MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010996	GCTGC	2	10	38386	38395	0 %	20 %	40 %	40 %	190894012
502	NC_010996	GCA	2	6	38409	38414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894012
503	NC_010996	TGC	2	6	38507	38512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894012
504	NC_010996	GAA	2	6	38572	38577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894012
505	NC_010996	TAG	2	6	39706	39711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894013
506	NC_010996	CGC	2	6	39741	39746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894013
507	NC_010996	CCGC	2	8	39782	39789	0 %	0 %	25 %	75 %	190894013
508	NC_010996	CGC	2	6	39849	39854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894013
509	NC_010996	AGG	2	6	39911	39916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894013
510	NC_010996	TCG	2	6	39929	39934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894013
511	NC_010996	GTC	2	6	39943	39948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894013
512	NC_010996	CG	3	6	39976	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	190894013
513	NC_010996	GC	4	8	40010	40017	0 %	0 %	50 %	50 %	190894013
514	NC_010996	TGG	2	6	40074	40079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894013
515	NC_010996	AGC	2	6	40115	40120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894013
516	NC_010996	CGA	2	6	40155	40160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894013
517	NC_010996	CGA	2	6	40401	40406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894013
518	NC_010996	TGC	2	6	40714	40719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894014
519	NC_010996	GGC	2	6	40740	40745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894014
520	NC_010996	ATTT	2	8	40747	40754	25 %	75 %	0 %	0 %	190894014
521	NC_010996	AAG	2	6	40798	40803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894014
522	NC_010996	AGC	2	6	40846	40851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894014
523	NC_010996	CGG	2	6	40862	40867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894014
524	NC_010996	TCG	3	9	40879	40887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894014
525	NC_010996	TCT	2	6	40950	40955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894014
526	NC_010996	TGG	2	6	40972	40977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894014
527	NC_010996	CTC	2	6	41024	41029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894014
528	NC_010996	TCT	2	6	41033	41038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894014
529	NC_010996	GCAGT	2	10	41069	41078	20 %	20 %	40 %	20 %	190894014
530	NC_010996	CCG	2	6	41092	41097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894015
531	NC_010996	CAC	2	6	41132	41137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894015
532	NC_010996	CG	3	6	41200	41205	0 %	0 %	50 %	50 %	190894015
533	NC_010996	CCG	2	6	41269	41274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894015
534	NC_010996	GGA	2	6	41378	41383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894015
535	NC_010996	AG	3	6	41391	41396	50 %	0 %	50 %	0 %	190894015
536	NC_010996	TG	3	6	41407	41412	0 %	50 %	50 %	0 %	190894015
537	NC_010996	CGC	2	6	41438	41443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894015
538	NC_010996	CGC	2	6	41462	41467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894015
539	NC_010996	CGG	2	6	42604	42609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894016
540	NC_010996	GCG	2	6	42623	42628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894016
541	NC_010996	GGCG	2	8	42730	42737	0 %	0 %	75 %	25 %	190894016
542	NC_010996	GGA	2	6	42741	42746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894016
543	NC_010996	GCC	2	6	42773	42778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894016
544	NC_010996	CGGA	2	8	42850	42857	25 %	0 %	50 %	25 %	190894016
545	NC_010996	GCC	2	6	42907	42912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894016
546	NC_010996	CGC	2	6	42925	42930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894016
547	NC_010996	CAT	2	6	42931	42936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894016
548	NC_010996	GCCG	2	8	42943	42950	0 %	0 %	50 %	50 %	190894016
549	NC_010996	GTG	2	6	42977	42982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894016
550	NC_010996	GGT	2	6	42997	43002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894016
551	NC_010996	GCG	2	6	43005	43010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894016
552	NC_010996	GCG	2	6	43063	43068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894016
553	NC_010996	GTC	2	6	43070	43075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894016
554	NC_010996	TTC	2	6	43112	43117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894016
555	NC_010996	GGC	2	6	43129	43134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894016
556	NC_010996	CGA	2	6	43189	43194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894016
557	NC_010996	GC	3	6	43198	43203	0 %	0 %	50 %	50 %	190894016
558	NC_010996	GCC	2	6	43220	43225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894016
559	NC_010996	CGTT	2	8	43355	43362	0 %	50 %	25 %	25 %	190894017
560	NC_010996	GGC	2	6	43372	43377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894017
561	NC_010996	TCGC	2	8	43433	43440	0 %	25 %	25 %	50 %	190894017
562	NC_010996	CGT	2	6	43468	43473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
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564	NC_010996	CGA	2	6	43501	43506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
565	NC_010996	TTC	2	6	43544	43549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894017
566	NC_010996	GAC	2	6	43559	43564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
567	NC_010996	GTC	2	6	43607	43612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
568	NC_010996	CGA	2	6	43615	43620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
569	NC_010996	ACCA	2	8	43640	43647	50 %	0 %	0 %	50 %	190894017
570	NC_010996	ATC	2	6	43767	43772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894017
571	NC_010996	CGT	3	9	43819	43827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
572	NC_010996	CGA	2	6	43863	43868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
573	NC_010996	GC	3	6	43881	43886	0 %	0 %	50 %	50 %	190894017
574	NC_010996	GCCGT	2	10	43893	43902	0 %	20 %	40 %	40 %	190894017
575	NC_010996	ATTC	2	8	43924	43931	25 %	50 %	0 %	25 %	190894017
576	NC_010996	GACG	2	8	43933	43940	25 %	0 %	50 %	25 %	190894017
577	NC_010996	GCG	2	6	43965	43970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894017
578	NC_010996	CGT	2	6	43990	43995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
579	NC_010996	ATC	2	6	44015	44020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894017
580	NC_010996	GGA	2	6	44030	44035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894017
581	NC_010996	GCATCG	2	12	44037	44048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190894017
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583	NC_010996	CGG	2	6	44226	44231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894017
584	NC_010996	GCGCG	2	10	44287	44296	0 %	0 %	60 %	40 %	190894017
585	NC_010996	CG	3	6	44360	44365	0 %	0 %	50 %	50 %	190894017
586	NC_010996	GTG	2	6	44390	44395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894017
587	NC_010996	GCT	2	6	44420	44425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
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589	NC_010996	CGT	2	6	44503	44508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
590	NC_010996	GGCC	2	8	44533	44540	0 %	0 %	50 %	50 %	190894017
591	NC_010996	GAC	2	6	44549	44554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
592	NC_010996	TCG	2	6	44559	44564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
593	NC_010996	CAG	2	6	44573	44578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894017
594	NC_010996	GACG	2	8	44584	44591	25 %	0 %	50 %	25 %	190894017
595	NC_010996	CTC	2	6	44600	44605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894017
596	NC_010996	TCA	2	6	44637	44642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894017
597	NC_010996	CGT	2	6	44644	44649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894017
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599	NC_010996	CAGA	2	8	44839	44846	50 %	0 %	25 %	25 %	190894018
600	NC_010996	CGA	2	6	44854	44859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894018
601	NC_010996	ACTG	2	8	44926	44933	25 %	25 %	25 %	25 %	190894018
602	NC_010996	AAG	2	6	44958	44963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894018
603	NC_010996	GAC	4	12	45050	45061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894018
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607	NC_010996	CGC	2	6	45310	45315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894018
608	NC_010996	GGC	2	6	45400	45405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894018
609	NC_010996	GC	3	6	45409	45414	0 %	0 %	50 %	50 %	190894018
610	NC_010996	GAC	2	6	45446	45451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894018
611	NC_010996	TGA	2	6	46632	46637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894019
612	NC_010996	TCA	2	6	46723	46728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894019
613	NC_010996	AGC	2	6	46740	46745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894019
614	NC_010996	GTTG	2	8	46747	46754	0 %	50 %	50 %	0 %	190894019
615	NC_010996	TCGG	2	8	46770	46777	0 %	25 %	50 %	25 %	190894019
616	NC_010996	TGC	2	6	47450	47455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894020
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621	NC_010996	GCAC	2	8	47892	47899	25 %	0 %	25 %	50 %	190894020
622	NC_010996	GGC	3	9	47906	47914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894020
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624	NC_010996	GCC	2	6	48030	48035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894020
625	NC_010996	CCG	2	6	48066	48071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894020
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