MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_010263	ATT	2	6	173486	173491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932742
3503	NC_010263	ATT	2	6	173553	173558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932742
3504	NC_010263	T	7	7	173557	173563	0 %	100 %	0 %	0 %	165932742
3505	NC_010263	TGC	2	6	173575	173580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932742
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3507	NC_010263	A	7	7	173636	173642	100 %	0 %	0 %	0 %	165932742
3508	NC_010263	TTAA	2	8	173649	173656	50 %	50 %	0 %	0 %	165932742
3509	NC_010263	TA	4	8	173783	173790	50 %	50 %	0 %	0 %	165932743
3510	NC_010263	T	7	7	173793	173799	0 %	100 %	0 %	0 %	165932743
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3512	NC_010263	TAA	2	6	173988	173993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932743
3513	NC_010263	AT	3	6	174009	174014	50 %	50 %	0 %	0 %	165932743
3514	NC_010263	GGT	2	6	174064	174069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932743
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3519	NC_010263	CGT	2	6	174237	174242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932744
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3521	NC_010263	GAA	2	6	174332	174337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932744
3522	NC_010263	TAA	2	6	174371	174376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932744
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3531	NC_010263	TGA	2	6	174574	174579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932744
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3535	NC_010263	TAA	2	6	174671	174676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932744
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3537	NC_010263	A	7	7	174699	174705	100 %	0 %	0 %	0 %	165932744
3538	NC_010263	TAA	2	6	174721	174726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932745
3539	NC_010263	ATAA	2	8	174735	174742	75 %	25 %	0 %	0 %	165932745
3540	NC_010263	TAT	2	6	174819	174824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932745
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3542	NC_010263	TGGAT	2	10	174874	174883	20 %	40 %	40 %	0 %	165932745
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3554	NC_010263	GAA	2	6	175425	175430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932745
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3557	NC_010263	GTA	2	6	175548	175553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932745
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3559	NC_010263	GAA	2	6	175614	175619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932745
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3561	NC_010263	AT	3	6	175713	175718	50 %	50 %	0 %	0 %	165932745
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3565	NC_010263	ATGC	2	8	175797	175804	25 %	25 %	25 %	25 %	165932745
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3589	NC_010263	AT	3	6	176594	176599	50 %	50 %	0 %	0 %	165932745
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3606	NC_010263	A	8	8	177673	177680	100 %	0 %	0 %	0 %	165932747
3607	NC_010263	A	6	6	177740	177745	100 %	0 %	0 %	0 %	165932747
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3990	NC_010263	TTA	2	6	196699	196704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932758
3991	NC_010263	TAT	2	6	196752	196757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932758
3992	NC_010263	A	6	6	196776	196781	100 %	0 %	0 %	0 %	165932758
3993	NC_010263	AAGAAT	2	12	196790	196801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165932758
3994	NC_010263	TTG	2	6	197083	197088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932759
3995	NC_010263	TCCT	2	8	197096	197103	0 %	50 %	0 %	50 %	165932759
3996	NC_010263	GA	3	6	197115	197120	50 %	0 %	50 %	0 %	165932759
3997	NC_010263	TCTT	2	8	197161	197168	0 %	75 %	0 %	25 %	165932759
3998	NC_010263	CTT	2	6	197170	197175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932759
3999	NC_010263	TGT	2	6	197177	197182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932759
4000	NC_010263	TAT	2	6	197226	197231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932759

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