MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010263	ATG	2	6	148391	148396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3002	NC_010263	TGC	2	6	148455	148460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
3003	NC_010263	AGGAG	2	10	148527	148536	40 %	0 %	60 %	0 %	165932718
3004	NC_010263	TAG	2	6	148566	148571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3005	NC_010263	ATA	2	6	148685	148690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3006	NC_010263	TAA	2	6	148709	148714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3007	NC_010263	TAA	2	6	148766	148771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3008	NC_010263	TAT	2	6	148778	148783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3009	NC_010263	CAA	2	6	148816	148821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932718
3010	NC_010263	TA	4	8	148871	148878	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3011	NC_010263	ATT	2	6	148971	148976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3012	NC_010263	T	6	6	148999	149004	0 %	100 %	0 %	0 %	165932718
3013	NC_010263	ATT	2	6	149009	149014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3014	NC_010263	T	6	6	149023	149028	0 %	100 %	0 %	0 %	165932718
3015	NC_010263	TAAT	2	8	149057	149064	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3016	NC_010263	GCTT	2	8	149096	149103	0 %	50 %	25 %	25 %	165932718
3017	NC_010263	CTC	2	6	149117	149122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932718
3018	NC_010263	ATT	2	6	149136	149141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3019	NC_010263	TTG	2	6	149153	149158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932718
3020	NC_010263	TA	4	8	149172	149179	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3021	NC_010263	TATTT	2	10	149203	149212	20 %	80 %	0 %	0 %	165932718
3022	NC_010263	TCTT	2	8	149213	149220	0 %	75 %	0 %	25 %	165932718
3023	NC_010263	TAT	2	6	149235	149240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3024	NC_010263	ATTT	2	8	149292	149299	25 %	75 %	0 %	0 %	165932718
3025	NC_010263	TGT	2	6	149306	149311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932718
3026	NC_010263	TCGT	2	8	149322	149329	0 %	50 %	25 %	25 %	165932718
3027	NC_010263	TTTA	2	8	149382	149389	25 %	75 %	0 %	0 %	165932718
3028	NC_010263	ATC	2	6	149413	149418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932718
3029	NC_010263	AT	3	6	149428	149433	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3030	NC_010263	TGG	2	6	149551	149556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932718
3031	NC_010263	AAT	2	6	149584	149589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3032	NC_010263	AT	3	6	149603	149608	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3033	NC_010263	ATA	2	6	149626	149631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3034	NC_010263	GAT	2	6	149635	149640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3035	NC_010263	TGC	2	6	149676	149681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
3036	NC_010263	TATT	2	8	149811	149818	25 %	75 %	0 %	0 %	165932718
3037	NC_010263	CAA	2	6	149932	149937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932718
3038	NC_010263	T	6	6	150025	150030	0 %	100 %	0 %	0 %	165932718
3039	NC_010263	ATG	3	9	150049	150057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3040	NC_010263	AAGC	2	8	150070	150077	50 %	0 %	25 %	25 %	165932718
3041	NC_010263	TTC	2	6	150084	150089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932718
3042	NC_010263	AATG	2	8	150153	150160	50 %	25 %	25 %	0 %	165932718
3043	NC_010263	ATT	2	6	150192	150197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932718
3044	NC_010263	GAAT	2	8	150216	150223	50 %	25 %	25 %	0 %	165932718
3045	NC_010263	TGC	2	6	150276	150281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
3046	NC_010263	AAAT	2	8	150282	150289	75 %	25 %	0 %	0 %	165932718
3047	NC_010263	GCT	2	6	150307	150312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
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3049	NC_010263	A	6	6	150560	150565	100 %	0 %	0 %	0 %	165932718
3050	NC_010263	GAT	2	6	150721	150726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3051	NC_010263	TAA	2	6	150765	150770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3052	NC_010263	GCT	2	6	150781	150786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
3053	NC_010263	AT	3	6	150794	150799	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3054	NC_010263	AAAG	2	8	150875	150882	75 %	0 %	25 %	0 %	165932718
3055	NC_010263	ATG	2	6	150931	150936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3056	NC_010263	GATA	2	8	150987	150994	50 %	25 %	25 %	0 %	165932718
3057	NC_010263	AT	3	6	151035	151040	50 %	50 %	0 %	0 %	165932718
3058	NC_010263	TCG	2	6	151041	151046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932718
3059	NC_010263	GAT	2	6	151132	151137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932718
3060	NC_010263	GAA	2	6	151147	151152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932718
3061	NC_010263	CCG	2	6	151187	151192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165932718
3062	NC_010263	TAA	2	6	151230	151235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3063	NC_010263	TAAA	2	8	151280	151287	75 %	25 %	0 %	0 %	165932718
3064	NC_010263	AAGC	2	8	151300	151307	50 %	0 %	25 %	25 %	165932718
3065	NC_010263	TAA	2	6	151344	151349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932718
3066	NC_010263	AGA	2	6	151422	151427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932718
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3068	NC_010263	AGA	2	6	154306	154311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932719
3069	NC_010263	T	6	6	154312	154317	0 %	100 %	0 %	0 %	165932719
3070	NC_010263	AAAG	2	8	154323	154330	75 %	0 %	25 %	0 %	165932719
3071	NC_010263	ATA	2	6	154358	154363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932719
3072	NC_010263	ATG	2	6	154379	154384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932719
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3077	NC_010263	TTA	2	6	154876	154881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932721
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3079	NC_010263	GGT	2	6	154938	154943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932721
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3081	NC_010263	CGG	2	6	155186	155191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932721
3082	NC_010263	ACT	2	6	155231	155236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932721
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3085	NC_010263	GGGC	2	8	155303	155310	0 %	0 %	75 %	25 %	165932721
3086	NC_010263	TA	3	6	155323	155328	50 %	50 %	0 %	0 %	165932721
3087	NC_010263	TAAT	2	8	155392	155399	50 %	50 %	0 %	0 %	165932721
3088	NC_010263	A	6	6	155406	155411	100 %	0 %	0 %	0 %	165932721
3089	NC_010263	A	6	6	155481	155486	100 %	0 %	0 %	0 %	165932722
3090	NC_010263	ATT	2	6	155492	155497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932722
3091	NC_010263	A	7	7	155540	155546	100 %	0 %	0 %	0 %	165932722
3092	NC_010263	TTG	2	6	155592	155597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932722
3093	NC_010263	TCTT	2	8	155696	155703	0 %	75 %	0 %	25 %	165932722
3094	NC_010263	GTA	2	6	155780	155785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932722
3095	NC_010263	AGT	2	6	155794	155799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932722
3096	NC_010263	TCG	2	6	155800	155805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932722
3097	NC_010263	TAT	2	6	155816	155821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932722
3098	NC_010263	AG	3	6	155857	155862	50 %	0 %	50 %	0 %	165932722
3099	NC_010263	GCA	2	6	155888	155893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932722
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3102	NC_010263	CTT	2	6	156218	156223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932723
3103	NC_010263	TA	3	6	156267	156272	50 %	50 %	0 %	0 %	165932723
3104	NC_010263	TAC	2	6	156294	156299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932723
3105	NC_010263	AAT	2	6	156377	156382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932724
3106	NC_010263	TAA	2	6	156410	156415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932724
3107	NC_010263	GATTTT	2	12	156420	156431	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	165932724
3108	NC_010263	A	6	6	156441	156446	100 %	0 %	0 %	0 %	165932724
3109	NC_010263	GTTA	2	8	156447	156454	25 %	50 %	25 %	0 %	165932724
3110	NC_010263	ATT	2	6	156465	156470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932724
3111	NC_010263	TA	4	8	156500	156507	50 %	50 %	0 %	0 %	165932724
3112	NC_010263	AATTT	2	10	156508	156517	40 %	60 %	0 %	0 %	165932724
3113	NC_010263	CGG	2	6	156533	156538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932724
3114	NC_010263	AGGTG	2	10	156614	156623	20 %	20 %	60 %	0 %	165932724
3115	NC_010263	GTA	2	6	156670	156675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932724
3116	NC_010263	GAA	2	6	156681	156686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932724
3117	NC_010263	TTAA	2	8	156708	156715	50 %	50 %	0 %	0 %	165932724
3118	NC_010263	TCTT	2	8	156828	156835	0 %	75 %	0 %	25 %	165932724
3119	NC_010263	TTTTGG	2	12	156875	156886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932724
3120	NC_010263	TGC	2	6	156971	156976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932724
3121	NC_010263	TAT	2	6	156986	156991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932724
3122	NC_010263	GTA	2	6	157014	157019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932724
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3367	NC_010263	AAAG	2	8	167185	167192	75 %	0 %	25 %	0 %	165932736
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3493	NC_010263	TAA	2	6	173013	173018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932742
3494	NC_010263	T	6	6	173036	173041	0 %	100 %	0 %	0 %	165932742
3495	NC_010263	TGC	2	6	173112	173117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932742
3496	NC_010263	TAAA	2	8	173133	173140	75 %	25 %	0 %	0 %	165932742
3497	NC_010263	TTA	2	6	173198	173203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932742
3498	NC_010263	TAT	2	6	173215	173220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932742
3499	NC_010263	GT	3	6	173259	173264	0 %	50 %	50 %	0 %	165932742
3500	NC_010263	CAGGG	2	10	173323	173332	20 %	0 %	60 %	20 %	165932742

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