MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010683	GCCT	2	8	139	146	0 %	25 %	25 %	50 %	187930823
2	NC_010683	GCAG	2	8	205	212	25 %	0 %	50 %	25 %	187930823
3	NC_010683	GCCA	2	8	1202	1209	25 %	0 %	25 %	50 %	187930826
4	NC_010683	TGCG	2	8	1489	1496	0 %	25 %	50 %	25 %	187930827
5	NC_010683	TGCC	2	8	1885	1892	0 %	25 %	25 %	50 %	187930827
6	NC_010683	GCCG	2	8	1923	1930	0 %	0 %	50 %	50 %	187930827
7	NC_010683	CGCA	2	8	2240	2247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930827
8	NC_010683	CGAG	2	8	3436	3443	25 %	0 %	50 %	25 %	187930828
9	NC_010683	CACC	2	8	3649	3656	25 %	0 %	0 %	75 %	187930828
10	NC_010683	CCGT	2	8	4385	4392	0 %	25 %	25 %	50 %	187930830
11	NC_010683	CAAG	2	8	4612	4619	50 %	0 %	25 %	25 %	187930830
12	NC_010683	GTTC	2	8	4781	4788	0 %	50 %	25 %	25 %	187930831
13	NC_010683	TCTA	2	8	5208	5215	25 %	50 %	0 %	25 %	187930832
14	NC_010683	AGCT	2	8	5815	5822	25 %	25 %	25 %	25 %	187930834
15	NC_010683	CTGG	2	8	6402	6409	0 %	25 %	50 %	25 %	187930835
16	NC_010683	GCCG	2	8	7193	7200	0 %	0 %	50 %	50 %	187930836
17	NC_010683	TGGG	2	8	8685	8692	0 %	25 %	75 %	0 %	187930837
18	NC_010683	GCCG	2	8	8969	8976	0 %	0 %	50 %	50 %	187930837
19	NC_010683	CCGG	2	8	9674	9681	0 %	0 %	50 %	50 %	187930838
20	NC_010683	CGGC	2	8	10037	10044	0 %	0 %	50 %	50 %	187930839
21	NC_010683	CCGC	2	8	10155	10162	0 %	0 %	25 %	75 %	187930839
22	NC_010683	TGGT	2	8	10211	10218	0 %	50 %	50 %	0 %	187930839
23	NC_010683	TCGA	2	8	13646	13653	25 %	25 %	25 %	25 %	187930840
24	NC_010683	CATA	2	8	13731	13738	50 %	25 %	0 %	25 %	187930840
25	NC_010683	CGGC	2	8	13778	13785	0 %	0 %	50 %	50 %	187930840
26	NC_010683	AACA	2	8	14081	14088	75 %	0 %	0 %	25 %	187930840
27	NC_010683	GTTC	2	8	15027	15034	0 %	50 %	25 %	25 %	187930841
28	NC_010683	CTGC	2	8	15044	15051	0 %	25 %	25 %	50 %	187930841
29	NC_010683	CATC	2	8	15279	15286	25 %	25 %	0 %	50 %	187930841
30	NC_010683	CAGC	2	8	16240	16247	25 %	0 %	25 %	50 %	187930844
31	NC_010683	AGCG	2	8	16744	16751	25 %	0 %	50 %	25 %	187930844
32	NC_010683	GGGT	2	8	16842	16849	0 %	25 %	75 %	0 %	187930844
33	NC_010683	CAAC	2	8	17796	17803	50 %	0 %	0 %	50 %	187930845
34	NC_010683	CAAG	2	8	18103	18110	50 %	0 %	25 %	25 %	187930845
35	NC_010683	AGCG	2	8	18291	18298	25 %	0 %	50 %	25 %	187930845
36	NC_010683	GCGA	2	8	18686	18693	25 %	0 %	50 %	25 %	187930845
37	NC_010683	CGAC	2	8	19105	19112	25 %	0 %	25 %	50 %	187930846
38	NC_010683	TGCG	2	8	19261	19268	0 %	25 %	50 %	25 %	187930846
39	NC_010683	GTGC	2	8	19392	19399	0 %	25 %	50 %	25 %	187930846
40	NC_010683	CTGC	2	8	20152	20159	0 %	25 %	25 %	50 %	187930847
41	NC_010683	AACA	2	8	20630	20637	75 %	0 %	0 %	25 %	187930847
42	NC_010683	AATG	2	8	21434	21441	50 %	25 %	25 %	0 %	187930848
43	NC_010683	GTAG	2	8	21518	21525	25 %	25 %	50 %	0 %	187930848
44	NC_010683	GCCC	2	8	22411	22418	0 %	0 %	25 %	75 %	187930849
45	NC_010683	GCAC	2	8	22522	22529	25 %	0 %	25 %	50 %	187930849
46	NC_010683	CCAG	2	8	22932	22939	25 %	0 %	25 %	50 %	187930850
47	NC_010683	AAGC	2	8	23108	23115	50 %	0 %	25 %	25 %	187930850
48	NC_010683	ATCA	2	8	23367	23374	50 %	25 %	0 %	25 %	187930850
49	NC_010683	ATCT	2	8	24017	24024	25 %	50 %	0 %	25 %	187930851
50	NC_010683	CCAT	2	8	24552	24559	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
51	NC_010683	ACTC	2	8	24865	24872	25 %	25 %	0 %	50 %	187930852
52	NC_010683	ATCG	2	8	25024	25031	25 %	25 %	25 %	25 %	187930852
53	NC_010683	AAAG	2	8	25347	25354	75 %	0 %	25 %	0 %	187930852
54	NC_010683	ACCC	2	8	25679	25686	25 %	0 %	0 %	75 %	187930852
55	NC_010683	CAAG	2	8	26671	26678	50 %	0 %	25 %	25 %	187930853
56	NC_010683	TCGC	2	8	26719	26726	0 %	25 %	25 %	50 %	187930853
57	NC_010683	CACC	2	8	26851	26858	25 %	0 %	0 %	75 %	187930853
58	NC_010683	GTCG	2	8	26988	26995	0 %	25 %	50 %	25 %	187930853
59	NC_010683	CTGC	2	8	27414	27421	0 %	25 %	25 %	50 %	187930854
60	NC_010683	CATC	2	8	27632	27639	25 %	25 %	0 %	50 %	187930854
61	NC_010683	ATCG	2	8	29161	29168	25 %	25 %	25 %	25 %	187930855
62	NC_010683	GGAT	2	8	29280	29287	25 %	25 %	50 %	0 %	187930855
63	NC_010683	CAAC	2	8	29359	29366	50 %	0 %	0 %	50 %	187930855
64	NC_010683	TGTC	2	8	30108	30115	0 %	50 %	25 %	25 %	187930856
65	NC_010683	GATC	2	8	31095	31102	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
66	NC_010683	CGCC	2	8	31115	31122	0 %	0 %	25 %	75 %	187930857
67	NC_010683	CGCT	2	8	31572	31579	0 %	25 %	25 %	50 %	187930857
68	NC_010683	GGTC	2	8	31887	31894	0 %	25 %	50 %	25 %	187930857
69	NC_010683	AGCT	2	8	31996	32003	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
70	NC_010683	CACG	2	8	32147	32154	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
71	NC_010683	ATCA	2	8	32619	32626	50 %	25 %	0 %	25 %	187930858
72	NC_010683	CAGC	2	8	32930	32937	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
73	NC_010683	ATGC	2	8	33083	33090	25 %	25 %	25 %	25 %	187930858
74	NC_010683	CCGC	2	8	33118	33125	0 %	0 %	25 %	75 %	187930858
75	NC_010683	GCCT	2	8	33132	33139	0 %	25 %	25 %	50 %	187930858
76	NC_010683	GCGG	2	8	33972	33979	0 %	0 %	75 %	25 %	187930859
77	NC_010683	CGCA	2	8	34067	34074	25 %	0 %	25 %	50 %	187930859
78	NC_010683	GAGC	2	8	34099	34106	25 %	0 %	50 %	25 %	187930859
79	NC_010683	CACG	2	8	34968	34975	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
80	NC_010683	GGGC	2	8	35781	35788	0 %	0 %	75 %	25 %	187930860
81	NC_010683	GAAC	2	8	36084	36091	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
82	NC_010683	CCGA	2	8	36311	36318	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
83	NC_010683	CGGC	2	8	36665	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
84	NC_010683	ACGA	2	8	37208	37215	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
85	NC_010683	TCAG	2	8	37498	37505	25 %	25 %	25 %	25 %	187930861
86	NC_010683	CGGT	2	8	37652	37659	0 %	25 %	50 %	25 %	187930861
87	NC_010683	CGAC	2	8	37836	37843	25 %	0 %	25 %	50 %	187930861
88	NC_010683	CCGG	2	8	37876	37883	0 %	0 %	50 %	50 %	187930861
89	NC_010683	CTGC	2	8	38316	38323	0 %	25 %	25 %	50 %	187930861
90	NC_010683	GAGC	2	8	38607	38614	25 %	0 %	50 %	25 %	187930861
91	NC_010683	CGTG	2	8	39808	39815	0 %	25 %	50 %	25 %	187930862
92	NC_010683	AGGT	2	8	39849	39856	25 %	25 %	50 %	0 %	187930862
93	NC_010683	GCGG	2	8	40018	40025	0 %	0 %	75 %	25 %	187930862
94	NC_010683	CGCA	2	8	40162	40169	25 %	0 %	25 %	50 %	187930862
95	NC_010683	TCGG	2	8	40465	40472	0 %	25 %	50 %	25 %	187930863
96	NC_010683	AACG	2	8	40510	40517	50 %	0 %	25 %	25 %	187930863
97	NC_010683	GAGC	2	8	40812	40819	25 %	0 %	50 %	25 %	187930863
98	NC_010683	TGCA	2	8	41203	41210	25 %	25 %	25 %	25 %	187930863
99	NC_010683	ATGG	2	8	41213	41220	25 %	25 %	50 %	0 %	187930863
100	NC_010683	GCGG	2	8	41784	41791	0 %	0 %	75 %	25 %	187930864
101	NC_010683	AGGA	2	8	41837	41844	50 %	0 %	50 %	0 %	187930864
102	NC_010683	TTCG	2	8	42210	42217	0 %	50 %	25 %	25 %	187930865
103	NC_010683	CAGC	2	8	42531	42538	25 %	0 %	25 %	50 %	187930865
104	NC_010683	GCCG	2	8	44496	44503	0 %	0 %	50 %	50 %	187930867
105	NC_010683	ACTG	2	8	44611	44618	25 %	25 %	25 %	25 %	187930867
106	NC_010683	TCAT	2	8	44656	44663	25 %	50 %	0 %	25 %	187930867
107	NC_010683	TGCG	2	8	47550	47557	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
108	NC_010683	CCCG	2	8	47558	47565	0 %	0 %	25 %	75 %	187930868
109	NC_010683	GCGT	2	8	47659	47666	0 %	25 %	50 %	25 %	187930868
110	NC_010683	CTTG	2	8	48088	48095	0 %	50 %	25 %	25 %	187930868
111	NC_010683	CCTT	2	8	48959	48966	0 %	50 %	0 %	50 %	187930869
112	NC_010683	GCTG	2	8	49609	49616	0 %	25 %	50 %	25 %	187930870
113	NC_010683	TTGG	2	8	50304	50311	0 %	50 %	50 %	0 %	187930871
114	NC_010683	GAGC	2	8	50871	50878	25 %	0 %	50 %	25 %	187930873
115	NC_010683	CGCC	2	8	51154	51161	0 %	0 %	25 %	75 %	187930873
116	NC_010683	TAAT	2	8	51685	51692	50 %	50 %	0 %	0 %	187930875
117	NC_010683	AGGT	2	8	51972	51979	25 %	25 %	50 %	0 %	187930876
118	NC_010683	ACGA	2	8	51994	52001	50 %	0 %	25 %	25 %	187930876
119	NC_010683	TGGA	2	8	52324	52331	25 %	25 %	50 %	0 %	187930877
120	NC_010683	CTTT	2	8	52780	52787	0 %	75 %	0 %	25 %	187930878
121	NC_010683	GGGT	2	8	52809	52816	0 %	25 %	75 %	0 %	187930879
122	NC_010683	TGCG	2	8	53337	53344	0 %	25 %	50 %	25 %	187930879
123	NC_010683	CCAT	2	8	53736	53743	25 %	25 %	0 %	50 %	187930879
124	NC_010683	CGAA	2	8	54446	54453	50 %	0 %	25 %	25 %	187930880
125	NC_010683	TGGC	2	8	54675	54682	0 %	25 %	50 %	25 %	187930881
126	NC_010683	GGCC	2	8	55439	55446	0 %	0 %	50 %	50 %	187930881
127	NC_010683	TCCT	2	8	56828	56835	0 %	50 %	0 %	50 %	187930883
128	NC_010683	CGTG	2	8	57091	57098	0 %	25 %	50 %	25 %	187930883
129	NC_010683	GCAA	2	8	58393	58400	50 %	0 %	25 %	25 %	187930884
130	NC_010683	GTTG	2	8	58466	58473	0 %	50 %	50 %	0 %	187930884
131	NC_010683	CGGC	2	8	58545	58552	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
132	NC_010683	CGAG	2	8	58950	58957	25 %	0 %	50 %	25 %	187930886
133	NC_010683	GATC	2	8	59051	59058	25 %	25 %	25 %	25 %	187930886
134	NC_010683	AGCC	2	8	59561	59568	25 %	0 %	25 %	50 %	187930886
135	NC_010683	TCCA	2	8	60176	60183	25 %	25 %	0 %	50 %	187930887
136	NC_010683	CCCA	2	8	60473	60480	25 %	0 %	0 %	75 %	187930887
137	NC_010683	GCTG	2	8	60624	60631	0 %	25 %	50 %	25 %	187930887
138	NC_010683	GCAC	2	8	61931	61938	25 %	0 %	25 %	50 %	187930887
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140	NC_010683	GCTT	2	8	63132	63139	0 %	50 %	25 %	25 %	187930889
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.