MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010996	CGG	2	6	145226	145231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894100
2002	NC_010996	TCC	2	6	145285	145290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894100
2003	NC_010996	CCT	2	6	145401	145406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894100
2004	NC_010996	ACCTG	2	10	145450	145459	20 %	20 %	20 %	40 %	190894100
2005	NC_010996	TCG	2	6	145483	145488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894100
2006	NC_010996	TCG	2	6	145501	145506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894100
2007	NC_010996	GGA	2	6	145509	145514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894100
2008	NC_010996	GCG	2	6	145524	145529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894100
2009	NC_010996	GGC	2	6	145544	145549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894100
2010	NC_010996	GCC	2	6	145589	145594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894100
2011	NC_010996	CAACGT	2	12	145631	145642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190894100
2012	NC_010996	AAG	2	6	145702	145707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894100
2013	NC_010996	CGC	2	6	145713	145718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894100
2014	NC_010996	CGA	2	6	145781	145786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894100
2015	NC_010996	CGT	2	6	145799	145804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894100
2016	NC_010996	ACCG	2	8	145832	145839	25 %	0 %	25 %	50 %	190894100
2017	NC_010996	TTC	2	6	145840	145845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894100
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2019	NC_010996	ACT	2	6	145861	145866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894100
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2021	NC_010996	CTT	2	6	145982	145987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894100
2022	NC_010996	TCG	2	6	146005	146010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894100
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2025	NC_010996	CTTCG	2	10	147918	147927	0 %	40 %	20 %	40 %	190894101
2026	NC_010996	CG	4	8	148017	148024	0 %	0 %	50 %	50 %	190894101
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2029	NC_010996	TTC	2	6	148206	148211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894101
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2043	NC_010996	GTC	3	9	149122	149130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894102
2044	NC_010996	TAG	2	6	149150	149155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894102
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2052	NC_010996	CGA	2	6	149615	149620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894103
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2055	NC_010996	CGCT	2	8	149800	149807	0 %	25 %	25 %	50 %	190894104
2056	NC_010996	ACCT	2	8	149822	149829	25 %	25 %	0 %	50 %	190894104
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2121	NC_010996	CGC	2	6	152657	152662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894106
2122	NC_010996	GCGG	2	8	152667	152674	0 %	0 %	75 %	25 %	190894106
2123	NC_010996	TCG	2	6	152738	152743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894106
2124	NC_010996	CGT	2	6	152766	152771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894106
2125	NC_010996	AAG	2	6	152782	152787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894106
2126	NC_010996	CAT	2	6	152793	152798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894106
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2132	NC_010996	TTCGGC	2	12	153265	153276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894106
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2135	NC_010996	TCG	2	6	153308	153313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894106
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2146	NC_010996	AAGC	2	8	154273	154280	50 %	0 %	25 %	25 %	190894108
2147	NC_010996	GTT	2	6	154392	154397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894108
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2151	NC_010996	CG	3	6	154670	154675	0 %	0 %	50 %	50 %	190894108
2152	NC_010996	ATA	2	6	154691	154696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894108
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2155	NC_010996	A	6	6	154823	154828	100 %	0 %	0 %	0 %	190894109
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2160	NC_010996	GAAG	2	8	155445	155452	50 %	0 %	50 %	0 %	190894109
2161	NC_010996	ATGCG	2	10	155506	155515	20 %	20 %	40 %	20 %	190894109
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2200	NC_010996	CG	4	8	158277	158284	0 %	0 %	50 %	50 %	190894111
2201	NC_010996	AGCG	2	8	158607	158614	25 %	0 %	50 %	25 %	190894112
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2224	NC_010996	CGAA	2	8	159638	159645	50 %	0 %	25 %	25 %	190894112
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2230	NC_010996	TCG	2	6	160045	160050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894113
2231	NC_010996	TCGA	2	8	160061	160068	25 %	25 %	25 %	25 %	190894113
2232	NC_010996	CGCGCT	2	12	160088	160099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190894113
2233	NC_010996	GCTG	2	8	160102	160109	0 %	25 %	50 %	25 %	190894113
2234	NC_010996	TCG	2	6	160140	160145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894113
2235	NC_010996	ACTG	2	8	160150	160157	25 %	25 %	25 %	25 %	190894113
2236	NC_010996	GCA	3	9	160162	160170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894113
2237	NC_010996	CGA	2	6	160222	160227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894113
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2239	NC_010996	GTC	2	6	160307	160312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894113
2240	NC_010996	TC	3	6	160317	160322	0 %	50 %	0 %	50 %	190894113
2241	NC_010996	ATGA	2	8	160328	160335	50 %	25 %	25 %	0 %	190894113
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2243	NC_010996	CTT	2	6	160459	160464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894113
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2364	NC_010996	GCA	2	6	167125	167130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894119
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2484	NC_010996	CCG	2	6	175306	175311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894124
2485	NC_010996	GAACGA	2	12	175317	175328	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190894124
2486	NC_010996	CG	3	6	175334	175339	0 %	0 %	50 %	50 %	190894124
2487	NC_010996	GTC	2	6	175345	175350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894124
2488	NC_010996	GA	3	6	175363	175368	50 %	0 %	50 %	0 %	190894124
2489	NC_010996	TGA	2	6	175374	175379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894124
2490	NC_010996	GTC	2	6	175386	175391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894124
2491	NC_010996	GAT	2	6	175393	175398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894124
2492	NC_010996	A	6	6	175414	175419	100 %	0 %	0 %	0 %	190894124
2493	NC_010996	TCAG	2	8	176060	176067	25 %	25 %	25 %	25 %	190894125
2494	NC_010996	CCT	2	6	176078	176083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894125
2495	NC_010996	AGG	2	6	176113	176118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894125
2496	NC_010996	TTC	2	6	176164	176169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894125
2497	NC_010996	CCA	2	6	176180	176185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894125
2498	NC_010996	AG	3	6	176262	176267	50 %	0 %	50 %	0 %	190894125
2499	NC_010996	TGG	2	6	176278	176283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894125
2500	NC_010996	TCA	2	6	176309	176314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894125

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