MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010683	ATCGGA	2	12	56505	56516	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930882
1002	NC_010683	CGT	2	6	56530	56535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930882
1003	NC_010683	TGC	2	6	56562	56567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930882
1004	NC_010683	AGA	2	6	56588	56593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930882
1005	NC_010683	CGC	2	6	56609	56614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930882
1006	NC_010683	GAG	2	6	56665	56670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930882
1007	NC_010683	GCA	2	6	56718	56723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930882
1008	NC_010683	ATG	2	6	56724	56729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930882
1009	NC_010683	TCG	2	6	56757	56762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930883
1010	NC_010683	TCCT	2	8	56828	56835	0 %	50 %	0 %	50 %	187930883
1011	NC_010683	GTT	2	6	56850	56855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930883
1012	NC_010683	GCG	2	6	56856	56861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930883
1013	NC_010683	AGC	2	6	56882	56887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930883
1014	NC_010683	GAC	2	6	57016	57021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930883
1015	NC_010683	CGTG	2	8	57091	57098	0 %	25 %	50 %	25 %	187930883
1016	NC_010683	GTT	2	6	57184	57189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930883
1017	NC_010683	CGG	2	6	57192	57197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930883
1018	NC_010683	GTA	2	6	57229	57234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930883
1019	NC_010683	CGA	2	6	57261	57266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930883
1020	NC_010683	GCA	2	6	57392	57397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930883
1021	NC_010683	GCG	2	6	57429	57434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930883
1022	NC_010683	GGA	3	9	57463	57471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930883
1023	NC_010683	TCA	2	6	57477	57482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930883
1024	NC_010683	CCG	4	12	57547	57558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930884
1025	NC_010683	CGA	2	6	57614	57619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1026	NC_010683	GGGCGA	2	12	57620	57631	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	187930884
1027	NC_010683	GTA	2	6	57654	57659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930884
1028	NC_010683	GCA	2	6	57698	57703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1029	NC_010683	CAT	2	6	57744	57749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930884
1030	NC_010683	AGC	2	6	57967	57972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1031	NC_010683	TGG	2	6	58048	58053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930884
1032	NC_010683	GCC	2	6	58071	58076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930884
1033	NC_010683	TG	3	6	58110	58115	0 %	50 %	50 %	0 %	187930884
1034	NC_010683	GGT	2	6	58263	58268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930884
1035	NC_010683	AGG	2	6	58276	58281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930884
1036	NC_010683	GAC	2	6	58296	58301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1037	NC_010683	CAT	2	6	58311	58316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930884
1038	NC_010683	AGT	2	6	58322	58327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930884
1039	NC_010683	AGC	2	6	58345	58350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1040	NC_010683	CGA	2	6	58373	58378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930884
1041	NC_010683	GCAA	2	8	58393	58400	50 %	0 %	25 %	25 %	187930884
1042	NC_010683	GA	3	6	58431	58436	50 %	0 %	50 %	0 %	187930884
1043	NC_010683	CGG	2	6	58454	58459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930884
1044	NC_010683	GTTG	2	8	58466	58473	0 %	50 %	50 %	0 %	187930884
1045	NC_010683	CGGC	2	8	58545	58552	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
1046	NC_010683	CGA	2	6	58557	58562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930885
1047	NC_010683	GGC	3	9	58564	58572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930885
1048	NC_010683	GC	3	6	58627	58632	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
1049	NC_010683	GCG	2	6	58636	58641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930885
1050	NC_010683	CG	3	6	58646	58651	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
1051	NC_010683	GC	3	6	58677	58682	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
1052	NC_010683	TGC	2	6	58739	58744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930885
1053	NC_010683	CG	3	6	58756	58761	0 %	0 %	50 %	50 %	187930885
1054	NC_010683	ACG	2	6	58763	58768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930885
1055	NC_010683	GGA	2	6	58809	58814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930885
1056	NC_010683	CG	3	6	58877	58882	0 %	0 %	50 %	50 %	187930886
1057	NC_010683	CGAG	2	8	58950	58957	25 %	0 %	50 %	25 %	187930886
1058	NC_010683	AGC	2	6	58963	58968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930886
1059	NC_010683	GATC	2	8	59051	59058	25 %	25 %	25 %	25 %	187930886
1060	NC_010683	TTGGA	2	10	59134	59143	20 %	40 %	40 %	0 %	187930886
1061	NC_010683	CGC	2	6	59219	59224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930886
1062	NC_010683	GAC	2	6	59242	59247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930886
1063	NC_010683	AAC	2	6	59311	59316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930886
1064	NC_010683	TGG	2	6	59321	59326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930886
1065	NC_010683	TTG	2	6	59337	59342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930886
1066	NC_010683	GCT	2	6	59384	59389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930886
1067	NC_010683	TGA	2	6	59414	59419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930886
1068	NC_010683	GTT	2	6	59523	59528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930886
1069	NC_010683	CGC	2	6	59552	59557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930886
1070	NC_010683	AGCC	2	8	59561	59568	25 %	0 %	25 %	50 %	187930886
1071	NC_010683	CG	3	6	59619	59624	0 %	0 %	50 %	50 %	187930886
1072	NC_010683	TTC	2	6	59688	59693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930886
1073	NC_010683	GCA	2	6	59731	59736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930886
1074	NC_010683	CCT	2	6	59832	59837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930887
1075	NC_010683	CCG	2	6	59969	59974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1076	NC_010683	AGT	2	6	59988	59993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930887
1077	NC_010683	CTT	2	6	60010	60015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930887
1078	NC_010683	CTG	2	6	60025	60030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1079	NC_010683	CTT	2	6	60064	60069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930887
1080	NC_010683	TCCA	2	8	60176	60183	25 %	25 %	0 %	50 %	187930887
1081	NC_010683	AGC	2	6	60194	60199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1082	NC_010683	AGC	2	6	60254	60259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1083	NC_010683	GAC	2	6	60280	60285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1084	NC_010683	GC	3	6	60364	60369	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1085	NC_010683	GTC	2	6	60421	60426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1086	NC_010683	CCCA	2	8	60473	60480	25 %	0 %	0 %	75 %	187930887
1087	NC_010683	CG	3	6	60555	60560	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1088	NC_010683	AGC	2	6	60562	60567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1089	NC_010683	GTG	2	6	60605	60610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930887
1090	NC_010683	GCTG	2	8	60624	60631	0 %	25 %	50 %	25 %	187930887
1091	NC_010683	CAG	2	6	60634	60639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1092	NC_010683	CAG	2	6	60682	60687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1093	NC_010683	CTC	2	6	60712	60717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187930887
1094	NC_010683	CG	3	6	60818	60823	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1095	NC_010683	GGT	2	6	60955	60960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930887
1096	NC_010683	CGC	2	6	60964	60969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1097	NC_010683	CG	3	6	61026	61031	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1098	NC_010683	CGC	2	6	61035	61040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1099	NC_010683	GCA	2	6	61047	61052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1100	NC_010683	GC	4	8	61087	61094	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1101	NC_010683	TGG	2	6	61116	61121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930887
1102	NC_010683	GC	3	6	61175	61180	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1103	NC_010683	TG	3	6	61200	61205	0 %	50 %	50 %	0 %	187930887
1104	NC_010683	GT	3	6	61344	61349	0 %	50 %	50 %	0 %	187930887
1105	NC_010683	CGG	2	6	61359	61364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930887
1106	NC_010683	CGC	2	6	61426	61431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1107	NC_010683	AGC	2	6	61433	61438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1108	NC_010683	TGC	2	6	61498	61503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1109	NC_010683	GAC	2	6	61511	61516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1110	NC_010683	AC	3	6	61515	61520	50 %	0 %	0 %	50 %	187930887
1111	NC_010683	AGG	2	6	61559	61564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187930887
1112	NC_010683	AGT	2	6	61599	61604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930887
1113	NC_010683	GTGAT	2	10	61745	61754	20 %	40 %	40 %	0 %	187930887
1114	NC_010683	CCG	2	6	61787	61792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1115	NC_010683	CGC	2	6	61811	61816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930887
1116	NC_010683	CAG	2	6	61875	61880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1117	NC_010683	ACTGGT	2	12	61908	61919	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187930887
1118	NC_010683	GCAC	2	8	61931	61938	25 %	0 %	25 %	50 %	187930887
1119	NC_010683	GC	3	6	61950	61955	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1120	NC_010683	GTC	2	6	61969	61974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1121	NC_010683	CATG	2	8	61986	61993	25 %	25 %	25 %	25 %	187930887
1122	NC_010683	CG	3	6	61995	62000	0 %	0 %	50 %	50 %	187930887
1123	NC_010683	GAA	2	6	62028	62033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930887
1124	NC_010683	TCG	3	9	62096	62104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930887
1125	NC_010683	CCA	2	6	62173	62178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930887
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1495	NC_010683	AAAG	2	8	80675	80682	75 %	0 %	25 %	0 %	187930912
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