MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 2

Total Repeats: 29024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010678	GGCC	2	8	145	152	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
2	NC_010678	CAGC	2	8	191	198	25 %	0 %	25 %	50 %	187925959
3	NC_010678	GCGG	2	8	322	329	0 %	0 %	75 %	25 %	187925959
4	NC_010678	CTT	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925959
5	NC_010678	TGC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925959
6	NC_010678	GTT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187925959
7	NC_010678	CG	4	8	408	415	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
8	NC_010678	GAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187925959
9	NC_010678	ACG	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
10	NC_010678	GAT	2	6	518	523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925959
11	NC_010678	GTG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925959
12	NC_010678	GTT	2	6	581	586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187925959
13	NC_010678	GCA	2	6	616	621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
14	NC_010678	CA	3	6	651	656	50 %	0 %	0 %	50 %	187925959
15	NC_010678	CG	3	6	751	756	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
16	NC_010678	GC	3	6	767	772	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
17	NC_010678	GTT	2	6	827	832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187925959
18	NC_010678	CCG	2	6	835	840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925959
19	NC_010678	ATGCG	2	10	896	905	20 %	20 %	40 %	20 %	187925959
20	NC_010678	TCGATG	2	12	918	929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187925959
21	NC_010678	TTC	2	6	935	940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925959
22	NC_010678	CGG	2	6	997	1002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925959
23	NC_010678	GCA	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
24	NC_010678	GC	3	6	1162	1167	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
25	NC_010678	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187925959
26	NC_010678	TGC	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925959
27	NC_010678	GGC	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925959
28	NC_010678	AGC	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
29	NC_010678	CGG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925959
30	NC_010678	CGA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
31	NC_010678	GCT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925959
32	NC_010678	TCCATC	2	12	1437	1448	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187925959
33	NC_010678	TGGCG	2	10	1459	1468	0 %	20 %	60 %	20 %	187925959
34	NC_010678	GC	3	6	1478	1483	0 %	0 %	50 %	50 %	187925959
35	NC_010678	GCC	2	6	1511	1516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925959
36	NC_010678	CAG	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925959
37	NC_010678	ATG	2	6	1569	1574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925959
38	NC_010678	CGG	2	6	1584	1589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925959
39	NC_010678	CTG	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925959
40	NC_010678	GAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187925960
41	NC_010678	CCG	2	6	2005	2010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925960
42	NC_010678	GCGT	2	8	2062	2069	0 %	25 %	50 %	25 %	187925960
43	NC_010678	GCG	2	6	2070	2075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925960
44	NC_010678	GCC	2	6	2088	2093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925960
45	NC_010678	CGC	2	6	2097	2102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925960
46	NC_010678	GTG	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925960
47	NC_010678	ACCGA	2	10	2333	2342	40 %	0 %	20 %	40 %	187925961
48	NC_010678	CCA	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187925961
49	NC_010678	GATC	2	8	2401	2408	25 %	25 %	25 %	25 %	187925961
50	NC_010678	CGG	2	6	2436	2441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925961
51	NC_010678	TGC	2	6	2604	2609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925961
52	NC_010678	TGCCGC	2	12	2676	2687	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187925962
53	NC_010678	AGC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
54	NC_010678	GGC	2	6	2757	2762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925962
55	NC_010678	GAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187925962
56	NC_010678	AGT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925962
57	NC_010678	ACG	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
58	NC_010678	AGC	2	6	2933	2938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
59	NC_010678	CG	3	6	2979	2984	0 %	0 %	50 %	50 %	187925962
60	NC_010678	GCA	2	6	2991	2996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
61	NC_010678	AGC	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
62	NC_010678	CGA	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
63	NC_010678	TGA	3	9	3135	3143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925962
64	NC_010678	AAG	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187925962
65	NC_010678	CAG	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
66	NC_010678	GCA	2	6	3204	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
67	NC_010678	GCT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925962
68	NC_010678	GCG	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925962
69	NC_010678	GTG	2	6	3287	3292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925962
70	NC_010678	CGG	2	6	3378	3383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925962
71	NC_010678	CCA	2	6	3399	3404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187925962
72	NC_010678	CG	3	6	3432	3437	0 %	0 %	50 %	50 %	187925962
73	NC_010678	A	6	6	3451	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	187925962
74	NC_010678	AGCACC	2	12	3479	3490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187925962
75	NC_010678	AAC	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187925962
76	NC_010678	GCGCC	2	10	3522	3531	0 %	0 %	40 %	60 %	187925962
77	NC_010678	CG	3	6	3541	3546	0 %	0 %	50 %	50 %	187925962
78	NC_010678	CTG	2	6	3559	3564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925962
79	NC_010678	CAG	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925962
80	NC_010678	TCG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925963
81	NC_010678	CGCC	2	8	3731	3738	0 %	0 %	25 %	75 %	187925963
82	NC_010678	CAG	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925963
83	NC_010678	GT	3	6	3796	3801	0 %	50 %	50 %	0 %	187925963
84	NC_010678	GCT	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925963
85	NC_010678	ACGC	2	8	3843	3850	25 %	0 %	25 %	50 %	187925963
86	NC_010678	CGG	2	6	3867	3872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925963
87	NC_010678	TCG	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925963
88	NC_010678	GGC	3	9	3889	3897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925963
89	NC_010678	GCGGT	2	10	3902	3911	0 %	20 %	60 %	20 %	187925963
90	NC_010678	GTC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925963
91	NC_010678	CGG	2	6	3945	3950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925963
92	NC_010678	AG	3	6	4015	4020	50 %	0 %	50 %	0 %	187925963
93	NC_010678	CCA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187925964
94	NC_010678	GAC	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925964
95	NC_010678	CAC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187925964
96	NC_010678	GCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925964
97	NC_010678	CGG	2	6	4172	4177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925964
98	NC_010678	ATG	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925964
99	NC_010678	GCA	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925964
100	NC_010678	GC	3	6	4384	4389	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
101	NC_010678	GCTGTT	2	12	4427	4438	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187925965
102	NC_010678	AGC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925965
103	NC_010678	CCG	2	6	4489	4494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925965
104	NC_010678	CG	3	6	4493	4498	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
105	NC_010678	CTT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925965
106	NC_010678	GAT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925965
107	NC_010678	CTT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925965
108	NC_010678	GCC	2	6	4592	4597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925965
109	NC_010678	CGT	2	6	4654	4659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925965
110	NC_010678	CG	3	6	4724	4729	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
111	NC_010678	CGG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925965
112	NC_010678	CTT	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925965
113	NC_010678	TGC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925965
114	NC_010678	AGC	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925965
115	NC_010678	GGT	2	6	4873	4878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925965
116	NC_010678	GC	3	6	4887	4892	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
117	NC_010678	CTT	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187925965
118	NC_010678	TGG	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925965
119	NC_010678	GCA	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925965
120	NC_010678	GC	3	6	5079	5084	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
121	NC_010678	GCT	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187925965
122	NC_010678	GCG	2	6	5207	5212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925965
123	NC_010678	GGC	2	6	5371	5376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925965
124	NC_010678	GC	3	6	5432	5437	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
125	NC_010678	GAT	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187925965
126	NC_010678	GC	3	6	5660	5665	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
127	NC_010678	GGT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187925965
128	NC_010678	GCGCG	2	10	5725	5734	0 %	0 %	60 %	40 %	187925965
129	NC_010678	CG	4	8	5731	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	187925965
130	NC_010678	CAT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187925965
131	NC_010678	ACG	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187925966
132	NC_010678	CTGCC	2	10	6361	6370	0 %	20 %	20 %	60 %	187925966
133	NC_010678	C	7	7	6369	6375	0 %	0 %	0 %	100 %	187925966
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264	NC_010678	CGG	2	6	11255	11260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187925970
265	NC_010678	CGGC	2	8	11293	11300	0 %	0 %	50 %	50 %	187925970
266	NC_010678	GCC	2	6	11358	11363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187925970
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