MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4003	NC_010263	CT	3	6	197295	197300	0 %	50 %	0 %	50 %	165932759
4004	NC_010263	A	6	6	197307	197312	100 %	0 %	0 %	0 %	165932759
4005	NC_010263	AT	3	6	197326	197331	50 %	50 %	0 %	0 %	165932759
4006	NC_010263	TAA	2	6	197368	197373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932759
4007	NC_010263	T	7	7	197455	197461	0 %	100 %	0 %	0 %	165932759
4008	NC_010263	TTG	2	6	197477	197482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932759
4009	NC_010263	GTT	2	6	197519	197524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932759
4010	NC_010263	CAA	2	6	197541	197546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932759
4011	NC_010263	CTT	2	6	197646	197651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932759
4012	NC_010263	TTTC	2	8	197652	197659	0 %	75 %	0 %	25 %	165932759
4013	NC_010263	TTG	2	6	197686	197691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932759
4014	NC_010263	T	6	6	197707	197712	0 %	100 %	0 %	0 %	165932759
4015	NC_010263	ATT	2	6	197740	197745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932759
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4018	NC_010263	CTT	2	6	197916	197921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932759
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4021	NC_010263	T	6	6	198008	198013	0 %	100 %	0 %	0 %	165932759
4022	NC_010263	T	7	7	198028	198034	0 %	100 %	0 %	0 %	165932759
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4047	NC_010263	AT	3	6	199019	199024	50 %	50 %	0 %	0 %	165932759
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4061	NC_010263	A	6	6	199844	199849	100 %	0 %	0 %	0 %	165932761
4062	NC_010263	AAAG	2	8	199925	199932	75 %	0 %	25 %	0 %	165932761
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4107	NC_010263	ATA	2	6	202018	202023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932764
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4112	NC_010263	TA	3	6	202202	202207	50 %	50 %	0 %	0 %	165932764
4113	NC_010263	AT	3	6	202249	202254	50 %	50 %	0 %	0 %	165932764
4114	NC_010263	T	6	6	202345	202350	0 %	100 %	0 %	0 %	165932764
4115	NC_010263	T	6	6	202359	202364	0 %	100 %	0 %	0 %	165932764
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4118	NC_010263	TC	3	6	202415	202420	0 %	50 %	0 %	50 %	165932764
4119	NC_010263	AGG	2	6	202440	202445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932764
4120	NC_010263	GCA	2	6	202453	202458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932764
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4122	NC_010263	T	8	8	202488	202495	0 %	100 %	0 %	0 %	165932764
4123	NC_010263	T	7	7	202864	202870	0 %	100 %	0 %	0 %	165932765
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4125	NC_010263	TTA	2	6	202980	202985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932765
4126	NC_010263	TCT	2	6	203010	203015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932765
4127	NC_010263	ATT	2	6	203016	203021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932765
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4129	NC_010263	TTTA	2	8	203165	203172	25 %	75 %	0 %	0 %	165932765
4130	NC_010263	AAT	2	6	203181	203186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932765
4131	NC_010263	CATT	2	8	203223	203230	25 %	50 %	0 %	25 %	165932765
4132	NC_010263	TGC	2	6	203231	203236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932765
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4145	NC_010263	GCT	2	6	203730	203735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932765
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4235	NC_010263	ATT	2	6	208667	208672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932772
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4239	NC_010263	AATTT	2	10	208733	208742	40 %	60 %	0 %	0 %	165932772
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4242	NC_010263	TATT	2	8	208840	208847	25 %	75 %	0 %	0 %	165932773
4243	NC_010263	CAT	2	6	208861	208866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932773
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4245	NC_010263	TAA	2	6	208883	208888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932773
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4248	NC_010263	GTT	2	6	208951	208956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932773
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4253	NC_010263	TAT	2	6	209137	209142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932773
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4261	NC_010263	AACG	2	8	209453	209460	50 %	0 %	25 %	25 %	165932773
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4494	NC_010263	AT	3	6	220656	220661	50 %	50 %	0 %	0 %	165932785
4495	NC_010263	TCA	2	6	220719	220724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932785
4496	NC_010263	TAT	2	6	220812	220817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
4497	NC_010263	T	6	6	220819	220824	0 %	100 %	0 %	0 %	319717302
4498	NC_010263	AT	3	6	220842	220847	50 %	50 %	0 %	0 %	319717302
4499	NC_010263	ATC	2	6	220913	220918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319717302
4500	NC_010263	ATG	2	6	220958	220963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319717302

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