MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J plasmid pRPIC01

Total Repeats: 1503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010683	GTT	2	6	31273	31278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930857
502	NC_010683	TTCGA	2	10	31337	31346	20 %	40 %	20 %	20 %	187930857
503	NC_010683	GCG	2	6	31351	31356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930857
504	NC_010683	TGC	2	6	31373	31378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930857
505	NC_010683	TGT	2	6	31502	31507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930857
506	NC_010683	GC	5	10	31533	31542	0 %	0 %	50 %	50 %	187930857
507	NC_010683	CGCT	2	8	31572	31579	0 %	25 %	25 %	50 %	187930857
508	NC_010683	TGG	2	6	31598	31603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930857
509	NC_010683	TCG	2	6	31616	31621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930857
510	NC_010683	GTT	2	6	31666	31671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930857
511	NC_010683	TGG	2	6	31844	31849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930857
512	NC_010683	GGTC	2	8	31887	31894	0 %	25 %	50 %	25 %	187930857
513	NC_010683	AGCT	2	8	31996	32003	25 %	25 %	25 %	25 %	187930857
514	NC_010683	CTT	2	6	32045	32050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930858
515	NC_010683	CACG	2	8	32147	32154	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
516	NC_010683	ATGCCC	2	12	32191	32202	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187930858
517	NC_010683	AC	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	187930858
518	NC_010683	GCACAC	2	12	32243	32254	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187930858
519	NC_010683	GAA	2	6	32337	32342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930858
520	NC_010683	TCA	2	6	32353	32358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930858
521	NC_010683	TCG	2	6	32371	32376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
522	NC_010683	CGT	2	6	32469	32474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
523	NC_010683	CCG	2	6	32534	32539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930858
524	NC_010683	CG	3	6	32538	32543	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
525	NC_010683	GGC	2	6	32575	32580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930858
526	NC_010683	ATCA	2	8	32619	32626	50 %	25 %	0 %	25 %	187930858
527	NC_010683	GTG	2	6	32633	32638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930858
528	NC_010683	CGG	2	6	32723	32728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930858
529	NC_010683	TGC	2	6	32750	32755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
530	NC_010683	GC	3	6	32784	32789	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
531	NC_010683	TCG	2	6	32815	32820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
532	NC_010683	GTT	2	6	32856	32861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930858
533	NC_010683	GCA	2	6	32890	32895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930858
534	NC_010683	CAGC	2	8	32930	32937	25 %	0 %	25 %	50 %	187930858
535	NC_010683	CTA	2	6	32954	32959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930858
536	NC_010683	ATG	2	6	32971	32976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930858
537	NC_010683	CG	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
538	NC_010683	CTG	2	6	33020	33025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
539	NC_010683	TCA	2	6	33050	33055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930858
540	NC_010683	GT	3	6	33062	33067	0 %	50 %	50 %	0 %	187930858
541	NC_010683	ATGC	2	8	33083	33090	25 %	25 %	25 %	25 %	187930858
542	NC_010683	CCGC	2	8	33118	33125	0 %	0 %	25 %	75 %	187930858
543	NC_010683	GCCT	2	8	33132	33139	0 %	25 %	25 %	50 %	187930858
544	NC_010683	ATC	2	6	33148	33153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930858
545	NC_010683	TCG	2	6	33292	33297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930858
546	NC_010683	GC	3	6	33313	33318	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
547	NC_010683	CG	3	6	33348	33353	0 %	0 %	50 %	50 %	187930858
548	NC_010683	GTT	2	6	33369	33374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187930858
549	NC_010683	ACC	2	6	33478	33483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930858
550	NC_010683	A	7	7	33490	33496	100 %	0 %	0 %	0 %	187930858
551	NC_010683	GCC	2	6	33563	33568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930858
552	NC_010683	CCG	2	6	33732	33737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930859
553	NC_010683	ACG	2	6	33789	33794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930859
554	NC_010683	GCGG	2	8	33972	33979	0 %	0 %	75 %	25 %	187930859
555	NC_010683	CGCA	2	8	34067	34074	25 %	0 %	25 %	50 %	187930859
556	NC_010683	GAGC	2	8	34099	34106	25 %	0 %	50 %	25 %	187930859
557	NC_010683	GC	3	6	34133	34138	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
558	NC_010683	GC	3	6	34211	34216	0 %	0 %	50 %	50 %	187930859
559	NC_010683	CGG	2	6	34354	34359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930860
560	NC_010683	CAG	2	6	34402	34407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
561	NC_010683	GCC	2	6	34429	34434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
562	NC_010683	GCC	2	6	34490	34495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
563	NC_010683	TCA	2	6	34527	34532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930860
564	NC_010683	GTA	2	6	34612	34617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
565	NC_010683	ATC	2	6	34622	34627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930860
566	NC_010683	AAC	2	6	34655	34660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930860
567	NC_010683	GCC	2	6	34676	34681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
568	NC_010683	CCACC	2	10	34719	34728	20 %	0 %	0 %	80 %	187930860
569	NC_010683	AGC	2	6	34796	34801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
570	NC_010683	GCT	2	6	34845	34850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930860
571	NC_010683	TTC	2	6	34864	34869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
572	NC_010683	CTT	2	6	34938	34943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
573	NC_010683	CACG	2	8	34968	34975	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
574	NC_010683	TTC	2	6	35003	35008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
575	NC_010683	ACG	2	6	35022	35027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
576	NC_010683	GCC	2	6	35080	35085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
577	NC_010683	TGG	3	9	35193	35201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930860
578	NC_010683	CAC	2	6	35227	35232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
579	NC_010683	GC	3	6	35263	35268	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
580	NC_010683	GCC	2	6	35270	35275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
581	NC_010683	GAT	2	6	35410	35415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
582	NC_010683	GAA	2	6	35593	35598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930860
583	NC_010683	ACC	2	6	35657	35662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
584	NC_010683	CTT	2	6	35772	35777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
585	NC_010683	GGGC	2	8	35781	35788	0 %	0 %	75 %	25 %	187930860
586	NC_010683	CAG	2	6	35803	35808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
587	NC_010683	TCT	2	6	35946	35951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
588	NC_010683	GCA	2	6	35955	35960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
589	NC_010683	GAAC	2	8	36084	36091	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
590	NC_010683	GCC	2	6	36092	36097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
591	NC_010683	GAA	2	6	36115	36120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930860
592	NC_010683	CG	3	6	36124	36129	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
593	NC_010683	TCA	2	6	36207	36212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930860
594	NC_010683	TCTGC	2	10	36222	36231	0 %	40 %	20 %	40 %	187930860
595	NC_010683	CCA	2	6	36264	36269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
596	NC_010683	GAT	2	6	36289	36294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
597	NC_010683	CCGA	2	8	36311	36318	25 %	0 %	25 %	50 %	187930860
598	NC_010683	CAG	3	9	36343	36351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
599	NC_010683	GAA	2	6	36364	36369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187930860
600	NC_010683	ATG	2	6	36398	36403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
601	NC_010683	CAG	2	6	36448	36453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
602	NC_010683	CAG	2	6	36463	36468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
603	NC_010683	GTG	2	6	36488	36493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187930860
604	NC_010683	GTA	2	6	36517	36522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
605	NC_010683	CCG	2	6	36540	36545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
606	NC_010683	CG	3	6	36588	36593	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
607	NC_010683	CCA	2	6	36594	36599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
608	NC_010683	CGT	2	6	36600	36605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930860
609	NC_010683	TCA	2	6	36624	36629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930860
610	NC_010683	GAC	2	6	36643	36648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187930860
611	NC_010683	CGGC	2	8	36665	36672	0 %	0 %	50 %	50 %	187930860
612	NC_010683	TCTTCG	2	12	36699	36710	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187930860
613	NC_010683	CGC	2	6	36795	36800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
614	NC_010683	CTG	2	6	36814	36819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930860
615	NC_010683	CCG	2	6	36839	36844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
616	NC_010683	TCA	2	6	36873	36878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187930860
617	NC_010683	CTT	2	6	36910	36915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187930860
618	NC_010683	CGT	2	6	36930	36935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930860
619	NC_010683	ACC	2	6	36962	36967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
620	NC_010683	GGC	2	6	36993	36998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187930860
621	NC_010683	CAC	2	6	37072	37077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187930860
622	NC_010683	CTG	2	6	37138	37143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187930860
623	NC_010683	GCC	2	6	37154	37159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187930860
624	NC_010683	AGT	3	9	37173	37181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930860
625	NC_010683	ACGA	2	8	37208	37215	50 %	0 %	25 %	25 %	187930860
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