %	190894133
2609	NC_010996	CGG	2	6	181769	181774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894133
2610	NC_010996	CAT	2	6	181872	181877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894133
2611	NC_010996	CG	3	6	181946	181951	0 %	0 %	50 %	50 %	190894133
2612	NC_010996	GGC	2	6	182086	182091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894133
2613	NC_010996	TA	3	6	182134	182139	50 %	50 %	0 %	0 %	190894133
2614	NC_010996	CCG	2	6	182223	182228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894133
2615	NC_010996	GCT	2	6	182301	182306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894133
2616	NC_010996	ACG	2	6	182323	182328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894133
2617	NC_010996	GCC	2	6	182395	182400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894133
2618	NC_010996	TCT	2	6	182408	182413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894133
2619	NC_010996	GCG	2	6	182443	182448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894133
2620	NC_010996	CTACGG	2	12	182466	182477	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190894133
2621	NC_010996	CGC	2	6	182478	182483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894133
2622	NC_010996	CGGC	2	8	182537	182544	0 %	0 %	50 %	50 %	190894133
2623	NC_010996	GC	3	6	182549	182554	0 %	0 %	50 %	50 %	190894133
2624	NC_010996	GCC	3	9	182564	182572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894133
2625	NC_010996	CCG	2	6	182666	182671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894134
2626	NC_010996	GCCG	2	8	182729	182736	0 %	0 %	50 %	50 %	190894134
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2630	NC_010996	CCG	2	6	182959	182964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894135
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2633	NC_010996	TCG	2	6	183018	183023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894135
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2739	NC_010996	GAT	2	6	187530	187535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894140
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2859	NC_010996	AGCGC	2	10	195472	195481	20 %	0 %	40 %	40 %	190894151
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2982	NC_010996	CGA	3	9	200838	200846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894154
2983	NC_010996	CAG	2	6	200884	200889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894154
2984	NC_010996	GTC	2	6	200941	200946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894154
2985	NC_010996	GCC	2	6	200980	200985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894154
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2990	NC_010996	GC	4	8	201129	201136	0 %	0 %	50 %	50 %	190894154
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