MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	CG	3	6	348	353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930824
2	NC_010683	CG	3	6	1297	1302	0 %	0 %	50 %	50 %	187930826
3	NC_010683	GC	3	6	1397	1402	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
4	NC_010683	CG	3	6	1500	1505	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
5	NC_010683	CG	3	6	1929	1934	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
6	NC_010683	GC	3	6	2087	2092	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
7	NC_010683	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
8	NC_010683	TC	3	6	4076	4081	0 %	50 %	0 %	50 %	187930829
9	NC_010683	CG	3	6	4095	4100	0 %	0 %	50 %	50 %	187930829
10	NC_010683	GT	3	6	4428	4433	0 %	50 %	50 %	0 %	187930830
11	NC_010683	CG	4	8	6266	6273	0 %	0 %	50 %	50 %	187930835
12	NC_010683	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
13	NC_010683	GC	3	6	7130	7135	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
14	NC_010683	CA	3	6	8431	8436	50 %	0 %	0 %	50 %	187930837
15	NC_010683	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	187930837
16	NC_010683	GC	3	6	10043	10048	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
17	NC_010683	GC	3	6	10190	10195	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
18	NC_010683	TC	3	6	12817	12822	0 %	50 %	0 %	50 %	187930840
19	NC_010683	GC	3	6	13414	13419	0 %	0 %	50 %	50 %	187930840
20	NC_010683	CG	3	6	14936	14941	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
21	NC_010683	CG	3	6	15037	15042	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
22	NC_010683	GC	3	6	15175	15180	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
23	NC_010683	GC	3	6	15453	15458	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
24	NC_010683	CG	3	6	15523	15528	0 %	0 %	50 %	50 %	187930841
25	NC_010683	CG	3	6	15650	15655	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
26	NC_010683	CA	3	6	15661	15666	50 %	0 %	0 %	50 %	187930842
27	NC_010683	CG	3	6	15683	15688	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
28	NC_010683	CG	3	6	15698	15703	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
29	NC_010683	CG	3	6	15763	15768	0 %	0 %	50 %	50 %	187930842
30	NC_010683	CG	3	6	15891	15896	0 %	0 %	50 %	50 %	187930843
31	NC_010683	GC	5	10	16260	16269	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
32	NC_010683	CG	4	8	16462	16469	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
33	NC_010683	CG	3	6	16527	16532	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
34	NC_010683	CG	4	8	16621	16628	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
35	NC_010683	TG	3	6	16652	16657	0 %	50 %	50 %	0 %	187930844
36	NC_010683	CG	3	6	16890	16895	0 %	0 %	50 %	50 %	187930844
37	NC_010683	AC	3	6	18034	18039	50 %	0 %	0 %	50 %	187930845
38	NC_010683	AG	3	6	18534	18539	50 %	0 %	50 %	0 %	187930845
39	NC_010683	GC	3	6	18555	18560	0 %	0 %	50 %	50 %	187930845
40	NC_010683	GC	3	6	18639	18644	0 %	0 %	50 %	50 %	187930845
41	NC_010683	CG	3	6	19459	19464	0 %	0 %	50 %	50 %	187930846
42	NC_010683	GC	3	6	19593	19598	0 %	0 %	50 %	50 %	187930846
43	NC_010683	GT	3	6	19600	19605	0 %	50 %	50 %	0 %	187930846
44	NC_010683	CG	3	6	19921	19926	0 %	0 %	50 %	50 %	187930847
45	NC_010683	GA	3	6	20230	20235	50 %	0 %	50 %	0 %	187930847
46	NC_010683	GA	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	187930847
47	NC_010683	GC	3	6	21396	21401	0 %	0 %	50 %	50 %	187930848
48	NC_010683	GC	3	6	21609	21614	0 %	0 %	50 %	50 %	187930848
49	NC_010683	GC	3	6	23267	23272	0 %	0 %	50 %	50 %	187930850
50	NC_010683	GC	3	6	25168	25173	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
51	NC_010683	GC	3	6	25977	25982	0 %	0 %	50 %	50 %	187930852
52	NC_010683	CA	3	6	26053	26058	50 %	0 %	0 %	50 %	187930852
53	NC_010683	GC	3	6	26141	26146	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
54	NC_010683	CG	3	6	26180	26185	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
55	NC_010683	CG	3	6	26517	26522	0 %	0 %	50 %	50 %	187930853
56	NC_010683	TG	3	6	26947	26952	0 %	50 %	50 %	0 %	187930853
57	NC_010683	GT	3	6	27176	27181	0 %	50 %	50 %	0 %	187930854
58	NC_010683	CG	3	6	28265	28270	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
59	NC_010683	CG	3	6	28336	28341	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
60	NC_010683	CG	3	6	28730	28735	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
61	NC_010683	CG	3	6	29861	29866	0 %	0 %	50 %	50 %	187930855
62	NC_010683	TA	3	6	29899	29904	50 %	50 %	0 %	0 %	187930855
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64	NC_010683	GC	3	6	31128	31133	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
65	NC_010683	GC	5	10	31533	31542	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
66	NC_010683	AC	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	187930858
67	NC_010683	CG	3	6	32538	32543	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
68	NC_010683	GC	3	6	32784	32789	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
69	NC_010683	CG	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
70	NC_010683	GT	3	6	33062	33067	0 %	50 %	50 %	0 %	187930858
71	NC_010683	GC	3	6	33313	33318	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
72	NC_010683	CG	3	6	33348	33353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
73	NC_010683	GC	3	6	34133	34138	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
74	NC_010683	GC	3	6	34211	34216	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
75	NC_010683	GC	3	6	35263	35268	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
76	NC_010683	CG	3	6	36124	36129	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
77	NC_010683	CG	3	6	36588	36593	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
78	NC_010683	GC	3	6	37734	37739	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
79	NC_010683	GC	3	6	38041	38046	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
80	NC_010683	CG	3	6	38159	38164	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
81	NC_010683	GC	3	6	38251	38256	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
82	NC_010683	GC	3	6	38589	38594	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
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84	NC_010683	GC	4	8	40277	40284	0 %	0 %	50 %	50 %	187930862
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86	NC_010683	CG	3	6	40643	40648	0 %	0 %	50 %	50 %	187930863
87	NC_010683	AG	3	6	40696	40701	50 %	0 %	50 %	0 %	187930863
88	NC_010683	CG	3	6	41019	41024	0 %	0 %	50 %	50 %	187930863
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90	NC_010683	GC	3	6	42795	42800	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
91	NC_010683	GC	3	6	42880	42885	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
92	NC_010683	CG	3	6	43023	43028	0 %	0 %	50 %	50 %	187930865
93	NC_010683	CA	3	6	43167	43172	50 %	0 %	0 %	50 %	187930865
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102	NC_010683	CG	3	6	48011	48016	0 %	0 %	50 %	50 %	187930868
103	NC_010683	GC	3	6	48389	48394	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
104	NC_010683	GC	3	6	48486	48491	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
105	NC_010683	CG	3	6	48581	48586	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
106	NC_010683	GC	3	6	48785	48790	0 %	0 %	50 %	50 %	187930869
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108	NC_010683	TG	3	6	49380	49385	0 %	50 %	50 %	0 %	187930870
109	NC_010683	GC	3	6	49436	49441	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
110	NC_010683	CG	3	6	49466	49471	0 %	0 %	50 %	50 %	187930870
111	NC_010683	GT	3	6	50127	50132	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
112	NC_010683	GC	3	6	51587	51592	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
113	NC_010683	GC	3	6	51676	51681	0 %	0 %	50 %	50 %	187930875
114	NC_010683	GC	3	6	51858	51863	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
115	NC_010683	GC	3	6	52066	52071	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
116	NC_010683	CG	3	6	52114	52119	0 %	0 %	50 %	50 %	187930876
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118	NC_010683	GC	3	6	52335	52340	0 %	0 %	50 %	50 %	187930877
119	NC_010683	GC	3	6	52392	52397	0 %	0 %	50 %	50 %	187930877
120	NC_010683	CG	3	6	52567	52572	0 %	0 %	50 %	50 %	187930878
121	NC_010683	GC	3	6	52835	52840	0 %	0 %	50 %	50 %	187930879
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123	NC_010683	GC	3	6	53365	53370	0 %	0 %	50 %	50 %	187930879
124	NC_010683	GC	3	6	53687	53692	0 %	0 %	50 %	50 %	187930879
125	NC_010683	CG	3	6	54169	54174	0 %	0 %	50 %	50 %	187930880
126	NC_010683	GC	3	6	54432	54437	0 %	0 %	50 %	50 %	187930880
127	NC_010683	CG	3	6	55135	55140	0 %	0 %	50 %	50 %	187930881
128	NC_010683	CG	3	6	55748	55753	0 %	0 %	50 %	50 %	187930881
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131	NC_010683	CG	3	6	56351	56356	0 %	0 %	50 %	50 %	187930882
132	NC_010683	TG	3	6	58110	58115	0 %	50 %	50 %	0 %	187930884
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136	NC_010683	GC	3	6	58677	58682	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
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138	NC_010683	CG	3	6	58877	58882	0 %	0 %	50 %	50 %	187930886
139	NC_010683	CG	3	6	59619	59624	0 %	0 %	50 %	50 %	187930886
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.