MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010996	ACA	2	6	113485	113490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894072
1502	NC_010996	GGCAAC	2	12	113551	113562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894073
1503	NC_010996	GCCA	2	8	113656	113663	25 %	0 %	25 %	50 %	190894073
1504	NC_010996	TCG	2	6	113668	113673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894073
1505	NC_010996	GGA	2	6	113914	113919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894074
1506	NC_010996	ATC	2	6	113953	113958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894074
1507	NC_010996	ACCG	2	8	114004	114011	25 %	0 %	25 %	50 %	190894074
1508	NC_010996	CG	3	6	114060	114065	0 %	0 %	50 %	50 %	190894074
1509	NC_010996	TTC	2	6	114102	114107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894074
1510	NC_010996	CAG	2	6	114108	114113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894074
1511	NC_010996	TCA	2	6	114133	114138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894074
1512	NC_010996	GTC	2	6	114151	114156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894074
1513	NC_010996	GC	5	10	114158	114167	0 %	0 %	50 %	50 %	190894074
1514	NC_010996	GTC	2	6	114499	114504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894075
1515	NC_010996	GGA	2	6	114552	114557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894075
1516	NC_010996	CTA	2	6	114642	114647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894075
1517	NC_010996	GC	3	6	115158	115163	0 %	0 %	50 %	50 %	190894076
1518	NC_010996	TCA	2	6	115245	115250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894076
1519	NC_010996	AGC	2	6	115278	115283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894076
1520	NC_010996	AT	3	6	115285	115290	50 %	50 %	0 %	0 %	190894076
1521	NC_010996	CT	3	6	115367	115372	0 %	50 %	0 %	50 %	190894076
1522	NC_010996	GAA	2	6	115386	115391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894076
1523	NC_010996	TCG	2	6	115441	115446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894076
1524	NC_010996	CGTC	2	8	115483	115490	0 %	25 %	25 %	50 %	190894076
1525	NC_010996	GAG	2	6	115575	115580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894076
1526	NC_010996	CG	3	6	115602	115607	0 %	0 %	50 %	50 %	190894076
1527	NC_010996	CAG	2	6	115629	115634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894076
1528	NC_010996	CGG	2	6	115651	115656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894076
1529	NC_010996	CGG	2	6	115702	115707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894076
1530	NC_010996	GCG	2	6	115711	115716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894076
1531	NC_010996	GATG	2	8	115763	115770	25 %	25 %	50 %	0 %	190894076
1532	NC_010996	GCA	2	6	115771	115776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894076
1533	NC_010996	TCT	2	6	115826	115831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894076
1534	NC_010996	CAC	2	6	115947	115952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894076
1535	NC_010996	CAA	2	6	115991	115996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894076
1536	NC_010996	CAC	2	6	116326	116331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894077
1537	NC_010996	A	6	6	116333	116338	100 %	0 %	0 %	0 %	190894077
1538	NC_010996	GGGC	2	8	116372	116379	0 %	0 %	75 %	25 %	190894077
1539	NC_010996	TGT	2	6	116395	116400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894077
1540	NC_010996	CGG	2	6	116465	116470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894077
1541	NC_010996	GTT	2	6	116544	116549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894077
1542	NC_010996	CT	3	6	116726	116731	0 %	50 %	0 %	50 %	190894077
1543	NC_010996	GGC	2	6	116796	116801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894077
1544	NC_010996	CAA	2	6	116852	116857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894077
1545	NC_010996	TTC	2	6	116899	116904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894077
1546	NC_010996	TCG	2	6	116938	116943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894077
1547	NC_010996	TCG	2	6	116955	116960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894077
1548	NC_010996	AAC	2	6	116970	116975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894077
1549	NC_010996	TGC	2	6	117134	117139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894077
1550	NC_010996	GCGA	2	8	117324	117331	25 %	0 %	50 %	25 %	190894078
1551	NC_010996	TCG	2	6	117370	117375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894078
1552	NC_010996	CGAC	2	8	117420	117427	25 %	0 %	25 %	50 %	190894078
1553	NC_010996	TTG	2	6	117463	117468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894078
1554	NC_010996	TCGA	2	8	117508	117515	25 %	25 %	25 %	25 %	190894078
1555	NC_010996	ACCG	2	8	117546	117553	25 %	0 %	25 %	50 %	190894078
1556	NC_010996	CAA	2	6	117586	117591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894078
1557	NC_010996	CTTC	2	8	117622	117629	0 %	50 %	0 %	50 %	190894078
1558	NC_010996	CAG	2	6	117654	117659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894078
1559	NC_010996	GGA	2	6	117828	117833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894079
1560	NC_010996	ACG	3	9	117953	117961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894079
1561	NC_010996	GCT	2	6	118008	118013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894079
1562	NC_010996	TCA	2	6	118051	118056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894079
1563	NC_010996	AAC	2	6	118087	118092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894079
1564	NC_010996	CTGC	2	8	118108	118115	0 %	25 %	25 %	50 %	190894079
1565	NC_010996	ACC	2	6	118129	118134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894079
1566	NC_010996	AGC	3	9	118161	118169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894079
1567	NC_010996	TATCTC	2	12	118200	118211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	190894080
1568	NC_010996	GAA	2	6	118245	118250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894080
1569	NC_010996	TCG	2	6	118273	118278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894080
1570	NC_010996	C	6	6	118392	118397	0 %	0 %	0 %	100 %	190894080
1571	NC_010996	TGG	2	6	118410	118415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894080
1572	NC_010996	ACA	2	6	118426	118431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894080
1573	NC_010996	AAG	2	6	118437	118442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894080
1574	NC_010996	ATG	2	6	118446	118451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894080
1575	NC_010996	GGC	2	6	118518	118523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894080
1576	NC_010996	CGG	3	9	118600	118608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894080
1577	NC_010996	ACGTCG	2	12	118612	118623	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190894080
1578	NC_010996	TGGC	2	8	118627	118634	0 %	25 %	50 %	25 %	190894080
1579	NC_010996	GCG	2	6	118683	118688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894080
1580	NC_010996	ATG	2	6	118689	118694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894080
1581	NC_010996	TAC	4	12	118791	118802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894080
1582	NC_010996	AGA	2	6	118820	118825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894080
1583	NC_010996	TGC	2	6	118913	118918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894080
1584	NC_010996	GAG	2	6	119022	119027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894080
1585	NC_010996	TCA	2	6	119037	119042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894080
1586	NC_010996	AGA	2	6	119195	119200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894081
1587	NC_010996	TCC	2	6	119271	119276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894081
1588	NC_010996	AGC	2	6	119296	119301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1589	NC_010996	CAG	2	6	119434	119439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1590	NC_010996	TGG	2	6	119450	119455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894081
1591	NC_010996	ATC	3	9	119473	119481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894081
1592	NC_010996	TGC	2	6	119482	119487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1593	NC_010996	TGGC	2	8	119632	119639	0 %	25 %	50 %	25 %	190894081
1594	NC_010996	A	6	6	119642	119647	100 %	0 %	0 %	0 %	190894081
1595	NC_010996	AAG	2	6	119653	119658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894081
1596	NC_010996	CTT	2	6	119696	119701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894081
1597	NC_010996	TCG	2	6	119759	119764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1598	NC_010996	GACC	2	8	119784	119791	25 %	0 %	25 %	50 %	190894081
1599	NC_010996	CGA	2	6	119825	119830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1600	NC_010996	CGA	2	6	119834	119839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1601	NC_010996	TGC	2	6	119894	119899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1602	NC_010996	G	7	7	119932	119938	0 %	0 %	100 %	0 %	190894081
1603	NC_010996	CCG	2	6	119945	119950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894081
1604	NC_010996	GCC	2	6	120003	120008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894081
1605	NC_010996	TCCT	2	8	120079	120086	0 %	50 %	0 %	50 %	190894081
1606	NC_010996	CG	3	6	120121	120126	0 %	0 %	50 %	50 %	190894081
1607	NC_010996	AGA	2	6	120135	120140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894081
1608	NC_010996	GGT	2	6	120185	120190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894081
1609	NC_010996	CTG	2	6	120194	120199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1610	NC_010996	TGC	2	6	120204	120209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894081
1611	NC_010996	ACT	2	6	120212	120217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894081
1612	NC_010996	AAG	2	6	120416	120421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894082
1613	NC_010996	TCG	2	6	120459	120464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894082
1614	NC_010996	GA	3	6	120465	120470	50 %	0 %	50 %	0 %	190894082
1615	NC_010996	TGG	2	6	120615	120620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894082
1616	NC_010996	CGA	2	6	120622	120627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894082
1617	NC_010996	GGC	2	6	120683	120688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894082
1618	NC_010996	GAG	2	6	120710	120715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894082
1619	NC_010996	TCG	2	6	120729	120734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894082
1620	NC_010996	ATG	2	6	121052	121057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894082
1621	NC_010996	GCC	2	6	121115	121120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894082
1622	NC_010996	GCCG	2	8	121123	121130	0 %	0 %	50 %	50 %	190894082
1623	NC_010996	TTCGAT	2	12	121175	121186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	190894082
1624	NC_010996	ATC	2	6	121202	121207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894082
1625	NC_010996	GGGCAG	2	12	121226	121237	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	190894082
1626	NC_010996	ATC	2	6	121265	121270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894082
1627	NC_010996	TGG	2	6	121279	121284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894082
1628	NC_010996	GA	3	6	121313	121318	50 %	0 %	50 %	0 %	190894082
1629	NC_010996	CAG	2	6	121406	121411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894082
1630	NC_010996	GGCC	2	8	121480	121487	0 %	0 %	50 %	50 %	190894082
1631	NC_010996	CCGT	2	8	121616	121623	0 %	25 %	25 %	50 %	190894082
1632	NC_010996	TATC	2	8	121724	121731	25 %	50 %	0 %	25 %	190894082
1633	NC_010996	TCT	2	6	121776	121781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894082
1634	NC_010996	ATG	2	6	121900	121905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894082
1635	NC_010996	GCCG	2	8	121953	121960	0 %	0 %	50 %	50 %	190894083
1636	NC_010996	AAC	2	6	122017	122022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894083
1637	NC_010996	TCA	2	6	122141	122146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894083
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1639	NC_010996	G	6	6	122378	122383	0 %	0 %	100 %	0 %	190894083
1640	NC_010996	CAT	2	6	122394	122399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894083
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1642	NC_010996	GCG	2	6	122516	122521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894083
1643	NC_010996	CAT	2	6	122541	122546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894083
1644	NC_010996	GTT	2	6	122554	122559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894083
1645	NC_010996	GCC	2	6	122581	122586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894083
1646	NC_010996	GCA	2	6	122630	122635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894083
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1648	NC_010996	GTG	2	6	122696	122701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894083
1649	NC_010996	TCTCC	2	10	122751	122760	0 %	40 %	0 %	60 %	190894083
1650	NC_010996	TCG	2	6	122819	122824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894083
1651	NC_010996	TCA	2	6	122849	122854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894083
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1653	NC_010996	AAATC	2	10	122911	122920	60 %	20 %	0 %	20 %	190894084
1654	NC_010996	TTC	2	6	122974	122979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894084
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1656	NC_010996	ATC	2	6	123026	123031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894084
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1659	NC_010996	AT	3	6	123134	123139	50 %	50 %	0 %	0 %	190894084
1660	NC_010996	TCC	2	6	123157	123162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894084
1661	NC_010996	CTC	2	6	123219	123224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894084
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1664	NC_010996	TGG	2	6	123356	123361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894084
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1671	NC_010996	TGC	2	6	123628	123633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894084
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1678	NC_010996	GCGG	2	8	123735	123742	0 %	0 %	75 %	25 %	190894084
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1722	NC_010996	ATCG	2	8	127959	127966	25 %	25 %	25 %	25 %	190894088
1723	NC_010996	TCA	2	6	128035	128040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894088
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1726	NC_010996	CAC	2	6	128067	128072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894088
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1730	NC_010996	GAG	2	6	128140	128145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894088
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1732	NC_010996	GCAG	2	8	128220	128227	25 %	0 %	50 %	25 %	190894088
1733	NC_010996	AAG	2	6	128230	128235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894088
1734	NC_010996	ACG	2	6	128269	128274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894088
1735	NC_010996	GTG	2	6	128330	128335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894088
1736	NC_010996	ACG	2	6	128416	128421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894088
1737	NC_010996	CCGAT	2	10	128459	128468	20 %	20 %	20 %	40 %	190894088
1738	NC_010996	GC	3	6	128538	128543	0 %	0 %	50 %	50 %	190894088
1739	NC_010996	CGA	2	6	128544	128549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894088
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1983	NC_010996	CG	3	6	144249	144254	0 %	0 %	50 %	50 %	190894099
1984	NC_010996	CTC	2	6	144318	144323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894099
1985	NC_010996	ATC	2	6	144375	144380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894099
1986	NC_010996	TGA	2	6	144409	144414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894099
1987	NC_010996	GCA	2	6	144418	144423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894099
1988	NC_010996	CGT	2	6	144451	144456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894099
1989	NC_010996	TTG	2	6	144474	144479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894099
1990	NC_010996	CCAG	2	8	144497	144504	25 %	0 %	25 %	50 %	190894099
1991	NC_010996	GGC	2	6	144505	144510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894099
1992	NC_010996	AG	3	6	144534	144539	50 %	0 %	50 %	0 %	190894099
1993	NC_010996	TTGCG	2	10	144553	144562	0 %	40 %	40 %	20 %	190894099
1994	NC_010996	ACT	2	6	144628	144633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894099
1995	NC_010996	AGT	2	6	144661	144666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894099
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1997	NC_010996	TCA	2	6	144912	144917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894100
1998	NC_010996	GCC	3	9	145019	145027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894100
1999	NC_010996	TCG	2	6	145141	145146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894100
2000	NC_010996	TCGA	2	8	145177	145184	25 %	25 %	25 %	25 %	190894100

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