MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 2

Total Repeats: 29024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010678	CGGT	2	8	224869	224876	0 %	25 %	50 %	25 %	187926153
5002	NC_010678	GGCGT	2	10	224896	224905	0 %	20 %	60 %	20 %	187926153
5003	NC_010678	CGA	2	6	224918	224923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926153
5004	NC_010678	CG	3	6	224950	224955	0 %	0 %	50 %	50 %	187926153
5005	NC_010678	GC	4	8	224975	224982	0 %	0 %	50 %	50 %	187926153
5006	NC_010678	CCGT	2	8	225031	225038	0 %	25 %	25 %	50 %	187926153
5007	NC_010678	TCA	2	6	225041	225046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926153
5008	NC_010678	CGG	2	6	225065	225070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926153
5009	NC_010678	CG	3	6	225081	225086	0 %	0 %	50 %	50 %	187926153
5010	NC_010678	CAC	2	6	225093	225098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926153
5011	NC_010678	TCA	2	6	225128	225133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926153
5012	NC_010678	GTA	2	6	225304	225309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187926154
5013	NC_010678	CG	4	8	225318	225325	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5014	NC_010678	AGC	2	6	225326	225331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5015	NC_010678	CGA	2	6	225351	225356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5016	NC_010678	GAC	2	6	225373	225378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5017	NC_010678	GGT	2	6	225478	225483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926154
5018	NC_010678	TGA	2	6	225531	225536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187926154
5019	NC_010678	CGC	2	6	225570	225575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926154
5020	NC_010678	CACC	2	8	225597	225604	25 %	0 %	0 %	75 %	187926154
5021	NC_010678	CGTGGG	2	12	225642	225653	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187926154
5022	NC_010678	CG	3	6	225659	225664	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5023	NC_010678	CG	3	6	225681	225686	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5024	NC_010678	TGT	2	6	225711	225716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187926154
5025	NC_010678	GAA	2	6	225730	225735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187926154
5026	NC_010678	GCA	2	6	225750	225755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5027	NC_010678	AGCG	2	8	225791	225798	25 %	0 %	50 %	25 %	187926154
5028	NC_010678	CCA	2	6	225894	225899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926154
5029	NC_010678	ATC	2	6	225905	225910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926154
5030	NC_010678	CG	3	6	225949	225954	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5031	NC_010678	GCCG	2	8	226078	226085	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5032	NC_010678	CCA	2	6	226164	226169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926154
5033	NC_010678	CGT	2	6	226188	226193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5034	NC_010678	CAC	2	6	226222	226227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926154
5035	NC_010678	CAG	2	6	226228	226233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5036	NC_010678	CAG	2	6	226246	226251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5037	NC_010678	TTG	2	6	226316	226321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187926154
5038	NC_010678	TCT	2	6	226434	226439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187926154
5039	NC_010678	ATC	2	6	226475	226480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926154
5040	NC_010678	GCCA	2	8	226517	226524	25 %	0 %	25 %	50 %	187926154
5041	NC_010678	TCGA	2	8	226529	226536	25 %	25 %	25 %	25 %	187926154
5042	NC_010678	ATC	2	6	226562	226567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926154
5043	NC_010678	GC	3	6	226639	226644	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5044	NC_010678	GGT	2	6	226708	226713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926154
5045	NC_010678	CG	3	6	226746	226751	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5046	NC_010678	CAG	2	6	226753	226758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
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5048	NC_010678	CCAGC	2	10	226771	226780	20 %	0 %	20 %	60 %	187926154
5049	NC_010678	CCA	2	6	226788	226793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926154
5050	NC_010678	GCG	2	6	226796	226801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926154
5051	NC_010678	CGG	2	6	226903	226908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926154
5052	NC_010678	GGC	2	6	226918	226923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926154
5053	NC_010678	CAG	3	9	226933	226941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5054	NC_010678	GCA	2	6	226995	227000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5055	NC_010678	GCT	2	6	227019	227024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5056	NC_010678	CCGG	2	8	227060	227067	0 %	0 %	50 %	50 %	187926154
5057	NC_010678	GGT	2	6	227125	227130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926154
5058	NC_010678	AAC	2	6	227350	227355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187926154
5059	NC_010678	TCT	2	6	227420	227425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187926154
5060	NC_010678	GAC	2	6	227473	227478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926154
5061	NC_010678	GGA	2	6	227497	227502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187926154
5062	NC_010678	TCA	2	6	227508	227513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926154
5063	NC_010678	GAA	3	9	227803	227811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187926155
5064	NC_010678	ATGTC	2	10	227829	227838	20 %	40 %	20 %	20 %	187926155
5065	NC_010678	GGA	2	6	227905	227910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187926155
5066	NC_010678	CTCC	2	8	227913	227920	0 %	25 %	0 %	75 %	187926155
5067	NC_010678	GCG	2	6	228000	228005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926155
5068	NC_010678	GAAG	2	8	228022	228029	50 %	0 %	50 %	0 %	187926155
5069	NC_010678	CGG	2	6	228094	228099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926155
5070	NC_010678	GC	3	6	228110	228115	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
5071	NC_010678	GCG	2	6	228129	228134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926155
5072	NC_010678	TGC	2	6	228178	228183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5074	NC_010678	GGC	2	6	228211	228216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926155
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5079	NC_010678	GCC	2	6	228317	228322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926155
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5081	NC_010678	CG	3	6	228450	228455	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
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5087	NC_010678	TGA	2	6	228621	228626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187926155
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5089	NC_010678	TCG	2	6	228684	228689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
5090	NC_010678	CTG	2	6	228719	228724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5093	NC_010678	GGC	4	12	228742	228753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926155
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5100	NC_010678	CG	3	6	228889	228894	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
5101	NC_010678	GCC	2	6	228937	228942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926155
5102	NC_010678	GCAACG	2	12	228969	228980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926155
5103	NC_010678	GACC	2	8	228994	229001	25 %	0 %	25 %	50 %	187926155
5104	NC_010678	CGCA	2	8	229023	229030	25 %	0 %	25 %	50 %	187926155
5105	NC_010678	CG	3	6	229039	229044	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
5106	NC_010678	TGG	2	6	229077	229082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926155
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5109	NC_010678	CTG	2	6	229151	229156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
5110	NC_010678	CGGC	2	8	229166	229173	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
5111	NC_010678	CG	3	6	229199	229204	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
5112	NC_010678	ACC	2	6	229212	229217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926155
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5119	NC_010678	CGC	2	6	229414	229419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926155
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5122	NC_010678	GCC	2	6	229463	229468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926155
5123	NC_010678	CGT	2	6	229534	229539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
5124	NC_010678	CGAAGA	2	12	229582	229593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187926155
5125	NC_010678	GTG	2	6	229628	229633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187926155
5126	NC_010678	CGGCGT	2	12	229642	229653	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187926155
5127	NC_010678	GCC	2	6	229661	229666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926155
5128	NC_010678	GC	3	6	229670	229675	0 %	0 %	50 %	50 %	187926155
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5131	NC_010678	GCT	2	6	229760	229765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5137	NC_010678	CAT	2	6	229957	229962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926155
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5143	NC_010678	GACA	2	8	230178	230185	50 %	0 %	25 %	25 %	187926155
5144	NC_010678	TGC	2	6	230196	230201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5148	NC_010678	GTC	3	9	230303	230311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5151	NC_010678	CAG	2	6	230417	230422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926155
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5154	NC_010678	CTG	2	6	230611	230616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926156
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5161	NC_010678	GCC	2	6	230881	230886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926156
5162	NC_010678	CGA	2	6	230889	230894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926156
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5234	NC_010678	TGGTCG	2	12	233888	233899	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187926157
5235	NC_010678	CG	3	6	233965	233970	0 %	0 %	50 %	50 %	187926157
5236	NC_010678	GCCC	2	8	234051	234058	0 %	0 %	25 %	75 %	187926157
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5241	NC_010678	TGA	2	6	234437	234442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187926158
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5243	NC_010678	GCG	2	6	234527	234532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926158
5244	NC_010678	TTG	2	6	234580	234585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187926158
5245	NC_010678	CGGCG	2	10	234597	234606	0 %	0 %	60 %	40 %	187926158
5246	NC_010678	GCCG	2	8	234612	234619	0 %	0 %	50 %	50 %	187926158
5247	NC_010678	CTG	2	6	234621	234626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926158
5248	NC_010678	CGC	2	6	234629	234634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926158
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5250	NC_010678	TGC	2	6	234650	234655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926158
5251	NC_010678	GCGCC	2	10	234749	234758	0 %	0 %	40 %	60 %	187926158
5252	NC_010678	ACG	2	6	234781	234786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926158
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5256	NC_010678	GTC	2	6	234971	234976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926159
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5264	NC_010678	GCC	2	6	235348	235353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926159
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5269	NC_010678	GCCG	2	8	235537	235544	0 %	0 %	50 %	50 %	187926159
5270	NC_010678	GC	3	6	235547	235552	0 %	0 %	50 %	50 %	187926159
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5277	NC_010678	GC	3	6	235764	235769	0 %	0 %	50 %	50 %	187926159
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5332	NC_010678	TCG	2	6	238144	238149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926161
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5356	NC_010678	CGGC	2	8	239128	239135	0 %	0 %	50 %	50 %	187926162
5357	NC_010678	TCCGC	2	10	239152	239161	0 %	20 %	20 %	60 %	187926162
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5361	NC_010678	CAT	2	6	239213	239218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926162
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5364	NC_010678	GCA	2	6	239366	239371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926162
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5404	NC_010678	GCG	2	6	241004	241009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926163
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5472	NC_010678	GGCG	2	8	243327	243334	0 %	0 %	75 %	25 %	187926165
5473	NC_010678	ATTC	2	8	243732	243739	25 %	50 %	0 %	25 %	187926166
5474	NC_010678	GCCGAT	2	12	243791	243802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187926166
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5476	NC_010678	GGGCG	2	10	243844	243853	0 %	0 %	80 %	20 %	187926166
5477	NC_010678	CCAT	2	8	243891	243898	25 %	25 %	0 %	50 %	187926166
5478	NC_010678	CGC	2	6	243906	243911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926166
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5480	NC_010678	TGC	2	6	243985	243990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5481	NC_010678	CG	3	6	244015	244020	0 %	0 %	50 %	50 %	187926166
5482	NC_010678	CGA	2	6	244032	244037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5483	NC_010678	CG	3	6	244056	244061	0 %	0 %	50 %	50 %	187926166
5484	NC_010678	CGTCAC	2	12	244072	244083	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	187926166
5485	NC_010678	GCA	2	6	244087	244092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5486	NC_010678	GTC	2	6	244138	244143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5487	NC_010678	CGG	2	6	244165	244170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187926166
5488	NC_010678	GC	4	8	244195	244202	0 %	0 %	50 %	50 %	187926166
5489	NC_010678	CGC	2	6	244212	244217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926166
5490	NC_010678	GCC	3	9	244272	244280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926166
5491	NC_010678	TCA	2	6	244281	244286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926166
5492	NC_010678	CAT	2	6	244363	244368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187926166
5493	NC_010678	CGA	2	6	244465	244470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5494	NC_010678	CCG	2	6	244522	244527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926166
5495	NC_010678	CA	3	6	244528	244533	50 %	0 %	0 %	50 %	187926166
5496	NC_010678	CAC	2	6	244550	244555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187926166
5497	NC_010678	CTG	2	6	244565	244570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5498	NC_010678	TGC	2	6	244576	244581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187926166
5499	NC_010678	GGAT	2	8	244715	244722	25 %	25 %	50 %	0 %	187926166
5500	NC_010678	GCC	2	6	244790	244795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187926166

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